MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	TGTTAT	2	12	6566	6577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019431	TTTGAT	2	12	8276	8287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414073266
3	NC_019431	TTTTTC	2	12	8328	8339	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414073266
4	NC_019431	AAAATT	2	12	9313	9324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073267
5	NC_019431	GAAGCA	2	12	10632	10643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414073268
6	NC_019431	CAGTAA	2	12	12464	12475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019431	AACTTT	2	12	14056	14067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	414073270
8	NC_019431	ATCTTT	2	12	19963	19974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073276
9	NC_019431	TAGTGT	2	12	20747	20758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414073277
10	NC_019431	TTTTAT	2	12	30890	30901	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019431	TTTTAT	2	12	31703	31714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019431	TAGAAA	2	12	35644	35655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073290
13	NC_019431	GATCCA	2	12	40250	40261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073293
14	NC_019431	AAAACA	2	12	43060	43071	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019431	CTCCTT	2	12	44973	44984	0 %	50 %	0 %	50 %	414073296
16	NC_019431	AAAAAT	2	12	47532	47543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019431	AAAATA	2	12	47969	47980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414073298
18	NC_019431	CTTTAA	2	12	48478	48489	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019431	AAGAAA	2	12	48937	48948	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	ACAAAG	2	12	49187	49198	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019431	TCAAAC	2	12	49234	49245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019431	AGTTAC	2	12	52606	52617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.