MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 1792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019430	ATG	2	6	68469	68474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019430	T	7	7	68476	68482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_019430	TA	3	6	68487	68492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_019430	T	7	7	68498	68504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019430	TA	3	6	68509	68514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019430	T	7	7	68520	68526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019430	TA	3	6	68531	68536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019430	T	7	7	68542	68548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019430	TAT	2	6	68555	68560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_019430	T	8	8	68586	68593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019430	AGA	2	6	68602	68607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019430	AT	4	8	68618	68625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019430	T	7	7	68649	68655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_019430	T	7	7	68657	68663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_019430	ATC	2	6	68689	68694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_019430	TTAT	2	8	68748	68755	25 %	75 %	0 %	0 %	414073249
1517	NC_019430	TCT	2	6	68759	68764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073249
1518	NC_019430	ATA	2	6	68776	68781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1519	NC_019430	TAA	3	9	68789	68797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1520	NC_019430	ATC	2	6	68836	68841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1521	NC_019430	TAC	2	6	68889	68894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1522	NC_019430	CGA	2	6	68940	68945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073249
1523	NC_019430	AAT	2	6	69049	69054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1524	NC_019430	TCA	2	6	69056	69061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1525	NC_019430	AT	3	6	69086	69091	50 %	50 %	0 %	0 %	414073249
1526	NC_019430	A	7	7	69107	69113	100 %	0 %	0 %	0 %	414073249
1527	NC_019430	TGA	2	6	69200	69205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073249
1528	NC_019430	T	7	7	69279	69285	0 %	100 %	0 %	0 %	414073249
1529	NC_019430	TCT	2	6	69296	69301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073249
1530	NC_019430	CTG	2	6	69315	69320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073249
1531	NC_019430	CT	3	6	69367	69372	0 %	50 %	0 %	50 %	414073250
1532	NC_019430	T	7	7	69374	69380	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1533	NC_019430	AAACCA	2	12	69474	69485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073250
1534	NC_019430	AACAG	2	10	69622	69631	60 %	0 %	20 %	20 %	414073250
1535	NC_019430	T	6	6	69722	69727	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1536	NC_019430	TTTC	2	8	69760	69767	0 %	75 %	0 %	25 %	414073250
1537	NC_019430	GTT	2	6	69808	69813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073250
1538	NC_019430	T	6	6	69832	69837	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1539	NC_019430	T	6	6	69856	69861	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1540	NC_019430	TTA	2	6	69882	69887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073250
1541	NC_019430	AAC	2	6	69968	69973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073250
1542	NC_019430	GTT	2	6	69976	69981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073250
1543	NC_019430	TTG	2	6	70020	70025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1544	NC_019430	TGT	2	6	70076	70081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1545	NC_019430	ATC	2	6	70126	70131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073251
1546	NC_019430	TTTG	2	8	70145	70152	0 %	75 %	25 %	0 %	414073251
1547	NC_019430	TTG	2	6	70309	70314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1548	NC_019430	GTT	2	6	70350	70355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1549	NC_019430	GTTTT	2	10	70372	70381	0 %	80 %	20 %	0 %	414073251
1550	NC_019430	TC	3	6	70440	70445	0 %	50 %	0 %	50 %	414073251
1551	NC_019430	TTA	2	6	70460	70465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073251
1552	NC_019430	TTCT	2	8	70590	70597	0 %	75 %	0 %	25 %	414073251
1553	NC_019430	ATC	2	6	70603	70608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073251
1554	NC_019430	TGG	2	6	70669	70674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073251
1555	NC_019430	TCAT	2	8	70712	70719	25 %	50 %	0 %	25 %	414073251
1556	NC_019430	TTTC	2	8	70762	70769	0 %	75 %	0 %	25 %	414073251
1557	NC_019430	ATG	2	6	70796	70801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073251
1558	NC_019430	T	6	6	70820	70825	0 %	100 %	0 %	0 %	414073251
1559	NC_019430	TTTGG	2	10	70984	70993	0 %	60 %	40 %	0 %	414073251
1560	NC_019430	CCAC	2	8	71057	71064	25 %	0 %	0 %	75 %	414073251
1561	NC_019430	T	6	6	71133	71138	0 %	100 %	0 %	0 %	414073251
1562	NC_019430	CATG	2	8	71139	71146	25 %	25 %	25 %	25 %	414073251
1563	NC_019430	GTCT	2	8	71148	71155	0 %	50 %	25 %	25 %	414073251
1564	NC_019430	TTG	2	6	71214	71219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1565	NC_019430	GTAT	2	8	71262	71269	25 %	50 %	25 %	0 %	414073252
1566	NC_019430	ATTG	2	8	71318	71325	25 %	50 %	25 %	0 %	414073252
1567	NC_019430	GATTT	2	10	71337	71346	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
1568	NC_019430	TAA	3	9	71373	71381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073252
1569	NC_019430	T	7	7	71412	71418	0 %	100 %	0 %	0 %	414073252
1570	NC_019430	T	6	6	71439	71444	0 %	100 %	0 %	0 %	414073252
1571	NC_019430	GA	3	6	71459	71464	50 %	0 %	50 %	0 %	414073252
1572	NC_019430	TATTG	2	10	71495	71504	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
1573	NC_019430	TTC	2	6	71505	71510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073252
1574	NC_019430	TTTG	2	8	71533	71540	0 %	75 %	25 %	0 %	414073252
1575	NC_019430	CCT	2	6	71574	71579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_019430	TAA	2	6	71635	71640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_019430	AAAAT	2	10	71845	71854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019430	TCTT	2	8	71865	71872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1579	NC_019430	AGA	2	6	71887	71892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_019430	A	8	8	71892	71899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_019430	TCT	2	6	71910	71915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_019430	T	6	6	71932	71937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_019430	GAAC	2	8	71952	71959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_019430	A	6	6	71960	71965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019430	TC	3	6	71966	71971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_019430	TGTT	2	8	71978	71985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_019430	TTCA	2	8	72016	72023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_019430	TGT	2	6	72028	72033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_019430	CAA	2	6	72070	72075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_019430	A	7	7	72074	72080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019430	GAC	2	6	72094	72099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_019430	CATT	2	8	72114	72121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_019430	TAA	2	6	72210	72215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019430	AAT	2	6	72231	72236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_019430	TTG	2	6	72409	72414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019430	TTG	2	6	72445	72450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_019430	T	7	7	72486	72492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_019430	T	7	7	72547	72553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019430	CTA	2	6	72584	72589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_019430	AAT	2	6	72603	72608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_019430	AGG	2	6	72622	72627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_019430	CAG	2	6	72662	72667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073253
1603	NC_019430	ATT	2	6	72674	72679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073253
1604	NC_019430	CTA	2	6	72691	72696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073253
1605	NC_019430	ACG	2	6	72767	72772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073253
1606	NC_019430	ACT	2	6	72802	72807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073253
1607	NC_019430	GAAAAA	2	12	72820	72831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414073253
1608	NC_019430	A	6	6	72833	72838	100 %	0 %	0 %	0 %	414073253
1609	NC_019430	ATT	2	6	72894	72899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073253
1610	NC_019430	A	6	6	72950	72955	100 %	0 %	0 %	0 %	414073253
1611	NC_019430	AC	3	6	72960	72965	50 %	0 %	0 %	50 %	414073253
1612	NC_019430	AGC	2	6	72967	72972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073253
1613	NC_019430	TGA	2	6	73006	73011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073253
1614	NC_019430	AAT	2	6	73121	73126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073253
1615	NC_019430	TTGA	2	8	73127	73134	25 %	50 %	25 %	0 %	414073253
1616	NC_019430	TA	3	6	73230	73235	50 %	50 %	0 %	0 %	414073253
1617	NC_019430	AAG	2	6	73248	73253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073253
1618	NC_019430	CT	3	6	73257	73262	0 %	50 %	0 %	50 %	414073253
1619	NC_019430	TAT	2	6	73293	73298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073253
1620	NC_019430	TTTA	2	8	73344	73351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_019430	TCAC	2	8	73383	73390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_019430	AGT	2	6	73395	73400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019430	ACG	2	6	73433	73438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_019430	GAA	2	6	73504	73509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_019430	ACC	2	6	73533	73538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_019430	T	7	7	73552	73558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019430	CAGT	2	8	73560	73567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_019430	T	6	6	73576	73581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019430	ACAT	2	8	73616	73623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_019430	TAGT	2	8	73632	73639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019430	AT	3	6	73674	73679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019430	ATA	2	6	73758	73763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_019430	TA	3	6	73812	73817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_019430	TGAT	2	8	73833	73840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_019430	AGTTG	2	10	73855	73864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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