MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 46680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018528	AAGA	2	8	229671	229678	75 %	0 %	25 %	0 %	403514256
5002	NC_018528	AAG	2	6	229683	229688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514256
5003	NC_018528	AAG	2	6	229698	229703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514256
5004	NC_018528	CTA	2	6	229711	229716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5005	NC_018528	GCT	2	6	229737	229742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514256
5006	NC_018528	ACT	2	6	229755	229760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5007	NC_018528	A	6	6	229763	229768	100 %	0 %	0 %	0 %	403514256
5008	NC_018528	AAG	2	6	229836	229841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514256
5009	NC_018528	ACT	2	6	229863	229868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5010	NC_018528	TGA	2	6	229913	229918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514256
5011	NC_018528	TAC	2	6	229926	229931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5012	NC_018528	AT	3	6	229949	229954	50 %	50 %	0 %	0 %	403514256
5013	NC_018528	TCA	2	6	229992	229997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5014	NC_018528	AAG	2	6	230001	230006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514256
5015	NC_018528	CAT	2	6	230008	230013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5016	NC_018528	ACT	2	6	230019	230024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5017	NC_018528	TCA	2	6	230040	230045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514256
5018	NC_018528	TGA	2	6	230063	230068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514256
5019	NC_018528	AGA	2	6	230075	230080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018528	ATT	2	6	230146	230151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514257
5021	NC_018528	TAC	2	6	230223	230228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514257
5022	NC_018528	ATT	2	6	230245	230250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514257
5023	NC_018528	A	7	7	230312	230318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018528	AG	3	6	230346	230351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018528	TTCTTT	2	12	230392	230403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403514258
5026	NC_018528	TCT	2	6	230411	230416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514258
5027	NC_018528	GTTC	2	8	230468	230475	0 %	50 %	25 %	25 %	403514258
5028	NC_018528	AGC	2	6	230573	230578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514258
5029	NC_018528	GTT	2	6	230641	230646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514258
5030	NC_018528	AGT	2	6	230698	230703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514258
5031	NC_018528	TCA	2	6	230792	230797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514258
5032	NC_018528	CTT	2	6	230800	230805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514258
5033	NC_018528	CGAT	2	8	230927	230934	25 %	25 %	25 %	25 %	403514258
5034	NC_018528	TTC	2	6	231059	231064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514258
5035	NC_018528	TGA	2	6	231095	231100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514258
5036	NC_018528	AGC	2	6	231207	231212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514258
5037	NC_018528	CTTG	2	8	231337	231344	0 %	50 %	25 %	25 %	403514258
5038	NC_018528	GCT	2	6	231396	231401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514258
5039	NC_018528	TGGC	2	8	231425	231432	0 %	25 %	50 %	25 %	403514258
5040	NC_018528	T	7	7	231590	231596	0 %	100 %	0 %	0 %	403514258
5041	NC_018528	AG	3	6	231632	231637	50 %	0 %	50 %	0 %	403514258
5042	NC_018528	TTTA	2	8	231653	231660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018528	TG	3	6	231669	231674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018528	T	6	6	231708	231713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018528	A	6	6	231719	231724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018528	TCA	2	6	231754	231759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_018528	A	6	6	231764	231769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018528	T	6	6	231792	231797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018528	TTTTAG	2	12	231854	231865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018528	CAG	2	6	231915	231920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5051	NC_018528	ACT	2	6	231953	231958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5052	NC_018528	TGC	2	6	231970	231975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5053	NC_018528	AAG	2	6	231989	231994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5054	NC_018528	AGA	2	6	232005	232010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5055	NC_018528	AAG	2	6	232034	232039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5056	NC_018528	CTA	2	6	232047	232052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5057	NC_018528	GCT	2	6	232073	232078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5058	NC_018528	ACT	2	6	232091	232096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5059	NC_018528	A	6	6	232099	232104	100 %	0 %	0 %	0 %	403514259
5060	NC_018528	ACT	2	6	232199	232204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5061	NC_018528	TAC	2	6	232262	232267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5062	NC_018528	TGG	3	9	232273	232281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514259
5063	NC_018528	AT	3	6	232285	232290	50 %	50 %	0 %	0 %	403514259
5064	NC_018528	TCA	2	6	232328	232333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5065	NC_018528	TAT	2	6	232336	232341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514259
5066	NC_018528	AGA	2	6	232350	232355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5067	NC_018528	AAG	3	9	232388	232396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5068	NC_018528	AAG	2	6	232403	232408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514259
5069	NC_018528	ACT	2	6	232424	232429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5070	NC_018528	TAC	2	6	232457	232462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5071	NC_018528	CTA	2	6	232491	232496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5072	NC_018528	GCA	2	6	232550	232555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5073	NC_018528	ACT	2	6	232601	232606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514259
5074	NC_018528	GTT	2	6	232613	232618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514259
5075	NC_018528	CAA	2	6	232679	232684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514259
5076	NC_018528	AACTC	2	10	232718	232727	40 %	20 %	0 %	40 %	403514259
5077	NC_018528	ATG	3	9	232773	232781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514259
5078	NC_018528	ATGG	2	8	232787	232794	25 %	25 %	50 %	0 %	403514259
5079	NC_018528	CTG	3	9	232854	232862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5080	NC_018528	AGC	2	6	232894	232899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5081	NC_018528	TCAAGT	2	12	232931	232942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514259
5082	NC_018528	ACA	2	6	232989	232994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514259
5083	NC_018528	GCT	2	6	233045	233050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5084	NC_018528	GCT	2	6	233132	233137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514259
5085	NC_018528	TAA	2	6	233146	233151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514259
5086	NC_018528	CAATT	2	10	233166	233175	40 %	40 %	0 %	20 %	403514259
5087	NC_018528	ACA	3	9	233181	233189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514259
5088	NC_018528	AC	3	6	233217	233222	50 %	0 %	0 %	50 %	403514259
5089	NC_018528	TTAA	2	8	233272	233279	50 %	50 %	0 %	0 %	403514259
5090	NC_018528	AAATA	2	10	233285	233294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018528	A	6	6	233307	233312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018528	T	6	6	233325	233330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018528	T	6	6	233373	233378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_018528	TAGT	2	8	233388	233395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_018528	T	6	6	233407	233412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_018528	ATT	2	6	233495	233500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_018528	GGA	2	6	233506	233511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_018528	ATG	2	6	233534	233539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514260
5099	NC_018528	CTCAA	2	10	233549	233558	40 %	20 %	0 %	40 %	403514260
5100	NC_018528	TGA	2	6	233656	233661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514260
5101	NC_018528	CGT	2	6	233756	233761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514260
5102	NC_018528	TTG	2	6	233856	233861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514260
5103	NC_018528	CAC	2	6	233916	233921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514260
5104	NC_018528	CTT	2	6	233972	233977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514260
5105	NC_018528	CTT	2	6	233986	233991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514260
5106	NC_018528	AAC	2	6	233996	234001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514260
5107	NC_018528	AGA	2	6	234004	234009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514260
5108	NC_018528	GTT	3	9	234017	234025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514260
5109	NC_018528	GGT	2	6	234038	234043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514260
5110	NC_018528	TTG	2	6	234093	234098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514260
5111	NC_018528	CGT	2	6	234104	234109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514260
5112	NC_018528	ATT	2	6	234140	234145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514260
5113	NC_018528	TGA	2	6	234178	234183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514260
5114	NC_018528	TGAT	2	8	234186	234193	25 %	50 %	25 %	0 %	403514260
5115	NC_018528	AGC	2	6	234214	234219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514260
5116	NC_018528	TTCT	2	8	234276	234283	0 %	75 %	0 %	25 %	403514260
5117	NC_018528	AAG	2	6	234362	234367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514260
5118	NC_018528	ATT	2	6	234451	234456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514260
5119	NC_018528	T	6	6	234497	234502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_018528	TTA	2	6	234543	234548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_018528	TGG	2	6	234599	234604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514261
5122	NC_018528	GAA	2	6	234633	234638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514261
5123	NC_018528	AAAC	2	8	234667	234674	75 %	0 %	0 %	25 %	403514261
5124	NC_018528	TGG	2	6	234800	234805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514261
5125	NC_018528	ATG	2	6	234883	234888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514261
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5129	NC_018528	TAG	2	6	234985	234990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514261
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5146	NC_018528	GCTG	2	8	235573	235580	0 %	25 %	50 %	25 %	403514262
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5183	NC_018528	ACC	2	6	237209	237214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5185	NC_018528	TA	3	6	237241	237246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_018528	TGA	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514266
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5244	NC_018528	TGGT	2	8	239321	239328	0 %	50 %	50 %	0 %	403514266
5245	NC_018528	ACA	2	6	239396	239401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
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5247	NC_018528	ACA	2	6	239447	239452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
5248	NC_018528	TGG	2	6	239493	239498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514266
5249	NC_018528	TTTG	2	8	239576	239583	0 %	75 %	25 %	0 %	403514266
5250	NC_018528	TAC	2	6	239643	239648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514266
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5264	NC_018528	T	7	7	240114	240120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_018528	ATT	2	6	240138	240143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_018528	AAAAG	2	10	240160	240169	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5273	NC_018528	CTT	2	6	240481	240486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514267
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5354	NC_018528	TAAT	2	8	244067	244074	50 %	50 %	0 %	0 %	403514271
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5370	NC_018528	TAT	2	6	244642	244647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_018528	T	7	7	244709	244715	0 %	100 %	0 %	0 %	403514272
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5490	NC_018528	A	6	6	249573	249578	100 %	0 %	0 %	0 %	403514276
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5495	NC_018528	T	7	7	249679	249685	0 %	100 %	0 %	0 %	403514276
5496	NC_018528	GTT	2	6	249707	249712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514276
5497	NC_018528	CTTT	2	8	249732	249739	0 %	75 %	0 %	25 %	403514276
5498	NC_018528	ATAA	2	8	249774	249781	75 %	25 %	0 %	0 %	403514276
5499	NC_018528	ATA	2	6	249871	249876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514276
5500	NC_018528	ATAA	2	8	249953	249960	75 %	25 %	0 %	0 %	403514276

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