MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018528	TA	3	6	23768	23773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018528	TAT	2	6	23781	23786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018528	A	6	6	23792	23797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018528	GATT	2	8	23855	23862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018528	T	6	6	23861	23866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018528	TTTA	2	8	23871	23878	25 %	75 %	0 %	0 %	403514056
507	NC_018528	AGA	2	6	24104	24109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514057
508	NC_018528	CAG	2	6	24111	24116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514057
509	NC_018528	CAG	2	6	24200	24205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514057
510	NC_018528	TCC	2	6	24262	24267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403514057
511	NC_018528	CATGA	2	10	24294	24303	40 %	20 %	20 %	20 %	403514057
512	NC_018528	GAAA	2	8	24376	24383	75 %	0 %	25 %	0 %	403514057
513	NC_018528	AGC	2	6	24424	24429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514057
514	NC_018528	AGT	2	6	24467	24472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514057
515	NC_018528	GTAG	2	8	24558	24565	25 %	25 %	50 %	0 %	403514057
516	NC_018528	AGA	2	6	24581	24586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514057
517	NC_018528	ATC	2	6	24631	24636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514057
518	NC_018528	T	6	6	24686	24691	0 %	100 %	0 %	0 %	403514057
519	NC_018528	AATCA	2	10	24693	24702	60 %	20 %	0 %	20 %	403514057
520	NC_018528	TC	3	6	24707	24712	0 %	50 %	0 %	50 %	403514057
521	NC_018528	TGA	2	6	24740	24745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514057
522	NC_018528	TGC	2	6	24769	24774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514057
523	NC_018528	TGA	2	6	24796	24801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514057
524	NC_018528	CCAG	2	8	24900	24907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_018528	CAGT	2	8	24941	24948	25 %	25 %	25 %	25 %	403514058
526	NC_018528	TTG	2	6	24975	24980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514058
527	NC_018528	TTGA	2	8	25014	25021	25 %	50 %	25 %	0 %	403514058
528	NC_018528	TCAT	2	8	25051	25058	25 %	50 %	0 %	25 %	403514058
529	NC_018528	TTC	2	6	25066	25071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018528	T	6	6	25084	25089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018528	AATT	2	8	25140	25147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018528	TCAT	2	8	25155	25162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_018528	A	6	6	25196	25201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018528	GTAA	2	8	25202	25209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018528	TAA	3	9	25207	25215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018528	TAT	2	6	25219	25224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018528	TAT	2	6	25243	25248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018528	ACT	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018528	ATT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018528	AG	3	6	25325	25330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018528	ATTA	2	8	25404	25411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018528	AAT	2	6	25429	25434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018528	TAATAT	2	12	25507	25518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018528	AGAT	2	8	25524	25531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018528	TGG	2	6	25551	25556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018528	TTA	2	6	25595	25600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018528	A	7	7	25607	25613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018528	A	6	6	25641	25646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018528	GAT	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018528	TAA	2	6	25686	25691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018528	AAT	2	6	25707	25712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514059
552	NC_018528	A	6	6	25810	25815	100 %	0 %	0 %	0 %	403514059
553	NC_018528	ATA	2	6	25844	25849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514059
554	NC_018528	TAC	2	6	25857	25862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514059
555	NC_018528	TAG	2	6	25955	25960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514059
556	NC_018528	TTTA	2	8	26020	26027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018528	AAT	2	6	26030	26035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018528	TCAAAT	2	12	26073	26084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514060
559	NC_018528	CTC	2	6	26167	26172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403514060
560	NC_018528	TAT	2	6	26173	26178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514060
561	NC_018528	TAG	2	6	26180	26185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514060
562	NC_018528	CTG	2	6	26186	26191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514060
563	NC_018528	ATT	2	6	26209	26214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514060
564	NC_018528	TA	3	6	26258	26263	50 %	50 %	0 %	0 %	403514060
565	NC_018528	TGA	2	6	26268	26273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514060
566	NC_018528	TGC	2	6	26298	26303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514060
567	NC_018528	ATT	2	6	26338	26343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514060
568	NC_018528	GAA	2	6	26350	26355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514060
569	NC_018528	TAT	2	6	26384	26389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514060
570	NC_018528	AAC	2	6	26429	26434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514060
571	NC_018528	AATA	2	8	26446	26453	75 %	25 %	0 %	0 %	403514060
572	NC_018528	ATA	3	9	26462	26470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514060
573	NC_018528	ATC	2	6	26650	26655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514060
574	NC_018528	A	7	7	26658	26664	100 %	0 %	0 %	0 %	403514060
575	NC_018528	ATT	2	6	26714	26719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514060
576	NC_018528	TAAA	2	8	26782	26789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018528	AATT	2	8	26794	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018528	CTG	2	6	26814	26819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_018528	CTA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_018528	TA	3	6	27015	27020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018528	TGT	3	9	27037	27045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018528	T	6	6	27070	27075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018528	TTTG	2	8	27088	27095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018528	AAT	2	6	27097	27102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018528	GCC	2	6	27113	27118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_018528	AAT	2	6	27235	27240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018528	T	6	6	27245	27250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018528	ATT	2	6	27275	27280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018528	TGG	2	6	27300	27305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018528	ATAA	2	8	27404	27411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018528	ATT	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018528	TTTCA	2	10	27447	27456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
593	NC_018528	TA	3	6	27474	27479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018528	ATT	2	6	27484	27489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018528	A	6	6	27498	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018528	ATGG	2	8	27517	27524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018528	TGTA	2	8	27538	27545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018528	AAAT	2	8	27580	27587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018528	AAAG	2	8	27598	27605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018528	T	6	6	27615	27620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018528	ATT	2	6	27623	27628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018528	GTG	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018528	AAT	2	6	27661	27666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018528	A	6	6	27688	27693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018528	TAC	2	6	27705	27710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_018528	ATT	2	6	27722	27727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018528	ATA	2	6	27734	27739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018528	ATT	2	6	27745	27750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018528	TAG	2	6	27787	27792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018528	AGG	2	6	27832	27837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018528	CTG	2	6	27879	27884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018528	AAG	2	6	27949	27954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018528	A	6	6	28011	28016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018528	GTT	2	6	28128	28133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018528	TTC	2	6	28167	28172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_018528	ATTTT	2	10	28177	28186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018528	ATA	2	6	28261	28266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018528	T	7	7	28315	28321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018528	T	7	7	28323	28329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018528	GTA	2	6	28332	28337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018528	TAAA	2	8	28348	28355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018528	TTTA	2	8	28356	28363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018528	TGA	2	6	28393	28398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018528	T	8	8	28455	28462	0 %	100 %	0 %	0 %	403514061
625	NC_018528	A	7	7	28473	28479	100 %	0 %	0 %	0 %	403514061
626	NC_018528	AAT	2	6	28548	28553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514061
627	NC_018528	TAAA	2	8	28593	28600	75 %	25 %	0 %	0 %	403514061
628	NC_018528	TAAG	2	8	28615	28622	50 %	25 %	25 %	0 %	403514061
629	NC_018528	AATT	2	8	28647	28654	50 %	50 %	0 %	0 %	403514061
630	NC_018528	ATT	2	6	28744	28749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514061
631	NC_018528	CAT	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514061
632	NC_018528	TGA	2	6	28792	28797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514061
633	NC_018528	TTGG	2	8	28868	28875	0 %	50 %	50 %	0 %	403514061
634	NC_018528	AGT	2	6	28912	28917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514061
635	NC_018528	TGAT	2	8	28961	28968	25 %	50 %	25 %	0 %	403514061
636	NC_018528	TAT	2	6	29079	29084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018528	CTTT	2	8	29086	29093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
638	NC_018528	TAA	3	9	29114	29122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018528	T	6	6	29148	29153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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