MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	CTT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018698	TTA	4	12	347	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018698	AAG	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018698	GAA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018698	GAA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018698	GTC	2	6	539	544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018698	CTA	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018698	AGT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018698	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018698	TGT	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018698	ATA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018698	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018698	ATA	2	6	1074	1079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018698	CAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018698	GGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719129
16	NC_018698	ACT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719129
17	NC_018698	TGA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
18	NC_018698	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
19	NC_018698	GAA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719129
20	NC_018698	ATT	4	12	1764	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719129
21	NC_018698	CCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719129
22	NC_018698	TGA	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719129
23	NC_018698	CAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719129
24	NC_018698	TAG	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719130
25	NC_018698	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719130
26	NC_018698	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719130
27	NC_018698	GCA	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018698	AGC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018698	GGT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018698	AGT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018698	TCT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018698	CAT	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018698	CTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
34	NC_018698	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719131
35	NC_018698	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
36	NC_018698	AAT	3	9	3166	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719131
37	NC_018698	ATG	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719131
38	NC_018698	CAC	2	6	3303	3308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719131
39	NC_018698	GCC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719131
40	NC_018698	ATT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719131
41	NC_018698	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018698	AAT	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018698	AAT	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018698	CAC	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018698	ACG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719132
46	NC_018698	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
47	NC_018698	GTT	2	6	3755	3760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719132
48	NC_018698	CAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
49	NC_018698	AAG	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
50	NC_018698	TAA	2	6	3925	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719132
51	NC_018698	AAG	2	6	3939	3944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719132
52	NC_018698	ACA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
53	NC_018698	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719132
54	NC_018698	GAT	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
55	NC_018698	GCT	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
56	NC_018698	ATG	2	6	4112	4117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719132
57	NC_018698	GTC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719132
58	NC_018698	TTA	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719132
59	NC_018698	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
60	NC_018698	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719133
61	NC_018698	AAT	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
62	NC_018698	GTC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719133
63	NC_018698	ATG	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
64	NC_018698	AAC	2	6	4654	4659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719133
65	NC_018698	TGA	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
66	NC_018698	ATG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719133
67	NC_018698	ATC	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
68	NC_018698	TGG	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719133
69	NC_018698	TAC	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719133
70	NC_018698	AAT	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719133
71	NC_018698	CTA	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
72	NC_018698	TTG	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719134
73	NC_018698	CAA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
74	NC_018698	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
75	NC_018698	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
76	NC_018698	TGA	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
77	NC_018698	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719134
78	NC_018698	CAA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
79	NC_018698	AGT	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
80	NC_018698	CTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719134
81	NC_018698	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719134
82	NC_018698	GTA	3	9	5791	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719134
83	NC_018698	CAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719134
84	NC_018698	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719134
85	NC_018698	TAT	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018698	ATC	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018698	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018698	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018698	ATT	2	6	6554	6559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018698	GTT	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719135
91	NC_018698	TCT	2	6	6757	6762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
92	NC_018698	TCT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
93	NC_018698	ACC	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
94	NC_018698	GGA	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719135
95	NC_018698	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
96	NC_018698	ACT	2	6	6947	6952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
97	NC_018698	CTA	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719135
98	NC_018698	AAT	2	6	7024	7029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
99	NC_018698	GAT	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
100	NC_018698	CTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719135
101	NC_018698	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719135
102	NC_018698	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
103	NC_018698	TCC	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719135
104	NC_018698	CAC	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
105	NC_018698	ATG	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719135
106	NC_018698	ACC	2	6	7857	7862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719135
107	NC_018698	AAT	2	6	7883	7888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
108	NC_018698	AAC	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719135
109	NC_018698	ATA	2	6	8118	8123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719135
110	NC_018698	ACA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018698	TCA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719136
112	NC_018698	GTC	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719136
113	NC_018698	GCC	2	6	8476	8481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719136
114	NC_018698	AAT	3	9	8497	8505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
115	NC_018698	ATA	2	6	8535	8540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
116	NC_018698	AAT	2	6	8560	8565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719136
117	NC_018698	CAG	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719136
118	NC_018698	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719137
119	NC_018698	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719137
120	NC_018698	TGT	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719137
121	NC_018698	GAA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719137
122	NC_018698	TGA	2	6	8951	8956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719137
123	NC_018698	CTA	2	6	8957	8962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
124	NC_018698	ACT	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
125	NC_018698	TAG	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719137
126	NC_018698	TAC	2	6	9042	9047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719137
127	NC_018698	CAG	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719137
128	NC_018698	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018698	ATC	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018698	TAC	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018698	TGA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719138
132	NC_018698	CAA	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719138
133	NC_018698	ATT	2	6	9613	9618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719138
134	NC_018698	ACA	2	6	9621	9626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719138
135	NC_018698	GTT	2	6	9791	9796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_018698	TTA	2	6	19773	19778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719155
264	NC_018698	CAT	2	6	19849	19854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719155
265	NC_018698	TCT	2	6	19857	19862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719155
266	NC_018698	TCT	2	6	19914	19919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719155
267	NC_018698	TCA	2	6	19938	19943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719155
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269	NC_018698	AGT	2	6	20000	20005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719155
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295	NC_018698	ATG	2	6	22777	22782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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369	NC_018698	AAT	2	6	27222	27227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_018698	CAA	2	6	27266	27271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_018698	ATT	2	6	27325	27330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_018698	CCG	2	6	27617	27622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
374	NC_018698	GAG	2	6	27805	27810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
375	NC_018698	GAA	2	6	28057	28062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719165
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377	NC_018698	ATA	2	6	28406	28411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_018698	TAA	2	6	29089	29094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_018698	TAA	2	6	29158	29163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_018698	TAT	2	6	29240	29245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_018698	CAG	2	6	29492	29497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_018698	TTA	2	6	29553	29558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.