MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	AATA	2	8	369	376	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
2	NC_019431	TGAT	2	8	476	483	25 %	50 %	25 %	0 %	414073261
3	NC_019431	AAAT	2	8	1230	1237	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
4	NC_019431	AATG	2	8	1326	1333	50 %	25 %	25 %	0 %	414073261
5	NC_019431	TAAA	2	8	1347	1354	75 %	25 %	0 %	0 %	414073261
6	NC_019431	AAGT	2	8	1522	1529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019431	AATT	2	8	1537	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019431	ATAA	2	8	1670	1677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019431	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	414073262
10	NC_019431	TGGT	2	8	2974	2981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019431	ATAA	2	8	3125	3132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019431	TTGA	2	8	3251	3258	25 %	50 %	25 %	0 %	414073263
13	NC_019431	ATTC	2	8	3453	3460	25 %	50 %	0 %	25 %	414073263
14	NC_019431	ATCA	2	8	3653	3660	50 %	25 %	0 %	25 %	414073263
15	NC_019431	ATTG	2	8	4123	4130	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
16	NC_019431	CTCG	2	8	4275	4282	0 %	25 %	25 %	50 %	414073264
17	NC_019431	TTGA	2	8	4616	4623	25 %	50 %	25 %	0 %	414073264
18	NC_019431	TTTA	2	8	4664	4671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019431	TGAT	2	8	4789	4796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	GAAA	2	8	5117	5124	75 %	0 %	25 %	0 %	414073265
21	NC_019431	TTGC	2	8	5414	5421	0 %	50 %	25 %	25 %	414073265
22	NC_019431	GTTT	2	8	5685	5692	0 %	75 %	25 %	0 %	414073265
23	NC_019431	GCAA	2	8	5834	5841	50 %	0 %	25 %	25 %	414073265
24	NC_019431	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	414073265
25	NC_019431	TCCT	2	8	6601	6608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019431	GAAT	2	8	6699	6706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019431	TTAT	2	8	7773	7780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019431	ATCC	2	8	8233	8240	25 %	25 %	0 %	50 %	414073266
29	NC_019431	ATTA	2	8	8720	8727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019431	TCAT	2	8	9162	9169	25 %	50 %	0 %	25 %	414073267
31	NC_019431	CTGA	2	8	9813	9820	25 %	25 %	25 %	25 %	414073268
32	NC_019431	GGTT	2	8	10521	10528	0 %	50 %	50 %	0 %	414073268
33	NC_019431	ATTT	2	8	11167	11174	25 %	75 %	0 %	0 %	414073268
34	NC_019431	TAGA	2	8	11661	11668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019431	GTTG	2	8	11835	11842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019431	AAGC	2	8	11874	11881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019431	TAAA	2	8	12296	12303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019431	ACCA	2	8	12304	12311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019431	TCAA	2	8	12453	12460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019431	TGAT	2	8	12485	12492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019431	AGAT	2	8	12644	12651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019431	CAAA	2	8	12675	12682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019431	CATA	2	8	13130	13137	50 %	25 %	0 %	25 %	414073269
44	NC_019431	AAGA	2	8	13505	13512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019431	ACTT	2	8	14041	14048	25 %	50 %	0 %	25 %	414073270
46	NC_019431	AAAT	2	8	14404	14411	75 %	25 %	0 %	0 %	414073270
47	NC_019431	CAAT	2	8	14679	14686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019431	ATCA	2	8	15019	15026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019431	TAAT	2	8	15376	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	414073271
50	NC_019431	AACA	2	8	15407	15414	75 %	0 %	0 %	25 %	414073271
51	NC_019431	ATAA	2	8	16125	16132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019431	TTTA	2	8	16219	16226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019431	AGTG	2	8	16849	16856	25 %	25 %	50 %	0 %	414073272
54	NC_019431	CATC	2	8	16961	16968	25 %	25 %	0 %	50 %	414073273
55	NC_019431	TTTA	2	8	17509	17516	25 %	75 %	0 %	0 %	414073274
56	NC_019431	TTTC	2	8	19116	19123	0 %	75 %	0 %	25 %	414073275
57	NC_019431	AATC	2	8	19195	19202	50 %	25 %	0 %	25 %	414073275
58	NC_019431	TGAT	2	8	19305	19312	25 %	50 %	25 %	0 %	414073275
59	NC_019431	TAAT	2	8	19712	19719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019431	CAAA	2	8	20281	20288	75 %	0 %	0 %	25 %	414073277
61	NC_019431	ACTA	2	8	20363	20370	50 %	25 %	0 %	25 %	414073277
62	NC_019431	GTTG	2	8	20655	20662	0 %	50 %	50 %	0 %	414073277
63	NC_019431	CTTT	2	8	20710	20717	0 %	75 %	0 %	25 %	414073277
64	NC_019431	ACCA	2	8	20727	20734	50 %	0 %	0 %	50 %	414073277
65	NC_019431	ATAA	2	8	20838	20845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019431	TTTA	2	8	20866	20873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019431	TTAT	3	12	20923	20934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019431	ATTT	2	8	21244	21251	25 %	75 %	0 %	0 %	414073278
69	NC_019431	TACT	2	8	21480	21487	25 %	50 %	0 %	25 %	414073278
70	NC_019431	AAAT	2	8	21607	21614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019431	TGAT	2	8	21834	21841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019431	GAAA	2	8	22162	22169	75 %	0 %	25 %	0 %	414073279
73	NC_019431	TTGC	2	8	22459	22466	0 %	50 %	25 %	25 %	414073279
74	NC_019431	AGTC	2	8	22772	22779	25 %	25 %	25 %	25 %	414073279
75	NC_019431	GTTT	2	8	22799	22806	0 %	75 %	25 %	0 %	414073279
76	NC_019431	GCAA	2	8	22879	22886	50 %	0 %	25 %	25 %	414073279
77	NC_019431	AAGA	2	8	23029	23036	75 %	0 %	25 %	0 %	414073279
78	NC_019431	AACA	2	8	24726	24733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019431	ATTT	2	8	24778	24785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019431	AATT	2	8	24847	24854	50 %	50 %	0 %	0 %	414073281
81	NC_019431	AGGT	2	8	25084	25091	25 %	25 %	50 %	0 %	414073281
82	NC_019431	TTTG	2	8	25099	25106	0 %	75 %	25 %	0 %	414073281
83	NC_019431	GAAG	2	8	25136	25143	50 %	0 %	50 %	0 %	414073281
84	NC_019431	TTAT	2	8	25144	25151	25 %	75 %	0 %	0 %	414073281
85	NC_019431	TTGT	2	8	25274	25281	0 %	75 %	25 %	0 %	414073281
86	NC_019431	GAAA	2	8	25350	25357	75 %	0 %	25 %	0 %	414073281
87	NC_019431	AATA	2	8	25657	25664	75 %	25 %	0 %	0 %	414073281
88	NC_019431	CAAT	2	8	26388	26395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019431	TAGG	2	8	26427	26434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019431	GAAA	2	8	26544	26551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019431	AGTC	2	8	26958	26965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019431	AGTA	2	8	27100	27107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019431	TTTC	2	8	27688	27695	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
94	NC_019431	AAAG	2	8	27771	27778	75 %	0 %	25 %	0 %	414073283
95	NC_019431	TCAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	0 %	25 %	414073283
96	NC_019431	TTCT	2	8	27974	27981	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
97	NC_019431	TTCT	2	8	28004	28011	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
98	NC_019431	TCTT	2	8	28042	28049	0 %	75 %	0 %	25 %	414073283
99	NC_019431	AAGA	2	8	28370	28377	75 %	0 %	25 %	0 %	414073283
100	NC_019431	TTAA	2	8	28456	28463	50 %	50 %	0 %	0 %	414073283
101	NC_019431	CAAA	2	8	28612	28619	75 %	0 %	0 %	25 %	414073283
102	NC_019431	CTTT	2	8	29557	29564	0 %	75 %	0 %	25 %	414073284
103	NC_019431	TCAA	2	8	29630	29637	50 %	25 %	0 %	25 %	414073284
104	NC_019431	AAGC	2	8	29964	29971	50 %	0 %	25 %	25 %	414073284
105	NC_019431	AAGC	2	8	30159	30166	50 %	0 %	25 %	25 %	414073284
106	NC_019431	ATAG	2	8	30681	30688	50 %	25 %	25 %	0 %	414073284
107	NC_019431	GAAA	2	8	30808	30815	75 %	0 %	25 %	0 %	414073284
108	NC_019431	ATGG	3	12	31121	31132	25 %	25 %	50 %	0 %	414073285
109	NC_019431	GAAA	2	8	31263	31270	75 %	0 %	25 %	0 %	414073286
110	NC_019431	CAAA	2	8	31426	31433	75 %	0 %	0 %	25 %	414073286
111	NC_019431	AAAG	2	8	32360	32367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019431	AATA	2	8	32536	32543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019431	ATTT	2	8	32634	32641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019431	CAAA	2	8	32800	32807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019431	AACT	2	8	32809	32816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019431	ATCT	2	8	32930	32937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019431	AAAT	2	8	33050	33057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019431	GTTT	2	8	33361	33368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019431	CTAT	2	8	33447	33454	25 %	50 %	0 %	25 %	414073288
120	NC_019431	TTAG	2	8	33521	33528	25 %	50 %	25 %	0 %	414073288
121	NC_019431	ATTA	2	8	33628	33635	50 %	50 %	0 %	0 %	414073288
122	NC_019431	TTTA	2	8	33639	33646	25 %	75 %	0 %	0 %	414073288
123	NC_019431	TTTG	2	8	33660	33667	0 %	75 %	25 %	0 %	414073288
124	NC_019431	TTCA	2	8	34414	34421	25 %	50 %	0 %	25 %	414073289
125	NC_019431	TTGG	2	8	34900	34907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019431	AGGA	2	8	35396	35403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019431	TCTA	2	8	35707	35714	25 %	50 %	0 %	25 %	414073290
128	NC_019431	TAAA	2	8	35997	36004	75 %	25 %	0 %	0 %	414073290
129	NC_019431	AAGT	2	8	37189	37196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019431	GCTT	2	8	37395	37402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019431	CTAT	2	8	38205	38212	25 %	50 %	0 %	25 %	414073291
132	NC_019431	TTAT	2	8	38289	38296	25 %	75 %	0 %	0 %	414073291
133	NC_019431	CAAA	2	8	38395	38402	75 %	0 %	0 %	25 %	414073291
134	NC_019431	TCAC	2	8	38493	38500	25 %	25 %	0 %	50 %	414073291
135	NC_019431	ATAA	2	8	38674	38681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019431	TAAA	2	8	38985	38992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019431	TAAA	2	8	39090	39097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019431	GTAA	2	8	39229	39236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019431	CTTT	2	8	39636	39643	0 %	75 %	0 %	25 %	414073292
140	NC_019431	ATTT	2	8	39813	39820	25 %	75 %	0 %	0 %	414073292
141	NC_019431	CAAA	2	8	39894	39901	75 %	0 %	0 %	25 %	414073292
142	NC_019431	TAAA	2	8	39966	39973	75 %	25 %	0 %	0 %	414073292
143	NC_019431	TATT	2	8	40065	40072	25 %	75 %	0 %	0 %	414073292
144	NC_019431	CTTT	2	8	40105	40112	0 %	75 %	0 %	25 %	414073293
145	NC_019431	TTTC	2	8	40744	40751	0 %	75 %	0 %	25 %	414073295
146	NC_019431	CTAT	2	8	40871	40878	25 %	50 %	0 %	25 %	414073295
147	NC_019431	GCTT	2	8	41393	41400	0 %	50 %	25 %	25 %	414073295
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.