MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018528	TGA	2	6	138706	138711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514175
3002	NC_018528	GCA	3	9	138716	138724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514175
3003	NC_018528	AAG	2	6	138729	138734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514175
3004	NC_018528	A	6	6	138765	138770	100 %	0 %	0 %	0 %	403514175
3005	NC_018528	ATT	2	6	138938	138943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514175
3006	NC_018528	AAG	2	6	138952	138957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514175
3007	NC_018528	GGT	2	6	139028	139033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514175
3008	NC_018528	AGT	2	6	139036	139041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514175
3009	NC_018528	GTAT	2	8	139083	139090	25 %	50 %	25 %	0 %	403514175
3010	NC_018528	GTT	2	6	139096	139101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514175
3011	NC_018528	GAA	2	6	139103	139108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514175
3012	NC_018528	TTGA	2	8	139142	139149	25 %	50 %	25 %	0 %	403514175
3013	NC_018528	AAG	2	6	139175	139180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514175
3014	NC_018528	ACT	2	6	139235	139240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514176
3015	NC_018528	GAA	2	6	139256	139261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514176
3016	NC_018528	ATC	2	6	139395	139400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514176
3017	NC_018528	GGC	2	6	139468	139473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514176
3018	NC_018528	GAA	2	6	139505	139510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514176
3019	NC_018528	ATG	2	6	139545	139550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514176
3020	NC_018528	CAA	2	6	139562	139567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514176
3021	NC_018528	TCAAA	2	10	139604	139613	60 %	20 %	0 %	20 %	403514176
3022	NC_018528	TTGA	2	8	139673	139680	25 %	50 %	25 %	0 %	403514176
3023	NC_018528	TGC	2	6	139696	139701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514176
3024	NC_018528	ATA	2	6	139710	139715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514176
3025	NC_018528	GCT	2	6	139727	139732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514176
3026	NC_018528	GTT	2	6	139751	139756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514176
3027	NC_018528	TGA	2	6	139759	139764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514176
3028	NC_018528	TGC	2	6	139783	139788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514176
3029	NC_018528	GAA	2	6	139799	139804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514176
3030	NC_018528	AGA	2	6	139810	139815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514176
3031	NC_018528	AAG	2	6	139830	139835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514176
3032	NC_018528	ATT	2	6	139850	139855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514176
3033	NC_018528	A	6	6	139877	139882	100 %	0 %	0 %	0 %	403514176
3034	NC_018528	TGG	2	6	139946	139951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514176
3035	NC_018528	A	6	6	139953	139958	100 %	0 %	0 %	0 %	403514176
3036	NC_018528	AAGA	2	8	139971	139978	75 %	0 %	25 %	0 %	403514176
3037	NC_018528	A	6	6	139986	139991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_018528	TAA	2	6	140041	140046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_018528	GTT	2	6	140067	140072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_018528	TGC	2	6	140118	140123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514177
3041	NC_018528	TTA	2	6	140195	140200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514177
3042	NC_018528	TTGA	2	8	140224	140231	25 %	50 %	25 %	0 %	403514177
3043	NC_018528	GA	3	6	140268	140273	50 %	0 %	50 %	0 %	403514177
3044	NC_018528	TAT	2	6	140294	140299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514177
3045	NC_018528	TAA	2	6	140331	140336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514177
3046	NC_018528	TA	3	6	140337	140342	50 %	50 %	0 %	0 %	403514177
3047	NC_018528	TTC	2	6	140346	140351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514177
3048	NC_018528	AAC	2	6	140358	140363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514177
3049	NC_018528	A	6	6	140404	140409	100 %	0 %	0 %	0 %	403514177
3050	NC_018528	TAG	2	6	140516	140521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514177
3051	NC_018528	TTTA	2	8	140549	140556	25 %	75 %	0 %	0 %	403514177
3052	NC_018528	CA	3	6	140588	140593	50 %	0 %	0 %	50 %	403514177
3053	NC_018528	CTT	2	6	140631	140636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514177
3054	NC_018528	ATTG	2	8	140643	140650	25 %	50 %	25 %	0 %	403514177
3055	NC_018528	TAA	2	6	140661	140666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514177
3056	NC_018528	A	7	7	140665	140671	100 %	0 %	0 %	0 %	403514177
3057	NC_018528	GAAAT	2	10	140758	140767	60 %	20 %	20 %	0 %	403514177
3058	NC_018528	ATT	2	6	140866	140871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514177
3059	NC_018528	AAGA	2	8	140899	140906	75 %	0 %	25 %	0 %	403514177
3060	NC_018528	ATA	3	9	141035	141043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514177
3061	NC_018528	GTC	2	6	141124	141129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514177
3062	NC_018528	TAAAGA	2	12	141159	141170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514177
3063	NC_018528	TTTA	2	8	141180	141187	25 %	75 %	0 %	0 %	403514177
3064	NC_018528	AAG	2	6	141191	141196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514177
3065	NC_018528	TTG	2	6	141229	141234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514178
3066	NC_018528	TTG	2	6	141256	141261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514178
3067	NC_018528	AATTTT	2	12	141359	141370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514178
3068	NC_018528	ATT	2	6	141399	141404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514178
3069	NC_018528	CTT	2	6	141455	141460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514178
3070	NC_018528	TTTG	2	8	141463	141470	0 %	75 %	25 %	0 %	403514178
3071	NC_018528	ATTT	2	8	141482	141489	25 %	75 %	0 %	0 %	403514178
3072	NC_018528	ATT	2	6	141542	141547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514178
3073	NC_018528	TTGCAG	2	12	141589	141600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403514178
3074	NC_018528	AGC	2	6	141635	141640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514178
3075	NC_018528	TTA	2	6	141660	141665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514178
3076	NC_018528	GAA	3	9	141696	141704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514178
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3079	NC_018528	A	6	6	141959	141964	100 %	0 %	0 %	0 %	403514178
3080	NC_018528	TAA	2	6	141996	142001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514179
3081	NC_018528	GGT	2	6	142087	142092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514179
3082	NC_018528	TAA	2	6	142143	142148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514179
3083	NC_018528	TACT	2	8	142229	142236	25 %	50 %	0 %	25 %	403514179
3084	NC_018528	TGG	2	6	142314	142319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514179
3085	NC_018528	TAGT	2	8	142325	142332	25 %	50 %	25 %	0 %	403514179
3086	NC_018528	TAA	2	6	142338	142343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514179
3087	NC_018528	TAA	2	6	142383	142388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514179
3088	NC_018528	GAT	2	6	142390	142395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514179
3089	NC_018528	TAA	2	6	142404	142409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514179
3090	NC_018528	GAT	2	6	142465	142470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514179
3091	NC_018528	ATT	2	6	142500	142505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514179
3092	NC_018528	ATTT	2	8	142545	142552	25 %	75 %	0 %	0 %	403514179
3093	NC_018528	GAT	2	6	142564	142569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514179
3094	NC_018528	CAATT	2	10	142587	142596	40 %	40 %	0 %	20 %	403514179
3095	NC_018528	GAATAA	2	12	142614	142625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514179
3096	NC_018528	TAA	2	6	142831	142836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_018528	GAA	2	6	142886	142891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514180
3098	NC_018528	ATCG	2	8	142899	142906	25 %	25 %	25 %	25 %	403514180
3099	NC_018528	ATT	2	6	142947	142952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514180
3100	NC_018528	ATT	2	6	142973	142978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514180
3101	NC_018528	GTT	2	6	143015	143020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514180
3102	NC_018528	ATC	2	6	143039	143044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514180
3103	NC_018528	A	6	6	143052	143057	100 %	0 %	0 %	0 %	403514180
3104	NC_018528	A	6	6	143074	143079	100 %	0 %	0 %	0 %	403514180
3105	NC_018528	TCA	2	6	143086	143091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_018528	T	6	6	143101	143106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018528	ATT	2	6	143115	143120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514181
3108	NC_018528	T	7	7	143122	143128	0 %	100 %	0 %	0 %	403514181
3109	NC_018528	AGA	2	6	143135	143140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514181
3110	NC_018528	CTT	2	6	143144	143149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514181
3111	NC_018528	CAG	2	6	143150	143155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514181
3112	NC_018528	CAA	2	6	143156	143161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514181
3113	NC_018528	GAT	2	6	143170	143175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514181
3114	NC_018528	AAGT	2	8	143252	143259	50 %	25 %	25 %	0 %	403514181
3115	NC_018528	TCTT	2	8	143339	143346	0 %	75 %	0 %	25 %	403514181
3116	NC_018528	CTAG	2	8	143446	143453	25 %	25 %	25 %	25 %	403514181
3117	NC_018528	GAT	2	6	143480	143485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514181
3118	NC_018528	TAG	2	6	143507	143512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514181
3119	NC_018528	AACGCA	2	12	143606	143617	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403514181
3120	NC_018528	CAT	2	6	143675	143680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514181
3121	NC_018528	ACT	2	6	143731	143736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514181
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3123	NC_018528	GCT	2	6	143777	143782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514181
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3239	NC_018528	ATT	2	6	149413	149418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3241	NC_018528	GGA	2	6	149489	149494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_018528	TGC	2	6	149828	149833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514186
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3326	NC_018528	ATA	2	6	153481	153486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3354	NC_018528	AG	3	6	154377	154382	50 %	0 %	50 %	0 %	403514191
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3361	NC_018528	A	6	6	154516	154521	100 %	0 %	0 %	0 %	403514191
3362	NC_018528	TAAAGA	2	12	154578	154589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514191
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3369	NC_018528	ATA	2	6	154997	155002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
3370	NC_018528	ATA	2	6	155021	155026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514191
3371	NC_018528	GAA	2	6	155059	155064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514191
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3496	NC_018528	TCA	2	6	160580	160585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514194
3497	NC_018528	GAT	2	6	160686	160691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514194
3498	NC_018528	TTC	2	6	160701	160706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514194
3499	NC_018528	CTA	2	6	160720	160725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514194
3500	NC_018528	GAA	2	6	160794	160799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514194

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