MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	AG	3	6	214	219	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
2	NC_018889	GA	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
3	NC_018889	GT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	50 %	0 %	410679641
4	NC_018889	AG	3	6	1744	1749	50 %	0 %	50 %	0 %	410679641
5	NC_018889	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	410679644
6	NC_018889	AT	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	410679646
7	NC_018889	AT	3	6	4802	4807	50 %	50 %	0 %	0 %	410679646
8	NC_018889	TG	3	6	4983	4988	0 %	50 %	50 %	0 %	410679646
9	NC_018889	TC	4	8	5444	5451	0 %	50 %	0 %	50 %	410679646
10	NC_018889	AG	4	8	6055	6062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018889	GA	3	6	6721	6726	50 %	0 %	50 %	0 %	410679649
12	NC_018889	CG	3	6	7931	7936	0 %	0 %	50 %	50 %	410679650
13	NC_018889	AC	3	6	8292	8297	50 %	0 %	0 %	50 %	410679651
14	NC_018889	CA	3	6	8426	8431	50 %	0 %	0 %	50 %	410679651
15	NC_018889	AT	3	6	8634	8639	50 %	50 %	0 %	0 %	410679652
16	NC_018889	GA	3	6	9527	9532	50 %	0 %	50 %	0 %	410679652
17	NC_018889	AC	3	6	9549	9554	50 %	0 %	0 %	50 %	410679652
18	NC_018889	AG	3	6	9561	9566	50 %	0 %	50 %	0 %	410679652
19	NC_018889	TA	3	6	9581	9586	50 %	50 %	0 %	0 %	410679652
20	NC_018889	GA	3	6	9724	9729	50 %	0 %	50 %	0 %	410679652
21	NC_018889	TG	3	6	11497	11502	0 %	50 %	50 %	0 %	410679655
22	NC_018889	AT	3	6	12257	12262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018889	AT	3	6	12926	12931	50 %	50 %	0 %	0 %	410679658
24	NC_018889	AT	3	6	13970	13975	50 %	50 %	0 %	0 %	410679658
25	NC_018889	AG	4	8	14371	14378	50 %	0 %	50 %	0 %	410679659
26	NC_018889	AG	3	6	14755	14760	50 %	0 %	50 %	0 %	410679660
27	NC_018889	TA	3	6	14782	14787	50 %	50 %	0 %	0 %	410679660
28	NC_018889	AT	3	6	15076	15081	50 %	50 %	0 %	0 %	410679660
29	NC_018889	CT	3	6	15820	15825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018889	AG	3	6	15998	16003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018889	TA	3	6	16275	16280	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
32	NC_018889	AT	3	6	16429	16434	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
33	NC_018889	AT	3	6	16448	16453	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
34	NC_018889	AC	3	6	16549	16554	50 %	0 %	0 %	50 %	410679662
35	NC_018889	AT	3	6	16598	16603	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
36	NC_018889	TA	3	6	16641	16646	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
37	NC_018889	AT	4	8	17556	17563	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
38	NC_018889	TC	3	6	17993	17998	0 %	50 %	0 %	50 %	410679662
39	NC_018889	TA	3	6	18027	18032	50 %	50 %	0 %	0 %	410679662
40	NC_018889	AT	3	6	18538	18543	50 %	50 %	0 %	0 %	410679663
41	NC_018889	AT	3	6	18592	18597	50 %	50 %	0 %	0 %	410679663
42	NC_018889	AT	3	6	18740	18745	50 %	50 %	0 %	0 %	410679663
43	NC_018889	AT	3	6	20261	20266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018889	TA	3	6	20327	20332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018889	CA	3	6	20850	20855	50 %	0 %	0 %	50 %	410679665
46	NC_018889	TA	4	8	23104	23111	50 %	50 %	0 %	0 %	410679666
47	NC_018889	AT	3	6	23375	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	410679666
48	NC_018889	TC	3	6	24449	24454	0 %	50 %	0 %	50 %	410679667
49	NC_018889	CT	3	6	25934	25939	0 %	50 %	0 %	50 %	410679667
50	NC_018889	TA	3	6	25998	26003	50 %	50 %	0 %	0 %	410679667
51	NC_018889	GT	3	6	26238	26243	0 %	50 %	50 %	0 %	410679667
52	NC_018889	GT	3	6	26304	26309	0 %	50 %	50 %	0 %	410679667
53	NC_018889	TC	3	6	28182	28187	0 %	50 %	0 %	50 %	410679670
54	NC_018889	GT	3	6	28945	28950	0 %	50 %	50 %	0 %	410679670
55	NC_018889	GA	3	6	29153	29158	50 %	0 %	50 %	0 %	410679670
56	NC_018889	TC	3	6	30138	30143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018889	TA	3	6	30743	30748	50 %	50 %	0 %	0 %	410679671
58	NC_018889	TA	3	6	30754	30759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018889	AT	3	6	31121	31126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018889	TA	3	6	31736	31741	50 %	50 %	0 %	0 %	410679674
61	NC_018889	GC	3	6	31929	31934	0 %	0 %	50 %	50 %	410679674
62	NC_018889	TG	3	6	32688	32693	0 %	50 %	50 %	0 %	410679676
63	NC_018889	AG	4	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	410679676
64	NC_018889	GA	3	6	33519	33524	50 %	0 %	50 %	0 %	410679677
65	NC_018889	AT	3	6	33526	33531	50 %	50 %	0 %	0 %	410679677
66	NC_018889	TA	3	6	33874	33879	50 %	50 %	0 %	0 %	410679678
67	NC_018889	GA	3	6	34772	34777	50 %	0 %	50 %	0 %	410679680
68	NC_018889	GA	3	6	35506	35511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018889	CT	3	6	36692	36697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018889	AT	4	8	37049	37056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018889	TA	4	8	37060	37067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018889	TA	3	6	37133	37138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018889	TA	3	6	38000	38005	50 %	50 %	0 %	0 %	410679684
74	NC_018889	GC	3	6	38086	38091	0 %	0 %	50 %	50 %	410679684
75	NC_018889	AT	3	6	38273	38278	50 %	50 %	0 %	0 %	410679684
76	NC_018889	AG	3	6	38654	38659	50 %	0 %	50 %	0 %	410679684
77	NC_018889	AT	3	6	39683	39688	50 %	50 %	0 %	0 %	410679685
78	NC_018889	GC	3	6	41190	41195	0 %	0 %	50 %	50 %	410679687
79	NC_018889	AT	3	6	42738	42743	50 %	50 %	0 %	0 %	410679688
80	NC_018889	TA	3	6	43980	43985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018889	AG	3	6	44300	44305	50 %	0 %	50 %	0 %	410679689
82	NC_018889	TA	3	6	44458	44463	50 %	50 %	0 %	0 %	410679689
83	NC_018889	AT	3	6	44479	44484	50 %	50 %	0 %	0 %	410679689
84	NC_018889	TA	3	6	44845	44850	50 %	50 %	0 %	0 %	410679689
85	NC_018889	AT	3	6	45272	45277	50 %	50 %	0 %	0 %	410679689
86	NC_018889	TA	3	6	45690	45695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018889	TA	3	6	45817	45822	50 %	50 %	0 %	0 %	410679690
88	NC_018889	TA	3	6	46039	46044	50 %	50 %	0 %	0 %	410679690
89	NC_018889	AG	3	6	46103	46108	50 %	0 %	50 %	0 %	410679690
90	NC_018889	AT	3	6	46462	46467	50 %	50 %	0 %	0 %	410679690
91	NC_018889	TA	3	6	46595	46600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018889	GA	3	6	46954	46959	50 %	0 %	50 %	0 %	410679691
93	NC_018889	AT	3	6	48880	48885	50 %	50 %	0 %	0 %	410679694
94	NC_018889	AG	3	6	49190	49195	50 %	0 %	50 %	0 %	410679694
95	NC_018889	TA	3	6	49571	49576	50 %	50 %	0 %	0 %	410679694
96	NC_018889	TC	3	6	49595	49600	0 %	50 %	0 %	50 %	410679694
97	NC_018889	AT	3	6	49611	49616	50 %	50 %	0 %	0 %	410679694
98	NC_018889	TA	3	6	49720	49725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018889	AT	3	6	49811	49816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018889	AT	3	6	49843	49848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018889	TA	4	8	49882	49889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018889	TA	3	6	49932	49937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.