MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	AT	3	6	375	380	50 %	50 %	0 %	0 %	397668687
2	NC_018141	GA	3	6	1051	1056	50 %	0 %	50 %	0 %	397668688
3	NC_018141	AT	3	6	1616	1621	50 %	50 %	0 %	0 %	397668688
4	NC_018141	TA	3	6	2846	2851	50 %	50 %	0 %	0 %	397668690
5	NC_018141	GC	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	397668691
6	NC_018141	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	397668693
7	NC_018141	TG	3	6	8864	8869	0 %	50 %	50 %	0 %	397668698
8	NC_018141	CT	3	6	9359	9364	0 %	50 %	0 %	50 %	397668698
9	NC_018141	TA	3	6	10215	10220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018141	CG	3	6	10743	10748	0 %	0 %	50 %	50 %	397668701
11	NC_018141	AG	3	6	11199	11204	50 %	0 %	50 %	0 %	397668701
12	NC_018141	CT	3	6	11621	11626	0 %	50 %	0 %	50 %	397668702
13	NC_018141	AT	3	6	13362	13367	50 %	50 %	0 %	0 %	397668706
14	NC_018141	TG	3	6	13956	13961	0 %	50 %	50 %	0 %	397668706
15	NC_018141	TC	3	6	15572	15577	0 %	50 %	0 %	50 %	397668708
16	NC_018141	AG	3	6	15744	15749	50 %	0 %	50 %	0 %	397668708
17	NC_018141	GA	3	6	16433	16438	50 %	0 %	50 %	0 %	397668709
18	NC_018141	CT	3	6	17334	17339	0 %	50 %	0 %	50 %	397668711
19	NC_018141	GT	3	6	18722	18727	0 %	50 %	50 %	0 %	397668712
20	NC_018141	AT	3	6	19036	19041	50 %	50 %	0 %	0 %	397668712
21	NC_018141	GT	3	6	19733	19738	0 %	50 %	50 %	0 %	397668713
22	NC_018141	CT	3	6	20652	20657	0 %	50 %	0 %	50 %	397668715
23	NC_018141	CA	3	6	21412	21417	50 %	0 %	0 %	50 %	397668715
24	NC_018141	AT	3	6	21747	21752	50 %	50 %	0 %	0 %	397668715
25	NC_018141	CT	3	6	22176	22181	0 %	50 %	0 %	50 %	397668716
26	NC_018141	CT	3	6	23825	23830	0 %	50 %	0 %	50 %	397668718
27	NC_018141	AC	3	6	24235	24240	50 %	0 %	0 %	50 %	397668718
28	NC_018141	TG	3	6	24758	24763	0 %	50 %	50 %	0 %	397668719
29	NC_018141	TG	3	6	26141	26146	0 %	50 %	50 %	0 %	397668720
30	NC_018141	AT	3	6	26197	26202	50 %	50 %	0 %	0 %	397668720
31	NC_018141	TA	3	6	26422	26427	50 %	50 %	0 %	0 %	397668720
32	NC_018141	GT	3	6	28167	28172	0 %	50 %	50 %	0 %	397668723
33	NC_018141	GC	3	6	29459	29464	0 %	0 %	50 %	50 %	397668725
34	NC_018141	CG	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	397668728
35	NC_018141	CT	3	6	31730	31735	0 %	50 %	0 %	50 %	397668728
36	NC_018141	AC	3	6	31943	31948	50 %	0 %	0 %	50 %	397668728
37	NC_018141	AT	3	6	35332	35337	50 %	50 %	0 %	0 %	397668730
38	NC_018141	TA	3	6	35548	35553	50 %	50 %	0 %	0 %	397668730
39	NC_018141	TA	4	8	35645	35652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018141	AT	3	6	35710	35715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018141	AT	4	8	35844	35851	50 %	50 %	0 %	0 %	397668731
42	NC_018141	CT	3	6	36546	36551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018141	AC	3	6	36615	36620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018141	TA	3	6	36638	36643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018141	TA	3	6	37000	37005	50 %	50 %	0 %	0 %	397668732
46	NC_018141	TC	3	6	37177	37182	0 %	50 %	0 %	50 %	397668732
47	NC_018141	TG	3	6	37524	37529	0 %	50 %	50 %	0 %	397668732
48	NC_018141	TA	4	8	38047	38054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018141	GA	3	6	39407	39412	50 %	0 %	50 %	0 %	397668734
50	NC_018141	GA	3	6	39765	39770	50 %	0 %	50 %	0 %	397668734
51	NC_018141	AT	3	6	39784	39789	50 %	50 %	0 %	0 %	397668734
52	NC_018141	TA	3	6	41478	41483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018141	AT	3	6	41688	41693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018141	AT	3	6	41830	41835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018141	AT	3	6	42306	42311	50 %	50 %	0 %	0 %	397668738
56	NC_018141	GA	3	6	42665	42670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018141	GA	3	6	42972	42977	50 %	0 %	50 %	0 %	397668739
58	NC_018141	GA	3	6	43336	43341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018141	GC	3	6	43598	43603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018141	CT	3	6	43895	43900	0 %	50 %	0 %	50 %	397668740
61	NC_018141	GA	3	6	45767	45772	50 %	0 %	50 %	0 %	397668742
62	NC_018141	AG	4	8	47852	47859	50 %	0 %	50 %	0 %	397668744
63	NC_018141	GT	3	6	48086	48091	0 %	50 %	50 %	0 %	397668744
64	NC_018141	AT	3	6	48286	48291	50 %	50 %	0 %	0 %	397668744
65	NC_018141	CT	3	6	49653	49658	0 %	50 %	0 %	50 %	397668745
66	NC_018141	AT	3	6	50308	50313	50 %	50 %	0 %	0 %	397668746
67	NC_018141	GT	3	6	50654	50659	0 %	50 %	50 %	0 %	397668746
68	NC_018141	CA	3	6	52716	52721	50 %	0 %	0 %	50 %	397668747
69	NC_018141	GT	3	6	56398	56403	0 %	50 %	50 %	0 %	397668749
70	NC_018141	TA	3	6	57395	57400	50 %	50 %	0 %	0 %	397668750
71	NC_018141	AG	3	6	57561	57566	50 %	0 %	50 %	0 %	397668750
72	NC_018141	AT	3	6	57803	57808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018141	TA	3	6	57942	57947	50 %	50 %	0 %	0 %	397668751
74	NC_018141	AC	3	6	58961	58966	50 %	0 %	0 %	50 %	397668753
75	NC_018141	TC	3	6	60130	60135	0 %	50 %	0 %	50 %	397668754
76	NC_018141	TC	4	8	61069	61076	0 %	50 %	0 %	50 %	397668755
77	NC_018141	TG	3	6	61967	61972	0 %	50 %	50 %	0 %	397668756
78	NC_018141	CT	3	6	62408	62413	0 %	50 %	0 %	50 %	397668756
79	NC_018141	TG	3	6	63272	63277	0 %	50 %	50 %	0 %	397668756
80	NC_018141	TC	3	6	64512	64517	0 %	50 %	0 %	50 %	397668757
81	NC_018141	GT	3	6	67851	67856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018141	CT	3	6	68054	68059	0 %	50 %	0 %	50 %	397668762
83	NC_018141	TC	3	6	69370	69375	0 %	50 %	0 %	50 %	397668763
84	NC_018141	AT	3	6	72505	72510	50 %	50 %	0 %	0 %	397668766
85	NC_018141	CT	3	6	73350	73355	0 %	50 %	0 %	50 %	397668766
86	NC_018141	CT	3	6	73497	73502	0 %	50 %	0 %	50 %	397668767
87	NC_018141	TC	3	6	74694	74699	0 %	50 %	0 %	50 %	397668769
88	NC_018141	TA	3	6	75022	75027	50 %	50 %	0 %	0 %	397668769
89	NC_018141	AT	4	8	76320	76327	50 %	50 %	0 %	0 %	397668769
90	NC_018141	GT	3	6	78312	78317	0 %	50 %	50 %	0 %	397668770
91	NC_018141	AC	3	6	81086	81091	50 %	0 %	0 %	50 %	397668771
92	NC_018141	TG	3	6	81470	81475	0 %	50 %	50 %	0 %	397668772
93	NC_018141	CT	3	6	81498	81503	0 %	50 %	0 %	50 %	397668772
94	NC_018141	TA	3	6	81675	81680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018141	TA	3	6	81705	81710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018141	GT	3	6	82054	82059	0 %	50 %	50 %	0 %	397668773
97	NC_018141	TG	4	8	82321	82328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018141	AT	3	6	82544	82549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018141	AG	3	6	83963	83968	50 %	0 %	50 %	0 %	397668775
100	NC_018141	CA	3	6	85093	85098	50 %	0 %	0 %	50 %	397668775
101	NC_018141	GA	3	6	85753	85758	50 %	0 %	50 %	0 %	397668776
102	NC_018141	GA	3	6	86604	86609	50 %	0 %	50 %	0 %	397668777
103	NC_018141	GT	3	6	87584	87589	0 %	50 %	50 %	0 %	397668778
104	NC_018141	AG	4	8	87614	87621	50 %	0 %	50 %	0 %	397668778
105	NC_018141	GC	3	6	87656	87661	0 %	0 %	50 %	50 %	397668778
106	NC_018141	CT	3	6	89456	89461	0 %	50 %	0 %	50 %	397668779
107	NC_018141	TC	3	6	89770	89775	0 %	50 %	0 %	50 %	397668779
108	NC_018141	AT	3	6	93304	93309	50 %	50 %	0 %	0 %	397668782
109	NC_018141	TA	3	6	95014	95019	50 %	50 %	0 %	0 %	397668783
110	NC_018141	CT	3	6	95475	95480	0 %	50 %	0 %	50 %	397668783
111	NC_018141	GC	3	6	95928	95933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018141	TA	3	6	97005	97010	50 %	50 %	0 %	0 %	397668785
113	NC_018141	TA	3	6	98091	98096	50 %	50 %	0 %	0 %	397668786
114	NC_018141	CT	3	6	98119	98124	0 %	50 %	0 %	50 %	397668786
115	NC_018141	GA	3	6	98265	98270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018141	TC	3	6	98515	98520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018141	AT	3	6	98755	98760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018141	AT	3	6	99061	99066	50 %	50 %	0 %	0 %	397668787
119	NC_018141	TC	3	6	100267	100272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018141	GA	4	8	101662	101669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018141	GT	3	6	101969	101974	0 %	50 %	50 %	0 %	397668790
122	NC_018141	TC	3	6	102338	102343	0 %	50 %	0 %	50 %	397668790
123	NC_018141	TC	3	6	102809	102814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018141	TA	4	8	103451	103458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018141	GT	3	6	104400	104405	0 %	50 %	50 %	0 %	397668794
126	NC_018141	GC	3	6	104489	104494	0 %	0 %	50 %	50 %	397668794
127	NC_018141	AG	3	6	105270	105275	50 %	0 %	50 %	0 %	397668795
128	NC_018141	CT	3	6	105646	105651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018141	AT	3	6	106289	106294	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
130	NC_018141	TA	3	6	106527	106532	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
131	NC_018141	TA	4	8	107912	107919	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
132	NC_018141	TA	3	6	108039	108044	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
133	NC_018141	AC	3	6	108757	108762	50 %	0 %	0 %	50 %	397668799
134	NC_018141	CG	3	6	108893	108898	0 %	0 %	50 %	50 %	397668799
135	NC_018141	AC	3	6	110139	110144	50 %	0 %	0 %	50 %	397668801
136	NC_018141	TG	3	6	110170	110175	0 %	50 %	50 %	0 %	397668801
137	NC_018141	CA	3	6	110454	110459	50 %	0 %	0 %	50 %	397668802
138	NC_018141	TG	3	6	110727	110732	0 %	50 %	50 %	0 %	397668802
139	NC_018141	AC	4	8	113191	113198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018141	AC	3	6	113226	113231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018141	TA	3	6	113323	113328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018141	AC	3	6	113428	113433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018141	AC	3	6	113732	113737	50 %	0 %	0 %	50 %	397668807
144	NC_018141	AT	3	6	113879	113884	50 %	50 %	0 %	0 %	397668807
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.