MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	TGGC	2	8	148	155	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018698	CAAG	2	8	423	430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018698	TTGA	2	8	441	448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018698	CAAA	2	8	513	520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018698	TATT	2	8	647	654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018698	TTGT	2	8	761	768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018698	CAAA	2	8	991	998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018698	ATGT	2	8	1003	1010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018698	ATTT	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	407719129
10	NC_018698	AAAG	2	8	1749	1756	75 %	0 %	25 %	0 %	407719129
11	NC_018698	TAAA	2	8	1897	1904	75 %	25 %	0 %	0 %	407719129
12	NC_018698	TCAA	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	407719130
13	NC_018698	AAAT	2	8	2987	2994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018698	ATAG	2	8	3100	3107	50 %	25 %	25 %	0 %	407719131
15	NC_018698	TAAA	3	12	3256	3267	75 %	25 %	0 %	0 %	407719131
16	NC_018698	CTGG	2	8	3803	3810	0 %	25 %	50 %	25 %	407719132
17	NC_018698	GTAT	2	8	3856	3863	25 %	50 %	25 %	0 %	407719132
18	NC_018698	ACGC	2	8	4050	4057	25 %	0 %	25 %	50 %	407719132
19	NC_018698	GTTT	2	8	4541	4548	0 %	75 %	25 %	0 %	407719133
20	NC_018698	TGCC	2	8	5263	5270	0 %	25 %	25 %	50 %	407719134
21	NC_018698	AGAA	2	8	5443	5450	75 %	0 %	25 %	0 %	407719134
22	NC_018698	CAAA	2	8	5596	5603	75 %	0 %	0 %	25 %	407719134
23	NC_018698	CTCA	2	8	6450	6457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018698	ATTT	2	8	6631	6638	25 %	75 %	0 %	0 %	407719135
25	NC_018698	ATAA	2	8	6697	6704	75 %	25 %	0 %	0 %	407719135
26	NC_018698	CAAA	2	8	7542	7549	75 %	0 %	0 %	25 %	407719135
27	NC_018698	GATT	2	8	7715	7722	25 %	50 %	25 %	0 %	407719135
28	NC_018698	TGTA	2	8	8281	8288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018698	AATA	2	8	8368	8375	75 %	25 %	0 %	0 %	407719136
30	NC_018698	TAAT	2	8	8759	8766	50 %	50 %	0 %	0 %	407719137
31	NC_018698	CAAA	2	8	9328	9335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018698	TAAA	2	8	9652	9659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018698	CTTG	2	8	10052	10059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018698	TAAA	2	8	10060	10067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018698	ATTA	2	8	10778	10785	50 %	50 %	0 %	0 %	407719139
36	NC_018698	GTCA	2	8	11154	11161	25 %	25 %	25 %	25 %	407719140
37	NC_018698	TTCA	2	8	11972	11979	25 %	50 %	0 %	25 %	407719142
38	NC_018698	TTGG	2	8	12044	12051	0 %	50 %	50 %	0 %	407719142
39	NC_018698	TTTA	2	8	12281	12288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018698	GATT	2	8	12352	12359	25 %	50 %	25 %	0 %	407719143
41	NC_018698	CGTC	2	8	13596	13603	0 %	25 %	25 %	50 %	407719145
42	NC_018698	AATT	2	8	14099	14106	50 %	50 %	0 %	0 %	407719146
43	NC_018698	AATT	2	8	14363	14370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018698	CACT	2	8	14428	14435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018698	CGAT	2	8	14594	14601	25 %	25 %	25 %	25 %	407719147
46	NC_018698	CGAA	2	8	15186	15193	50 %	0 %	25 %	25 %	407719148
47	NC_018698	GGCT	2	8	15874	15881	0 %	25 %	50 %	25 %	407719149
48	NC_018698	CGTG	2	8	15977	15984	0 %	25 %	50 %	25 %	407719149
49	NC_018698	ACCA	2	8	16007	16014	50 %	0 %	0 %	50 %	407719149
50	NC_018698	AGTC	2	8	16040	16047	25 %	25 %	25 %	25 %	407719149
51	NC_018698	TCAT	2	8	16330	16337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018698	GTGA	2	8	16527	16534	25 %	25 %	50 %	0 %	407719150
53	NC_018698	CTTA	2	8	16917	16924	25 %	50 %	0 %	25 %	407719150
54	NC_018698	CAAG	2	8	16938	16945	50 %	0 %	25 %	25 %	407719150
55	NC_018698	GTTT	2	8	17207	17214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018698	AATG	2	8	18042	18049	50 %	25 %	25 %	0 %	407719152
57	NC_018698	TGAT	2	8	18081	18088	25 %	50 %	25 %	0 %	407719152
58	NC_018698	ATTT	2	8	18277	18284	25 %	75 %	0 %	0 %	407719152
59	NC_018698	CCAG	2	8	18536	18543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018698	ATTG	2	8	18728	18735	25 %	50 %	25 %	0 %	407719153
61	NC_018698	GTTT	2	8	19277	19284	0 %	75 %	25 %	0 %	407719154
62	NC_018698	TAAT	2	8	19730	19737	50 %	50 %	0 %	0 %	407719155
63	NC_018698	CCTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	0 %	50 %	407719156
64	NC_018698	GTTT	2	8	20443	20450	0 %	75 %	25 %	0 %	407719156
65	NC_018698	TAAA	2	8	20537	20544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018698	TACC	2	8	20867	20874	25 %	25 %	0 %	50 %	407719157
67	NC_018698	TGCT	2	8	20961	20968	0 %	50 %	25 %	25 %	407719157
68	NC_018698	TTCT	2	8	21191	21198	0 %	75 %	0 %	25 %	407719157
69	NC_018698	ATTT	2	8	21362	21369	25 %	75 %	0 %	0 %	407719157
70	NC_018698	TAAA	2	8	21557	21564	75 %	25 %	0 %	0 %	407719157
71	NC_018698	TCTT	2	8	21895	21902	0 %	75 %	0 %	25 %	407719157
72	NC_018698	TACT	2	8	22241	22248	25 %	50 %	0 %	25 %	407719157
73	NC_018698	AGCC	2	8	22620	22627	25 %	0 %	25 %	50 %	407719158
74	NC_018698	AAAC	2	8	22896	22903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018698	TGTT	2	8	23261	23268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018698	CAAA	2	8	23339	23346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018698	AAAG	2	8	23846	23853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018698	CTAT	2	8	23914	23921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018698	ATTT	2	8	24190	24197	25 %	75 %	0 %	0 %	407719161
80	NC_018698	CAAA	2	8	25800	25807	75 %	0 %	0 %	25 %	407719163
81	NC_018698	TGCC	2	8	26055	26062	0 %	25 %	25 %	50 %	407719163
82	NC_018698	GTTC	2	8	26321	26328	0 %	50 %	25 %	25 %	407719163
83	NC_018698	TTTC	2	8	26391	26398	0 %	75 %	0 %	25 %	407719163
84	NC_018698	TAAC	2	8	26637	26644	50 %	25 %	0 %	25 %	407719163
85	NC_018698	ATTT	2	8	27199	27206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018698	TCAA	2	8	27303	27310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018698	CATT	2	8	27373	27380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018698	CCAT	2	8	27466	27473	25 %	25 %	0 %	50 %	407719164
89	NC_018698	ACCA	2	8	28248	28255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018698	ATTA	2	8	28475	28482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018698	TTCA	2	8	28613	28620	25 %	50 %	0 %	25 %	407719166

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.