MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 1792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019430	A	7	7	46058	46064	100 %	0 %	0 %	0 %	414073229
1002	NC_019430	CTT	2	6	46092	46097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073229
1003	NC_019430	A	6	6	46181	46186	100 %	0 %	0 %	0 %	414073229
1004	NC_019430	TGCT	2	8	46220	46227	0 %	50 %	25 %	25 %	414073229
1005	NC_019430	AGC	2	6	46326	46331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073229
1006	NC_019430	GCT	2	6	46342	46347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073229
1007	NC_019430	TAA	2	6	46374	46379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073229
1008	NC_019430	AAG	2	6	46422	46427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_019430	TA	4	8	46460	46467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019430	TTAAG	2	10	46508	46517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019430	AGGA	2	8	46532	46539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_019430	CCT	2	6	46548	46553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_019430	TTTTA	2	10	46555	46564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019430	AAG	2	6	46573	46578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019430	ATT	2	6	46596	46601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019430	AAT	2	6	46607	46612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019430	TAC	2	6	46660	46665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073230
1018	NC_019430	TCA	2	6	46693	46698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073230
1019	NC_019430	AGA	2	6	46714	46719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073230
1020	NC_019430	ATC	2	6	46740	46745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073230
1021	NC_019430	TAGAAA	2	12	46780	46791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073230
1022	NC_019430	ATC	2	6	46817	46822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073230
1023	NC_019430	CT	3	6	46823	46828	0 %	50 %	0 %	50 %	414073230
1024	NC_019430	TCTA	2	8	46843	46850	25 %	50 %	0 %	25 %	414073230
1025	NC_019430	GTA	2	6	46917	46922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073230
1026	NC_019430	ATG	2	6	47016	47021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073230
1027	NC_019430	TAAA	2	8	47133	47140	75 %	25 %	0 %	0 %	414073230
1028	NC_019430	A	6	6	47163	47168	100 %	0 %	0 %	0 %	414073230
1029	NC_019430	TGA	2	6	47209	47214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073230
1030	NC_019430	CAA	2	6	47232	47237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073230
1031	NC_019430	TTA	2	6	47238	47243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073230
1032	NC_019430	A	7	7	47288	47294	100 %	0 %	0 %	0 %	414073230
1033	NC_019430	A	7	7	47384	47390	100 %	0 %	0 %	0 %	414073230
1034	NC_019430	AAG	2	6	47407	47412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073230
1035	NC_019430	A	7	7	47428	47434	100 %	0 %	0 %	0 %	414073230
1036	NC_019430	TAT	2	6	47704	47709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073230
1037	NC_019430	TCT	2	6	47887	47892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073230
1038	NC_019430	AGA	2	6	47921	47926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073230
1039	NC_019430	TAA	2	6	47928	47933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073230
1040	NC_019430	A	6	6	47932	47937	100 %	0 %	0 %	0 %	414073230
1041	NC_019430	T	6	6	47950	47955	0 %	100 %	0 %	0 %	414073230
1042	NC_019430	T	7	7	48002	48008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019430	CTTAA	2	10	48086	48095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_019430	T	7	7	48264	48270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019430	CCT	2	6	48417	48422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_019430	GA	3	6	48438	48443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019430	TAG	2	6	48486	48491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019430	T	8	8	48557	48564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019430	ATA	2	6	48573	48578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019430	A	7	7	48597	48603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_019430	A	7	7	48607	48613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019430	TTA	2	6	48641	48646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019430	TAATT	2	10	48678	48687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019430	TCAT	2	8	48809	48816	25 %	50 %	0 %	25 %	414073231
1055	NC_019430	CAT	2	6	48819	48824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073231
1056	NC_019430	T	6	6	48944	48949	0 %	100 %	0 %	0 %	414073231
1057	NC_019430	GAA	2	6	48966	48971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073231
1058	NC_019430	AT	4	8	49012	49019	50 %	50 %	0 %	0 %	414073231
1059	NC_019430	TTA	2	6	49079	49084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073231
1060	NC_019430	AGA	2	6	49207	49212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073231
1061	NC_019430	TC	3	6	49259	49264	0 %	50 %	0 %	50 %	414073231
1062	NC_019430	ATTA	2	8	49267	49274	50 %	50 %	0 %	0 %	414073231
1063	NC_019430	TCT	2	6	49311	49316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073231
1064	NC_019430	TTG	2	6	49321	49326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073231
1065	NC_019430	CTAT	2	8	49373	49380	25 %	50 %	0 %	25 %	414073231
1066	NC_019430	T	7	7	49380	49386	0 %	100 %	0 %	0 %	414073231
1067	NC_019430	TGT	2	6	49388	49393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073231
1068	NC_019430	TATT	2	8	49527	49534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019430	CTT	2	6	49642	49647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_019430	CT	3	6	49679	49684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_019430	GATG	2	8	49755	49762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019430	ATA	2	6	49778	49783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019430	GCA	2	6	49863	49868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019430	CTT	2	6	49873	49878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_019430	T	7	7	49903	49909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019430	TTC	2	6	49921	49926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019430	TAGAG	2	10	49995	50004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019430	TTG	2	6	50022	50027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019430	CGT	2	6	50037	50042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_019430	ATAA	2	8	50190	50197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019430	AAT	2	6	50198	50203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019430	AATTA	2	10	50225	50234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019430	AAT	2	6	50237	50242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019430	TAGT	2	8	50278	50285	25 %	50 %	25 %	0 %	414073232
1085	NC_019430	A	6	6	50304	50309	100 %	0 %	0 %	0 %	414073232
1086	NC_019430	ACA	2	6	50345	50350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073232
1087	NC_019430	ATT	2	6	50357	50362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073232
1088	NC_019430	TG	3	6	50371	50376	0 %	50 %	50 %	0 %	414073232
1089	NC_019430	TTTA	2	8	50404	50411	25 %	75 %	0 %	0 %	414073232
1090	NC_019430	ATTA	2	8	50444	50451	50 %	50 %	0 %	0 %	414073232
1091	NC_019430	ATTT	2	8	50467	50474	25 %	75 %	0 %	0 %	414073232
1092	NC_019430	TAAA	2	8	50485	50492	75 %	25 %	0 %	0 %	414073232
1093	NC_019430	AAT	2	6	50565	50570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073232
1094	NC_019430	A	9	9	50597	50605	100 %	0 %	0 %	0 %	414073232
1095	NC_019430	GAATG	2	10	50652	50661	40 %	20 %	40 %	0 %	414073232
1096	NC_019430	TAA	2	6	50699	50704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073232
1097	NC_019430	AGA	2	6	50744	50749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073232
1098	NC_019430	TAAA	2	8	50773	50780	75 %	25 %	0 %	0 %	414073232
1099	NC_019430	TAA	2	6	50816	50821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073232
1100	NC_019430	ATA	2	6	50824	50829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073232
1101	NC_019430	AT	3	6	50836	50841	50 %	50 %	0 %	0 %	414073232
1102	NC_019430	ATA	2	6	50851	50856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073232
1103	NC_019430	TTAT	2	8	50891	50898	25 %	75 %	0 %	0 %	414073232
1104	NC_019430	CTTT	2	8	51070	51077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_019430	ATC	2	6	51086	51091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073233
1106	NC_019430	CCA	2	6	51109	51114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073233
1107	NC_019430	TTC	2	6	51133	51138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073233
1108	NC_019430	T	6	6	51144	51149	0 %	100 %	0 %	0 %	414073233
1109	NC_019430	ATTG	2	8	51213	51220	25 %	50 %	25 %	0 %	414073233
1110	NC_019430	GTTT	2	8	51353	51360	0 %	75 %	25 %	0 %	414073233
1111	NC_019430	TTTA	2	8	51394	51401	25 %	75 %	0 %	0 %	414073233
1112	NC_019430	TAG	2	6	51607	51612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073233
1113	NC_019430	TA	3	6	51634	51639	50 %	50 %	0 %	0 %	414073233
1114	NC_019430	TTAA	2	8	51796	51803	50 %	50 %	0 %	0 %	414073234
1115	NC_019430	AAT	2	6	51810	51815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073234
1116	NC_019430	AG	3	6	51857	51862	50 %	0 %	50 %	0 %	414073234
1117	NC_019430	A	6	6	51930	51935	100 %	0 %	0 %	0 %	414073234
1118	NC_019430	A	6	6	51954	51959	100 %	0 %	0 %	0 %	414073234
1119	NC_019430	AATATC	2	12	51961	51972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	414073234
1120	NC_019430	TTA	2	6	52031	52036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073234
1121	NC_019430	AAAT	2	8	52043	52050	75 %	25 %	0 %	0 %	414073234
1122	NC_019430	T	7	7	52100	52106	0 %	100 %	0 %	0 %	414073234
1123	NC_019430	A	7	7	52111	52117	100 %	0 %	0 %	0 %	414073234
1124	NC_019430	AAT	3	9	52122	52130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073234
1125	NC_019430	AT	4	8	52138	52145	50 %	50 %	0 %	0 %	414073234
1126	NC_019430	CCT	2	6	52177	52182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073234
1127	NC_019430	TCC	2	6	52221	52226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073234
1128	NC_019430	TTTCA	2	10	52254	52263	20 %	60 %	0 %	20 %	414073234
1129	NC_019430	T	6	6	52318	52323	0 %	100 %	0 %	0 %	414073235
1130	NC_019430	AGT	2	6	52350	52355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073235
1131	NC_019430	AG	3	6	52378	52383	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
1132	NC_019430	AG	3	6	52431	52436	50 %	0 %	50 %	0 %	414073235
1133	NC_019430	TCT	2	6	52586	52591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073235
1134	NC_019430	TCT	2	6	52641	52646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073235
1135	NC_019430	CTTT	2	8	52683	52690	0 %	75 %	0 %	25 %	414073235
1136	NC_019430	TCT	2	6	52730	52735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073235
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1143	NC_019430	T	6	6	53218	53223	0 %	100 %	0 %	0 %	414073235
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1152	NC_019430	TA	3	6	53589	53594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1168	NC_019430	T	7	7	54307	54313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_019430	TTA	2	6	58866	58871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_019430	CTT	2	6	58999	59004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_019430	A	7	7	59008	59014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_019430	TAT	2	6	59108	59113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073239
1259	NC_019430	CATTC	2	10	59144	59153	20 %	40 %	0 %	40 %	414073239
1260	NC_019430	TAT	2	6	59165	59170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073239
1261	NC_019430	AAAT	2	8	59211	59218	75 %	25 %	0 %	0 %	414073239
1262	NC_019430	CTT	2	6	59232	59237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073239
1263	NC_019430	TTTG	2	8	59238	59245	0 %	75 %	25 %	0 %	414073239
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