MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 7460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	389853199
2	NC_017949	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	389853199
3	NC_017949	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	389853199
4	NC_017949	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	389853199
5	NC_017949	ACTT	2	8	644	651	25 %	50 %	0 %	25 %	389853199
6	NC_017949	TCAA	2	8	1678	1685	50 %	25 %	0 %	25 %	389853200
7	NC_017949	GAAA	2	8	1947	1954	75 %	0 %	25 %	0 %	389853200
8	NC_017949	ATCA	2	8	2139	2146	50 %	25 %	0 %	25 %	389853200
9	NC_017949	TTGA	2	8	2251	2258	25 %	50 %	25 %	0 %	389853200
10	NC_017949	CAAC	2	8	2381	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	389853200
11	NC_017949	TATC	2	8	2501	2508	25 %	50 %	0 %	25 %	389853200
12	NC_017949	TGAT	2	8	2528	2535	25 %	50 %	25 %	0 %	389853200
13	NC_017949	GTAC	2	8	2650	2657	25 %	25 %	25 %	25 %	389853200
14	NC_017949	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	389853200
15	NC_017949	TGTC	2	8	2709	2716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017949	GAAA	2	8	2898	2905	75 %	0 %	25 %	0 %	389853201
17	NC_017949	TTAT	2	8	3379	3386	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
18	NC_017949	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	389853201
19	NC_017949	GACT	2	8	5184	5191	25 %	25 %	25 %	25 %	389853201
20	NC_017949	TATT	2	8	5433	5440	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
21	NC_017949	TCAT	2	8	5514	5521	25 %	50 %	0 %	25 %	389853201
22	NC_017949	TTTA	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
23	NC_017949	AACC	2	8	5638	5645	50 %	0 %	0 %	50 %	389853201
24	NC_017949	CAAT	2	8	5876	5883	50 %	25 %	0 %	25 %	389853201
25	NC_017949	ATGA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	25 %	0 %	389853201
26	NC_017949	TTAT	2	8	6505	6512	25 %	75 %	0 %	0 %	389853202
27	NC_017949	AATT	2	8	7059	7066	50 %	50 %	0 %	0 %	389853202
28	NC_017949	TGAT	2	8	7263	7270	25 %	50 %	25 %	0 %	389853202
29	NC_017949	GAAA	2	8	7456	7463	75 %	0 %	25 %	0 %	389853202
30	NC_017949	TTTG	2	8	7954	7961	0 %	75 %	25 %	0 %	389853202
31	NC_017949	TCAA	2	8	8106	8113	50 %	25 %	0 %	25 %	389853202
32	NC_017949	GGCA	2	8	8232	8239	25 %	0 %	50 %	25 %	389853202
33	NC_017949	TAAA	2	8	8607	8614	75 %	25 %	0 %	0 %	389853202
34	NC_017949	GGAA	2	8	8761	8768	50 %	0 %	50 %	0 %	389853202
35	NC_017949	AGGT	2	8	9096	9103	25 %	25 %	50 %	0 %	389853202
36	NC_017949	CAGT	2	8	9114	9121	25 %	25 %	25 %	25 %	389853202
37	NC_017949	ATTT	2	8	9240	9247	25 %	75 %	0 %	0 %	389853202
38	NC_017949	AAAT	2	8	9990	9997	75 %	25 %	0 %	0 %	389853204
39	NC_017949	TGAG	2	8	10424	10431	25 %	25 %	50 %	0 %	389853204
40	NC_017949	TAAT	2	8	10726	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017949	AAAT	2	8	11017	11024	75 %	25 %	0 %	0 %	389853205
42	NC_017949	AATT	2	8	11160	11167	50 %	50 %	0 %	0 %	389853205
43	NC_017949	ACTT	2	8	11621	11628	25 %	50 %	0 %	25 %	389853205
44	NC_017949	GTGC	2	8	11648	11655	0 %	25 %	50 %	25 %	389853205
45	NC_017949	CAAA	2	8	11939	11946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017949	AAGG	2	8	11972	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017949	TCAG	2	8	12030	12037	25 %	25 %	25 %	25 %	389853206
48	NC_017949	ATCT	2	8	12073	12080	25 %	50 %	0 %	25 %	389853206
49	NC_017949	GGTT	2	8	12244	12251	0 %	50 %	50 %	0 %	389853206
50	NC_017949	TTGT	2	8	12799	12806	0 %	75 %	25 %	0 %	389853207
51	NC_017949	ATCT	2	8	12817	12824	25 %	50 %	0 %	25 %	389853207
52	NC_017949	TTTA	2	8	12895	12902	25 %	75 %	0 %	0 %	389853207
53	NC_017949	GCTA	2	8	13227	13234	25 %	25 %	25 %	25 %	389853207
54	NC_017949	TATG	2	8	13250	13257	25 %	50 %	25 %	0 %	389853207
55	NC_017949	AGGC	2	8	13387	13394	25 %	0 %	50 %	25 %	389853207
56	NC_017949	ATAG	2	8	13732	13739	50 %	25 %	25 %	0 %	389853208
57	NC_017949	TAAA	2	8	13794	13801	75 %	25 %	0 %	0 %	389853208
58	NC_017949	ATTC	2	8	14153	14160	25 %	50 %	0 %	25 %	389853209
59	NC_017949	ATGA	2	8	14634	14641	50 %	25 %	25 %	0 %	389853210
60	NC_017949	CATG	2	8	14705	14712	25 %	25 %	25 %	25 %	389853210
61	NC_017949	GCGT	2	8	14737	14744	0 %	25 %	50 %	25 %	389853210
62	NC_017949	TGAT	2	8	16360	16367	25 %	50 %	25 %	0 %	389853211
63	NC_017949	AGTA	2	8	16668	16675	50 %	25 %	25 %	0 %	389853211
64	NC_017949	TCAA	2	8	16902	16909	50 %	25 %	0 %	25 %	389853211
65	NC_017949	AACC	2	8	17420	17427	50 %	0 %	0 %	50 %	389853211
66	NC_017949	AAAC	2	8	17455	17462	75 %	0 %	0 %	25 %	389853211
67	NC_017949	TGAG	2	8	18478	18485	25 %	25 %	50 %	0 %	389853211
68	NC_017949	TAAA	2	8	18742	18749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017949	CAAA	2	8	18831	18838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017949	GAAT	2	8	19989	19996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017949	CTAT	2	8	20406	20413	25 %	50 %	0 %	25 %	389853215
72	NC_017949	AACT	2	8	20521	20528	50 %	25 %	0 %	25 %	389853215
73	NC_017949	AATA	2	8	20891	20898	75 %	25 %	0 %	0 %	389853215
74	NC_017949	TGCT	2	8	20961	20968	0 %	50 %	25 %	25 %	389853215
75	NC_017949	TGGT	2	8	21069	21076	0 %	50 %	50 %	0 %	389853215
76	NC_017949	AATT	2	8	21800	21807	50 %	50 %	0 %	0 %	389853216
77	NC_017949	ATTT	2	8	22056	22063	25 %	75 %	0 %	0 %	389853216
78	NC_017949	CAAA	2	8	22066	22073	75 %	0 %	0 %	25 %	389853216
79	NC_017949	AGTA	2	8	22128	22135	50 %	25 %	25 %	0 %	389853216
80	NC_017949	ATTG	2	8	22760	22767	25 %	50 %	25 %	0 %	389853217
81	NC_017949	GAAG	2	8	22988	22995	50 %	0 %	50 %	0 %	389853217
82	NC_017949	TACT	2	8	23197	23204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017949	AACA	2	8	23591	23598	75 %	0 %	0 %	25 %	389853218
84	NC_017949	TGCT	2	8	24061	24068	0 %	50 %	25 %	25 %	389853218
85	NC_017949	ATTT	2	8	24166	24173	25 %	75 %	0 %	0 %	389853218
86	NC_017949	ATCA	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	389853218
87	NC_017949	AAAC	2	8	24473	24480	75 %	0 %	0 %	25 %	389853218
88	NC_017949	TGAA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	389853218
89	NC_017949	AAGA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	25 %	0 %	389853218
90	NC_017949	TCAA	2	8	24671	24678	50 %	25 %	0 %	25 %	389853218
91	NC_017949	TGCT	2	8	24802	24809	0 %	50 %	25 %	25 %	389853218
92	NC_017949	CAAC	2	8	24831	24838	50 %	0 %	0 %	50 %	389853218
93	NC_017949	TGAT	2	8	25087	25094	25 %	50 %	25 %	0 %	389853218
94	NC_017949	GCGT	2	8	25784	25791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017949	TTTA	2	8	26426	26433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017949	CAAT	2	8	27110	27117	50 %	25 %	0 %	25 %	389853219
97	NC_017949	TGGC	2	8	27356	27363	0 %	25 %	50 %	25 %	389853219
98	NC_017949	AGGA	2	8	28546	28553	50 %	0 %	50 %	0 %	389853220
99	NC_017949	ATTG	2	8	28646	28653	25 %	50 %	25 %	0 %	389853220
100	NC_017949	AAGC	2	8	28920	28927	50 %	0 %	25 %	25 %	389853220
101	NC_017949	AAGA	2	8	29388	29395	75 %	0 %	25 %	0 %	389853220
102	NC_017949	GTAA	2	8	29544	29551	50 %	25 %	25 %	0 %	389853220
103	NC_017949	TTCA	2	8	30031	30038	25 %	50 %	0 %	25 %	389853220
104	NC_017949	ATCA	2	8	30385	30392	50 %	25 %	0 %	25 %	389853221
105	NC_017949	AATT	2	8	30417	30424	50 %	50 %	0 %	0 %	389853221
106	NC_017949	GCTG	2	8	30738	30745	0 %	25 %	50 %	25 %	389853221
107	NC_017949	TAAA	2	8	30915	30922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017949	AGTA	2	8	30928	30935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017949	AGAA	2	8	31695	31702	75 %	0 %	25 %	0 %	389853222
110	NC_017949	AGTC	2	8	31964	31971	25 %	25 %	25 %	25 %	389853222
111	NC_017949	CGAA	2	8	32291	32298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017949	ATCA	2	8	32909	32916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017949	TCAA	2	8	32974	32981	50 %	25 %	0 %	25 %	389853223
114	NC_017949	TTTA	2	8	33013	33020	25 %	75 %	0 %	0 %	389853223
115	NC_017949	TTCA	2	8	33289	33296	25 %	50 %	0 %	25 %	389853223
116	NC_017949	AGTA	2	8	33907	33914	50 %	25 %	25 %	0 %	389853225
117	NC_017949	TATT	2	8	34422	34429	25 %	75 %	0 %	0 %	389853226
118	NC_017949	TGCA	2	8	34572	34579	25 %	25 %	25 %	25 %	389853226
119	NC_017949	GTTT	2	8	34616	34623	0 %	75 %	25 %	0 %	389853226
120	NC_017949	AATT	2	8	34926	34933	50 %	50 %	0 %	0 %	389853226
121	NC_017949	CGGT	2	8	35502	35509	0 %	25 %	50 %	25 %	389853227
122	NC_017949	CAGC	2	8	36184	36191	25 %	0 %	25 %	50 %	389853227
123	NC_017949	GAAA	2	8	36447	36454	75 %	0 %	25 %	0 %	389853227
124	NC_017949	GTTT	2	8	36460	36467	0 %	75 %	25 %	0 %	389853227
125	NC_017949	CCAG	2	8	36717	36724	25 %	0 %	25 %	50 %	389853227
126	NC_017949	AGTG	2	8	37184	37191	25 %	25 %	50 %	0 %	389853228
127	NC_017949	CTGA	2	8	37310	37317	25 %	25 %	25 %	25 %	389853228
128	NC_017949	CTTG	2	8	37848	37855	0 %	50 %	25 %	25 %	389853229
129	NC_017949	TTGT	2	8	37983	37990	0 %	75 %	25 %	0 %	389853229
130	NC_017949	TTGC	2	8	38046	38053	0 %	50 %	25 %	25 %	389853230
131	NC_017949	TCCG	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	389853230
132	NC_017949	TAAA	2	8	38751	38758	75 %	25 %	0 %	0 %	389853232
133	NC_017949	TTCA	2	8	38809	38816	25 %	50 %	0 %	25 %	389853232
134	NC_017949	GATA	2	8	39089	39096	50 %	25 %	25 %	0 %	389853233
135	NC_017949	TTTG	2	8	39433	39440	0 %	75 %	25 %	0 %	389853234
136	NC_017949	TTGT	2	8	39719	39726	0 %	75 %	25 %	0 %	389853235
137	NC_017949	TAAA	2	8	39808	39815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017949	TAAG	2	8	40167	40174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017949	CTGC	2	8	40447	40454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017949	GTTA	2	8	40487	40494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_017949	GATA	2	8	41407	41414	50 %	25 %	25 %	0 %	389853239
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