MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018528	TGA	2	6	47553	47558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514082
1002	NC_018528	AAG	2	6	47593	47598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514082
1003	NC_018528	CTT	2	6	47632	47637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514082
1004	NC_018528	TGAA	2	8	47738	47745	50 %	25 %	25 %	0 %	403514082
1005	NC_018528	GAT	2	6	47794	47799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514082
1006	NC_018528	AGA	2	6	47820	47825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514082
1007	NC_018528	GTT	2	6	47847	47852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514082
1008	NC_018528	ATA	2	6	47864	47869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514082
1009	NC_018528	CA	3	6	47879	47884	50 %	0 %	0 %	50 %	403514082
1010	NC_018528	TAA	2	6	47943	47948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514082
1011	NC_018528	GAT	3	9	47974	47982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514082
1012	NC_018528	ACG	2	6	48075	48080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514082
1013	NC_018528	ATT	2	6	48144	48149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514082
1014	NC_018528	AGA	2	6	48162	48167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514082
1015	NC_018528	A	6	6	48174	48179	100 %	0 %	0 %	0 %	403514082
1016	NC_018528	TAA	2	6	48180	48185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514082
1017	NC_018528	AGC	2	6	48243	48248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514082
1018	NC_018528	AAGA	2	8	48286	48293	75 %	0 %	25 %	0 %	403514082
1019	NC_018528	AGT	2	6	48298	48303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514082
1020	NC_018528	AAT	2	6	48307	48312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514082
1021	NC_018528	ACTAA	2	10	48319	48328	60 %	20 %	0 %	20 %	403514082
1022	NC_018528	AGATGA	2	12	48348	48359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514082
1023	NC_018528	TGC	2	6	48405	48410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514082
1024	NC_018528	AAATA	2	10	48511	48520	80 %	20 %	0 %	0 %	403514082
1025	NC_018528	GATA	2	8	48547	48554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018528	TAT	2	6	48572	48577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018528	ATA	2	6	48608	48613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514083
1028	NC_018528	ATT	2	6	48634	48639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514083
1029	NC_018528	T	6	6	48646	48651	0 %	100 %	0 %	0 %	403514083
1030	NC_018528	TGGC	2	8	48666	48673	0 %	25 %	50 %	25 %	403514083
1031	NC_018528	TCAA	2	8	48694	48701	50 %	25 %	0 %	25 %	403514083
1032	NC_018528	ATC	2	6	48704	48709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514083
1033	NC_018528	CTTT	2	8	48726	48733	0 %	75 %	0 %	25 %	403514083
1034	NC_018528	ATT	2	6	48905	48910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514083
1035	NC_018528	TGC	2	6	48980	48985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514083
1036	NC_018528	ATGG	2	8	49046	49053	25 %	25 %	50 %	0 %	403514083
1037	NC_018528	TAC	2	6	49125	49130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514083
1038	NC_018528	ATCA	2	8	49153	49160	50 %	25 %	0 %	25 %	403514083
1039	NC_018528	CAT	2	6	49234	49239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514083
1040	NC_018528	GCA	2	6	49248	49253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514083
1041	NC_018528	A	6	6	49357	49362	100 %	0 %	0 %	0 %	403514083
1042	NC_018528	A	6	6	49372	49377	100 %	0 %	0 %	0 %	403514083
1043	NC_018528	T	7	7	49420	49426	0 %	100 %	0 %	0 %	403514084
1044	NC_018528	T	6	6	49452	49457	0 %	100 %	0 %	0 %	403514084
1045	NC_018528	AT	3	6	49544	49549	50 %	50 %	0 %	0 %	403514084
1046	NC_018528	GTTC	2	8	49565	49572	0 %	50 %	25 %	25 %	403514084
1047	NC_018528	CCA	2	6	49651	49656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514084
1048	NC_018528	TAG	2	6	49676	49681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514084
1049	NC_018528	T	6	6	49709	49714	0 %	100 %	0 %	0 %	403514084
1050	NC_018528	AATT	2	8	49736	49743	50 %	50 %	0 %	0 %	403514084
1051	NC_018528	TTC	2	6	49821	49826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514084
1052	NC_018528	AAGAT	2	10	49860	49869	60 %	20 %	20 %	0 %	403514084
1053	NC_018528	TCA	2	6	49876	49881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514084
1054	NC_018528	T	6	6	50008	50013	0 %	100 %	0 %	0 %	403514085
1055	NC_018528	GTAT	2	8	50073	50080	25 %	50 %	25 %	0 %	403514085
1056	NC_018528	CAATG	2	10	50238	50247	40 %	20 %	20 %	20 %	403514085
1057	NC_018528	CAAC	2	8	50257	50264	50 %	0 %	0 %	50 %	403514085
1058	NC_018528	TAAAGT	2	12	50364	50375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514085
1059	NC_018528	GGAATA	2	12	50413	50424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514085
1060	NC_018528	TAC	2	6	50442	50447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514085
1061	NC_018528	TTA	2	6	50549	50554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514086
1062	NC_018528	TCT	2	6	50622	50627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514086
1063	NC_018528	T	6	6	50638	50643	0 %	100 %	0 %	0 %	403514086
1064	NC_018528	T	6	6	50692	50697	0 %	100 %	0 %	0 %	403514086
1065	NC_018528	TAA	2	6	50706	50711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514086
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1067	NC_018528	ATT	2	6	50821	50826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514086
1068	NC_018528	A	6	6	50854	50859	100 %	0 %	0 %	0 %	403514086
1069	NC_018528	T	6	6	50904	50909	0 %	100 %	0 %	0 %	403514086
1070	NC_018528	ATT	2	6	50921	50926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514087
1071	NC_018528	CTT	2	6	51008	51013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514087
1072	NC_018528	TTA	2	6	51058	51063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514087
1073	NC_018528	GCTT	2	8	51079	51086	0 %	50 %	25 %	25 %	403514087
1074	NC_018528	CCA	2	6	51094	51099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514087
1075	NC_018528	CAG	2	6	51272	51277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514087
1076	NC_018528	CTTG	2	8	51403	51410	0 %	50 %	25 %	25 %	403514087
1077	NC_018528	AC	3	6	51464	51469	50 %	0 %	0 %	50 %	403514087
1078	NC_018528	GTG	2	6	51505	51510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514087
1079	NC_018528	TTC	2	6	51537	51542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514087
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1081	NC_018528	ATA	2	6	51751	51756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514087
1082	NC_018528	AGC	2	6	51810	51815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514087
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1084	NC_018528	CGT	2	6	51938	51943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514087
1085	NC_018528	ATT	2	6	52056	52061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514087
1086	NC_018528	TAT	2	6	52085	52090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514087
1087	NC_018528	GGT	2	6	52103	52108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514087
1088	NC_018528	TGA	2	6	52139	52144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514087
1089	NC_018528	ACG	2	6	52185	52190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514087
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1093	NC_018528	ATCA	2	8	52434	52441	50 %	25 %	0 %	25 %	403514087
1094	NC_018528	AGCG	2	8	52442	52449	25 %	0 %	50 %	25 %	403514087
1095	NC_018528	GTA	2	6	52488	52493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514087
1096	NC_018528	ATT	2	6	52515	52520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514087
1097	NC_018528	TGAT	2	8	52633	52640	25 %	50 %	25 %	0 %	403514087
1098	NC_018528	CGC	3	9	52667	52675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514087
1099	NC_018528	CTT	2	6	52721	52726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514087
1100	NC_018528	CAA	2	6	52795	52800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514087
1101	NC_018528	GTTA	2	8	52914	52921	25 %	50 %	25 %	0 %	403514087
1102	NC_018528	TCA	2	6	52924	52929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514087
1103	NC_018528	T	7	7	53026	53032	0 %	100 %	0 %	0 %	403514087
1104	NC_018528	TAG	2	6	53144	53149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514087
1105	NC_018528	ATT	2	6	53177	53182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018528	CAT	2	6	53197	53202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_018528	A	6	6	53316	53321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018528	T	6	6	53322	53327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018528	A	6	6	53355	53360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018528	AAT	2	6	53438	53443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514088
1111	NC_018528	GTA	2	6	53462	53467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514088
1112	NC_018528	TTG	2	6	53478	53483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514088
1113	NC_018528	TGCG	2	8	53499	53506	0 %	25 %	50 %	25 %	403514088
1114	NC_018528	ATG	2	6	53507	53512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514088
1115	NC_018528	GTT	2	6	53609	53614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514088
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1117	NC_018528	T	6	6	53647	53652	0 %	100 %	0 %	0 %	403514088
1118	NC_018528	TCG	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514088
1119	NC_018528	TTG	2	6	53744	53749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514088
1120	NC_018528	ACGCA	2	10	53754	53763	40 %	0 %	20 %	40 %	403514088
1121	NC_018528	ATC	2	6	53783	53788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514088
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1123	NC_018528	TGA	2	6	53847	53852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514088
1124	NC_018528	TAC	2	6	53854	53859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514088
1125	NC_018528	CTT	2	6	53881	53886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514088
1126	NC_018528	A	6	6	53902	53907	100 %	0 %	0 %	0 %	403514088
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1244	NC_018528	AAAAC	2	10	58720	58729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1247	NC_018528	T	7	7	58945	58951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_018528	CAA	2	6	59019	59024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514095
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1255	NC_018528	GAA	2	6	59196	59201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514095
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