MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2479

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018589	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018589	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405756993
3	NC_018589	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405756994
4	NC_018589	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405756995
5	NC_018589	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405756995
6	NC_018589	GCAAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018589	ATTTTC	2	12	19878	19889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757002
8	NC_018589	CTTCAT	2	12	20895	20906	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757004
9	NC_018589	TTTTGG	2	12	21259	21270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405757004
10	NC_018589	AGTTGC	2	12	23648	23659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757006
11	NC_018589	TAAAGC	2	12	23701	23712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757006
12	NC_018589	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757007
13	NC_018589	TCGATT	2	12	32437	32448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757016
14	NC_018589	TCACCA	2	12	32719	32730	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405757017
15	NC_018589	CGATTA	2	12	38149	38160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757021
16	NC_018589	TTATGT	2	12	42635	42646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757024
17	NC_018589	AAAGAT	2	12	46288	46299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757027
18	NC_018589	TGAAAT	2	12	47125	47136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757028
19	NC_018589	TGGCGG	2	12	50260	50271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757032
20	NC_018589	TCAAAA	2	12	50380	50391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405757032
21	NC_018589	ACAGTG	2	12	51964	51975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757035
22	NC_018589	AAAAAT	2	12	52828	52839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757037
23	NC_018589	TTTATA	2	12	55306	55317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405757039
24	NC_018589	GCAGAA	2	12	56753	56764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405757039
25	NC_018589	AGGTAA	2	12	56844	56855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757040
26	NC_018589	TGATCG	2	12	58232	58243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757041
27	NC_018589	TGATTT	2	12	63577	63588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757045
28	NC_018589	TTTTGC	2	12	64182	64193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405757046
29	NC_018589	GATACA	2	12	75076	75087	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757055
30	NC_018589	TAAATT	2	12	76948	76959	50 %	50 %	0 %	0 %	405757058
31	NC_018589	ATTTAT	2	12	77122	77133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018589	GTGGCT	2	12	82642	82653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018589	TGATAT	2	12	85327	85338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757068
34	NC_018589	ATCACT	2	12	89486	89497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405757072
35	NC_018589	AAACAC	2	12	89919	89930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405757072
36	NC_018589	AAGATA	2	12	92918	92929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757072
37	NC_018589	TATAAA	2	12	95136	95147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757073
38	NC_018589	TATTAG	2	12	105367	105378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757083
39	NC_018589	TAAAAT	2	12	115201	115212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757094
40	NC_018589	CAAAAT	2	12	115342	115353	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405757094
41	NC_018589	GTCCGC	2	12	115474	115485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	405757094
42	NC_018589	GTTTTA	2	12	122110	122121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757102
43	NC_018589	TGATTT	2	12	124124	124135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757106
44	NC_018589	AAGTAA	2	12	128095	128106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757109
45	NC_018589	ATCTGT	2	12	132277	132288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757116
46	NC_018589	TCTATT	2	12	134216	134227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757117
47	NC_018589	GATATT	2	12	144244	144255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757129
48	NC_018589	TCTGAA	2	12	145480	145491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757132
49	NC_018589	GTTGCA	2	12	152322	152333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757141
50	NC_018589	GATTGC	2	12	152384	152395	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757141
51	NC_018589	TTAAAA	2	12	153057	153068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405757142
52	NC_018589	GGCGGT	2	12	158034	158045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757145
53	NC_018589	CGAATT	2	12	160952	160963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757146
54	NC_018589	GTAAAA	2	12	164104	164115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757149
55	NC_018589	TTTTAC	2	12	166151	166162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757153
56	NC_018589	TTTTTA	2	12	167189	167200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405757155
57	NC_018589	AAAGTG	2	12	168401	168412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757156
58	NC_018589	TACTAG	2	12	173408	173419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757161
59	NC_018589	AAGCGA	2	12	175912	175923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405757163
60	NC_018589	CAATCC	2	12	179227	179238	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405757166
61	NC_018589	AAAGAT	2	12	181237	181248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757168
62	NC_018589	ATGGCT	2	12	182362	182373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757169
63	NC_018589	CAGAAA	2	12	183036	183047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405757169
64	NC_018589	AAAAGA	2	12	183112	183123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757169
65	NC_018589	AAAAAC	2	12	183442	183453	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405757169
66	NC_018589	TGAAGT	2	12	185482	185493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405757169
67	NC_018589	CATTGA	2	12	193615	193626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757176
68	NC_018589	TGCAGC	2	12	194270	194281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405757177
69	NC_018589	TAAAAA	2	12	196508	196519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757179
70	NC_018589	AATAAA	2	12	199514	199525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018589	TTCTTT	2	12	214517	214528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757197
72	NC_018589	GAAAAA	2	12	216606	216617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757199
73	NC_018589	AGGAAA	2	12	216925	216936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405757199
74	NC_018589	GAAAAA	2	12	217831	217842	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757201
75	NC_018589	AAGGAG	2	12	221768	221779	50 %	0 %	50 %	0 %	405757202
76	NC_018589	GCAAGT	2	12	223658	223669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757204
77	NC_018589	TTAAAG	2	12	225601	225612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757206
78	NC_018589	GAAAAC	2	12	226528	226539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018589	TGTCGG	2	12	227577	227588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405757207
80	NC_018589	TCTCCA	2	12	231444	231455	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	405757210
81	NC_018589	GGTTTT	2	12	233155	233166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405757212
82	NC_018589	ATTGAT	2	12	234102	234113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405757214
83	NC_018589	AGAACC	2	12	235128	235139	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405757215
84	NC_018589	ATTCAA	2	12	237415	237426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018589	AAGGAA	2	12	238986	238997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018589	TAGGCG	2	12	240639	240650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018589	ATTCAA	2	12	243437	243448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018589	AAGGAA	2	12	245008	245019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018589	TAGGCG	2	12	246661	246672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018589	AGTCAA	2	12	248475	248486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018589	TTTACC	2	12	248904	248915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757217
92	NC_018589	AGTAAA	2	12	256161	256172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757223
93	NC_018589	AAAGGT	2	12	258287	258298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757225
94	NC_018589	TTATAT	2	12	263259	263270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018589	ACAGTA	2	12	263588	263599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757232
96	NC_018589	AAAACA	2	12	263963	263974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405757233
97	NC_018589	GCATGG	2	12	264144	264155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405757233
98	NC_018589	CTGTAG	2	12	267088	267099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757238
99	NC_018589	GACAAT	2	12	271457	271468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757244
100	NC_018589	AAGAAA	2	12	274041	274052	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405757245
101	NC_018589	TACACT	2	12	278285	278296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405757246
102	NC_018589	TTCGTG	2	12	279797	279808	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405757246
103	NC_018589	GAATTA	2	12	286482	286493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757251
104	NC_018589	AACTTT	2	12	288963	288974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018589	CGAAAT	2	12	290781	290792	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757255
106	NC_018589	TCTTTT	2	12	293744	293755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757257
107	NC_018589	ATCAAT	2	12	296151	296162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405757259
108	NC_018589	ATGAAA	2	12	296509	296520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757260
109	NC_018589	AATACA	2	12	297553	297564	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018589	CTTTTA	2	12	298382	298393	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757262
111	NC_018589	TAGAAA	2	12	299328	299339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405757263
112	NC_018589	ACGTTG	2	12	301259	301270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405757265
113	NC_018589	GAAAAC	2	12	303166	303177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405757266
114	NC_018589	GCTGCG	2	12	308539	308550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	405757273
115	NC_018589	TTTTGA	2	12	308939	308950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757273
116	NC_018589	AAATAA	2	12	312246	312257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405757276
117	NC_018589	GAAGGG	2	12	314043	314054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405757277
118	NC_018589	GATTCA	2	12	317686	317697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757280
119	NC_018589	GCAATT	2	12	317716	317727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757280
120	NC_018589	GAACCA	2	12	324507	324518	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405757286
121	NC_018589	TCCATT	2	12	327115	327126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405757289
122	NC_018589	TTGGTT	2	12	327525	327536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018589	CTTTTT	2	12	331374	331385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757294
124	NC_018589	GTAGAT	2	12	332281	332292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405757295
125	NC_018589	TATCTG	2	12	337315	337326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757300
126	NC_018589	ATATGA	2	12	338466	338477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757301
127	NC_018589	TGCGGG	2	12	339973	339984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405757302
128	NC_018589	GGACAT	2	12	343829	343840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757307
129	NC_018589	TATATT	2	12	348847	348858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405757312
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131	NC_018589	TGAAAC	2	12	351581	351592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757315
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142	NC_018589	CTGACT	2	12	384570	384581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405757345
143	NC_018589	CAGACC	2	12	385952	385963	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405757346
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146	NC_018589	ATGATA	2	12	390276	390287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018589	GGGACG	2	12	391867	391878	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405757353
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154	NC_018589	GAAATG	2	12	403473	403484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757369
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157	NC_018589	TTGTTT	2	12	410622	410633	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018589	TAACAA	2	12	411713	411724	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405757378
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188	NC_018589	ACAAAA	2	12	472570	472581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
189	NC_018589	TGTTCC	2	12	480971	480982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	405757438
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206	NC_018589	TTTAGT	2	12	543168	543179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
207	NC_018589	GAACTA	2	12	548350	548361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757509
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214	NC_018589	GAAATC	2	12	566074	566085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405757524
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216	NC_018589	AGATTT	2	12	569590	569601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
217	NC_018589	GACGGC	2	12	570035	570046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	405757528
218	NC_018589	TTGCTT	2	12	579246	579257	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405757535
219	NC_018589	AATCAC	2	12	583789	583800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405757541
220	NC_018589	TGCAGA	2	12	587096	587107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405757543
221	NC_018589	ATCCAG	2	12	588307	588318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405757545
222	NC_018589	AGAATT	2	12	589619	589630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405757546
223	NC_018589	TGCGTT	2	12	598173	598184	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405757554
224	NC_018589	GAGACC	2	12	601968	601979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405757559
225	NC_018589	TCTTTT	2	12	602935	602946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405757561
226	NC_018589	TTTGCT	2	12	603871	603882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405757561
227	NC_018589	TCGCTG	2	12	605295	605306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405757563
228	NC_018589	CCAATC	2	12	605525	605536	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405757563
229	NC_018589	GTACTT	2	12	611566	611577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405757569
230	NC_018589	ACTGTA	2	12	613186	613197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405757570
231	NC_018589	AGAATG	2	12	615696	615707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405757574
232	NC_018589	ACTTTT	2	12	617551	617562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405757575
233	NC_018589	GCACTT	2	12	618007	618018	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405757576
234	NC_018589	ATTTGT	6	36	618138	618173	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405757576
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456	NC_018589	AAAATG	2	12	1274401	1274412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405758273
457	NC_018589	AAAGGT	2	12	1274767	1274778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405758273
458	NC_018589	TCAAGC	2	12	1276515	1276526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405758273
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