MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_018528	TTC	2	6	2121813	2121818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46502	NC_018528	GCA	2	6	2121838	2121843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46503	NC_018528	TCT	2	6	2121892	2121897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46504	NC_018528	AATTC	2	10	2121935	2121944	40 %	40 %	0 %	20 %	403516038
46505	NC_018528	TGT	2	6	2121959	2121964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516038
46506	NC_018528	TCAA	2	8	2121979	2121986	50 %	25 %	0 %	25 %	403516038
46507	NC_018528	CCAT	2	8	2121994	2122001	25 %	25 %	0 %	50 %	403516038
46508	NC_018528	CTT	2	6	2122002	2122007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46509	NC_018528	TCA	2	6	2122012	2122017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46510	NC_018528	CTT	2	6	2122022	2122027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46511	NC_018528	TTCT	2	8	2122032	2122039	0 %	75 %	0 %	25 %	403516038
46512	NC_018528	AAC	2	6	2122047	2122052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516038
46513	NC_018528	TTCATA	2	12	2122060	2122071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403516038
46514	NC_018528	TGGT	2	8	2122122	2122129	0 %	50 %	50 %	0 %	403516038
46515	NC_018528	TCA	2	6	2122135	2122140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46516	NC_018528	ACA	2	6	2122183	2122188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516038
46517	NC_018528	CATG	2	8	2122196	2122203	25 %	25 %	25 %	25 %	403516038
46518	NC_018528	AAT	2	6	2122222	2122227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516038
46519	NC_018528	TCA	2	6	2122235	2122240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46520	NC_018528	ACC	2	6	2122248	2122253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403516038
46521	NC_018528	TGC	2	6	2122296	2122301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46522	NC_018528	ATC	2	6	2122365	2122370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46523	NC_018528	GAC	2	6	2122385	2122390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46524	NC_018528	TCA	2	6	2122438	2122443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46525	NC_018528	ATT	2	6	2122500	2122505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516038
46526	NC_018528	CAA	2	6	2122541	2122546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516038
46527	NC_018528	AGC	2	6	2122548	2122553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46528	NC_018528	GTG	2	6	2122562	2122567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403516038
46529	NC_018528	TTCT	2	8	2122574	2122581	0 %	75 %	0 %	25 %	403516038
46530	NC_018528	AAT	2	6	2122593	2122598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516038
46531	NC_018528	CTT	2	6	2122611	2122616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46532	NC_018528	AGT	2	6	2122638	2122643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516038
46533	NC_018528	CATCAA	2	12	2122670	2122681	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46534	NC_018528	ATA	2	6	2122712	2122717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516038
46535	NC_018528	GTT	2	6	2122731	2122736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516038
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46538	NC_018528	ACA	2	6	2122837	2122842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516038
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46540	NC_018528	CTT	2	6	2122901	2122906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
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46542	NC_018528	CTTC	2	8	2122955	2122962	0 %	50 %	0 %	50 %	403516038
46543	NC_018528	TCA	2	6	2122978	2122983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
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46545	NC_018528	TTTC	2	8	2123104	2123111	0 %	75 %	0 %	25 %	403516038
46546	NC_018528	TCA	2	6	2123131	2123136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46547	NC_018528	AATT	2	8	2123148	2123155	50 %	50 %	0 %	0 %	403516038
46548	NC_018528	TCA	2	6	2123209	2123214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516038
46549	NC_018528	GAA	2	6	2123223	2123228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403516038
46550	NC_018528	GCA	2	6	2123323	2123328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46551	NC_018528	TGA	2	6	2123382	2123387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403516038
46552	NC_018528	AGC	2	6	2123388	2123393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403516038
46553	NC_018528	CTT	2	6	2123405	2123410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516038
46554	NC_018528	ACC	2	6	2123481	2123486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403516038
46555	NC_018528	ATAA	2	8	2123520	2123527	75 %	25 %	0 %	0 %	403516038
46556	NC_018528	T	6	6	2123592	2123597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46557	NC_018528	TTA	2	6	2123650	2123655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46558	NC_018528	AAT	2	6	2123679	2123684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46559	NC_018528	AGAT	2	8	2123695	2123702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46560	NC_018528	ATT	2	6	2123759	2123764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46561	NC_018528	ATTT	2	8	2123777	2123784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46562	NC_018528	ATTT	2	8	2123792	2123799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46563	NC_018528	A	6	6	2123811	2123816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46564	NC_018528	TAA	2	6	2123818	2123823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46565	NC_018528	T	7	7	2123825	2123831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46566	NC_018528	ATT	2	6	2123857	2123862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46567	NC_018528	A	6	6	2123874	2123879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46568	NC_018528	T	6	6	2123907	2123912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46569	NC_018528	ATT	2	6	2123916	2123921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403516039
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46571	NC_018528	AT	3	6	2123955	2123960	50 %	50 %	0 %	0 %	403516039
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46574	NC_018528	CTT	2	6	2124112	2124117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403516039
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46592	NC_018528	GTT	2	6	2125061	2125066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403516039
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46597	NC_018528	GTTGT	2	10	2125278	2125287	0 %	60 %	40 %	0 %	403516039
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46601	NC_018528	TGC	2	6	2125334	2125339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403516039
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46603	NC_018528	AT	3	6	2125488	2125493	50 %	50 %	0 %	0 %	403516039
46604	NC_018528	GCAC	2	8	2125530	2125537	25 %	0 %	25 %	50 %	403516039
46605	NC_018528	ATGT	2	8	2125575	2125582	25 %	50 %	25 %	0 %	403516039
46606	NC_018528	CAAG	2	8	2125708	2125715	50 %	0 %	25 %	25 %	403516039
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46608	NC_018528	CAA	3	9	2125774	2125782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403516039
46609	NC_018528	CAT	2	6	2125786	2125791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403516039
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46618	NC_018528	AAT	2	6	2126209	2126214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403516040
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.