MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 48598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018610	CCA	2	6	175773	175778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026011
3502	NC_018610	TGAT	2	8	175785	175792	25 %	50 %	25 %	0 %	406026011
3503	NC_018610	TGA	2	6	176025	176030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026011
3504	NC_018610	TGA	2	6	176076	176081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026011
3505	NC_018610	GCA	2	6	176170	176175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026011
3506	NC_018610	ATT	2	6	176228	176233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026011
3507	NC_018610	AAG	2	6	176264	176269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_018610	ATT	2	6	176346	176351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_018610	AAG	2	6	176372	176377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_018610	GT	3	6	176396	176401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_018610	CTT	2	6	176418	176423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_018610	GAT	2	6	176546	176551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026012
3513	NC_018610	ACG	2	6	176562	176567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026012
3514	NC_018610	ACAA	2	8	176574	176581	75 %	0 %	0 %	25 %	406026012
3515	NC_018610	GCT	2	6	176643	176648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026012
3516	NC_018610	TAA	2	6	176654	176659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026012
3517	NC_018610	GAC	2	6	176698	176703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026012
3518	NC_018610	GAT	2	6	176717	176722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026012
3519	NC_018610	GACA	2	8	176768	176775	50 %	0 %	25 %	25 %	406026012
3520	NC_018610	AGCC	2	8	176866	176873	25 %	0 %	25 %	50 %	406026012
3521	NC_018610	AACC	2	8	176892	176899	50 %	0 %	0 %	50 %	406026012
3522	NC_018610	GCT	2	6	176901	176906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026012
3523	NC_018610	ACC	2	6	176912	176917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026012
3524	NC_018610	TTG	2	6	176935	176940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026012
3525	NC_018610	CCA	2	6	176964	176969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026012
3526	NC_018610	CCAA	2	8	177222	177229	50 %	0 %	0 %	50 %	406026012
3527	NC_018610	ATG	2	6	177303	177308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026012
3528	NC_018610	CCAG	2	8	177388	177395	25 %	0 %	25 %	50 %	406026012
3529	NC_018610	CGA	2	6	177400	177405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026012
3530	NC_018610	AAC	2	6	177438	177443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026012
3531	NC_018610	CAA	2	6	177493	177498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026012
3532	NC_018610	ATC	2	6	177621	177626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026012
3533	NC_018610	AAT	2	6	177665	177670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026013
3534	NC_018610	AAT	2	6	177742	177747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026013
3535	NC_018610	AAT	2	6	177822	177827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026013
3536	NC_018610	AAT	2	6	177850	177855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026013
3537	NC_018610	TCC	2	6	177945	177950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_018610	ATTA	2	8	177968	177975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_018610	TGA	2	6	178005	178010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_018610	AC	3	6	178018	178023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_018610	AGC	2	6	178065	178070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_018610	TGAA	2	8	178086	178093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_018610	TGA	2	6	178095	178100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_018610	TG	3	6	178153	178158	0 %	50 %	50 %	0 %	406026014
3545	NC_018610	GAA	2	6	178162	178167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026014
3546	NC_018610	TTC	2	6	178263	178268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026014
3547	NC_018610	ATT	2	6	178296	178301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026014
3548	NC_018610	ATTG	2	8	178328	178335	25 %	50 %	25 %	0 %	406026014
3549	NC_018610	ACT	2	6	178413	178418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026014
3550	NC_018610	TCA	2	6	178621	178626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026014
3551	NC_018610	T	6	6	178699	178704	0 %	100 %	0 %	0 %	406026014
3552	NC_018610	TTG	2	6	178722	178727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026014
3553	NC_018610	T	6	6	178731	178736	0 %	100 %	0 %	0 %	406026014
3554	NC_018610	TCC	2	6	178780	178785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406026014
3555	NC_018610	T	7	7	178789	178795	0 %	100 %	0 %	0 %	406026014
3556	NC_018610	AAC	2	6	178866	178871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026014
3557	NC_018610	TTA	2	6	178948	178953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026014
3558	NC_018610	CATT	2	8	178966	178973	25 %	50 %	0 %	25 %	406026014
3559	NC_018610	ATT	2	6	179001	179006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026014
3560	NC_018610	TTTC	2	8	179016	179023	0 %	75 %	0 %	25 %	406026014
3561	NC_018610	GCTT	2	8	179089	179096	0 %	50 %	25 %	25 %	406026014
3562	NC_018610	ACT	2	6	179178	179183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026014
3563	NC_018610	TCT	2	6	179269	179274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026014
3564	NC_018610	TAT	2	6	179295	179300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026014
3565	NC_018610	TCA	2	6	179311	179316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026014
3566	NC_018610	CTG	2	6	179346	179351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026014
3567	NC_018610	AAGTT	2	10	179399	179408	40 %	40 %	20 %	0 %	406026014
3568	NC_018610	TGT	2	6	179437	179442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026014
3569	NC_018610	TCC	2	6	179488	179493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_018610	ATT	2	6	179505	179510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_018610	TAC	2	6	179615	179620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_018610	AGG	2	6	179649	179654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_018610	CAG	2	6	179675	179680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026015
3574	NC_018610	TGC	2	6	179790	179795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026015
3575	NC_018610	CCA	2	6	179810	179815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026015
3576	NC_018610	AAG	2	6	179861	179866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026015
3577	NC_018610	GCA	2	6	179870	179875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026015
3578	NC_018610	TTGTC	2	10	179906	179915	0 %	60 %	20 %	20 %	406026015
3579	NC_018610	TGAA	2	8	179978	179985	50 %	25 %	25 %	0 %	406026015
3580	NC_018610	CACC	2	8	180015	180022	25 %	0 %	0 %	75 %	406026015
3581	NC_018610	T	6	6	180058	180063	0 %	100 %	0 %	0 %	406026015
3582	NC_018610	CGA	2	6	180096	180101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026015
3583	NC_018610	ATT	2	6	180194	180199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3584	NC_018610	ATG	2	6	180262	180267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026015
3585	NC_018610	ATT	2	6	180277	180282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3586	NC_018610	ATT	2	6	180295	180300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3587	NC_018610	GAA	2	6	180336	180341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026015
3588	NC_018610	TTA	2	6	180392	180397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3589	NC_018610	CTG	2	6	180449	180454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026015
3590	NC_018610	TTA	2	6	180455	180460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3591	NC_018610	AAG	3	9	180539	180547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026015
3592	NC_018610	ATT	2	6	180603	180608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026015
3593	NC_018610	ACT	2	6	180626	180631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026015
3594	NC_018610	ATCA	2	8	180688	180695	50 %	25 %	0 %	25 %	406026015
3595	NC_018610	TCA	2	6	180725	180730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026015
3596	NC_018610	A	6	6	180755	180760	100 %	0 %	0 %	0 %	406026015
3597	NC_018610	AGA	2	6	180821	180826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_018610	CA	3	6	180841	180846	50 %	0 %	0 %	50 %	406026016
3599	NC_018610	AGT	2	6	180928	180933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026016
3600	NC_018610	GGT	2	6	180971	180976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026016
3601	NC_018610	CTT	2	6	180988	180993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026016
3602	NC_018610	CCG	2	6	181014	181019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026016
3603	NC_018610	TGC	2	6	181031	181036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026016
3604	NC_018610	AAC	2	6	181037	181042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026016
3605	NC_018610	ATG	2	6	181071	181076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026016
3606	NC_018610	AAT	2	6	181102	181107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026016
3607	NC_018610	AATATT	2	12	181152	181163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_018610	ACG	2	6	181226	181231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026017
3609	NC_018610	TGC	2	6	181250	181255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026017
3610	NC_018610	ATA	2	6	181369	181374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026017
3611	NC_018610	TAA	2	6	181396	181401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026017
3612	NC_018610	CTGA	2	8	181642	181649	25 %	25 %	25 %	25 %	406026017
3613	NC_018610	AAC	2	6	181682	181687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026017
3614	NC_018610	GTC	2	6	181726	181731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026017
3615	NC_018610	CCA	2	6	181802	181807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_018610	AAT	2	6	181808	181813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_018610	TGGAA	2	10	182010	182019	40 %	20 %	40 %	0 %	406026018
3618	NC_018610	TGG	2	6	182129	182134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026018
3619	NC_018610	ATT	2	6	182290	182295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026018
3620	NC_018610	GGCC	2	8	182313	182320	0 %	0 %	50 %	50 %	406026018
3621	NC_018610	A	7	7	182321	182327	100 %	0 %	0 %	0 %	406026018
3622	NC_018610	ATTAA	2	10	182417	182426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_018610	GAT	2	6	182437	182442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_018610	AG	3	6	182471	182476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3743	NC_018610	ATTT	2	8	188520	188527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3995	NC_018610	TGA	2	6	201981	201986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026038
3996	NC_018610	AAC	2	6	202019	202024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026038
3997	NC_018610	TGA	2	6	202072	202077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026039
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4000	NC_018610	CGT	2	6	202303	202308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026039

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