MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2372 plasmid pLM1-2cUG1

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018889	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
2	NC_018889	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
3	NC_018889	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679641
4	NC_018889	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679641
5	NC_018889	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679641
6	NC_018889	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679641
7	NC_018889	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679641
8	NC_018889	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
9	NC_018889	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679641
10	NC_018889	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679641
11	NC_018889	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679641
12	NC_018889	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
13	NC_018889	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679641
14	NC_018889	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679641
15	NC_018889	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679641
16	NC_018889	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679641
17	NC_018889	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679641
18	NC_018889	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679642
19	NC_018889	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679642
20	NC_018889	ACC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018889	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679643
22	NC_018889	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
23	NC_018889	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679643
24	NC_018889	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
25	NC_018889	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679643
26	NC_018889	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679643
27	NC_018889	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679643
28	NC_018889	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679643
29	NC_018889	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679643
30	NC_018889	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679643
31	NC_018889	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
32	NC_018889	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
33	NC_018889	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
34	NC_018889	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679644
35	NC_018889	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
36	NC_018889	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679644
37	NC_018889	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679644
38	NC_018889	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
39	NC_018889	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
40	NC_018889	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679645
41	NC_018889	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679645
42	NC_018889	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679645
43	NC_018889	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679645
44	NC_018889	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679645
45	NC_018889	TCC	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018889	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679646
47	NC_018889	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
48	NC_018889	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
49	NC_018889	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
50	NC_018889	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679646
51	NC_018889	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679646
52	NC_018889	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679646
53	NC_018889	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
54	NC_018889	AAT	2	6	5399	5404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679646
55	NC_018889	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679646
56	NC_018889	AGG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679646
57	NC_018889	ATA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679646
58	NC_018889	GTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679646
59	NC_018889	GAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018889	TTA	2	6	5939	5944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018889	ACA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018889	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018889	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018889	TGA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679648
65	NC_018889	TTC	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679648
66	NC_018889	CAA	2	6	6514	6519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679648
67	NC_018889	GAA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
68	NC_018889	TTC	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679649
69	NC_018889	ATC	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679649
70	NC_018889	ATT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679649
71	NC_018889	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679649
72	NC_018889	GAT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679649
73	NC_018889	GTA	2	6	6942	6947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679649
74	NC_018889	GAT	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679649
75	NC_018889	GAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
76	NC_018889	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679649
77	NC_018889	AAC	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679649
78	NC_018889	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679649
79	NC_018889	ACA	2	6	7186	7191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679649
80	NC_018889	GAA	2	6	7196	7201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
81	NC_018889	GAA	2	6	7224	7229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
82	NC_018889	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679649
83	NC_018889	CAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679649
84	NC_018889	GAA	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
85	NC_018889	ATA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679649
86	NC_018889	AAG	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
87	NC_018889	GCT	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679649
88	NC_018889	GAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
89	NC_018889	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679649
90	NC_018889	ACC	2	6	7467	7472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018889	ACC	2	6	7501	7506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018889	ACC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018889	ACC	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018889	ATT	2	6	7720	7725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018889	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018889	ATT	2	6	7847	7852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679650
97	NC_018889	TGC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679650
98	NC_018889	GGA	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410679650
99	NC_018889	ATC	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679650
100	NC_018889	AAG	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679650
101	NC_018889	ATC	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679650
102	NC_018889	ATT	2	6	8067	8072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679650
103	NC_018889	TAT	2	6	8204	8209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679651
104	NC_018889	AAC	2	6	8227	8232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679651
105	NC_018889	GAA	2	6	8271	8276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679651
106	NC_018889	TCA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679651
107	NC_018889	AGA	3	9	8438	8446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679651
108	NC_018889	ACG	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679651
109	NC_018889	AAG	2	6	8485	8490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679651
110	NC_018889	CAG	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
111	NC_018889	TGA	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679652
112	NC_018889	GAA	3	9	8698	8706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
113	NC_018889	AGA	3	9	8712	8720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
114	NC_018889	CAG	2	6	8807	8812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
115	NC_018889	ATA	3	9	8855	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679652
116	NC_018889	CAA	2	6	8962	8967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679652
117	NC_018889	AGA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
118	NC_018889	AGC	2	6	9033	9038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
119	NC_018889	CAA	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679652
120	NC_018889	GTG	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679652
121	NC_018889	TGA	2	6	9255	9260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679652
122	NC_018889	CTT	2	6	9277	9282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679652
123	NC_018889	AAG	2	6	9302	9307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
124	NC_018889	AGA	2	6	9318	9323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
125	NC_018889	GGT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679652
126	NC_018889	ATT	2	6	9440	9445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679652
127	NC_018889	GCA	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
128	NC_018889	AGA	2	6	9462	9467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
129	NC_018889	GCA	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
130	NC_018889	TTC	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679652
131	NC_018889	ATT	2	6	9662	9667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679652
132	NC_018889	CAG	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679652
133	NC_018889	GAA	2	6	9807	9812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679652
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381	NC_018889	CCT	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
382	NC_018889	TCA	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_018889	TCT	2	6	36124	36129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679682

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