MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 1870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018649	TCCGG	2	10	298	307	0 %	20 %	40 %	40 %	410477578
2	NC_018649	GATCA	2	10	6330	6339	40 %	20 %	20 %	20 %	410477581
3	NC_018649	GTCTT	2	10	6991	7000	0 %	60 %	20 %	20 %	410477581
4	NC_018649	TGGAG	2	10	13461	13470	20 %	20 %	60 %	0 %	410477589
5	NC_018649	GAGAA	2	10	15723	15732	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018649	TCCCG	2	10	16843	16852	0 %	20 %	20 %	60 %	410477592
7	NC_018649	CCAAG	2	10	17799	17808	40 %	0 %	20 %	40 %	410477594
8	NC_018649	GAAGG	2	10	18021	18030	40 %	0 %	60 %	0 %	410477594
9	NC_018649	AGAAA	2	10	18813	18822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018649	CATTT	2	10	19444	19453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018649	AAATG	2	10	20353	20362	60 %	20 %	20 %	0 %	410477597
12	NC_018649	TGTCG	2	10	21736	21745	0 %	40 %	40 %	20 %	410477599
13	NC_018649	TGATC	2	10	23347	23356	20 %	40 %	20 %	20 %	410477599
14	NC_018649	ATGGC	2	10	24084	24093	20 %	20 %	40 %	20 %	410477599
15	NC_018649	AAAAG	2	10	27009	27018	80 %	0 %	20 %	0 %	410477600
16	NC_018649	CACAA	2	10	27149	27158	60 %	0 %	0 %	40 %	410477600
17	NC_018649	CTTCG	2	10	27691	27700	0 %	40 %	20 %	40 %	410477600
18	NC_018649	CGGAG	2	10	31838	31847	20 %	0 %	60 %	20 %	410477604
19	NC_018649	CGAAT	2	10	32142	32151	40 %	20 %	20 %	20 %	410477604
20	NC_018649	GGAAA	2	10	34587	34596	60 %	0 %	40 %	0 %	410477604
21	NC_018649	AATGG	2	10	34842	34851	40 %	20 %	40 %	0 %	410477604
22	NC_018649	GACCG	2	10	38441	38450	20 %	0 %	40 %	40 %	410477608
23	NC_018649	GAAAA	2	10	40136	40145	80 %	0 %	20 %	0 %	410477611
24	NC_018649	TCCGG	2	10	40646	40655	0 %	20 %	40 %	40 %	410477612
25	NC_018649	GGAGG	2	10	40720	40729	20 %	0 %	80 %	0 %	410477612
26	NC_018649	AGCCC	2	10	42830	42839	20 %	0 %	20 %	60 %	410477615
27	NC_018649	TCCAG	2	10	42972	42981	20 %	20 %	20 %	40 %	410477616
28	NC_018649	TTTCG	2	10	47233	47242	0 %	60 %	20 %	20 %	410477620
29	NC_018649	CGGGG	2	10	50288	50297	0 %	0 %	80 %	20 %	410477624
30	NC_018649	GTCGT	2	10	52318	52327	0 %	40 %	40 %	20 %	410477627
31	NC_018649	AGGAG	2	10	52993	53002	40 %	0 %	60 %	0 %	410477628
32	NC_018649	TGCCG	2	10	53416	53425	0 %	20 %	40 %	40 %	410477628
33	NC_018649	CGGAC	2	10	54430	54439	20 %	0 %	40 %	40 %	410477629
34	NC_018649	TCGGT	2	10	56516	56525	0 %	40 %	40 %	20 %	410477633
35	NC_018649	TCCGG	2	10	58242	58251	0 %	20 %	40 %	40 %	410477634
36	NC_018649	GGTCA	2	10	59062	59071	20 %	20 %	40 %	20 %	410477634
37	NC_018649	AACGG	2	10	60390	60399	40 %	0 %	40 %	20 %	410477635
38	NC_018649	CCTGG	2	10	60937	60946	0 %	20 %	40 %	40 %	410477635
39	NC_018649	GGGAG	2	10	63906	63915	20 %	0 %	80 %	0 %	410477639
40	NC_018649	CCGAT	2	10	66012	66021	20 %	20 %	20 %	40 %	410477642
41	NC_018649	TGCGT	2	10	67936	67945	0 %	40 %	40 %	20 %	410477644
42	NC_018649	GACGG	2	10	68894	68903	20 %	0 %	60 %	20 %	410477644
43	NC_018649	TCGGA	2	10	69466	69475	20 %	20 %	40 %	20 %	410477645
44	NC_018649	TGACC	2	10	70183	70192	20 %	20 %	20 %	40 %	410477646
45	NC_018649	CCTGG	2	10	70384	70393	0 %	20 %	40 %	40 %	410477646
46	NC_018649	CGGTC	2	10	70752	70761	0 %	20 %	40 %	40 %	410477647
47	NC_018649	ATTGT	2	10	71264	71273	20 %	60 %	20 %	0 %	410477647
48	NC_018649	GTTCC	2	10	72829	72838	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018649	ACACT	2	10	74339	74348	40 %	20 %	0 %	40 %	410477650
50	NC_018649	TCCGG	2	10	75760	75769	0 %	20 %	40 %	40 %	410477652
51	NC_018649	CGGAC	2	10	76868	76877	20 %	0 %	40 %	40 %	410477653
52	NC_018649	TCTCG	2	10	78198	78207	0 %	40 %	20 %	40 %	410477654
53	NC_018649	AAGGA	2	10	79373	79382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018649	TTCTT	2	10	79410	79419	0 %	80 %	0 %	20 %	410477657
55	NC_018649	CAAGG	2	10	79604	79613	40 %	0 %	40 %	20 %	410477657
56	NC_018649	GAAAA	2	10	80300	80309	80 %	0 %	20 %	0 %	410477658
57	NC_018649	AAGGG	2	10	82375	82384	40 %	0 %	60 %	0 %	410477660
58	NC_018649	TGGTC	2	10	83117	83126	0 %	40 %	40 %	20 %	410477661
59	NC_018649	CAGAA	2	10	85452	85461	60 %	0 %	20 %	20 %	410477663
60	NC_018649	ATAAA	2	10	85754	85763	80 %	20 %	0 %	0 %	410477664
61	NC_018649	ATCGT	2	10	86576	86585	20 %	40 %	20 %	20 %	410477664
62	NC_018649	GGGAG	2	10	87019	87028	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018649	TCTTT	2	10	87063	87072	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018649	CGGGG	2	10	88159	88168	0 %	0 %	80 %	20 %	410477666
65	NC_018649	GATCC	2	10	89409	89418	20 %	20 %	20 %	40 %	410477667
66	NC_018649	CCTGT	2	10	92144	92153	0 %	40 %	20 %	40 %	410477670
67	NC_018649	TCCTT	2	10	92302	92311	0 %	60 %	0 %	40 %	410477670
68	NC_018649	CAGAC	2	10	92711	92720	40 %	0 %	20 %	40 %	410477671
69	NC_018649	CGATT	2	10	92968	92977	20 %	40 %	20 %	20 %	410477671
70	NC_018649	ACTTT	2	10	93313	93322	20 %	60 %	0 %	20 %	410477672
71	NC_018649	CTGGC	2	10	93594	93603	0 %	20 %	40 %	40 %	410477672
72	NC_018649	GGTCC	2	10	93720	93729	0 %	20 %	40 %	40 %	410477672
73	NC_018649	CTTTT	2	10	93772	93781	0 %	80 %	0 %	20 %	410477672
74	NC_018649	GCGTT	2	10	94147	94156	0 %	40 %	40 %	20 %	410477672
75	NC_018649	GAAGA	2	10	95469	95478	60 %	0 %	40 %	0 %	410477674
76	NC_018649	TGGGC	2	10	99650	99659	0 %	20 %	60 %	20 %	410477677
77	NC_018649	CCGTC	2	10	100412	100421	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_018649	TCGTT	2	10	100506	100515	0 %	60 %	20 %	20 %	410477678
79	NC_018649	CATGC	2	10	101139	101148	20 %	20 %	20 %	40 %	410477678
80	NC_018649	TCGGG	2	10	103150	103159	0 %	20 %	60 %	20 %	410477681
81	NC_018649	GGACG	2	10	103263	103272	20 %	0 %	60 %	20 %	410477681
82	NC_018649	CCGGG	2	10	104335	104344	0 %	0 %	60 %	40 %	410477682
83	NC_018649	TCCTG	2	10	105898	105907	0 %	40 %	20 %	40 %	410477682
84	NC_018649	CGGAC	2	10	108504	108513	20 %	0 %	40 %	40 %	410477684
85	NC_018649	CGACT	2	10	110923	110932	20 %	20 %	20 %	40 %	410477688
86	NC_018649	CCCTT	2	10	113311	113320	0 %	40 %	0 %	60 %	410477689
87	NC_018649	AGAAA	2	10	115186	115195	80 %	0 %	20 %	0 %	410477691
88	NC_018649	TGTCC	2	10	115695	115704	0 %	40 %	20 %	40 %	410477691
89	NC_018649	AGAGA	2	10	116507	116516	60 %	0 %	40 %	0 %	410477693
90	NC_018649	TGATC	2	10	117235	117244	20 %	40 %	20 %	20 %	410477694
91	NC_018649	GTTTT	2	10	117270	117279	0 %	80 %	20 %	0 %	410477694
92	NC_018649	GGTCT	2	10	118573	118582	0 %	40 %	40 %	20 %	410477695
93	NC_018649	AGATG	2	10	119040	119049	40 %	20 %	40 %	0 %	410477696
94	NC_018649	TTCAG	2	10	119574	119583	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018649	AGGGG	2	10	120466	120475	20 %	0 %	80 %	0 %	410477699
96	NC_018649	TGACC	2	10	120663	120672	20 %	20 %	20 %	40 %	410477699
97	NC_018649	CCCCG	2	10	121350	121359	0 %	0 %	20 %	80 %	410477699
98	NC_018649	TGGAT	2	10	122253	122262	20 %	40 %	40 %	0 %	410477700
99	NC_018649	GAAAG	2	10	122586	122595	60 %	0 %	40 %	0 %	410477701
100	NC_018649	TTGGG	2	10	123712	123721	0 %	40 %	60 %	0 %	410477701
101	NC_018649	CCAGG	2	10	124341	124350	20 %	0 %	40 %	40 %	410477702
102	NC_018649	ACGGG	2	10	125263	125272	20 %	0 %	60 %	20 %	410477704
103	NC_018649	TCCGA	2	10	126447	126456	20 %	20 %	20 %	40 %	410477704
104	NC_018649	CGGAT	2	10	126875	126884	20 %	20 %	40 %	20 %	410477705
105	NC_018649	TCCGA	2	10	128818	128827	20 %	20 %	20 %	40 %	410477706
106	NC_018649	GATCC	2	10	129177	129186	20 %	20 %	20 %	40 %	410477706
107	NC_018649	CGGAT	2	10	129700	129709	20 %	20 %	40 %	20 %	410477707
108	NC_018649	GGGGC	2	10	132136	132145	0 %	0 %	80 %	20 %	410477710
109	NC_018649	TCCGG	2	10	133067	133076	0 %	20 %	40 %	40 %	410477711
110	NC_018649	CGGTC	2	10	133550	133559	0 %	20 %	40 %	40 %	410477711
111	NC_018649	ACGAT	2	10	134059	134068	40 %	20 %	20 %	20 %	410477712
112	NC_018649	GGAAA	2	10	135304	135313	60 %	0 %	40 %	0 %	410477712
113	NC_018649	TGGGG	2	10	136382	136391	0 %	20 %	80 %	0 %	410477713
114	NC_018649	CGGAT	2	10	136491	136500	20 %	20 %	40 %	20 %	410477713
115	NC_018649	GGTCC	2	10	139980	139989	0 %	20 %	40 %	40 %	410477717
116	NC_018649	TGTCT	2	10	141533	141542	0 %	60 %	20 %	20 %	410477718
117	NC_018649	GCCCG	2	10	145648	145657	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018649	CTGAA	2	10	145807	145816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018649	TTTGC	2	10	148436	148445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018649	GGCCT	2	10	148853	148862	0 %	20 %	40 %	40 %	410477725
121	NC_018649	ACAGG	2	10	149590	149599	40 %	0 %	40 %	20 %	410477725
122	NC_018649	GTCGG	2	10	150063	150072	0 %	20 %	60 %	20 %	410477727
123	NC_018649	GGCCA	2	10	150108	150117	20 %	0 %	40 %	40 %	410477727
124	NC_018649	GTCGG	2	10	152930	152939	0 %	20 %	60 %	20 %	410477730
125	NC_018649	CGTCG	2	10	154917	154926	0 %	20 %	40 %	40 %	410477731
126	NC_018649	CCGGT	2	10	156210	156219	0 %	20 %	40 %	40 %	410477732
127	NC_018649	TCCGG	2	10	159492	159501	0 %	20 %	40 %	40 %	410477734
128	NC_018649	CGGAA	2	10	160919	160928	40 %	0 %	40 %	20 %	410477737
129	NC_018649	GGTCA	2	10	161997	162006	20 %	20 %	40 %	20 %	410477738
130	NC_018649	ACAGG	2	10	162981	162990	40 %	0 %	40 %	20 %	410477739
131	NC_018649	TTCCT	2	10	165427	165436	0 %	60 %	0 %	40 %	410477742
132	NC_018649	CCGGA	2	10	166724	166733	20 %	0 %	40 %	40 %	410477744
133	NC_018649	GAACG	2	10	167424	167433	40 %	0 %	40 %	20 %	410477744
134	NC_018649	CGGGA	2	10	167738	167747	20 %	0 %	60 %	20 %	410477745
135	NC_018649	TCCGG	2	10	167946	167955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018649	GAAGG	2	10	173058	173067	40 %	0 %	60 %	0 %	410477749
137	NC_018649	GCGTT	2	10	174427	174436	0 %	40 %	40 %	20 %	410477751
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151	NC_018649	TCCGG	2	10	189314	189323	0 %	20 %	40 %	40 %	410477766
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498	NC_018649	AGACC	2	10	652894	652903	40 %	0 %	20 %	40 %	410478288
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