MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 41238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018641	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018641	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
4	NC_018641	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995666
5	NC_018641	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
6	NC_018641	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
7	NC_018641	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995666
8	NC_018641	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995666
9	NC_018641	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
10	NC_018641	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995666
11	NC_018641	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995666
12	NC_018641	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
13	NC_018641	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995666
14	NC_018641	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995666
15	NC_018641	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
16	NC_018641	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995666
17	NC_018641	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995666
18	NC_018641	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018641	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018641	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995667
21	NC_018641	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
22	NC_018641	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995667
23	NC_018641	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
24	NC_018641	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
25	NC_018641	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
26	NC_018641	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
27	NC_018641	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995667
28	NC_018641	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995667
29	NC_018641	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995667
30	NC_018641	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995667
31	NC_018641	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018641	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018641	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995668
34	NC_018641	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995668
35	NC_018641	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995668
36	NC_018641	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018641	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018641	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018641	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018641	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018641	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995669
42	NC_018641	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409995669
43	NC_018641	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995669
44	NC_018641	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
45	NC_018641	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
46	NC_018641	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
47	NC_018641	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
48	NC_018641	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995670
49	NC_018641	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
50	NC_018641	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
51	NC_018641	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
52	NC_018641	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
53	NC_018641	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995670
54	NC_018641	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995670
55	NC_018641	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
56	NC_018641	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
57	NC_018641	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995670
58	NC_018641	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
59	NC_018641	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995670
60	NC_018641	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995670
61	NC_018641	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995670
62	NC_018641	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995670
63	NC_018641	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018641	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018641	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
66	NC_018641	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
67	NC_018641	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
68	NC_018641	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
69	NC_018641	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
70	NC_018641	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995671
71	NC_018641	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
72	NC_018641	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
73	NC_018641	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
74	NC_018641	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995671
75	NC_018641	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
76	NC_018641	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995671
77	NC_018641	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
78	NC_018641	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
79	NC_018641	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
80	NC_018641	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
81	NC_018641	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
82	NC_018641	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995671
83	NC_018641	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
84	NC_018641	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
85	NC_018641	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995671
86	NC_018641	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
87	NC_018641	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995671
88	NC_018641	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995671
89	NC_018641	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995671
90	NC_018641	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
91	NC_018641	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995671
92	NC_018641	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
93	NC_018641	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995671
94	NC_018641	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995671
95	NC_018641	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995671
96	NC_018641	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995671
97	NC_018641	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018641	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
99	NC_018641	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995672
100	NC_018641	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
101	NC_018641	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
102	NC_018641	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
103	NC_018641	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995672
104	NC_018641	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
105	NC_018641	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
106	NC_018641	TTG	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
107	NC_018641	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
108	NC_018641	CCG	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409995672
109	NC_018641	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995672
110	NC_018641	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995672
111	NC_018641	ATC	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
112	NC_018641	TCG	2	6	8154	8159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
113	NC_018641	TGA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
114	NC_018641	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
115	NC_018641	AGC	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
116	NC_018641	TCA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
117	NC_018641	ATC	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
118	NC_018641	AGA	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
119	NC_018641	AAG	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995672
120	NC_018641	TCA	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995672
121	NC_018641	ATG	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
122	NC_018641	ATG	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
123	NC_018641	CTT	2	6	8742	8747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995672
124	NC_018641	CAA	2	6	8751	8756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995672
125	NC_018641	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
126	NC_018641	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995672
127	NC_018641	TCT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995672
128	NC_018641	GTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995672
129	NC_018641	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
130	NC_018641	AAT	2	6	9019	9024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995672
131	NC_018641	GAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
132	NC_018641	CGA	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
133	NC_018641	GCA	2	6	9518	9523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
134	NC_018641	CTG	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995672
135	NC_018641	GCA	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995672
136	NC_018641	AAT	2	6	9686	9691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995672
137	NC_018641	TAA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018641	GAT	2	6	9843	9848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995673
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261	NC_018641	AAG	2	6	17871	17876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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