MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 2100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	389853201
2	NC_017949	GAGGT	2	10	7476	7485	20 %	20 %	60 %	0 %	389853202
3	NC_017949	ATTAT	2	10	9479	9488	40 %	60 %	0 %	0 %	389853202
4	NC_017949	AAGCA	2	10	10177	10186	60 %	0 %	20 %	20 %	389853204
5	NC_017949	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017949	ATGGT	2	10	12733	12742	20 %	40 %	40 %	0 %	389853207
7	NC_017949	GCATG	2	10	14852	14861	20 %	20 %	40 %	20 %	389853210
8	NC_017949	ATTTT	2	10	15682	15691	20 %	80 %	0 %	0 %	389853211
9	NC_017949	AAATG	2	10	15974	15983	60 %	20 %	20 %	0 %	389853211
10	NC_017949	TGCGA	2	10	16991	17000	20 %	20 %	40 %	20 %	389853211
11	NC_017949	TACTT	2	10	17636	17645	20 %	60 %	0 %	20 %	389853211
12	NC_017949	TGATT	2	10	19703	19712	20 %	60 %	20 %	0 %	389853214
13	NC_017949	TGGTA	2	10	24998	25007	20 %	40 %	40 %	0 %	389853218
14	NC_017949	CTTAA	2	10	26057	26066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017949	AAGTC	2	10	26198	26207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017949	TGGCT	2	10	26996	27005	0 %	40 %	40 %	20 %	389853219
17	NC_017949	ATTTT	2	10	27091	27100	20 %	80 %	0 %	0 %	389853219
18	NC_017949	AGAGA	2	10	28009	28018	60 %	0 %	40 %	0 %	389853219
19	NC_017949	CAAAA	2	10	28357	28366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017949	CTATC	2	10	33228	33237	20 %	40 %	0 %	40 %	389853223
21	NC_017949	ATTTT	2	10	35005	35014	20 %	80 %	0 %	0 %	389853226
22	NC_017949	CTTTC	2	10	35845	35854	0 %	60 %	0 %	40 %	389853227
23	NC_017949	CAATC	2	10	37701	37710	40 %	20 %	0 %	40 %	389853229
24	NC_017949	TGCCT	2	10	38517	38526	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017949	TTTTC	2	10	38852	38861	0 %	80 %	0 %	20 %	389853233
26	NC_017949	TTTAC	2	10	39958	39967	20 %	60 %	0 %	20 %	389853236
27	NC_017949	TTTAA	2	10	40238	40247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017949	CTAAT	2	10	40620	40629	40 %	40 %	0 %	20 %	389853237
29	NC_017949	AGAAA	2	10	40905	40914	80 %	0 %	20 %	0 %	389853238
30	NC_017949	CGGAG	2	10	41063	41072	20 %	0 %	60 %	20 %	389853238
31	NC_017949	ATGAA	2	10	42449	42458	60 %	20 %	20 %	0 %	389853241
32	NC_017949	TCATT	2	10	42860	42869	20 %	60 %	0 %	20 %	389853242
33	NC_017949	AAAAT	2	10	45004	45013	80 %	20 %	0 %	0 %	389853245
34	NC_017949	CAAAA	2	10	45158	45167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017949	TTTGA	2	10	45499	45508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017949	TTTTG	2	10	45982	45991	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017949	GAAAA	2	10	46591	46600	80 %	0 %	20 %	0 %	389853248
38	NC_017949	ATAAA	2	10	49043	49052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017949	TTTAC	2	10	49458	49467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017949	TGCCT	2	10	50420	50429	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017949	AATAA	2	10	51600	51609	80 %	20 %	0 %	0 %	389853253
42	NC_017949	TATAA	2	10	55279	55288	60 %	40 %	0 %	0 %	389853257
43	NC_017949	TAAGC	2	10	56129	56138	40 %	20 %	20 %	20 %	389853259
44	NC_017949	TTTAA	2	10	56467	56476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017949	TGGAT	2	10	56689	56698	20 %	40 %	40 %	0 %	389853260
46	NC_017949	AAAAG	2	10	57154	57163	80 %	0 %	20 %	0 %	389853261
47	NC_017949	TCAAA	2	10	57322	57331	60 %	20 %	0 %	20 %	389853261
48	NC_017949	GTGAG	2	10	60219	60228	20 %	20 %	60 %	0 %	389853263
49	NC_017949	AGTAA	2	10	60788	60797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017949	AATTA	2	10	61501	61510	60 %	40 %	0 %	0 %	389853264
51	NC_017949	ATTAT	2	10	61774	61783	40 %	60 %	0 %	0 %	389853264
52	NC_017949	AATCA	2	10	65834	65843	60 %	20 %	0 %	20 %	389853268
53	NC_017949	AATTT	2	10	66427	66436	40 %	60 %	0 %	0 %	389853268
54	NC_017949	GCTTG	2	10	69521	69530	0 %	40 %	40 %	20 %	389853271
55	NC_017949	TCCAT	2	10	69872	69881	20 %	40 %	0 %	40 %	389853271
56	NC_017949	AAAAT	2	10	73783	73792	80 %	20 %	0 %	0 %	389853275
57	NC_017949	AGTTT	2	10	74983	74992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017949	ATTAA	2	10	75758	75767	60 %	40 %	0 %	0 %	389853277
59	NC_017949	GTCTT	2	10	76029	76038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017949	CAAAT	2	10	78853	78862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017949	CAAGC	2	10	81184	81193	40 %	0 %	20 %	40 %	389853282
62	NC_017949	CCATT	2	10	83425	83434	20 %	40 %	0 %	40 %	389853284
63	NC_017949	GAAGT	2	10	83869	83878	40 %	20 %	40 %	0 %	389853285
64	NC_017949	TACTA	2	10	85799	85808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017949	ACAAG	2	10	86149	86158	60 %	0 %	20 %	20 %	389853288
66	NC_017949	TCCAA	2	10	86305	86314	40 %	20 %	0 %	40 %	389853288
67	NC_017949	TGAGT	2	10	88657	88666	20 %	40 %	40 %	0 %	389853290
68	NC_017949	TGAAA	2	10	89173	89182	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017949	AATTT	2	10	90590	90599	40 %	60 %	0 %	0 %	389853293
70	NC_017949	ACTGG	2	10	91421	91430	20 %	20 %	40 %	20 %	389853294
71	NC_017949	GTAAA	2	10	93215	93224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017949	TTATT	2	10	94209	94218	20 %	80 %	0 %	0 %	389853298
73	NC_017949	TCTTT	2	10	95395	95404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017949	TTGCT	2	10	95696	95705	0 %	60 %	20 %	20 %	389853299
75	NC_017949	TGAGT	2	10	97071	97080	20 %	40 %	40 %	0 %	389853300
76	NC_017949	GCAGA	2	10	97686	97695	40 %	0 %	40 %	20 %	389853301
77	NC_017949	AAGCT	2	10	100413	100422	40 %	20 %	20 %	20 %	389853304
78	NC_017949	TGGAT	2	10	101408	101417	20 %	40 %	40 %	0 %	389853305
79	NC_017949	ATAAA	2	10	103797	103806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017949	CAAGA	2	10	104794	104803	60 %	0 %	20 %	20 %	389853310
81	NC_017949	ATAGA	2	10	105665	105674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017949	AAAGA	2	10	109285	109294	80 %	0 %	20 %	0 %	389853313
83	NC_017949	AGAGT	2	10	109695	109704	40 %	20 %	40 %	0 %	389853314
84	NC_017949	TGGTT	2	10	110368	110377	0 %	60 %	40 %	0 %	389853314
85	NC_017949	TATGA	2	10	112980	112989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017949	TCGTA	2	10	113435	113444	20 %	40 %	20 %	20 %	389853318
87	NC_017949	TTATA	2	10	114200	114209	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017949	GAAGC	2	10	114682	114691	40 %	0 %	40 %	20 %	389853320
89	NC_017949	TACAA	2	10	115483	115492	60 %	20 %	0 %	20 %	389853321
90	NC_017949	GATTT	2	10	118537	118546	20 %	60 %	20 %	0 %	389853324
91	NC_017949	TCAAA	2	10	120967	120976	60 %	20 %	0 %	20 %	389853327
92	NC_017949	TCGCA	2	10	124595	124604	20 %	20 %	20 %	40 %	389853331
93	NC_017949	TATTC	2	10	125428	125437	20 %	60 %	0 %	20 %	389853332
94	NC_017949	TTTTA	2	10	127602	127611	20 %	80 %	0 %	0 %	389853334
95	NC_017949	AATAA	2	10	128543	128552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017949	AAATG	2	10	128859	128868	60 %	20 %	20 %	0 %	389853335
97	NC_017949	CAAAA	2	10	128988	128997	80 %	0 %	0 %	20 %	389853335
98	NC_017949	ATTTT	2	10	129698	129707	20 %	80 %	0 %	0 %	389853336
99	NC_017949	TTGTC	2	10	130078	130087	0 %	60 %	20 %	20 %	389853336
100	NC_017949	TATAT	2	10	130813	130822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017949	ATTTG	2	10	133580	133589	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017949	GCTCC	2	10	133882	133891	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017949	TGGAT	2	10	134083	134092	20 %	40 %	40 %	0 %	389853342
104	NC_017949	GAAGG	2	10	134162	134171	40 %	0 %	60 %	0 %	389853342
105	NC_017949	AATTA	2	10	135064	135073	60 %	40 %	0 %	0 %	389853342
106	NC_017949	ATTTT	2	10	135970	135979	20 %	80 %	0 %	0 %	389853343
107	NC_017949	TTTTC	2	10	137274	137283	0 %	80 %	0 %	20 %	389853344
108	NC_017949	ACCAG	2	10	137708	137717	40 %	0 %	20 %	40 %	389853344
109	NC_017949	CCAAA	2	10	137819	137828	60 %	0 %	0 %	40 %	389853344
110	NC_017949	TGGCT	2	10	138782	138791	0 %	40 %	40 %	20 %	389853346
111	NC_017949	TCAAA	2	10	139360	139369	60 %	20 %	0 %	20 %	389853347
112	NC_017949	TTTTA	2	10	139633	139642	20 %	80 %	0 %	0 %	389853347
113	NC_017949	TTTTA	2	10	139963	139972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017949	CAGGT	2	10	141833	141842	20 %	20 %	40 %	20 %	389853350
115	NC_017949	GTTTG	2	10	141894	141903	0 %	60 %	40 %	0 %	389853350
116	NC_017949	AGGAT	2	10	142352	142361	40 %	20 %	40 %	0 %	389853351
117	NC_017949	TTTAC	2	10	143859	143868	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017949	TTGTT	2	10	144806	144815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017949	TAAAA	2	10	145186	145195	80 %	20 %	0 %	0 %	389853356
120	NC_017949	TTAAC	2	10	152904	152913	40 %	40 %	0 %	20 %	389853366
121	NC_017949	AAACA	2	10	153660	153669	80 %	0 %	0 %	20 %	389853366
122	NC_017949	TTTTA	2	10	154507	154516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017949	ATTTT	2	10	158192	158201	20 %	80 %	0 %	0 %	389853370
124	NC_017949	CCTTT	2	10	160628	160637	0 %	60 %	0 %	40 %	389853374
125	NC_017949	TAATT	2	10	162689	162698	40 %	60 %	0 %	0 %	389853375
126	NC_017949	TACAA	2	10	163631	163640	60 %	20 %	0 %	20 %	389853376
127	NC_017949	TTTTA	2	10	164391	164400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017949	TGATT	2	10	166009	166018	20 %	60 %	20 %	0 %	389853378
129	NC_017949	GATTG	2	10	167401	167410	20 %	40 %	40 %	0 %	389853379
130	NC_017949	TAAAA	2	10	169406	169415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017949	AGCCA	2	10	169507	169516	40 %	0 %	20 %	40 %	389853381
132	NC_017949	TTGGC	2	10	170402	170411	0 %	40 %	40 %	20 %	389853381
133	NC_017949	AAAGT	2	10	171276	171285	60 %	20 %	20 %	0 %	389853383
134	NC_017949	AATTT	2	10	171435	171444	40 %	60 %	0 %	0 %	389853383
135	NC_017949	ATTTA	2	10	174742	174751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017949	CCAAA	2	10	176538	176547	60 %	0 %	0 %	40 %	389853389
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138	NC_017949	AAATT	2	10	179889	179898	60 %	40 %	0 %	0 %	389853393
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