MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes ATCC 19117

Total Repeats: 2163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018584	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018584	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	405748337
3	NC_018584	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	405748337
4	NC_018584	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	405748338
5	NC_018584	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	405748341
6	NC_018584	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	405748343
7	NC_018584	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	405748344
8	NC_018584	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	405748346
9	NC_018584	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018584	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	405748348
11	NC_018584	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	405748350
12	NC_018584	ATGAA	2	10	19331	19340	60 %	20 %	20 %	0 %	405748351
13	NC_018584	GAATG	2	10	21073	21082	40 %	20 %	40 %	0 %	405748352
14	NC_018584	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	405748355
15	NC_018584	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	405748356
16	NC_018584	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	405748356
17	NC_018584	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	405748357
18	NC_018584	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	405748357
19	NC_018584	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018584	TCAGG	2	10	28204	28213	20 %	20 %	40 %	20 %	405748361
21	NC_018584	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	405748364
22	NC_018584	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	405748366
23	NC_018584	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	405748367
24	NC_018584	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	405748367
25	NC_018584	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	405748368
26	NC_018584	GAAAA	2	10	36437	36446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018584	AGATA	2	10	36694	36703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018584	AATTG	2	10	37005	37014	40 %	40 %	20 %	0 %	405748370
29	NC_018584	TAAAA	2	10	37257	37266	80 %	20 %	0 %	0 %	405748370
30	NC_018584	AAAGG	2	10	37665	37674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018584	TTCTA	2	10	38158	38167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018584	GAAAA	2	10	39246	39255	80 %	0 %	20 %	0 %	405748373
33	NC_018584	TGAAA	2	10	40401	40410	60 %	20 %	20 %	0 %	405748374
34	NC_018584	GAATG	2	10	42272	42281	40 %	20 %	40 %	0 %	405748376
35	NC_018584	AAATT	2	10	42399	42408	60 %	40 %	0 %	0 %	405748376
36	NC_018584	ATTTT	2	10	43005	43014	20 %	80 %	0 %	0 %	405748376
37	NC_018584	AAAAC	2	10	46632	46641	80 %	0 %	0 %	20 %	405748378
38	NC_018584	TTATT	2	10	48121	48130	20 %	80 %	0 %	0 %	405748380
39	NC_018584	GAAAA	2	10	49334	49343	80 %	0 %	20 %	0 %	405748380
40	NC_018584	ATAAA	2	10	50159	50168	80 %	20 %	0 %	0 %	405748381
41	NC_018584	ATTTT	2	10	51963	51972	20 %	80 %	0 %	0 %	405748383
42	NC_018584	GACAT	2	10	53176	53185	40 %	20 %	20 %	20 %	405748384
43	NC_018584	GACTT	2	10	53460	53469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018584	ATTTT	2	10	53546	53555	20 %	80 %	0 %	0 %	405748385
45	NC_018584	AAATG	2	10	54675	54684	60 %	20 %	20 %	0 %	405748386
46	NC_018584	ATGGT	2	10	55712	55721	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018584	GTAGA	2	10	55761	55770	40 %	20 %	40 %	0 %	405748387
48	NC_018584	TTACT	2	10	56743	56752	20 %	60 %	0 %	20 %	405748389
49	NC_018584	CAAAA	2	10	57250	57259	80 %	0 %	0 %	20 %	405748390
50	NC_018584	GAAAT	2	10	57400	57409	60 %	20 %	20 %	0 %	405748390
51	NC_018584	CTTAG	2	10	57499	57508	20 %	40 %	20 %	20 %	405748390
52	NC_018584	AAATA	2	10	57768	57777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018584	TAAAA	2	10	58750	58759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018584	TGCTA	2	10	58924	58933	20 %	40 %	20 %	20 %	405748393
55	NC_018584	TTTTA	2	10	59092	59101	20 %	80 %	0 %	0 %	405748393
56	NC_018584	AGTTA	2	10	60408	60417	40 %	40 %	20 %	0 %	405748394
57	NC_018584	TTATG	2	10	60957	60966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018584	AGTCT	2	10	61873	61882	20 %	40 %	20 %	20 %	405748395
59	NC_018584	TTTTA	2	10	64869	64878	20 %	80 %	0 %	0 %	405748398
60	NC_018584	AAACG	2	10	69238	69247	60 %	0 %	20 %	20 %	405748402
61	NC_018584	CAAAA	2	10	70738	70747	80 %	0 %	0 %	20 %	405748403
62	NC_018584	AACAA	2	10	72157	72166	80 %	0 %	0 %	20 %	405748405
63	NC_018584	ATGGA	2	10	78857	78866	40 %	20 %	40 %	0 %	405748411
64	NC_018584	AAAAT	2	10	78885	78894	80 %	20 %	0 %	0 %	405748412
65	NC_018584	ATATC	2	10	79224	79233	40 %	40 %	0 %	20 %	405748412
66	NC_018584	GTATA	2	10	80272	80281	40 %	40 %	20 %	0 %	405748413
67	NC_018584	TATTT	2	10	80412	80421	20 %	80 %	0 %	0 %	405748414
68	NC_018584	ATATA	2	10	80667	80676	60 %	40 %	0 %	0 %	405748414
69	NC_018584	AGTAG	2	10	81172	81181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018584	ATGGA	2	10	82210	82219	40 %	20 %	40 %	0 %	405748417
71	NC_018584	GAGAA	2	10	82938	82947	60 %	0 %	40 %	0 %	405748419
72	NC_018584	TAGTG	2	10	83765	83774	20 %	40 %	40 %	0 %	405748420
73	NC_018584	TAAAA	2	10	86817	86826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018584	TAGTG	2	10	87098	87107	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018584	GCTTG	2	10	89000	89009	0 %	40 %	40 %	20 %	405748426
76	NC_018584	GCGCT	2	10	91054	91063	0 %	20 %	40 %	40 %	405748428
77	NC_018584	ATTTG	2	10	93031	93040	20 %	60 %	20 %	0 %	405748429
78	NC_018584	TAAAA	2	10	94275	94284	80 %	20 %	0 %	0 %	405748431
79	NC_018584	TTTGT	2	10	95380	95389	0 %	80 %	20 %	0 %	405748433
80	NC_018584	TTTCT	2	10	96118	96127	0 %	80 %	0 %	20 %	405748433
81	NC_018584	ATTTT	2	10	96367	96376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018584	CTAAA	2	10	98479	98488	60 %	20 %	0 %	20 %	405748435
83	NC_018584	GAAAA	2	10	99822	99831	80 %	0 %	20 %	0 %	405748435
84	NC_018584	TGAAA	2	10	100064	100073	60 %	20 %	20 %	0 %	405748435
85	NC_018584	AAATT	2	10	100408	100417	60 %	40 %	0 %	0 %	405748435
86	NC_018584	AGCGG	2	10	100992	101001	20 %	0 %	60 %	20 %	405748435
87	NC_018584	GGAAA	2	10	102171	102180	60 %	0 %	40 %	0 %	405748435
88	NC_018584	CGAAA	2	10	103487	103496	60 %	0 %	20 %	20 %	405748436
89	NC_018584	AAAAG	2	10	103800	103809	80 %	0 %	20 %	0 %	405748436
90	NC_018584	TGCAT	2	10	107460	107469	20 %	40 %	20 %	20 %	405748439
91	NC_018584	TTACT	2	10	107706	107715	20 %	60 %	0 %	20 %	405748439
92	NC_018584	GTTTT	2	10	109304	109313	0 %	80 %	20 %	0 %	405748441
93	NC_018584	TGGCT	2	10	109455	109464	0 %	40 %	40 %	20 %	405748441
94	NC_018584	AGCGG	2	10	110904	110913	20 %	0 %	60 %	20 %	405748442
95	NC_018584	ATATC	2	10	118327	118336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018584	AAAAG	2	10	121015	121024	80 %	0 %	20 %	0 %	405748455
97	NC_018584	ACGGT	2	10	122559	122568	20 %	20 %	40 %	20 %	405748456
98	NC_018584	GAAAT	2	10	123798	123807	60 %	20 %	20 %	0 %	405748457
99	NC_018584	GAATT	2	10	124439	124448	40 %	40 %	20 %	0 %	405748458
100	NC_018584	CTTTA	2	10	128643	128652	20 %	60 %	0 %	20 %	405748461
101	NC_018584	AGAGA	2	10	129153	129162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018584	CTCGA	2	10	129994	130003	20 %	20 %	20 %	40 %	405748463
103	NC_018584	TTCCA	2	10	130328	130337	20 %	40 %	0 %	40 %	405748463
104	NC_018584	TTACT	2	10	130592	130601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018584	TTTTA	2	10	131526	131535	20 %	80 %	0 %	0 %	405748465
106	NC_018584	AAAAG	2	10	131795	131804	80 %	0 %	20 %	0 %	405748466
107	NC_018584	TTAGT	2	10	133955	133964	20 %	60 %	20 %	0 %	405748470
108	NC_018584	TGAAC	2	10	134637	134646	40 %	20 %	20 %	20 %	405748472
109	NC_018584	AGATG	2	10	134679	134688	40 %	20 %	40 %	0 %	405748472
110	NC_018584	TTTAT	2	10	136955	136964	20 %	80 %	0 %	0 %	405748473
111	NC_018584	AAGTG	2	10	138977	138986	40 %	20 %	40 %	0 %	405748476
112	NC_018584	AGTCT	2	10	139257	139266	20 %	40 %	20 %	20 %	405748476
113	NC_018584	TGTAA	2	10	140337	140346	40 %	40 %	20 %	0 %	405748478
114	NC_018584	AATTT	2	10	140719	140728	40 %	60 %	0 %	0 %	405748479
115	NC_018584	TTGTT	2	10	143085	143094	0 %	80 %	20 %	0 %	405748481
116	NC_018584	ATTTT	2	10	144887	144896	20 %	80 %	0 %	0 %	405748483
117	NC_018584	AAAAT	2	10	146389	146398	80 %	20 %	0 %	0 %	405748483
118	NC_018584	AACTT	2	10	147698	147707	40 %	40 %	0 %	20 %	405748486
119	NC_018584	ACAAA	2	10	147800	147809	80 %	0 %	0 %	20 %	405748486
120	NC_018584	CTTGA	2	10	148595	148604	20 %	40 %	20 %	20 %	405748486
121	NC_018584	CCACA	2	10	148935	148944	40 %	0 %	0 %	60 %	405748486
122	NC_018584	TTGGT	2	10	149390	149399	0 %	60 %	40 %	0 %	405748487
123	NC_018584	TGTTT	2	10	149733	149742	0 %	80 %	20 %	0 %	405748487
124	NC_018584	TATGA	2	10	152370	152379	40 %	40 %	20 %	0 %	405748491
125	NC_018584	TAACG	2	10	154219	154228	40 %	20 %	20 %	20 %	405748494
126	NC_018584	AGTAG	2	10	154541	154550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018584	ATAAA	2	10	155752	155761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018584	ATCCG	2	10	156884	156893	20 %	20 %	20 %	40 %	405748499
129	NC_018584	ACGGC	2	10	157505	157514	20 %	0 %	40 %	40 %	405748499
130	NC_018584	TTTAA	2	10	157577	157586	40 %	60 %	0 %	0 %	405748499
131	NC_018584	AATTT	2	10	157763	157772	40 %	60 %	0 %	0 %	405748499
132	NC_018584	GATAA	2	10	157930	157939	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018584	AAACG	2	10	158913	158922	60 %	0 %	20 %	20 %	405748501
134	NC_018584	AATAA	2	10	159036	159045	80 %	20 %	0 %	0 %	405748501
135	NC_018584	GAATA	2	10	160997	161006	60 %	20 %	20 %	0 %	405748504
136	NC_018584	TTACT	2	10	162195	162204	20 %	60 %	0 %	20 %	405748505
137	NC_018584	AGATG	2	10	162243	162252	40 %	20 %	40 %	0 %	405748505
138	NC_018584	ATATG	2	10	164910	164919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_018584	AAGGT	2	10	249343	249352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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