MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2378

Total Repeats: 1190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018585	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018585	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751209
3	NC_018585	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751210
4	NC_018585	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751210
5	NC_018585	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751210
6	NC_018585	TGAAGA	2	12	9549	9560	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751211
7	NC_018585	AAAAGC	2	12	11269	11280	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405751212
8	NC_018585	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018585	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018585	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	405751218
11	NC_018585	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405751218
12	NC_018585	ATTTTC	2	12	21959	21970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405751222
13	NC_018585	CTTCAT	2	12	22978	22989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405751224
14	NC_018585	TTTTGG	2	12	23342	23353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405751224
15	NC_018585	ATTGAA	2	12	26991	27002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751227
16	NC_018585	CCAAAA	2	12	37142	37153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405751240
17	NC_018585	AATTAT	2	12	37756	37767	50 %	50 %	0 %	0 %	405751241
18	NC_018585	TCACCA	2	12	38903	38914	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405751243
19	NC_018585	CGATTA	2	12	44333	44344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751247
20	NC_018585	TTATGT	2	12	48822	48833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751250
21	NC_018585	AAAGAT	2	12	52474	52485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751253
22	NC_018585	TGAAAT	2	12	53311	53322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751254
23	NC_018585	TGGCGG	2	12	56444	56455	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	405751258
24	NC_018585	TCAAAA	2	12	56564	56575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751258
25	NC_018585	AAAAAT	2	12	59011	59022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751263
26	NC_018585	GCAGAA	2	12	62936	62947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405751266
27	NC_018585	AGGTAA	2	12	63027	63038	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751267
28	NC_018585	TGATTG	2	12	64415	64426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405751268
29	NC_018585	TGATTT	2	12	69746	69757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751273
30	NC_018585	TTTTGC	2	12	70351	70362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751274
31	NC_018585	AATATA	2	12	81811	81822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018585	AAATAA	2	12	84616	84627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751288
33	NC_018585	TAAATT	2	12	87768	87779	50 %	50 %	0 %	0 %	405751292
34	NC_018585	ATTTAT	2	12	87942	87953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018585	CTTTTT	2	12	97115	97126	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751304
36	NC_018585	ATCACT	2	12	100175	100186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405751307
37	NC_018585	GATATT	2	12	100234	100245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751307
38	NC_018585	CAGATT	2	12	103751	103762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751307
39	NC_018585	AACTAT	2	12	106527	106538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405751308
40	NC_018585	AACCAG	2	12	111765	111776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405751313
41	NC_018585	TATTAG	2	12	116058	116069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751318
42	NC_018585	TAGCAG	2	12	116121	116132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751318
43	NC_018585	TTATTT	2	12	119583	119594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751322
44	NC_018585	ATTACA	2	12	123777	123788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	405751327
45	NC_018585	TAAAAT	2	12	127501	127512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405751330
46	NC_018585	CAAAAT	2	12	127642	127653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751330
47	NC_018585	CAAGCG	2	12	128643	128654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405751330
48	NC_018585	GTTTTA	2	12	134409	134420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751338
49	NC_018585	TGATTT	2	12	136425	136436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	405751342
50	NC_018585	AAGTAA	2	12	140396	140407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751345
51	NC_018585	CCGTTA	2	12	143903	143914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751352
52	NC_018585	CAGGTT	2	12	151228	151239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018585	CAACTG	2	12	153649	153660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751361
54	NC_018585	TCTGAA	2	12	156630	156641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751367
55	NC_018585	GTTGCA	2	12	162377	162388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751375
56	NC_018585	GATTGC	2	12	162439	162450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751375
57	NC_018585	AGGCGG	2	12	168087	168098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	405751379
58	NC_018585	CGTAAC	2	12	170908	170919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751380
59	NC_018585	AGTACC	2	12	170953	170964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751380
60	NC_018585	GTTTTC	2	12	171930	171941	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751381
61	NC_018585	GTTGAT	2	12	173546	173557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	405751383
62	NC_018585	GTAAAA	2	12	173909	173920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751383
63	NC_018585	TTTTAC	2	12	175953	175964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	405751387
64	NC_018585	TTTTTA	2	12	176990	177001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751389
65	NC_018585	GCATTA	2	12	177220	177231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751389
66	NC_018585	AAAGTA	2	12	178202	178213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751390
67	NC_018585	ACACTT	2	12	179119	179130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018585	TTGCAC	2	12	181096	181107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751392
69	NC_018585	AGAAGT	2	12	183244	183255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405751393
70	NC_018585	CAATCC	2	12	185160	185171	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	405751395
71	NC_018585	AAAGAT	2	12	187171	187182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751397
72	NC_018585	TGAAGT	2	12	191416	191427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405751398
73	NC_018585	CATTGA	2	12	199549	199560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751406
74	NC_018585	TGCAGC	2	12	200204	200215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405751407
75	NC_018585	TAAAAA	2	12	202442	202453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751409
76	NC_018585	AATAAA	2	12	205448	205459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018585	AAAGCA	2	12	215654	215665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	405751421
78	NC_018585	TTCTTT	2	12	220353	220364	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751426
79	NC_018585	GAAAAA	2	12	222442	222453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751428
80	NC_018585	GAAAAA	2	12	223666	223677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751430
81	NC_018585	GCAAGT	2	12	229493	229504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751433
82	NC_018585	GAAAAC	2	12	232363	232374	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018585	TGTCGG	2	12	233413	233424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	405751436
84	NC_018585	AAAAAC	2	12	234898	234909	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405751437
85	NC_018585	GCAGAA	2	12	236442	236453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405751438
86	NC_018585	TAAAAT	2	12	239755	239766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405751443
87	NC_018585	CCAGAA	2	12	240968	240979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	405751444
88	NC_018585	ATTCAA	2	12	243257	243268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018585	AAGGAA	2	12	244828	244839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018585	TAGGCG	2	12	246481	246492	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018585	ATTCAA	2	12	249276	249287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018585	AAGGAA	2	12	250847	250858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018585	TAGGCG	2	12	252500	252511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018585	AGTCAA	2	12	254314	254325	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018585	TTTACC	2	12	254743	254754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	405751446
96	NC_018585	AGTAAA	2	12	262000	262011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	405751452
97	NC_018585	GTACGT	2	12	262806	262817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751454
98	NC_018585	AAGTCG	2	12	268075	268086	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405751459
99	NC_018585	TTATAT	2	12	269099	269110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018585	ACAGTA	2	12	269428	269439	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751461
101	NC_018585	AAAACA	2	12	269803	269814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	405751462
102	NC_018585	GCATGG	2	12	269984	269995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405751462
103	NC_018585	CTGTAG	2	12	272928	272939	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	405751467
104	NC_018585	GACAAT	2	12	274440	274451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751469
105	NC_018585	GTGAGC	2	12	274895	274906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	405751469
106	NC_018585	ATTGAT	2	12	275089	275100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	405751469
107	NC_018585	TAAAAA	2	12	276159	276170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	405751470
108	NC_018585	TGAATC	2	12	276944	276955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751471
109	NC_018585	GCTACT	2	12	278636	278647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	405751472
110	NC_018585	TTCTGA	2	12	281710	281721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	405751474
111	NC_018585	AAGAAA	2	12	284926	284937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	405751477
112	NC_018585	TTCGTG	2	12	290682	290693	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405751478
113	NC_018585	TAACAA	2	12	293987	293998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	405751481
114	NC_018585	TTTAAC	2	12	295060	295071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405751482
115	NC_018585	GTTGAG	2	12	296914	296925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405751483
116	NC_018585	ATTTTT	2	12	297187	297198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	405751483
117	NC_018585	TTTATA	2	12	297731	297742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405751484
118	NC_018585	CCAAAT	2	12	299720	299731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405751486
119	NC_018585	AGAACT	2	12	302334	302345	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751488
120	NC_018585	AACTTT	2	12	304814	304825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018585	TACAAG	2	12	306578	306589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751492
122	NC_018585	CGAAAT	2	12	306632	306643	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405751492
123	NC_018585	TAAAAA	2	12	310183	310194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018585	CATTAT	2	12	310362	310373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	405751495
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157	NC_018585	GCCATC	2	12	388618	388629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	405751563
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222	NC_018585	GGAAAA	2	12	573241	573252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405751757
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224	NC_018585	GCCGGA	2	12	576182	576193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	405751758
225	NC_018585	AGATTT	2	12	577977	577988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
226	NC_018585	GACGGC	2	12	578422	578433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	405751762
227	NC_018585	CGCACT	2	12	579234	579245	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	405751762
228	NC_018585	TTGCTT	2	12	587626	587637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	405751769
229	NC_018585	TTTTTC	2	12	587669	587680	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	405751769
230	NC_018585	GCAACC	2	12	590866	590877	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	405751774
231	NC_018585	AATCAC	2	12	592169	592180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	405751775
232	NC_018585	TACAGT	2	12	594540	594551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405751777
233	NC_018585	ATCCAG	2	12	596707	596718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	405751779
234	NC_018585	AGAATT	2	12	598019	598030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	405751780
235	NC_018585	TTTGGC	2	12	602537	602548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	405751784
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342	NC_018585	GGAGAA	2	12	878900	878911	50 %	0 %	50 %	0 %	405752060
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459	NC_018585	CTTTTT	2	12	1181480	1181491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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