MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 58899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018641	TTG	2	6	258241	258246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995929
5002	NC_018641	ATGC	2	8	258247	258254	25 %	25 %	25 %	25 %	409995929
5003	NC_018641	GAC	2	6	258281	258286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995929
5004	NC_018641	CAAT	2	8	258287	258294	50 %	25 %	0 %	25 %	409995929
5005	NC_018641	CAT	2	6	258319	258324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995929
5006	NC_018641	GCAG	2	8	258374	258381	25 %	0 %	50 %	25 %	409995929
5007	NC_018641	GTGC	2	8	258500	258507	0 %	25 %	50 %	25 %	409995929
5008	NC_018641	T	6	6	258526	258531	0 %	100 %	0 %	0 %	409995929
5009	NC_018641	A	6	6	258532	258537	100 %	0 %	0 %	0 %	409995929
5010	NC_018641	TGAG	2	8	258548	258555	25 %	25 %	50 %	0 %	409995929
5011	NC_018641	GTA	2	6	258564	258569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995929
5012	NC_018641	GTCA	2	8	258581	258588	25 %	25 %	25 %	25 %	409995929
5013	NC_018641	A	7	7	258618	258624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018641	AAG	2	6	258752	258757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018641	AAC	2	6	258784	258789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018641	GGC	2	6	258854	258859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_018641	TGA	2	6	258894	258899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018641	TGGA	2	8	259066	259073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018641	GAT	2	6	259119	259124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018641	GCA	2	6	259192	259197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_018641	CGC	2	6	259239	259244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_018641	GTGA	2	8	259245	259252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018641	TGT	2	6	259278	259283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018641	GAA	2	6	259288	259293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018641	TGT	2	6	259310	259315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018641	CAG	2	6	259360	259365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_018641	AGCG	2	8	259415	259422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_018641	T	6	6	259430	259435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_018641	AGA	2	6	259501	259506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018641	AT	3	6	259545	259550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018641	GAA	2	6	259552	259557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018641	GGC	2	6	259571	259576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_018641	GTCTG	2	10	259578	259587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_018641	GAA	2	6	259815	259820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018641	GA	3	6	259853	259858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018641	GGT	2	6	259889	259894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018641	GTC	2	6	259903	259908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_018641	TCGTG	2	10	259912	259921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5039	NC_018641	GGA	2	6	260015	260020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018641	ATC	2	6	260039	260044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_018641	AC	3	6	260066	260071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_018641	ATGG	2	8	260080	260087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018641	CGC	2	6	260205	260210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_018641	AC	3	6	260235	260240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_018641	GAGC	2	8	260299	260306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_018641	CCT	2	6	260379	260384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_018641	CA	3	6	260422	260427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_018641	TCGCA	2	10	260572	260581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5049	NC_018641	TAAG	2	8	260694	260701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018641	CGG	2	6	260778	260783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_018641	AGAA	2	8	260824	260831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018641	TAG	2	6	260845	260850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018641	GCGA	2	8	260853	260860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_018641	GCTT	2	8	260885	260892	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_018641	CGG	2	6	261023	261028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_018641	GGA	2	6	261055	261060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018641	TTGC	2	8	261239	261246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_018641	GTG	2	6	261358	261363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_018641	AC	3	6	261366	261371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_018641	GGA	2	6	261373	261378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018641	ATGT	2	8	261387	261394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018641	TC	3	6	261459	261464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_018641	GGA	2	6	261489	261494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018641	AGC	2	6	261717	261722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_018641	ATA	2	6	261793	261798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018641	TCC	2	6	261972	261977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_018641	AGG	2	6	262080	262085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_018641	TAG	2	6	262189	262194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018641	GAG	2	6	262276	262281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018641	GAGC	2	8	262295	262302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_018641	GAA	2	6	262346	262351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018641	AAC	2	6	262392	262397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_018641	GAT	2	6	262434	262439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_018641	GA	3	6	262623	262628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_018641	TAGG	2	8	262741	262748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_018641	TGG	2	6	262787	262792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018641	TAC	2	6	262795	262800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5081	NC_018641	GGT	2	6	263019	263024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018641	CGT	2	6	263214	263219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_018641	GAG	2	6	263263	263268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_018641	GCC	2	6	263322	263327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_018641	C	6	6	263390	263395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5086	NC_018641	GAGAT	2	10	263398	263407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_018641	GA	3	6	263438	263443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_018641	TGGAAG	2	12	263461	263472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_018641	CTGCGA	2	12	263550	263561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_018641	AAG	2	6	263661	263666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018641	CTT	2	6	263703	263708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_018641	AGT	2	6	263718	263723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_018641	TGG	2	6	263724	263729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_018641	CTGC	2	8	263734	263741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_018641	T	7	7	263792	263798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_018641	TAAG	2	8	263808	263815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_018641	AGCA	2	8	263839	263846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_018641	CAT	2	6	263860	263865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995930
5101	NC_018641	GTG	2	6	263941	263946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995930
5102	NC_018641	GC	3	6	264104	264109	0 %	0 %	50 %	50 %	409995930
5103	NC_018641	TGCT	3	12	264238	264249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_018641	CGA	2	6	264304	264309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409995931
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5107	NC_018641	CG	3	6	264443	264448	0 %	0 %	50 %	50 %	409995931
5108	NC_018641	CT	3	6	264457	264462	0 %	50 %	0 %	50 %	409995931
5109	NC_018641	CGTT	2	8	264463	264470	0 %	50 %	25 %	25 %	409995931
5110	NC_018641	T	6	6	264537	264542	0 %	100 %	0 %	0 %	409995931
5111	NC_018641	GGT	2	6	264558	264563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995931
5112	NC_018641	CGGT	2	8	264644	264651	0 %	25 %	50 %	25 %	409995931
5113	NC_018641	TTA	2	6	264704	264709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995931
5114	NC_018641	TAT	3	9	264789	264797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995931
5115	NC_018641	ATTCG	2	10	264839	264848	20 %	40 %	20 %	20 %	409995931
5116	NC_018641	TTC	2	6	264949	264954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409995931
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5118	NC_018641	GTG	2	6	264984	264989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409995932
5119	NC_018641	TTA	2	6	264997	265002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995932
5120	NC_018641	GAT	2	6	265095	265100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995932
5121	NC_018641	GTT	2	6	265119	265124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409995932
5122	NC_018641	GAT	2	6	265146	265151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409995932
5123	NC_018641	TG	3	6	265184	265189	0 %	50 %	50 %	0 %	409995932
5124	NC_018641	T	6	6	265195	265200	0 %	100 %	0 %	0 %	409995932
5125	NC_018641	GC	3	6	265201	265206	0 %	0 %	50 %	50 %	409995932
5126	NC_018641	TCA	2	6	265223	265228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995932
5127	NC_018641	CCG	2	6	265514	265519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_018641	T	6	6	265629	265634	0 %	100 %	0 %	0 %	409995933
5129	NC_018641	GACT	2	8	265651	265658	25 %	25 %	25 %	25 %	409995933
5130	NC_018641	TAA	2	6	265682	265687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409995933
5131	NC_018641	TTA	2	6	265690	265695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409995933
5132	NC_018641	TCA	2	6	265758	265763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995933
5133	NC_018641	AACC	2	8	265843	265850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_018641	AGG	2	6	265864	265869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_018641	TTG	3	9	265938	265946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_018641	CCGA	2	8	265958	265965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_018641	T	6	6	266053	266058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_018641	GAA	2	6	266115	266120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409995934
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5142	NC_018641	ACA	2	6	266386	266391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5143	NC_018641	GCG	2	6	266404	266409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_018641	A	7	7	267186	267192	100 %	0 %	0 %	0 %	409995935
5163	NC_018641	CTG	2	6	267196	267201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409995935
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5191	NC_018641	TTA	2	6	268392	268397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5192	NC_018641	ATC	2	6	268466	268471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409995938
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5237	NC_018641	T	6	6	270805	270810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_018641	TCCA	2	8	271674	271681	25 %	25 %	0 %	50 %	409995941
5252	NC_018641	AAC	2	6	271731	271736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409995941
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5254	NC_018641	ACC	2	6	271767	271772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995941
5255	NC_018641	GATT	2	8	271790	271797	25 %	50 %	25 %	0 %	409995941
5256	NC_018641	CGG	2	6	271944	271949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409995942
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5374	NC_018641	CAC	2	6	278431	278436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409995947
5375	NC_018641	AAATT	2	10	278527	278536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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