MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482

Total Repeats: 2157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018591	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018591	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	404285369
3	NC_018591	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	404285369
4	NC_018591	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	404285370
5	NC_018591	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	404285373
6	NC_018591	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	404285375
7	NC_018591	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	404285376
8	NC_018591	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	404285378
9	NC_018591	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018591	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	404285380
11	NC_018591	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	404285381
12	NC_018591	TAATT	2	10	20372	20381	40 %	60 %	0 %	0 %	404285384
13	NC_018591	ATTAA	2	10	21889	21898	60 %	40 %	0 %	0 %	404285385
14	NC_018591	AAATC	2	10	22350	22359	60 %	20 %	0 %	20 %	404285385
15	NC_018591	ATTTT	2	10	23127	23136	20 %	80 %	0 %	0 %	404285386
16	NC_018591	GGATT	2	10	23472	23481	20 %	40 %	40 %	0 %	404285386
17	NC_018591	AAATG	2	10	24027	24036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018591	ATGGA	2	10	28830	28839	40 %	20 %	40 %	0 %	404285393
19	NC_018591	AATAA	2	10	31668	31677	80 %	20 %	0 %	0 %	404285395
20	NC_018591	GGTTT	2	10	32213	32222	0 %	60 %	40 %	0 %	404285396
21	NC_018591	CATAT	2	10	32545	32554	40 %	40 %	0 %	20 %	404285396
22	NC_018591	TTTCT	2	10	32828	32837	0 %	80 %	0 %	20 %	404285397
23	NC_018591	CCATA	2	10	33514	33523	40 %	20 %	0 %	40 %	404285398
24	NC_018591	GAAAA	2	10	34358	34367	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018591	AGATA	2	10	34615	34624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018591	AATTG	2	10	34926	34935	40 %	40 %	20 %	0 %	404285399
27	NC_018591	TAAAA	2	10	35178	35187	80 %	20 %	0 %	0 %	404285399
28	NC_018591	AAAGG	2	10	35586	35595	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018591	TTCTA	2	10	36080	36089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018591	GAAAA	2	10	37168	37177	80 %	0 %	20 %	0 %	404285402
31	NC_018591	TGAAA	2	10	38323	38332	60 %	20 %	20 %	0 %	404285403
32	NC_018591	GAATG	2	10	40194	40203	40 %	20 %	40 %	0 %	404285405
33	NC_018591	AAATT	2	10	40321	40330	60 %	40 %	0 %	0 %	404285405
34	NC_018591	ATTTT	2	10	40927	40936	20 %	80 %	0 %	0 %	404285405
35	NC_018591	AAAAC	2	10	44554	44563	80 %	0 %	0 %	20 %	404285407
36	NC_018591	TTATT	2	10	46042	46051	20 %	80 %	0 %	0 %	404285409
37	NC_018591	GAAAA	2	10	47255	47264	80 %	0 %	20 %	0 %	404285409
38	NC_018591	ATAAA	2	10	48080	48089	80 %	20 %	0 %	0 %	404285410
39	NC_018591	ATTTT	2	10	49884	49893	20 %	80 %	0 %	0 %	404285412
40	NC_018591	GACAT	2	10	51097	51106	40 %	20 %	20 %	20 %	404285413
41	NC_018591	GACTT	2	10	51381	51390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018591	ATTTT	2	10	51466	51475	20 %	80 %	0 %	0 %	404285414
43	NC_018591	AAATG	2	10	52595	52604	60 %	20 %	20 %	0 %	404285415
44	NC_018591	ATGGT	2	10	53632	53641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018591	GTAGA	2	10	53681	53690	40 %	20 %	40 %	0 %	404285416
46	NC_018591	TTACT	2	10	54663	54672	20 %	60 %	0 %	20 %	404285418
47	NC_018591	CAAAA	2	10	55170	55179	80 %	0 %	0 %	20 %	404285419
48	NC_018591	GAAAT	2	10	55320	55329	60 %	20 %	20 %	0 %	404285419
49	NC_018591	CTTAG	2	10	55419	55428	20 %	40 %	20 %	20 %	404285419
50	NC_018591	AAATA	2	10	55688	55697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018591	TAAAA	2	10	56670	56679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018591	TGCTA	2	10	56844	56853	20 %	40 %	20 %	20 %	404285422
53	NC_018591	TTTTA	2	10	57012	57021	20 %	80 %	0 %	0 %	404285422
54	NC_018591	AGTTA	2	10	58328	58337	40 %	40 %	20 %	0 %	404285423
55	NC_018591	TTATG	2	10	58877	58886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018591	AGTCT	2	10	59793	59802	20 %	40 %	20 %	20 %	404285424
57	NC_018591	TTTTA	2	10	62789	62798	20 %	80 %	0 %	0 %	404285427
58	NC_018591	AAACG	2	10	67158	67167	60 %	0 %	20 %	20 %	404285431
59	NC_018591	CAAAA	2	10	68657	68666	80 %	0 %	0 %	20 %	404285433
60	NC_018591	AACAA	2	10	70076	70085	80 %	0 %	0 %	20 %	404285435
61	NC_018591	ATTTT	2	10	77184	77193	20 %	80 %	0 %	0 %	404285440
62	NC_018591	AGTAG	2	10	79014	79023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018591	ATGGA	2	10	80055	80064	40 %	20 %	40 %	0 %	404285445
64	NC_018591	AAAAT	2	10	80083	80092	80 %	20 %	0 %	0 %	404285446
65	NC_018591	ATATC	2	10	80422	80431	40 %	40 %	0 %	20 %	404285446
66	NC_018591	GTATA	2	10	81470	81479	40 %	40 %	20 %	0 %	404285447
67	NC_018591	TATTT	2	10	81610	81619	20 %	80 %	0 %	0 %	404285448
68	NC_018591	ATATA	2	10	81865	81874	60 %	40 %	0 %	0 %	404285448
69	NC_018591	TTTTA	2	10	83382	83391	20 %	80 %	0 %	0 %	404285450
70	NC_018591	TTTTA	2	10	83487	83496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018591	GCTTG	2	10	85457	85466	0 %	40 %	40 %	20 %	404285452
72	NC_018591	GCGCT	2	10	87511	87520	0 %	20 %	40 %	40 %	404285454
73	NC_018591	ATTTG	2	10	89487	89496	20 %	60 %	20 %	0 %	404285455
74	NC_018591	TAAAA	2	10	90731	90740	80 %	20 %	0 %	0 %	404285457
75	NC_018591	TTTGT	2	10	91836	91845	0 %	80 %	20 %	0 %	404285459
76	NC_018591	TTTCT	2	10	92574	92583	0 %	80 %	0 %	20 %	404285459
77	NC_018591	ATTTT	2	10	92823	92832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018591	CTAAA	2	10	94935	94944	60 %	20 %	0 %	20 %	404285461
79	NC_018591	GAAAA	2	10	96278	96287	80 %	0 %	20 %	0 %	404285461
80	NC_018591	TGAAA	2	10	96520	96529	60 %	20 %	20 %	0 %	404285461
81	NC_018591	AAATT	2	10	96865	96874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018591	AGCGG	2	10	97449	97458	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018591	GGAAA	2	10	98628	98637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018591	CGAAA	2	10	99944	99953	60 %	0 %	20 %	20 %	404285462
85	NC_018591	AAAAG	2	10	100257	100266	80 %	0 %	20 %	0 %	404285462
86	NC_018591	TGCAT	2	10	103917	103926	20 %	40 %	20 %	20 %	404285465
87	NC_018591	TTACT	2	10	104163	104172	20 %	60 %	0 %	20 %	404285465
88	NC_018591	GTTTT	2	10	105761	105770	0 %	80 %	20 %	0 %	404285467
89	NC_018591	TGGCT	2	10	105912	105921	0 %	40 %	40 %	20 %	404285467
90	NC_018591	ATATC	2	10	113165	113174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018591	AAAAG	2	10	115853	115862	80 %	0 %	20 %	0 %	404285480
92	NC_018591	CAATT	2	10	117731	117740	40 %	40 %	0 %	20 %	404285481
93	NC_018591	GAAAA	2	10	118926	118935	80 %	0 %	20 %	0 %	404285483
94	NC_018591	TTTGG	2	10	121426	121435	0 %	60 %	40 %	0 %	404285486
95	NC_018591	GAAAT	2	10	122027	122036	60 %	20 %	20 %	0 %	404285487
96	NC_018591	GAATT	2	10	122668	122677	40 %	40 %	20 %	0 %	404285487
97	NC_018591	CTTTA	2	10	126872	126881	20 %	60 %	0 %	20 %	404285490
98	NC_018591	AGAGA	2	10	127382	127391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018591	CTCGA	2	10	128223	128232	20 %	20 %	20 %	40 %	404285492
100	NC_018591	TTCCA	2	10	128557	128566	20 %	40 %	0 %	40 %	404285492
101	NC_018591	TTACT	2	10	128821	128830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018591	TTTTA	2	10	129755	129764	20 %	80 %	0 %	0 %	404285494
103	NC_018591	AAAAG	2	10	130024	130033	80 %	0 %	20 %	0 %	404285495
104	NC_018591	AAAGT	2	10	131062	131071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018591	TTAGT	2	10	132184	132193	20 %	60 %	20 %	0 %	404285499
106	NC_018591	TGAAC	2	10	132866	132875	40 %	20 %	20 %	20 %	404285501
107	NC_018591	AGATG	2	10	132908	132917	40 %	20 %	40 %	0 %	404285501
108	NC_018591	TTTAT	2	10	135184	135193	20 %	80 %	0 %	0 %	404285502
109	NC_018591	AAGTG	2	10	137206	137215	40 %	20 %	40 %	0 %	404285505
110	NC_018591	AGTCT	2	10	137486	137495	20 %	40 %	20 %	20 %	404285505
111	NC_018591	AATTT	2	10	138948	138957	40 %	60 %	0 %	0 %	404285508
112	NC_018591	TTGTT	2	10	141314	141323	0 %	80 %	20 %	0 %	404285510
113	NC_018591	ATTTT	2	10	143116	143125	20 %	80 %	0 %	0 %	404285512
114	NC_018591	AAAAT	2	10	144618	144627	80 %	20 %	0 %	0 %	404285512
115	NC_018591	AACTT	2	10	145928	145937	40 %	40 %	0 %	20 %	404285515
116	NC_018591	ACAAA	2	10	146030	146039	80 %	0 %	0 %	20 %	404285515
117	NC_018591	CTTGA	2	10	146825	146834	20 %	40 %	20 %	20 %	404285515
118	NC_018591	CCACA	2	10	147165	147174	40 %	0 %	0 %	60 %	404285515
119	NC_018591	TTGGT	2	10	147620	147629	0 %	60 %	40 %	0 %	404285516
120	NC_018591	TTGGT	2	10	147671	147680	0 %	60 %	40 %	0 %	404285516
121	NC_018591	TATGA	2	10	150599	150608	40 %	40 %	20 %	0 %	404285520
122	NC_018591	TAAAA	2	10	151120	151129	80 %	20 %	0 %	0 %	404285520
123	NC_018591	ACGGC	2	10	153356	153365	20 %	0 %	40 %	40 %	404285522
124	NC_018591	TTTAA	2	10	153428	153437	40 %	60 %	0 %	0 %	404285522
125	NC_018591	AATTT	2	10	153614	153623	40 %	60 %	0 %	0 %	404285522
126	NC_018591	GATAA	2	10	153781	153790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018591	AAACG	2	10	154764	154773	60 %	0 %	20 %	20 %	404285524
128	NC_018591	AATAA	2	10	154887	154896	80 %	20 %	0 %	0 %	404285524
129	NC_018591	GAATA	2	10	156848	156857	60 %	20 %	20 %	0 %	404285527
130	NC_018591	TTACT	2	10	158046	158055	20 %	60 %	0 %	20 %	404285528
131	NC_018591	AGATG	2	10	158094	158103	40 %	20 %	40 %	0 %	404285528
132	NC_018591	ATATG	2	10	160761	160770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018591	GCCAA	2	10	161074	161083	40 %	0 %	20 %	40 %	404285530
134	NC_018591	TCTAA	2	10	163110	163119	40 %	40 %	0 %	20 %	404285531
135	NC_018591	AAACA	2	10	163722	163731	80 %	0 %	0 %	20 %	404285531
136	NC_018591	GGAAT	2	10	166242	166251	40 %	20 %	40 %	0 %	404285533
137	NC_018591	AAGAT	2	10	166663	166672	60 %	20 %	20 %	0 %	404285533
138	NC_018591	GAATT	2	10	167034	167043	40 %	40 %	20 %	0 %	404285534
139	NC_018591	AAATA	2	10	170086	170095	80 %	20 %	0 %	0 %	404285538
140	NC_018591	TTGTA	2	10	172814	172823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_018591	AAAAG	2	10	212676	212685	80 %	0 %	20 %	0 %	404285574
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179	NC_018591	AGATT	2	10	217004	217013	40 %	40 %	20 %	0 %	404285580
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197	NC_018591	TCGTG	2	10	243746	243755	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_018591	AAGGT	2	10	245214	245223	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_018591	GAAAT	2	10	332393	332402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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