MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2378

Total Repeats: 2154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018585	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018585	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	405751206
3	NC_018585	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	405751206
4	NC_018585	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	405751207
5	NC_018585	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	405751210
6	NC_018585	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	405751212
7	NC_018585	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	405751213
8	NC_018585	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	405751215
9	NC_018585	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018585	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	405751218
11	NC_018585	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	405751219
12	NC_018585	ATGAA	2	10	19330	19339	60 %	20 %	20 %	0 %	405751220
13	NC_018585	GAATG	2	10	21072	21081	40 %	20 %	40 %	0 %	405751221
14	NC_018585	TAATT	2	10	22452	22461	40 %	60 %	0 %	0 %	405751224
15	NC_018585	ATTAA	2	10	23969	23978	60 %	40 %	0 %	0 %	405751225
16	NC_018585	AAATC	2	10	24430	24439	60 %	20 %	0 %	20 %	405751225
17	NC_018585	ATTTT	2	10	25207	25216	20 %	80 %	0 %	0 %	405751226
18	NC_018585	GGATT	2	10	25552	25561	20 %	40 %	40 %	0 %	405751226
19	NC_018585	AAATG	2	10	26107	26116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018585	ATGGA	2	10	30910	30919	40 %	20 %	40 %	0 %	405751233
21	NC_018585	AATAA	2	10	33748	33757	80 %	20 %	0 %	0 %	405751235
22	NC_018585	GGTTT	2	10	34293	34302	0 %	60 %	40 %	0 %	405751236
23	NC_018585	CATAT	2	10	34625	34634	40 %	40 %	0 %	20 %	405751236
24	NC_018585	TTTCT	2	10	34908	34917	0 %	80 %	0 %	20 %	405751237
25	NC_018585	CCATA	2	10	35593	35602	40 %	20 %	0 %	40 %	405751238
26	NC_018585	GAAAA	2	10	36438	36447	80 %	0 %	20 %	0 %	405751239
27	NC_018585	AGATA	2	10	36695	36704	60 %	20 %	20 %	0 %	405751239
28	NC_018585	AATTG	2	10	37006	37015	40 %	40 %	20 %	0 %	405751240
29	NC_018585	TAAAA	2	10	37258	37267	80 %	20 %	0 %	0 %	405751240
30	NC_018585	AAAGG	2	10	37666	37675	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018585	CTATT	2	10	38162	38171	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018585	GAAAA	2	10	39248	39257	80 %	0 %	20 %	0 %	405751243
33	NC_018585	TGAAA	2	10	40403	40412	60 %	20 %	20 %	0 %	405751244
34	NC_018585	GAATG	2	10	42274	42283	40 %	20 %	40 %	0 %	405751246
35	NC_018585	AAATT	2	10	42401	42410	60 %	40 %	0 %	0 %	405751246
36	NC_018585	ATTTT	2	10	43007	43016	20 %	80 %	0 %	0 %	405751246
37	NC_018585	AAAAC	2	10	46634	46643	80 %	0 %	0 %	20 %	405751248
38	NC_018585	TTATT	2	10	48120	48129	20 %	80 %	0 %	0 %	405751250
39	NC_018585	GAAAA	2	10	49333	49342	80 %	0 %	20 %	0 %	405751250
40	NC_018585	ATAAA	2	10	50158	50167	80 %	20 %	0 %	0 %	405751251
41	NC_018585	ATTTT	2	10	51962	51971	20 %	80 %	0 %	0 %	405751253
42	NC_018585	GACAT	2	10	53175	53184	40 %	20 %	20 %	20 %	405751254
43	NC_018585	GACTT	2	10	53459	53468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018585	ATTTT	2	10	53545	53554	20 %	80 %	0 %	0 %	405751255
45	NC_018585	AAATG	2	10	54674	54683	60 %	20 %	20 %	0 %	405751256
46	NC_018585	ATGGT	2	10	55711	55720	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018585	GTAGA	2	10	55760	55769	40 %	20 %	40 %	0 %	405751257
48	NC_018585	TTACT	2	10	56742	56751	20 %	60 %	0 %	20 %	405751259
49	NC_018585	CAAAA	2	10	57249	57258	80 %	0 %	0 %	20 %	405751260
50	NC_018585	GAAAT	2	10	57399	57408	60 %	20 %	20 %	0 %	405751260
51	NC_018585	CTTAG	2	10	57498	57507	20 %	40 %	20 %	20 %	405751260
52	NC_018585	AAATA	2	10	57767	57776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018585	TAAAA	2	10	58749	58758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018585	TGCTA	2	10	58923	58932	20 %	40 %	20 %	20 %	405751263
55	NC_018585	TTTTA	2	10	59091	59100	20 %	80 %	0 %	0 %	405751263
56	NC_018585	AGTTA	2	10	60407	60416	40 %	40 %	20 %	0 %	405751264
57	NC_018585	TTATG	2	10	60956	60965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018585	AGTCT	2	10	61872	61881	20 %	40 %	20 %	20 %	405751266
59	NC_018585	TTTTA	2	10	64868	64877	20 %	80 %	0 %	0 %	405751269
60	NC_018585	AAACG	2	10	69237	69246	60 %	0 %	20 %	20 %	405751273
61	NC_018585	CAAAA	2	10	70737	70746	80 %	0 %	0 %	20 %	405751274
62	NC_018585	AACAA	2	10	72156	72165	80 %	0 %	0 %	20 %	405751276
63	NC_018585	GAGAG	2	10	77215	77224	40 %	0 %	60 %	0 %	405751278
64	NC_018585	GCAAA	2	10	78397	78406	60 %	0 %	20 %	20 %	405751281
65	NC_018585	CAATA	2	10	78462	78471	60 %	20 %	0 %	20 %	405751281
66	NC_018585	GCCTT	2	10	79265	79274	0 %	40 %	20 %	40 %	405751282
67	NC_018585	CAAAA	2	10	79642	79651	80 %	0 %	0 %	20 %	405751282
68	NC_018585	TAATT	2	10	82388	82397	40 %	60 %	0 %	0 %	405751286
69	NC_018585	AAATG	2	10	82805	82814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018585	GCCTT	2	10	83582	83591	0 %	40 %	20 %	40 %	405751287
71	NC_018585	CAAAA	2	10	83959	83968	80 %	0 %	0 %	20 %	405751287
72	NC_018585	AATTA	2	10	84901	84910	60 %	40 %	0 %	0 %	405751288
73	NC_018585	AATAG	2	10	85341	85350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018585	ATAAA	2	10	86153	86162	80 %	20 %	0 %	0 %	405751289
75	NC_018585	GAAAT	2	10	86479	86488	60 %	20 %	20 %	0 %	405751290
76	NC_018585	ATAGC	2	10	86499	86508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018585	GCTTT	2	10	87277	87286	0 %	60 %	20 %	20 %	405751292
78	NC_018585	AGTAG	2	10	88622	88631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018585	AGTAA	2	10	88873	88882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018585	TTATA	2	10	89122	89131	40 %	60 %	0 %	0 %	405751295
81	NC_018585	TATTT	2	10	89217	89226	20 %	80 %	0 %	0 %	405751296
82	NC_018585	GCTTG	2	10	91198	91207	0 %	40 %	40 %	20 %	405751298
83	NC_018585	GCGCT	2	10	93252	93261	0 %	20 %	40 %	40 %	405751300
84	NC_018585	ATTTG	2	10	95228	95237	20 %	60 %	20 %	0 %	405751301
85	NC_018585	TAAAA	2	10	96472	96481	80 %	20 %	0 %	0 %	405751303
86	NC_018585	TTTGT	2	10	97577	97586	0 %	80 %	20 %	0 %	405751305
87	NC_018585	TTTCT	2	10	98315	98324	0 %	80 %	0 %	20 %	405751305
88	NC_018585	ATTTT	2	10	98564	98573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018585	CTAAA	2	10	100676	100685	60 %	20 %	0 %	20 %	405751307
90	NC_018585	GAAAA	2	10	102019	102028	80 %	0 %	20 %	0 %	405751307
91	NC_018585	TGAAA	2	10	102261	102270	60 %	20 %	20 %	0 %	405751307
92	NC_018585	AAATT	2	10	102605	102614	60 %	40 %	0 %	0 %	405751307
93	NC_018585	AGCGG	2	10	103189	103198	20 %	0 %	60 %	20 %	405751307
94	NC_018585	GGAAA	2	10	104368	104377	60 %	0 %	40 %	0 %	405751307
95	NC_018585	CGAAA	2	10	105684	105693	60 %	0 %	20 %	20 %	405751308
96	NC_018585	AAAAG	2	10	105997	106006	80 %	0 %	20 %	0 %	405751308
97	NC_018585	TGCAT	2	10	109657	109666	20 %	40 %	20 %	20 %	405751311
98	NC_018585	TTACT	2	10	109903	109912	20 %	60 %	0 %	20 %	405751311
99	NC_018585	GTTTT	2	10	111501	111510	0 %	80 %	20 %	0 %	405751313
100	NC_018585	TGGCT	2	10	111652	111661	0 %	40 %	40 %	20 %	405751313
101	NC_018585	AGCGG	2	10	113101	113110	20 %	0 %	60 %	20 %	405751314
102	NC_018585	ATATC	2	10	120512	120521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018585	AAAAG	2	10	123200	123209	80 %	0 %	20 %	0 %	405751327
104	NC_018585	ACGGT	2	10	124744	124753	20 %	20 %	40 %	20 %	405751328
105	NC_018585	GAAAT	2	10	125983	125992	60 %	20 %	20 %	0 %	405751329
106	NC_018585	GAATT	2	10	126624	126633	40 %	40 %	20 %	0 %	405751329
107	NC_018585	CTTTA	2	10	130828	130837	20 %	60 %	0 %	20 %	405751332
108	NC_018585	AGAGA	2	10	131338	131347	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018585	CTCGA	2	10	132179	132188	20 %	20 %	20 %	40 %	405751334
110	NC_018585	TTCCA	2	10	132513	132522	20 %	40 %	0 %	40 %	405751334
111	NC_018585	TTACT	2	10	132777	132786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018585	TTTTA	2	10	133711	133720	20 %	80 %	0 %	0 %	405751336
113	NC_018585	AAAAG	2	10	133980	133989	80 %	0 %	20 %	0 %	405751337
114	NC_018585	AAAGT	2	10	135018	135027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018585	TTAGT	2	10	136140	136149	20 %	60 %	20 %	0 %	405751341
116	NC_018585	TGAAC	2	10	136822	136831	40 %	20 %	20 %	20 %	405751343
117	NC_018585	AGATG	2	10	136864	136873	40 %	20 %	40 %	0 %	405751343
118	NC_018585	TTTAT	2	10	139140	139149	20 %	80 %	0 %	0 %	405751344
119	NC_018585	AAGTG	2	10	141162	141171	40 %	20 %	40 %	0 %	405751347
120	NC_018585	AGTCT	2	10	141442	141451	20 %	40 %	20 %	20 %	405751347
121	NC_018585	TGTAA	2	10	142522	142531	40 %	40 %	20 %	0 %	405751349
122	NC_018585	AATTT	2	10	142904	142913	40 %	60 %	0 %	0 %	405751350
123	NC_018585	TTGTT	2	10	145270	145279	0 %	80 %	20 %	0 %	405751352
124	NC_018585	ATTTT	2	10	147072	147081	20 %	80 %	0 %	0 %	405751354
125	NC_018585	AAAAT	2	10	148574	148583	80 %	20 %	0 %	0 %	405751354
126	NC_018585	AACTT	2	10	149883	149892	40 %	40 %	0 %	20 %	405751357
127	NC_018585	ACAAA	2	10	149985	149994	80 %	0 %	0 %	20 %	405751357
128	NC_018585	ACTTG	2	10	150779	150788	20 %	40 %	20 %	20 %	405751357
129	NC_018585	CCACA	2	10	151120	151129	40 %	0 %	0 %	60 %	405751357
130	NC_018585	TTGGT	2	10	151575	151584	0 %	60 %	40 %	0 %	405751358
131	NC_018585	TGTTT	2	10	151918	151927	0 %	80 %	20 %	0 %	405751358
132	NC_018585	TATGA	2	10	154553	154562	40 %	40 %	20 %	0 %	405751363
133	NC_018585	TAACG	2	10	156402	156411	40 %	20 %	20 %	20 %	405751366
134	NC_018585	AGTAG	2	10	156724	156733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018585	ATAAA	2	10	157935	157944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018585	ATCCG	2	10	159067	159076	20 %	20 %	20 %	40 %	405751371
137	NC_018585	ACGGC	2	10	159688	159697	20 %	0 %	40 %	40 %	405751371
138	NC_018585	TTTAA	2	10	159760	159769	40 %	60 %	0 %	0 %	405751371
139	NC_018585	AATTT	2	10	159946	159955	40 %	60 %	0 %	0 %	405751371
140	NC_018585	GATAA	2	10	160113	160122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_018585	AATAA	2	10	161219	161228	80 %	20 %	0 %	0 %	405751373
143	NC_018585	GAATA	2	10	163180	163189	60 %	20 %	20 %	0 %	405751376
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152	NC_018585	GAATT	2	10	173352	173361	40 %	40 %	20 %	0 %	405751383
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187	NC_018585	GTGAG	2	10	217211	217220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_018585	GAGTG	2	10	221505	221514	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_018585	AGATT	2	10	223221	223230	40 %	40 %	20 %	0 %	405751429
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197	NC_018585	AGCCG	2	10	229682	229691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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248	NC_018585	GAAAC	2	10	304710	304719	60 %	0 %	20 %	20 %	405751489
249	NC_018585	ACTAA	2	10	304923	304932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_018585	ATTGC	2	10	305081	305090	20 %	40 %	20 %	20 %	405751490
251	NC_018585	GGAAT	2	10	306458	306467	40 %	20 %	40 %	0 %	405751492
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253	NC_018585	ATTTT	2	10	309790	309799	20 %	80 %	0 %	0 %	405751494
254	NC_018585	TATAA	2	10	310149	310158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018585	AGGTA	2	10	310714	310723	40 %	20 %	40 %	0 %	405751495
256	NC_018585	AAAGA	2	10	313377	313386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018585	ATTGT	2	10	314544	314553	20 %	60 %	20 %	0 %	405751499
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260	NC_018585	CTTCT	2	10	316275	316284	0 %	60 %	0 %	40 %	405751501
261	NC_018585	CAAAT	2	10	316513	316522	60 %	20 %	0 %	20 %	405751501
262	NC_018585	AGTTA	2	10	317666	317675	40 %	40 %	20 %	0 %	405751503
263	NC_018585	CGATG	2	10	319872	319881	20 %	20 %	40 %	20 %	405751504
264	NC_018585	AGAAA	2	10	327885	327894	80 %	0 %	20 %	0 %	405751513
265	NC_018585	TGCAA	2	10	328849	328858	40 %	20 %	20 %	20 %	405751514
266	NC_018585	CGAAT	2	10	329203	329212	40 %	20 %	20 %	20 %	405751514
267	NC_018585	GACAA	2	10	330745	330754	60 %	0 %	20 %	20 %	405751515
268	NC_018585	ATGGC	2	10	331610	331619	20 %	20 %	40 %	20 %	405751515
269	NC_018585	GTTAC	2	10	331714	331723	20 %	40 %	20 %	20 %	405751515
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