MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	406025808
2	NC_018611	TA	3	6	1278	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018611	TA	3	6	1944	1949	50 %	50 %	0 %	0 %	406025810
4	NC_018611	AT	3	6	2022	2027	50 %	50 %	0 %	0 %	406025811
5	NC_018611	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	406025811
6	NC_018611	AG	3	6	3598	3603	50 %	0 %	50 %	0 %	406025814
7	NC_018611	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	406025814
8	NC_018611	AC	3	6	4128	4133	50 %	0 %	0 %	50 %	406025814
9	NC_018611	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018611	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	406025816
11	NC_018611	CA	3	6	7419	7424	50 %	0 %	0 %	50 %	406025816
12	NC_018611	TA	3	6	9479	9484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018611	TC	3	6	10742	10747	0 %	50 %	0 %	50 %	406025819
14	NC_018611	TA	3	6	10755	10760	50 %	50 %	0 %	0 %	406025819
15	NC_018611	TA	4	8	10787	10794	50 %	50 %	0 %	0 %	406025819
16	NC_018611	GT	3	6	11677	11682	0 %	50 %	50 %	0 %	406025820
17	NC_018611	TC	3	6	11933	11938	0 %	50 %	0 %	50 %	406025820
18	NC_018611	TA	3	6	12051	12056	50 %	50 %	0 %	0 %	406025820
19	NC_018611	AT	4	8	12472	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	406025821
20	NC_018611	AT	3	6	13387	13392	50 %	50 %	0 %	0 %	406025821
21	NC_018611	TA	3	6	13605	13610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018611	TA	3	6	15283	15288	50 %	50 %	0 %	0 %	406025822
23	NC_018611	GT	3	6	15984	15989	0 %	50 %	50 %	0 %	406025823
24	NC_018611	AT	3	6	16057	16062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018611	AG	3	6	16072	16077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018611	TA	3	6	17936	17941	50 %	50 %	0 %	0 %	406025825
27	NC_018611	AT	3	6	18364	18369	50 %	50 %	0 %	0 %	406025825
28	NC_018611	GA	3	6	18804	18809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018611	AG	3	6	19235	19240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018611	TA	3	6	20716	20721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018611	TA	4	8	21778	21785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018611	GA	3	6	24262	24267	50 %	0 %	50 %	0 %	406025831
33	NC_018611	AT	3	6	24383	24388	50 %	50 %	0 %	0 %	406025831
34	NC_018611	AG	3	6	24742	24747	50 %	0 %	50 %	0 %	406025831
35	NC_018611	TA	3	6	24871	24876	50 %	50 %	0 %	0 %	406025831
36	NC_018611	TA	3	6	25279	25284	50 %	50 %	0 %	0 %	406025832
37	NC_018611	TG	3	6	25620	25625	0 %	50 %	50 %	0 %	406025833
38	NC_018611	TA	3	6	25783	25788	50 %	50 %	0 %	0 %	406025833
39	NC_018611	CA	3	6	28633	28638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018611	TA	3	6	29630	29635	50 %	50 %	0 %	0 %	406025837
41	NC_018611	CT	3	6	29694	29699	0 %	50 %	0 %	50 %	406025837
42	NC_018611	CT	3	6	30242	30247	0 %	50 %	0 %	50 %	406025837
43	NC_018611	TA	3	6	30932	30937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018611	AT	3	6	31005	31010	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
45	NC_018611	AT	3	6	31209	31214	50 %	50 %	0 %	0 %	406025838
46	NC_018611	GA	3	6	31728	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	406025838
47	NC_018611	TA	3	6	32206	32211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018611	TA	3	6	33202	33207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018611	AT	3	6	34507	34512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018611	AG	3	6	34711	34716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018611	TC	3	6	34735	34740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018611	TA	3	6	34806	34811	50 %	50 %	0 %	0 %	406025843
53	NC_018611	TA	3	6	36708	36713	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
54	NC_018611	AT	3	6	36874	36879	50 %	50 %	0 %	0 %	406025845
55	NC_018611	TA	3	6	37197	37202	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
56	NC_018611	TA	3	6	37671	37676	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
57	NC_018611	CT	3	6	37862	37867	0 %	50 %	0 %	50 %	406025846
58	NC_018611	AT	3	6	38331	38336	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
59	NC_018611	TA	3	6	38402	38407	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
60	NC_018611	TA	3	6	38466	38471	50 %	50 %	0 %	0 %	406025846
61	NC_018611	TA	4	8	38564	38571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018611	GC	3	6	38892	38897	0 %	0 %	50 %	50 %	406025847
63	NC_018611	CG	3	6	38954	38959	0 %	0 %	50 %	50 %	406025847
64	NC_018611	CA	3	6	39111	39116	50 %	0 %	0 %	50 %	406025847
65	NC_018611	TA	3	6	39443	39448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018611	AT	3	6	40042	40047	50 %	50 %	0 %	0 %	406025848
67	NC_018611	TA	3	6	40434	40439	50 %	50 %	0 %	0 %	406025848
68	NC_018611	CT	3	6	41170	41175	0 %	50 %	0 %	50 %	406025849
69	NC_018611	TG	3	6	41261	41266	0 %	50 %	50 %	0 %	406025849
70	NC_018611	TA	3	6	41790	41795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018611	GT	3	6	44939	44944	0 %	50 %	50 %	0 %	406025852
72	NC_018611	TG	3	6	46677	46682	0 %	50 %	50 %	0 %	406025854
73	NC_018611	TA	3	6	48626	48631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018611	GA	3	6	49829	49834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018611	TC	3	6	52233	52238	0 %	50 %	0 %	50 %	406025860
76	NC_018611	AT	3	6	52341	52346	50 %	50 %	0 %	0 %	406025860
77	NC_018611	TC	3	6	54318	54323	0 %	50 %	0 %	50 %	406025862
78	NC_018611	AG	3	6	54354	54359	50 %	0 %	50 %	0 %	406025862
79	NC_018611	TG	3	6	54815	54820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018611	CA	3	6	54855	54860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018611	CT	3	6	56427	56432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.