MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_018528	TGCAAC	2	12	1359685	1359696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403515314
30002	NC_018528	AGT	2	6	1359727	1359732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515314
30003	NC_018528	GAAT	2	8	1359763	1359770	50 %	25 %	25 %	0 %	403515314
30004	NC_018528	ATG	2	6	1359857	1359862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515314
30005	NC_018528	CAC	2	6	1359867	1359872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515314
30006	NC_018528	CTT	2	6	1359885	1359890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515314
30007	NC_018528	CTT	2	6	1359910	1359915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515314
30008	NC_018528	AGT	2	6	1359960	1359965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515314
30009	NC_018528	TGA	2	6	1359999	1360004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515314
30010	NC_018528	CTTG	2	8	1360080	1360087	0 %	50 %	25 %	25 %	403515314
30011	NC_018528	TGG	3	9	1360246	1360254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515314
30012	NC_018528	TCA	2	6	1360310	1360315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515314
30013	NC_018528	TCC	2	6	1360387	1360392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30014	NC_018528	A	7	7	1360395	1360401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30015	NC_018528	ACC	2	6	1360443	1360448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30016	NC_018528	ATTT	2	8	1360640	1360647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_018528	A	6	6	1360651	1360656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_018528	GAA	2	6	1360666	1360671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_018528	T	6	6	1360697	1360702	0 %	100 %	0 %	0 %	403515315
30020	NC_018528	AATT	2	8	1360712	1360719	50 %	50 %	0 %	0 %	403515315
30021	NC_018528	CGA	2	6	1360737	1360742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515315
30022	NC_018528	ATT	2	6	1360814	1360819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515315
30023	NC_018528	TGT	2	6	1360866	1360871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515315
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30025	NC_018528	T	7	7	1360979	1360985	0 %	100 %	0 %	0 %	403515315
30026	NC_018528	TTC	2	6	1360988	1360993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515315
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30028	NC_018528	A	6	6	1361124	1361129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30029	NC_018528	AAT	2	6	1361189	1361194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30030	NC_018528	TAC	2	6	1361213	1361218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30031	NC_018528	AT	3	6	1361227	1361232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30032	NC_018528	A	7	7	1361240	1361246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_018528	TA	3	6	1361314	1361319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30034	NC_018528	TA	3	6	1361350	1361355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30035	NC_018528	TAT	3	9	1361394	1361402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30036	NC_018528	CAC	2	6	1361422	1361427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30037	NC_018528	AAT	2	6	1361494	1361499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30038	NC_018528	CAA	2	6	1361523	1361528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30039	NC_018528	TGAT	2	8	1361669	1361676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30040	NC_018528	CATCTT	2	12	1361696	1361707	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30041	NC_018528	ATGATA	2	12	1361753	1361764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_018528	TCT	2	6	1361785	1361790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30043	NC_018528	AAT	2	6	1361830	1361835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_018528	ATT	2	6	1361873	1361878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_018528	TGC	2	6	1361895	1361900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30046	NC_018528	CTT	2	6	1361903	1361908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30047	NC_018528	AAT	2	6	1361939	1361944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30048	NC_018528	CTA	2	6	1362037	1362042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30049	NC_018528	T	6	6	1362068	1362073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_018528	GCAA	2	8	1362216	1362223	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30051	NC_018528	CAA	2	6	1362311	1362316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30052	NC_018528	TAA	2	6	1362329	1362334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30053	NC_018528	T	6	6	1362356	1362361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30054	NC_018528	ATA	2	6	1362377	1362382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30055	NC_018528	TG	3	6	1362415	1362420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_018528	TCC	2	6	1362437	1362442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30057	NC_018528	GAA	2	6	1362485	1362490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30058	NC_018528	TAT	2	6	1362494	1362499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30059	NC_018528	T	6	6	1362507	1362512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30060	NC_018528	TGCA	2	8	1362556	1362563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30061	NC_018528	CAT	2	6	1362671	1362676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30062	NC_018528	AAAT	2	8	1362757	1362764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30063	NC_018528	GCAA	2	8	1362769	1362776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30064	NC_018528	A	6	6	1362922	1362927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30065	NC_018528	TAAA	2	8	1363102	1363109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30066	NC_018528	ATCT	2	8	1363162	1363169	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30067	NC_018528	T	6	6	1363169	1363174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30068	NC_018528	TTTCCT	2	12	1363195	1363206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30069	NC_018528	AAAT	2	8	1363258	1363265	75 %	25 %	0 %	0 %	403515316
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30074	NC_018528	A	6	6	1363589	1363594	100 %	0 %	0 %	0 %	403515316
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30080	NC_018528	T	6	6	1363977	1363982	0 %	100 %	0 %	0 %	403515316
30081	NC_018528	CAT	2	6	1364012	1364017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515316
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30089	NC_018528	AAAT	2	8	1364257	1364264	75 %	25 %	0 %	0 %	403515317
30090	NC_018528	GTG	2	6	1364286	1364291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515317
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30094	NC_018528	CT	3	6	1364517	1364522	0 %	50 %	0 %	50 %	403515317
30095	NC_018528	AATT	2	8	1364524	1364531	50 %	50 %	0 %	0 %	403515317
30096	NC_018528	TCTTA	2	10	1364537	1364546	20 %	60 %	0 %	20 %	403515317
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30099	NC_018528	TTA	3	9	1364590	1364598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30101	NC_018528	TTA	2	6	1364624	1364629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30102	NC_018528	TTA	2	6	1364649	1364654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30103	NC_018528	ACA	2	6	1364664	1364669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30104	NC_018528	AAT	2	6	1364784	1364789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515318
30105	NC_018528	TG	3	6	1364799	1364804	0 %	50 %	50 %	0 %	403515318
30106	NC_018528	CTT	2	6	1364827	1364832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515318
30107	NC_018528	AAAG	2	8	1364834	1364841	75 %	0 %	25 %	0 %	403515318
30108	NC_018528	ATT	2	6	1364971	1364976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515318
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30113	NC_018528	ATT	2	6	1365085	1365090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515318
30114	NC_018528	TGCG	2	8	1365308	1365315	0 %	25 %	50 %	25 %	403515318
30115	NC_018528	CTT	2	6	1365343	1365348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515318
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30120	NC_018528	CGC	2	6	1365522	1365527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515318
30121	NC_018528	TTAG	2	8	1365542	1365549	25 %	50 %	25 %	0 %	403515318
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30123	NC_018528	ATC	2	6	1365607	1365612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515318
30124	NC_018528	TGAC	2	8	1365614	1365621	25 %	25 %	25 %	25 %	403515318
30125	NC_018528	GCT	2	6	1365637	1365642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515318
30126	NC_018528	AAT	2	6	1365663	1365668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515318
30127	NC_018528	ATT	2	6	1365794	1365799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515318
30128	NC_018528	TGA	2	6	1365801	1365806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515318
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30130	NC_018528	GAG	2	6	1365890	1365895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30137	NC_018528	GTG	2	6	1366143	1366148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30138	NC_018528	ATT	2	6	1366239	1366244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515320
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30155	NC_018528	TGATC	2	10	1366872	1366881	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30156	NC_018528	AACT	2	8	1366959	1366966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30157	NC_018528	ATG	2	6	1366972	1366977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30159	NC_018528	TAT	2	6	1367026	1367031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30160	NC_018528	TTTA	2	8	1367068	1367075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30161	NC_018528	CAC	2	6	1367095	1367100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30162	NC_018528	AT	3	6	1367112	1367117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30163	NC_018528	A	6	6	1367168	1367173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30164	NC_018528	AAAT	2	8	1367178	1367185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30165	NC_018528	A	6	6	1367201	1367206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30166	NC_018528	ATTT	2	8	1367223	1367230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30211	NC_018528	TAA	2	6	1369158	1369163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30213	NC_018528	TCT	2	6	1369197	1369202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30215	NC_018528	ATA	2	6	1369282	1369287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30232	NC_018528	CAT	2	6	1369990	1369995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515323
30233	NC_018528	ATTG	2	8	1370007	1370014	25 %	50 %	25 %	0 %	403515323
30234	NC_018528	ACC	2	6	1370066	1370071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515323
30235	NC_018528	TCA	2	6	1370125	1370130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515323
30236	NC_018528	CCTTAG	2	12	1370236	1370247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403515323
30237	NC_018528	AGT	2	6	1370261	1370266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515323
30238	NC_018528	ACC	2	6	1370348	1370353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515323
30239	NC_018528	CAT	2	6	1370360	1370365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515323
30240	NC_018528	CAG	2	6	1370377	1370382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515323
30241	NC_018528	AATA	2	8	1370511	1370518	75 %	25 %	0 %	0 %	403515323
30242	NC_018528	ACCA	2	8	1370522	1370529	50 %	0 %	0 %	50 %	403515323
30243	NC_018528	AAG	2	6	1370632	1370637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515323
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30358	NC_018528	GAC	2	6	1375850	1375855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515328
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