MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019431	ACT	2	6	42423	42428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019431	TCT	2	6	42517	42522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_019431	GTT	2	6	42587	42592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019431	AAG	2	6	42685	42690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019431	AAT	2	6	42697	42702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019431	AG	3	6	42768	42773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019431	TTTTC	2	10	42863	42872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_019431	TTTG	2	8	42940	42947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019431	T	6	6	43025	43030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019431	ATGA	2	8	43032	43039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019431	AAAACA	2	12	43060	43071	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1012	NC_019431	GTT	2	6	43090	43095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019431	ATT	2	6	43121	43126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019431	T	6	6	43172	43177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019431	AAT	2	6	43236	43241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019431	GAA	2	6	43352	43357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019431	TTC	2	6	43496	43501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_019431	AAAG	2	8	43509	43516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019431	AAGA	2	8	43547	43554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019431	ATA	2	6	43627	43632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019431	AAT	2	6	43639	43644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019431	GTA	2	6	43716	43721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019431	AATG	2	8	43749	43756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019431	CTTT	2	8	43781	43788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_019431	GAA	2	6	43822	43827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019431	GAAA	2	8	43864	43871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019431	A	7	7	43897	43903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019431	CTT	2	6	43904	43909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_019431	TAG	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019431	TAA	2	6	44012	44017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019431	CTTC	2	8	44042	44049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_019431	GCT	2	6	44107	44112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_019431	T	7	7	44112	44118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019431	TTG	2	6	44144	44149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019431	GA	3	6	44175	44180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019431	ATC	2	6	44206	44211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019431	AGC	2	6	44217	44222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_019431	TCTT	2	8	44279	44286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_019431	AAT	2	6	44323	44328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019431	ATT	2	6	44329	44334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019431	TAA	2	6	44358	44363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019431	GAA	2	6	44384	44389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019431	ATA	2	6	44403	44408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019431	TAG	2	6	44415	44420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019431	A	6	6	44439	44444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019431	TTA	2	6	44464	44469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019431	AGT	2	6	44476	44481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019431	A	7	7	44493	44499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019431	TA	3	6	44513	44518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019431	TGAC	2	8	44590	44597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_019431	T	7	7	44608	44614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019431	ATTT	2	8	44811	44818	25 %	75 %	0 %	0 %	414073296
1053	NC_019431	ATA	2	6	44842	44847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073296
1054	NC_019431	AT	3	6	44871	44876	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
1055	NC_019431	CTCCTT	2	12	44973	44984	0 %	50 %	0 %	50 %	414073296
1056	NC_019431	TCA	2	6	45025	45030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073296
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1059	NC_019431	TTA	2	6	45136	45141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073296
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1061	NC_019431	T	6	6	45160	45165	0 %	100 %	0 %	0 %	414073296
1062	NC_019431	AT	3	6	45167	45172	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
1063	NC_019431	T	8	8	45214	45221	0 %	100 %	0 %	0 %	414073296
1064	NC_019431	ATT	2	6	45222	45227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073296
1065	NC_019431	ATTAA	2	10	45271	45280	60 %	40 %	0 %	0 %	414073296
1066	NC_019431	TA	3	6	45374	45379	50 %	50 %	0 %	0 %	414073296
1067	NC_019431	CTTT	2	8	45421	45428	0 %	75 %	0 %	25 %	414073296
1068	NC_019431	ATA	3	9	45463	45471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073296
1069	NC_019431	CAT	2	6	45497	45502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073296
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1073	NC_019431	T	7	7	45730	45736	0 %	100 %	0 %	0 %	414073296
1074	NC_019431	GCAAA	2	10	45745	45754	60 %	0 %	20 %	20 %	414073296
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1079	NC_019431	A	6	6	45859	45864	100 %	0 %	0 %	0 %	414073296
1080	NC_019431	T	6	6	45875	45880	0 %	100 %	0 %	0 %	414073296
1081	NC_019431	CT	3	6	45922	45927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1093	NC_019431	CTT	2	6	46451	46456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073297
1094	NC_019431	CAGAA	2	10	46458	46467	60 %	0 %	20 %	20 %	414073297
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1101	NC_019431	ATC	2	6	46821	46826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1103	NC_019431	GAT	2	6	46930	46935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_019431	AGC	2	6	46977	46982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_019431	TAAA	2	8	47003	47010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019431	TA	3	6	47093	47098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019431	AT	3	6	47237	47242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019431	GAA	2	6	47253	47258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019431	AG	3	6	47338	47343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019431	AATT	2	8	47461	47468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019431	A	6	6	47473	47478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019431	TAAT	2	8	47491	47498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019431	T	7	7	47498	47504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019431	ACC	2	6	47526	47531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_019431	AAAAAT	2	12	47532	47543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019431	AAAAT	2	10	47562	47571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_019431	A	7	7	47794	47800	100 %	0 %	0 %	0 %	414073298
1123	NC_019431	T	6	6	47855	47860	0 %	100 %	0 %	0 %	414073298
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1132	NC_019431	GAACG	2	10	48110	48119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_019431	AAC	2	6	48142	48147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_019431	TGA	2	6	48160	48165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019431	A	6	6	48172	48177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_019431	ATTC	2	8	48219	48226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1138	NC_019431	A	6	6	48272	48277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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