MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 7848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	409995666
2	NC_018641	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	409995666
3	NC_018641	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	409995666
4	NC_018641	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	409995666
5	NC_018641	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	409995666
6	NC_018641	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	409995666
7	NC_018641	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	409995666
8	NC_018641	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	409995666
9	NC_018641	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	409995666
10	NC_018641	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	409995668
11	NC_018641	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018641	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	409995669
13	NC_018641	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	409995670
14	NC_018641	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	409995670
15	NC_018641	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	409995671
16	NC_018641	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	409995671
17	NC_018641	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	409995671
18	NC_018641	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	409995671
19	NC_018641	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	409995671
20	NC_018641	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	409995672
21	NC_018641	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	409995672
22	NC_018641	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	409995672
23	NC_018641	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	409995672
24	NC_018641	ACGG	2	8	9234	9241	25 %	0 %	50 %	25 %	409995672
25	NC_018641	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018641	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	409995673
27	NC_018641	GACA	2	8	10133	10140	50 %	0 %	25 %	25 %	409995673
28	NC_018641	ATCA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	409995673
29	NC_018641	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	409995673
30	NC_018641	TTGG	2	8	10984	10991	0 %	50 %	50 %	0 %	409995674
31	NC_018641	CGTA	2	8	11805	11812	25 %	25 %	25 %	25 %	409995676
32	NC_018641	AACC	2	8	11973	11980	50 %	0 %	0 %	50 %	409995676
33	NC_018641	AAGA	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	409995677
34	NC_018641	ATTA	2	8	12657	12664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018641	TTGG	2	8	12998	13005	0 %	50 %	50 %	0 %	409995678
36	NC_018641	AGTT	2	8	13381	13388	25 %	50 %	25 %	0 %	409995678
37	NC_018641	AAAG	2	8	13719	13726	75 %	0 %	25 %	0 %	409995678
38	NC_018641	TTTA	2	8	14042	14049	25 %	75 %	0 %	0 %	409995678
39	NC_018641	GCAG	2	8	14069	14076	25 %	0 %	50 %	25 %	409995678
40	NC_018641	TTTC	2	8	14239	14246	0 %	75 %	0 %	25 %	409995678
41	NC_018641	GATT	2	8	14917	14924	25 %	50 %	25 %	0 %	409995679
42	NC_018641	AACG	2	8	15201	15208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018641	GCTG	2	8	15395	15402	0 %	25 %	50 %	25 %	409995680
44	NC_018641	CAAT	2	8	15835	15842	50 %	25 %	0 %	25 %	409995680
45	NC_018641	ACTT	2	8	16275	16282	25 %	50 %	0 %	25 %	409995680
46	NC_018641	CTGG	2	8	16579	16586	0 %	25 %	50 %	25 %	409995680
47	NC_018641	TTCT	2	8	17122	17129	0 %	75 %	0 %	25 %	409995681
48	NC_018641	CAAT	2	8	17160	17167	50 %	25 %	0 %	25 %	409995681
49	NC_018641	ACAA	2	8	18415	18422	75 %	0 %	0 %	25 %	409995683
50	NC_018641	AAAG	2	8	18593	18600	75 %	0 %	25 %	0 %	409995683
51	NC_018641	TGTT	2	8	18812	18819	0 %	75 %	25 %	0 %	409995683
52	NC_018641	AAGC	2	8	18871	18878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018641	GACT	2	8	19169	19176	25 %	25 %	25 %	25 %	409995684
54	NC_018641	AAAC	2	8	19255	19262	75 %	0 %	0 %	25 %	409995684
55	NC_018641	TAAT	2	8	19638	19645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018641	CGTT	2	8	20292	20299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018641	ATAA	2	8	20483	20490	75 %	25 %	0 %	0 %	409995686
58	NC_018641	AGCT	2	8	21731	21738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018641	CGAG	2	8	21941	21948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018641	GGGT	2	8	22158	22165	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018641	GACT	2	8	22470	22477	25 %	25 %	25 %	25 %	409995689
62	NC_018641	CAAC	2	8	22751	22758	50 %	0 %	0 %	50 %	409995689
63	NC_018641	CAAA	2	8	24427	24434	75 %	0 %	0 %	25 %	409995690
64	NC_018641	AGAC	2	8	24746	24753	50 %	0 %	25 %	25 %	409995690
65	NC_018641	AAGA	2	8	25169	25176	75 %	0 %	25 %	0 %	409995690
66	NC_018641	CTGC	2	8	25936	25943	0 %	25 %	25 %	50 %	409995690
67	NC_018641	TAGT	2	8	26170	26177	25 %	50 %	25 %	0 %	409995690
68	NC_018641	AGCC	2	8	26569	26576	25 %	0 %	25 %	50 %	409995691
69	NC_018641	TTAC	2	8	27325	27332	25 %	50 %	0 %	25 %	409995692
70	NC_018641	TGGT	2	8	27431	27438	0 %	50 %	50 %	0 %	409995692
71	NC_018641	AATT	2	8	27787	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	409995693
72	NC_018641	AATT	2	8	28003	28010	50 %	50 %	0 %	0 %	409995693
73	NC_018641	ATTT	2	8	28222	28229	25 %	75 %	0 %	0 %	409995694
74	NC_018641	ATTG	2	8	28767	28774	25 %	50 %	25 %	0 %	409995696
75	NC_018641	GGTT	2	8	28925	28932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018641	CATA	2	8	28971	28978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018641	AGTG	2	8	29117	29124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018641	AACA	2	8	29924	29931	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018641	AATG	2	8	30276	30283	50 %	25 %	25 %	0 %	409995698
80	NC_018641	TACA	2	8	31130	31137	50 %	25 %	0 %	25 %	409995698
81	NC_018641	TTGC	2	8	31826	31833	0 %	50 %	25 %	25 %	409995698
82	NC_018641	CAAA	2	8	32015	32022	75 %	0 %	0 %	25 %	409995698
83	NC_018641	CTAC	2	8	32206	32213	25 %	25 %	0 %	50 %	409995698
84	NC_018641	GTGC	2	8	32973	32980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018641	GCAA	2	8	33267	33274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018641	ATTT	2	8	33926	33933	25 %	75 %	0 %	0 %	409995699
87	NC_018641	ATGA	2	8	34206	34213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018641	AGCA	2	8	34815	34822	50 %	0 %	25 %	25 %	409995700
89	NC_018641	AAGC	2	8	35972	35979	50 %	0 %	25 %	25 %	409995702
90	NC_018641	TTCA	2	8	37152	37159	25 %	50 %	0 %	25 %	409995703
91	NC_018641	AGCA	2	8	37478	37485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018641	ATTT	2	8	37526	37533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018641	AAAC	2	8	38563	38570	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018641	GTAT	2	8	38870	38877	25 %	50 %	25 %	0 %	409995706
95	NC_018641	GATT	2	8	39305	39312	25 %	50 %	25 %	0 %	409995706
96	NC_018641	AAGG	2	8	39387	39394	50 %	0 %	50 %	0 %	409995706
97	NC_018641	GCCG	2	8	39957	39964	0 %	0 %	50 %	50 %	409995706
98	NC_018641	AGAA	2	8	40295	40302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018641	TACT	2	8	42189	42196	25 %	50 %	0 %	25 %	409995710
100	NC_018641	TATT	2	8	43434	43441	25 %	75 %	0 %	0 %	409995713
101	NC_018641	CTTT	2	8	43673	43680	0 %	75 %	0 %	25 %	409995713
102	NC_018641	TCTT	2	8	43764	43771	0 %	75 %	0 %	25 %	409995713
103	NC_018641	ATGA	2	8	44097	44104	50 %	25 %	25 %	0 %	409995714
104	NC_018641	TCAT	2	8	45644	45651	25 %	50 %	0 %	25 %	409995716
105	NC_018641	ATCC	2	8	46080	46087	25 %	25 %	0 %	50 %	409995717
106	NC_018641	GTCA	2	8	46467	46474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018641	AATG	2	8	46698	46705	50 %	25 %	25 %	0 %	409995718
108	NC_018641	TAAT	2	8	46838	46845	50 %	50 %	0 %	0 %	409995718
109	NC_018641	GAAA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	409995718
110	NC_018641	AAAT	2	8	47120	47127	75 %	25 %	0 %	0 %	409995718
111	NC_018641	CAAA	2	8	47318	47325	75 %	0 %	0 %	25 %	409995718
112	NC_018641	AAAG	2	8	47376	47383	75 %	0 %	25 %	0 %	409995718
113	NC_018641	CAAA	2	8	47701	47708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018641	ATCG	2	8	49481	49488	25 %	25 %	25 %	25 %	409995720
115	NC_018641	CTTG	2	8	49509	49516	0 %	50 %	25 %	25 %	409995720
116	NC_018641	TCAT	2	8	49632	49639	25 %	50 %	0 %	25 %	409995720
117	NC_018641	AAAT	2	8	50894	50901	75 %	25 %	0 %	0 %	409995721
118	NC_018641	AATC	2	8	51380	51387	50 %	25 %	0 %	25 %	409995722
119	NC_018641	TCAA	2	8	51419	51426	50 %	25 %	0 %	25 %	409995722
120	NC_018641	CGCT	2	8	51615	51622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018641	CTAT	2	8	51887	51894	25 %	50 %	0 %	25 %	409995723
122	NC_018641	CTAG	2	8	52109	52116	25 %	25 %	25 %	25 %	409995723
123	NC_018641	ACTA	2	8	52394	52401	50 %	25 %	0 %	25 %	409995724
124	NC_018641	AAAT	2	8	52736	52743	75 %	25 %	0 %	0 %	409995724
125	NC_018641	TAGG	2	8	52774	52781	25 %	25 %	50 %	0 %	409995724
126	NC_018641	TGAT	2	8	53510	53517	25 %	50 %	25 %	0 %	409995725
127	NC_018641	CAAA	2	8	53571	53578	75 %	0 %	0 %	25 %	409995725
128	NC_018641	AAAT	2	8	53880	53887	75 %	25 %	0 %	0 %	409995725
129	NC_018641	TATT	2	8	54490	54497	25 %	75 %	0 %	0 %	409995725
130	NC_018641	TTGA	2	8	54787	54794	25 %	50 %	25 %	0 %	409995725
131	NC_018641	AACA	2	8	54887	54894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018641	TGAA	2	8	55066	55073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018641	TGAA	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018641	CCGC	2	8	55210	55217	0 %	0 %	25 %	75 %	409995726
135	NC_018641	TGAG	2	8	55933	55940	25 %	25 %	50 %	0 %	409995726
136	NC_018641	CAAA	2	8	56260	56267	75 %	0 %	0 %	25 %	409995726
137	NC_018641	TGCG	2	8	56541	56548	0 %	25 %	50 %	25 %	409995726
138	NC_018641	GTTA	2	8	56749	56756	25 %	50 %	25 %	0 %	409995727
139	NC_018641	TTTG	2	8	57059	57066	0 %	75 %	25 %	0 %	409995727
140	NC_018641	GTGC	2	8	57239	57246	0 %	25 %	50 %	25 %	409995728
141	NC_018641	GTCA	2	8	57448	57455	25 %	25 %	25 %	25 %	409995728
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143	NC_018641	TTAA	2	8	58694	58701	50 %	50 %	0 %	0 %	409995728
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