MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 64560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_018590	CCT	2	6	2837890	2837895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404409235
64502	NC_018590	T	6	6	2837895	2837900	0 %	100 %	0 %	0 %	404409235
64503	NC_018590	GCT	2	6	2837917	2837922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409235
64504	NC_018590	T	6	6	2837922	2837927	0 %	100 %	0 %	0 %	404409235
64505	NC_018590	AGC	2	6	2837952	2837957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409235
64506	NC_018590	CCT	2	6	2837966	2837971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404409235
64507	NC_018590	GTTT	2	8	2837978	2837985	0 %	75 %	25 %	0 %	404409235
64508	NC_018590	ATT	2	6	2837994	2837999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409235
64509	NC_018590	ATG	2	6	2838100	2838105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409235
64510	NC_018590	ATC	2	6	2838112	2838117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409235
64511	NC_018590	ATTT	2	8	2838125	2838132	25 %	75 %	0 %	0 %	404409235
64512	NC_018590	CAT	2	6	2838147	2838152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409235
64513	NC_018590	GAT	2	6	2838163	2838168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409235
64514	NC_018590	TGT	2	6	2838174	2838179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409235
64515	NC_018590	GAAT	2	8	2838240	2838247	50 %	25 %	25 %	0 %	404409235
64516	NC_018590	TAG	2	6	2838291	2838296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409235
64517	NC_018590	TAA	2	6	2838312	2838317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409235
64518	NC_018590	CAT	2	6	2838330	2838335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409235
64519	NC_018590	TTG	2	6	2838375	2838380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409235
64520	NC_018590	TGTTT	2	10	2838388	2838397	0 %	80 %	20 %	0 %	404409235
64521	NC_018590	AAC	2	6	2838522	2838527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409235
64522	NC_018590	TCT	2	6	2838728	2838733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409235
64523	NC_018590	CACT	2	8	2838775	2838782	25 %	25 %	0 %	50 %	404409236
64524	NC_018590	GCC	2	6	2838869	2838874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404409236
64525	NC_018590	GAT	2	6	2838886	2838891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409236
64526	NC_018590	AT	3	6	2838893	2838898	50 %	50 %	0 %	0 %	404409236
64527	NC_018590	GATT	2	8	2838909	2838916	25 %	50 %	25 %	0 %	404409236
64528	NC_018590	GACA	2	8	2838969	2838976	50 %	0 %	25 %	25 %	404409236
64529	NC_018590	T	7	7	2838987	2838993	0 %	100 %	0 %	0 %	404409236
64530	NC_018590	TTC	2	6	2839027	2839032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409236
64531	NC_018590	ACA	2	6	2839049	2839054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409236
64532	NC_018590	T	8	8	2839109	2839116	0 %	100 %	0 %	0 %	404409236
64533	NC_018590	T	9	9	2839126	2839134	0 %	100 %	0 %	0 %	404409236
64534	NC_018590	TCT	2	6	2839148	2839153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64535	NC_018590	A	10	10	2839195	2839204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64536	NC_018590	TTC	2	6	2839244	2839249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409237
64537	NC_018590	ACG	3	9	2839254	2839262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409237
64538	NC_018590	T	7	7	2839320	2839326	0 %	100 %	0 %	0 %	404409237
64539	NC_018590	ATTA	2	8	2839360	2839367	50 %	50 %	0 %	0 %	404409237
64540	NC_018590	TATCA	2	10	2839485	2839494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64541	NC_018590	ATT	2	6	2839528	2839533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409238
64542	NC_018590	AT	3	6	2839545	2839550	50 %	50 %	0 %	0 %	404409238
64543	NC_018590	TC	3	6	2839554	2839559	0 %	50 %	0 %	50 %	404409238
64544	NC_018590	GTG	2	6	2839560	2839565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404409238
64545	NC_018590	CTA	2	6	2839597	2839602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409238
64546	NC_018590	CAG	2	6	2839636	2839641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409238
64547	NC_018590	TTA	2	6	2839666	2839671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409238
64548	NC_018590	CTT	2	6	2839765	2839770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409238
64549	NC_018590	A	6	6	2839787	2839792	100 %	0 %	0 %	0 %	404409238
64550	NC_018590	T	8	8	2839809	2839816	0 %	100 %	0 %	0 %	404409238
64551	NC_018590	CTT	2	6	2839834	2839839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409238
64552	NC_018590	ATC	2	6	2839871	2839876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409238
64553	NC_018590	CTG	2	6	2839882	2839887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409238
64554	NC_018590	TAA	2	6	2839907	2839912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409238
64555	NC_018590	CGT	2	6	2839924	2839929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409238
64556	NC_018590	TC	3	6	2839968	2839973	0 %	50 %	0 %	50 %	404409238
64557	NC_018590	T	7	7	2840014	2840020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64558	NC_018590	TAA	2	6	2840098	2840103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64559	NC_018590	T	7	7	2840109	2840115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64560	NC_018590	AC	3	6	2840167	2840172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.