MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 29023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018649	TTA	2	6	180	185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477578
2	NC_018649	GTC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477578
3	NC_018649	GTC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477578
4	NC_018649	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477578
5	NC_018649	GAT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477578
6	NC_018649	GAA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477578
7	NC_018649	ATC	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477578
8	NC_018649	TTC	2	6	1124	1129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477578
9	NC_018649	TGG	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477578
10	NC_018649	AAC	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477578
11	NC_018649	AGG	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018649	CTG	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477579
13	NC_018649	AGG	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477579
14	NC_018649	TCA	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477579
15	NC_018649	ATT	2	6	1787	1792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
16	NC_018649	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477579
17	NC_018649	CTC	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477579
18	NC_018649	TTC	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477579
19	NC_018649	TCT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477579
20	NC_018649	TTA	2	6	2145	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
21	NC_018649	GCT	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477579
22	NC_018649	TCC	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477579
23	NC_018649	CCG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477579
24	NC_018649	TTA	2	6	2552	2557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477579
25	NC_018649	AGG	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018649	GAA	3	9	2672	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
27	NC_018649	CAC	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477580
28	NC_018649	ACA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
29	NC_018649	CAA	3	9	2977	2985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
30	NC_018649	GAA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
31	NC_018649	GGA	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
32	NC_018649	AGG	2	6	3319	3324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
33	NC_018649	ATG	2	6	3372	3377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477580
34	NC_018649	ACA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
35	NC_018649	ATC	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477580
36	NC_018649	GAA	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
37	NC_018649	GCC	2	6	3809	3814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
38	NC_018649	CCG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
39	NC_018649	TTC	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
40	NC_018649	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477580
41	NC_018649	CTT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
42	NC_018649	ATG	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477580
43	NC_018649	CTT	2	6	4412	4417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
44	NC_018649	GAA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
45	NC_018649	GAA	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
46	NC_018649	GCC	2	6	4538	4543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477580
47	NC_018649	GGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477580
48	NC_018649	GAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
49	NC_018649	CTT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
50	NC_018649	CTT	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477580
51	NC_018649	GAA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477580
52	NC_018649	AAC	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477580
53	NC_018649	ACC	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477580
54	NC_018649	TGA	3	9	5198	5206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477581
55	NC_018649	ATT	2	6	5227	5232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477581
56	NC_018649	CCG	2	6	5422	5427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
57	NC_018649	GCC	2	6	5511	5516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
58	NC_018649	GAA	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
59	NC_018649	ATG	2	6	5559	5564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477581
60	NC_018649	TTC	2	6	5632	5637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
61	NC_018649	CTT	3	9	5652	5660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
62	NC_018649	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477581
63	NC_018649	TCT	2	6	5738	5743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
64	NC_018649	CGA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477581
65	NC_018649	TCT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477581
66	NC_018649	GGT	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
67	NC_018649	GTG	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
68	NC_018649	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
69	NC_018649	ATC	3	9	5934	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477581
70	NC_018649	CGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
71	NC_018649	GTC	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477581
72	NC_018649	CCG	2	6	6248	6253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
73	NC_018649	GAA	2	6	6492	6497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
74	NC_018649	AGA	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
75	NC_018649	GGA	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
76	NC_018649	GGA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
77	NC_018649	GAA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477581
78	NC_018649	CTC	2	6	7046	7051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477581
79	NC_018649	ATC	2	6	7068	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477581
80	NC_018649	TTG	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477581
81	NC_018649	GTG	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477581
82	NC_018649	GGA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477581
83	NC_018649	TGT	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477581
84	NC_018649	TCA	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477581
85	NC_018649	TGT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477581
86	NC_018649	CGA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477581
87	NC_018649	CCG	2	6	7561	7566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477581
88	NC_018649	TCC	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477582
89	NC_018649	GCG	2	6	7747	7752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477583
90	NC_018649	TAT	2	6	8074	8079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477583
91	NC_018649	TCC	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477583
92	NC_018649	CAC	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018649	GAC	2	6	8529	8534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477584
94	NC_018649	GAG	2	6	8590	8595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477584
95	NC_018649	TTC	2	6	8628	8633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477584
96	NC_018649	CGG	2	6	8658	8663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477584
97	NC_018649	CTT	2	6	8707	8712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477584
98	NC_018649	GGA	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477584
99	NC_018649	CGA	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477585
100	NC_018649	CGG	2	6	9190	9195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477585
101	NC_018649	CTC	2	6	9334	9339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477585
102	NC_018649	GCC	2	6	9390	9395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477585
103	NC_018649	CCA	2	6	9463	9468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477585
104	NC_018649	GGA	2	6	9515	9520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477585
105	NC_018649	GGA	2	6	9547	9552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477585
106	NC_018649	ACG	2	6	9559	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477585
107	NC_018649	GGA	2	6	9847	9852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018649	CCT	2	6	9995	10000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477586
109	NC_018649	ATG	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477586
110	NC_018649	CGA	2	6	10151	10156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477586
111	NC_018649	GCC	2	6	10258	10263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410477586
112	NC_018649	ATG	2	6	10307	10312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477586
113	NC_018649	TCG	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477586
114	NC_018649	TTC	2	6	10526	10531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477586
115	NC_018649	ATC	2	6	10562	10567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477586
116	NC_018649	GAT	2	6	10590	10595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477586
117	NC_018649	GAA	2	6	10666	10671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477586
118	NC_018649	TGG	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477586
119	NC_018649	GAT	2	6	10890	10895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477586
120	NC_018649	GGT	2	6	10926	10931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477586
121	NC_018649	TTC	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477586
122	NC_018649	GAG	2	6	11254	11259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477586
123	NC_018649	CGG	3	9	11330	11338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477586
124	NC_018649	CGA	2	6	11358	11363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410477586
125	NC_018649	CTC	2	6	11569	11574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018649	ATA	2	6	11579	11584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018649	TCA	2	6	11663	11668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477587
128	NC_018649	GAA	2	6	11781	11786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477587
129	NC_018649	GCG	2	6	11823	11828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477587
130	NC_018649	TCC	2	6	11887	11892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410477587
131	NC_018649	GTT	2	6	11928	11933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477587
132	NC_018649	GCT	2	6	12249	12254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018649	TGA	2	6	12381	12386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018649	CGT	2	6	12406	12411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018649	CGC	2	6	12484	12489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018649	CCA	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018649	CTC	2	6	12636	12641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018649	TGG	2	6	12800	12805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410477588
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140	NC_018649	AGA	2	6	12909	12914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477589
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142	NC_018649	ATC	2	6	13052	13057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477589
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154	NC_018649	GCG	2	6	13926	13931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018649	TGA	2	6	14215	14220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018649	ACC	2	6	14447	14452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410477590
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174	NC_018649	CTT	2	6	15923	15928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477592
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194	NC_018649	GTT	2	6	17119	17124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_018649	TTC	2	6	22834	22839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477599
260	NC_018649	ATA	2	6	22953	22958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410477599
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300	NC_018649	TGA	2	6	25741	25746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477599
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380	NC_018649	AGA	2	6	32327	32332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477604
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382	NC_018649	CTT	2	6	32595	32600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477604
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