MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018528	ATC	2	6	249972	249977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514276
5502	NC_018528	T	6	6	250004	250009	0 %	100 %	0 %	0 %	403514276
5503	NC_018528	AGT	2	6	250061	250066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514276
5504	NC_018528	AGT	2	6	250068	250073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514276
5505	NC_018528	T	6	6	250103	250108	0 %	100 %	0 %	0 %	403514276
5506	NC_018528	CATT	2	8	250163	250170	25 %	50 %	0 %	25 %	403514276
5507	NC_018528	T	6	6	250169	250174	0 %	100 %	0 %	0 %	403514276
5508	NC_018528	GAT	2	6	250196	250201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_018528	T	6	6	250223	250228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_018528	A	6	6	250246	250251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_018528	TCGC	2	8	250284	250291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_018528	T	6	6	250354	250359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_018528	TAG	2	6	250382	250387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_018528	AGTT	2	8	250388	250395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_018528	ATT	2	6	250457	250462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514277
5516	NC_018528	TATT	2	8	250522	250529	25 %	75 %	0 %	0 %	403514277
5517	NC_018528	ATT	2	6	250589	250594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514277
5518	NC_018528	T	6	6	250593	250598	0 %	100 %	0 %	0 %	403514277
5519	NC_018528	TGG	2	6	250600	250605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514277
5520	NC_018528	GAT	2	6	250622	250627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514277
5521	NC_018528	CAAG	2	8	250884	250891	50 %	0 %	25 %	25 %	403514277
5522	NC_018528	TGC	2	6	250903	250908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514277
5523	NC_018528	AAG	2	6	251076	251081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5524	NC_018528	AAG	2	6	251090	251095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5525	NC_018528	TGC	2	6	251199	251204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514277
5526	NC_018528	ATT	2	6	251261	251266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514277
5527	NC_018528	ATC	2	6	251336	251341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514277
5528	NC_018528	GAA	2	6	251369	251374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5529	NC_018528	AAG	2	6	251378	251383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5530	NC_018528	CTT	2	6	251398	251403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514277
5531	NC_018528	CAC	2	6	251471	251476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514277
5532	NC_018528	TGG	2	6	251482	251487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514277
5533	NC_018528	GTT	2	6	251533	251538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514277
5534	NC_018528	CAGGTC	2	12	251610	251621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403514277
5535	NC_018528	AGA	2	6	251650	251655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5536	NC_018528	GAA	2	6	251696	251701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5537	NC_018528	AAG	2	6	251705	251710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514277
5538	NC_018528	CTG	2	6	251844	251849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514277
5539	NC_018528	ATTA	2	8	251987	251994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_018528	AT	3	6	252009	252014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_018528	ACT	2	6	252036	252041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_018528	AAT	2	6	252085	252090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_018528	T	6	6	252117	252122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_018528	G	6	6	252126	252131	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_018528	TCATT	2	10	252174	252183	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5546	NC_018528	TGA	2	6	252259	252264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_018528	T	6	6	252273	252278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_018528	GTTT	2	8	252280	252287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_018528	TCC	2	6	252295	252300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_018528	TTCT	2	8	252301	252308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_018528	AGG	2	6	252341	252346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_018528	ACA	2	6	252396	252401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514278
5553	NC_018528	TTTG	2	8	252436	252443	0 %	75 %	25 %	0 %	403514278
5554	NC_018528	ATG	2	6	252460	252465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_018528	AAT	2	6	252481	252486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_018528	T	6	6	252498	252503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_018528	A	6	6	252542	252547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_018528	T	6	6	252556	252561	0 %	100 %	0 %	0 %	403514279
5559	NC_018528	TTC	2	6	252574	252579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514279
5560	NC_018528	GAA	2	6	252619	252624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514279
5561	NC_018528	CTT	2	6	252625	252630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514279
5562	NC_018528	TTCA	2	8	252666	252673	25 %	50 %	0 %	25 %	403514279
5563	NC_018528	ATT	2	6	252840	252845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514279
5564	NC_018528	AAAG	2	8	252985	252992	75 %	0 %	25 %	0 %	403514279
5565	NC_018528	AGC	2	6	253147	253152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514279
5566	NC_018528	ACTA	2	8	253180	253187	50 %	25 %	0 %	25 %	403514279
5567	NC_018528	ATG	2	6	253206	253211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514279
5568	NC_018528	ATC	2	6	253254	253259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514279
5569	NC_018528	ACT	2	6	253593	253598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_018528	ATA	2	6	253683	253688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_018528	ATT	2	6	253708	253713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514280
5572	NC_018528	GAA	2	6	253778	253783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514280
5573	NC_018528	AGC	2	6	253828	253833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514280
5574	NC_018528	T	6	6	253891	253896	0 %	100 %	0 %	0 %	403514280
5575	NC_018528	AAG	2	6	253912	253917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514280
5576	NC_018528	TTG	2	6	253959	253964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_018528	AGT	2	6	253990	253995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_018528	T	7	7	253995	254001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_018528	TAT	2	6	254029	254034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_018528	AAT	2	6	254035	254040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_018528	TTAT	2	8	254085	254092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_018528	GTG	2	6	254119	254124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_018528	TGA	2	6	254285	254290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_018528	TCG	2	6	254393	254398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_018528	AAG	2	6	254401	254406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_018528	GATG	2	8	254416	254423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_018528	CAT	2	6	254456	254461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_018528	TGG	2	6	254552	254557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_018528	TTGG	2	8	254612	254619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_018528	TCT	2	6	254776	254781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_018528	AACT	2	8	254934	254941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5592	NC_018528	TGG	2	6	254948	254953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_018528	GCTTAA	2	12	254961	254972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5594	NC_018528	ATCAG	2	10	254982	254991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5595	NC_018528	CTTTT	2	10	254995	255004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5596	NC_018528	TAC	2	6	255008	255013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_018528	CAC	2	6	255050	255055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_018528	AT	3	6	255067	255072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_018528	TGT	2	6	255118	255123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_018528	ATA	2	6	255127	255132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_018528	TAC	2	6	255150	255155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_018528	ATTTT	2	10	255161	255170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_018528	A	7	7	255173	255179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_018528	TAAA	2	8	255199	255206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_018528	AT	3	6	255208	255213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_018528	T	6	6	255235	255240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_018528	AGA	2	6	255367	255372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514281
5608	NC_018528	CAA	2	6	255380	255385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514281
5609	NC_018528	TAA	2	6	255460	255465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514281
5610	NC_018528	TGG	2	6	255499	255504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514281
5611	NC_018528	AAC	2	6	255528	255533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514281
5612	NC_018528	AGA	2	6	255757	255762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514281
5613	NC_018528	TGA	2	6	255772	255777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514281
5614	NC_018528	AATT	2	8	255810	255817	50 %	50 %	0 %	0 %	403514281
5615	NC_018528	TAT	2	6	255844	255849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514281
5616	NC_018528	CA	3	6	255912	255917	50 %	0 %	0 %	50 %	403514281
5617	NC_018528	TGT	2	6	255970	255975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514281
5618	NC_018528	ACTACA	2	12	255977	255988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514281
5619	NC_018528	CA	3	6	255987	255992	50 %	0 %	0 %	50 %	403514281
5620	NC_018528	TAA	2	6	256030	256035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514281
5621	NC_018528	ATT	2	6	256066	256071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514281
5622	NC_018528	ATA	2	6	256218	256223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514281
5623	NC_018528	AGT	2	6	256228	256233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514281
5624	NC_018528	CTTG	2	8	256309	256316	0 %	50 %	25 %	25 %	403514281
5625	NC_018528	TCACA	2	10	256324	256333	40 %	20 %	0 %	40 %	403514281
5626	NC_018528	TGA	2	6	256426	256431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514281
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5628	NC_018528	CTG	2	6	256449	256454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514281
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6000	NC_018528	AGA	2	6	272937	272942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514296

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