MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 43538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_018631	CTA	2	6	1161170	1161175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600109
27002	NC_018631	TTA	2	6	1161204	1161209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600109
27003	NC_018631	TAT	2	6	1161271	1161276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600109
27004	NC_018631	TCC	2	6	1161320	1161325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406600109
27005	NC_018631	ACT	2	6	1161382	1161387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600109
27006	NC_018631	TTC	2	6	1161416	1161421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600109
27007	NC_018631	GTA	2	6	1161520	1161525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600109
27008	NC_018631	TA	3	6	1161565	1161570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27009	NC_018631	TACAA	2	10	1161600	1161609	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27010	NC_018631	ACA	2	6	1161612	1161617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27011	NC_018631	AAT	2	6	1161619	1161624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27012	NC_018631	CAATT	2	10	1161645	1161654	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27013	NC_018631	TA	3	6	1161672	1161677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27014	NC_018631	TTAA	2	8	1161696	1161703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27015	NC_018631	AAG	2	6	1161705	1161710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27016	NC_018631	TATT	2	8	1161730	1161737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27017	NC_018631	TTAA	2	8	1161792	1161799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27018	NC_018631	CAT	2	6	1161811	1161816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27019	NC_018631	AAAT	2	8	1161902	1161909	75 %	25 %	0 %	0 %	406600110
27020	NC_018631	CAT	2	6	1161916	1161921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600110
27021	NC_018631	CAG	2	6	1162009	1162014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600110
27022	NC_018631	ACT	2	6	1162059	1162064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600110
27023	NC_018631	CAT	2	6	1162136	1162141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600110
27024	NC_018631	TGC	2	6	1162205	1162210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600110
27025	NC_018631	GCT	2	6	1162218	1162223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600110
27026	NC_018631	AAT	2	6	1162229	1162234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600110
27027	NC_018631	TTTTG	2	10	1162244	1162253	0 %	80 %	20 %	0 %	406600110
27028	NC_018631	CTA	2	6	1162308	1162313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600110
27029	NC_018631	T	6	6	1162324	1162329	0 %	100 %	0 %	0 %	406600110
27030	NC_018631	A	7	7	1162408	1162414	100 %	0 %	0 %	0 %	406600110
27031	NC_018631	T	7	7	1162455	1162461	0 %	100 %	0 %	0 %	406600110
27032	NC_018631	GAT	2	6	1162462	1162467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600110
27033	NC_018631	CT	3	6	1162488	1162493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27034	NC_018631	A	6	6	1162510	1162515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27035	NC_018631	AAT	2	6	1162553	1162558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27036	NC_018631	TAA	2	6	1162601	1162606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27037	NC_018631	CAT	2	6	1162691	1162696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27038	NC_018631	ATT	3	9	1162722	1162730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27039	NC_018631	TTC	2	6	1162734	1162739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27040	NC_018631	ATT	2	6	1162749	1162754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27041	NC_018631	A	6	6	1162763	1162768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27042	NC_018631	GA	3	6	1162784	1162789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27043	NC_018631	GGTTCA	2	12	1162843	1162854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27044	NC_018631	TTC	2	6	1162860	1162865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27045	NC_018631	CATAT	2	10	1162906	1162915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27046	NC_018631	T	6	6	1162918	1162923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27047	NC_018631	ATCA	2	8	1162929	1162936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27048	NC_018631	ATT	2	6	1162947	1162952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600111
27049	NC_018631	TTAG	2	8	1162976	1162983	25 %	50 %	25 %	0 %	406600111
27050	NC_018631	GA	3	6	1162991	1162996	50 %	0 %	50 %	0 %	406600111
27051	NC_018631	T	8	8	1163042	1163049	0 %	100 %	0 %	0 %	406600111
27052	NC_018631	TGT	2	6	1163086	1163091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600111
27053	NC_018631	ACA	2	6	1163108	1163113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600111
27054	NC_018631	CTT	2	6	1163148	1163153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600111
27055	NC_018631	GTT	2	6	1163175	1163180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600111
27056	NC_018631	TCA	2	6	1163183	1163188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600111
27057	NC_018631	CAC	2	6	1163217	1163222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600111
27058	NC_018631	ATC	2	6	1163224	1163229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600111
27059	NC_018631	ATC	2	6	1163242	1163247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600111
27060	NC_018631	ATCA	2	8	1163254	1163261	50 %	25 %	0 %	25 %	406600111
27061	NC_018631	CAA	2	6	1163352	1163357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600111
27062	NC_018631	GTTG	2	8	1163369	1163376	0 %	50 %	50 %	0 %	406600111
27063	NC_018631	CCA	2	6	1163442	1163447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600111
27064	NC_018631	AGC	2	6	1163457	1163462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600111
27065	NC_018631	GC	3	6	1163477	1163482	0 %	0 %	50 %	50 %	406600111
27066	NC_018631	GCA	2	6	1163504	1163509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600111
27067	NC_018631	TAAA	2	8	1163560	1163567	75 %	25 %	0 %	0 %	406600111
27068	NC_018631	ATT	2	6	1163590	1163595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600111
27069	NC_018631	ATT	2	6	1163620	1163625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600111
27070	NC_018631	T	6	6	1163669	1163674	0 %	100 %	0 %	0 %	406600111
27071	NC_018631	AATTA	2	10	1163722	1163731	60 %	40 %	0 %	0 %	406600111
27072	NC_018631	TTG	2	6	1163740	1163745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600111
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27074	NC_018631	AT	3	6	1163799	1163804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27075	NC_018631	ATT	2	6	1163823	1163828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27076	NC_018631	ATT	2	6	1163855	1163860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27077	NC_018631	TGA	2	6	1163913	1163918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600112
27078	NC_018631	TTG	2	6	1163970	1163975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600112
27079	NC_018631	TAA	2	6	1163988	1163993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600112
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27081	NC_018631	CAT	2	6	1164029	1164034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600112
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27083	NC_018631	CTG	2	6	1164120	1164125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600112
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27085	NC_018631	T	8	8	1164277	1164284	0 %	100 %	0 %	0 %	406600112
27086	NC_018631	AGC	2	6	1164289	1164294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600112
27087	NC_018631	CAC	2	6	1164365	1164370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600112
27088	NC_018631	TTAA	2	8	1164382	1164389	50 %	50 %	0 %	0 %	406600112
27089	NC_018631	GTA	2	6	1164412	1164417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600112
27090	NC_018631	TAA	2	6	1164444	1164449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600112
27091	NC_018631	CCA	2	6	1164492	1164497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600112
27092	NC_018631	ATT	2	6	1164502	1164507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600112
27093	NC_018631	CAA	2	6	1164647	1164652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600112
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27096	NC_018631	ATA	2	6	1164791	1164796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27097	NC_018631	TAATTT	2	12	1164805	1164816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27098	NC_018631	ATA	2	6	1164817	1164822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27099	NC_018631	ATTAT	2	10	1164828	1164837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27100	NC_018631	AAT	2	6	1164878	1164883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600113
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27102	NC_018631	TGG	2	6	1165042	1165047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600113
27103	NC_018631	TCC	2	6	1165229	1165234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406600113
27104	NC_018631	AAT	2	6	1165245	1165250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600113
27105	NC_018631	TCT	2	6	1165256	1165261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600113
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27107	NC_018631	TGC	2	6	1165288	1165293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600113
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27110	NC_018631	GAC	2	6	1165401	1165406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600113
27111	NC_018631	AAT	2	6	1165410	1165415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600113
27112	NC_018631	CAA	2	6	1165428	1165433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600113
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27114	NC_018631	GTCA	2	8	1165546	1165553	25 %	25 %	25 %	25 %	406600113
27115	NC_018631	CAC	2	6	1165638	1165643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600113
27116	NC_018631	AAC	2	6	1165663	1165668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600113
27117	NC_018631	GAT	2	6	1165724	1165729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600113
27118	NC_018631	CAT	2	6	1165845	1165850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600113
27119	NC_018631	CAT	2	6	1165852	1165857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600113
27120	NC_018631	TCA	2	6	1165964	1165969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600113
27121	NC_018631	GC	4	8	1165976	1165983	0 %	0 %	50 %	50 %	406600113
27122	NC_018631	TAA	2	6	1166145	1166150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600113
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27132	NC_018631	TTG	2	6	1166694	1166699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600114
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27148	NC_018631	ATTT	2	8	1167635	1167642	25 %	75 %	0 %	0 %	406600114
27149	NC_018631	CTG	2	6	1167755	1167760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600114
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27153	NC_018631	A	6	6	1168002	1168007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27154	NC_018631	ACC	2	6	1168049	1168054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27155	NC_018631	ACA	2	6	1168120	1168125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27156	NC_018631	CAT	2	6	1168168	1168173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27157	NC_018631	TAAT	2	8	1168247	1168254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27158	NC_018631	ATA	2	6	1168304	1168309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600115
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27222	NC_018631	TCAA	2	8	1171406	1171413	50 %	25 %	0 %	25 %	406600117
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27230	NC_018631	A	6	6	1171674	1171679	100 %	0 %	0 %	0 %	406600117
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27348	NC_018631	GCG	2	6	1177358	1177363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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27473	NC_018631	TAG	2	6	1182808	1182813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600125
27474	NC_018631	TAAAC	2	10	1182866	1182875	60 %	20 %	0 %	20 %	406600125
27475	NC_018631	AACC	2	8	1182921	1182928	50 %	0 %	0 %	50 %	406600125
27476	NC_018631	AAC	2	6	1182932	1182937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600125
27477	NC_018631	ATA	2	6	1183016	1183021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600125
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