MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 451

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018674	ATA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018674	CAAA	2	8	31	38	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018674	ATGT	2	8	43	50	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018674	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018674	CTTTT	2	10	79	88	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018674	ATT	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018674	ATTTT	2	10	144	153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018674	TA	3	6	198	203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018674	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018674	TA	3	6	232	237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018674	CATA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018674	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018674	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018674	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018674	A	8	8	429	436	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
17	NC_018674	ACA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719063
18	NC_018674	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719063
19	NC_018674	AAAC	2	8	590	597	75 %	0 %	0 %	25 %	407719063
20	NC_018674	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719063
21	NC_018674	TAC	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719063
22	NC_018674	A	8	8	734	741	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
23	NC_018674	TA	3	6	814	819	50 %	50 %	0 %	0 %	407719063
24	NC_018674	CCA	2	6	832	837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719063
25	NC_018674	AGT	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719063
26	NC_018674	AC	3	6	944	949	50 %	0 %	0 %	50 %	407719063
27	NC_018674	GAA	2	6	1075	1080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719063
28	NC_018674	A	6	6	1183	1188	100 %	0 %	0 %	0 %	407719063
29	NC_018674	TAAA	2	8	1235	1242	75 %	25 %	0 %	0 %	407719063
30	NC_018674	TAC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719064
31	NC_018674	GAT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719064
32	NC_018674	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	407719064
33	NC_018674	CT	3	6	1331	1336	0 %	50 %	0 %	50 %	407719064
34	NC_018674	CAG	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719064
35	NC_018674	GAAA	2	8	1379	1386	75 %	0 %	25 %	0 %	407719064
36	NC_018674	AACA	2	8	1387	1394	75 %	0 %	0 %	25 %	407719064
37	NC_018674	TTAC	2	8	1443	1450	25 %	50 %	0 %	25 %	407719064
38	NC_018674	TTA	2	6	1485	1490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719064
39	NC_018674	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719064
40	NC_018674	A	7	7	1545	1551	100 %	0 %	0 %	0 %	407719064
41	NC_018674	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719064
42	NC_018674	A	6	6	1587	1592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018674	ATT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018674	A	6	6	1732	1737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018674	GC	3	6	1840	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018674	CAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
47	NC_018674	TAG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719065
48	NC_018674	CTA	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
49	NC_018674	TCA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719065
50	NC_018674	CAC	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
51	NC_018674	GAC	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
52	NC_018674	CCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
53	NC_018674	AAT	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719065
54	NC_018674	TTGA	2	8	2323	2330	25 %	50 %	25 %	0 %	407719065
55	NC_018674	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719065
56	NC_018674	CGA	2	6	2448	2453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719065
57	NC_018674	TC	3	6	2550	2555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018674	TA	3	6	2606	2611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018674	TAA	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018674	CAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018674	A	7	7	2778	2784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018674	AATA	2	8	2808	2815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018674	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018674	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018674	CA	3	6	2936	2941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018674	AAC	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
67	NC_018674	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
68	NC_018674	ATC	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
69	NC_018674	TCG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
70	NC_018674	ACT	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
71	NC_018674	TTG	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719066
72	NC_018674	TAA	2	6	3150	3155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719066
73	NC_018674	CGC	2	6	3212	3217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
74	NC_018674	GCTGA	2	10	3504	3513	20 %	20 %	40 %	20 %	407719066
75	NC_018674	ATG	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719066
76	NC_018674	TCG	2	6	3727	3732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
77	NC_018674	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
78	NC_018674	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719066
79	NC_018674	ACT	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719066
80	NC_018674	CAAT	2	8	4038	4045	50 %	25 %	0 %	25 %	407719066
81	NC_018674	GCCCT	2	10	4064	4073	0 %	20 %	20 %	60 %	407719066
82	NC_018674	GCT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719066
83	NC_018674	GCC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719066
84	NC_018674	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719066
85	NC_018674	CAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719066
86	NC_018674	TCC	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018674	CTT	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
88	NC_018674	CAA	2	6	4410	4415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719067
89	NC_018674	TTC	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
90	NC_018674	CAT	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
91	NC_018674	GCTCG	2	10	4592	4601	0 %	20 %	40 %	40 %	407719067
92	NC_018674	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719067
93	NC_018674	AGC	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719067
94	NC_018674	TCAT	2	8	4721	4728	25 %	50 %	0 %	25 %	407719067
95	NC_018674	TTG	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719067
96	NC_018674	CATC	2	8	4833	4840	25 %	25 %	0 %	50 %	407719067
97	NC_018674	TGC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
98	NC_018674	CAC	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719067
99	NC_018674	TCA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719067
100	NC_018674	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719067
101	NC_018674	CGT	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719067
102	NC_018674	CCT	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719068
103	NC_018674	CTT	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
104	NC_018674	TGTT	2	8	5480	5487	0 %	75 %	25 %	0 %	407719068
105	NC_018674	TCA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
106	NC_018674	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719068
107	NC_018674	TAGCG	2	10	5636	5645	20 %	20 %	40 %	20 %	407719068
108	NC_018674	TCT	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719068
109	NC_018674	CAT	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719068
110	NC_018674	ATG	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
111	NC_018674	TTG	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719068
112	NC_018674	CGTA	2	8	5826	5833	25 %	25 %	25 %	25 %	407719068
113	NC_018674	AAGT	2	8	5855	5862	50 %	25 %	25 %	0 %	407719068
114	NC_018674	ATT	2	6	5995	6000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719068
115	NC_018674	GCT	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
116	NC_018674	CCA	2	6	6182	6187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
117	NC_018674	GGCGT	2	10	6223	6232	0 %	20 %	60 %	20 %	407719068
118	NC_018674	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719068
119	NC_018674	CAG	2	6	6268	6273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719068
120	NC_018674	TGA	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
121	NC_018674	CAAT	2	8	6303	6310	50 %	25 %	0 %	25 %	407719068
122	NC_018674	AAT	2	6	6400	6405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
123	NC_018674	AAC	2	6	6470	6475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719068
124	NC_018674	CGG	2	6	6504	6509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719068
125	NC_018674	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
126	NC_018674	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719068
127	NC_018674	GTC	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719068
128	NC_018674	ATG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719068
129	NC_018674	TAA	2	6	6879	6884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018674	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018674	ATT	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018674	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018674	CAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018674	A	6	6	7134	7139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018674	TAAT	2	8	7196	7203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018674	AG	3	6	7226	7231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018674	TTA	2	6	7271	7276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018674	A	6	6	7282	7287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018674	ATA	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018674	GAA	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719069
141	NC_018674	AGTT	2	8	7517	7524	25 %	50 %	25 %	0 %	407719069
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413	NC_018674	CTAAA	2	10	20232	20241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
414	NC_018674	AAAT	2	8	20256	20263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_018674	AAT	2	6	20311	20316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_018674	TTA	2	6	20672	20677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_018674	TCA	2	6	20686	20691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_018674	TTA	2	6	20701	20706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_018674	ATA	2	6	20719	20724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_018674	GAG	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
424	NC_018674	C	7	7	20795	20801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
425	NC_018674	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_018674	TTA	2	6	20975	20980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_018674	CTT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_018674	A	7	7	21537	21543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_018674	A	7	7	21653	21659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_018674	TATT	2	8	21685	21692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_018674	TTGT	2	8	21799	21806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
450	NC_018674	AGT	2	6	21830	21835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018674	T	6	6	21860	21865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.