MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 57307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017949	TTG	2	6	22884	22889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853217
502	NC_017949	CTT	2	6	22973	22978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853217
503	NC_017949	GAAG	2	8	22988	22995	50 %	0 %	50 %	0 %	389853217
504	NC_017949	TTG	2	6	22998	23003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853217
505	NC_017949	ATT	2	6	23016	23021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853217
506	NC_017949	TGT	2	6	23047	23052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853217
507	NC_017949	GAA	2	6	23072	23077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853217
508	NC_017949	AAT	2	6	23130	23135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853217
509	NC_017949	A	6	6	23180	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017949	TACT	2	8	23197	23204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_017949	TTA	2	6	23269	23274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017949	AAG	2	6	23286	23291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017949	TAA	3	9	23309	23317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017949	AAC	2	6	23346	23351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853218
515	NC_017949	AAC	2	6	23353	23358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853218
516	NC_017949	A	6	6	23378	23383	100 %	0 %	0 %	0 %	389853218
517	NC_017949	TTG	4	12	23410	23421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
518	NC_017949	TCT	2	6	23434	23439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853218
519	NC_017949	AGT	2	6	23442	23447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
520	NC_017949	TGA	2	6	23485	23490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
521	NC_017949	TGA	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
522	NC_017949	TAA	2	6	23504	23509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853218
523	NC_017949	A	6	6	23568	23573	100 %	0 %	0 %	0 %	389853218
524	NC_017949	AACA	2	8	23591	23598	75 %	0 %	0 %	25 %	389853218
525	NC_017949	TAT	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853218
526	NC_017949	ATG	2	6	23704	23709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
527	NC_017949	TCA	2	6	23733	23738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853218
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529	NC_017949	AT	3	6	23765	23770	50 %	50 %	0 %	0 %	389853218
530	NC_017949	TTG	2	6	23788	23793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
531	NC_017949	TCT	2	6	23797	23802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853218
532	NC_017949	ATG	2	6	23808	23813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
533	NC_017949	GGC	2	6	23838	23843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389853218
534	NC_017949	ACA	2	6	23882	23887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853218
535	NC_017949	TTG	2	6	23953	23958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
536	NC_017949	GTT	2	6	23961	23966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
537	NC_017949	A	6	6	23985	23990	100 %	0 %	0 %	0 %	389853218
538	NC_017949	CAG	2	6	24016	24021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853218
539	NC_017949	TGCT	2	8	24061	24068	0 %	50 %	25 %	25 %	389853218
540	NC_017949	GTCGGA	2	12	24138	24149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853218
541	NC_017949	ATTT	2	8	24166	24173	25 %	75 %	0 %	0 %	389853218
542	NC_017949	GAA	2	6	24182	24187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853218
543	NC_017949	ATCA	2	8	24197	24204	50 %	25 %	0 %	25 %	389853218
544	NC_017949	GTG	2	6	24241	24246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853218
545	NC_017949	ATG	2	6	24265	24270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
546	NC_017949	TTG	2	6	24298	24303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
547	NC_017949	GAT	2	6	24321	24326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
548	NC_017949	TGC	2	6	24347	24352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853218
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550	NC_017949	AC	3	6	24503	24508	50 %	0 %	0 %	50 %	389853218
551	NC_017949	TGAA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	389853218
552	NC_017949	GCT	2	6	24567	24572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853218
553	NC_017949	TTG	2	6	24574	24579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853218
554	NC_017949	A	6	6	24594	24599	100 %	0 %	0 %	0 %	389853218
555	NC_017949	TGC	2	6	24608	24613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853218
556	NC_017949	TGA	2	6	24620	24625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
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558	NC_017949	TCAA	2	8	24671	24678	50 %	25 %	0 %	25 %	389853218
559	NC_017949	GCGTGA	2	12	24680	24691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389853218
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562	NC_017949	TGCT	2	8	24802	24809	0 %	50 %	25 %	25 %	389853218
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574	NC_017949	ACA	2	6	25236	25241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853218
575	NC_017949	TGA	2	6	25253	25258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853218
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580	NC_017949	ATGCAA	2	12	25312	25323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389853218
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585	NC_017949	AAT	2	6	25456	25461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_017949	TAT	2	6	25488	25493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017949	GAC	2	6	25523	25528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017949	TTA	2	6	25537	25542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017949	AT	3	6	25551	25556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017949	A	7	7	25590	25596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017949	ATA	2	6	25608	25613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017949	CAA	2	6	25637	25642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017949	CGG	2	6	25685	25690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017949	GGA	2	6	25725	25730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017949	GCGT	2	8	25784	25791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
597	NC_017949	TCC	2	6	25808	25813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_017949	AGC	2	6	25835	25840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017949	TCG	2	6	25849	25854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017949	CGG	2	6	25951	25956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017949	CTTAA	2	10	26057	26066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
602	NC_017949	AAGTC	2	10	26198	26207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_017949	GTA	2	6	26289	26294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017949	ATG	2	6	26312	26317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017949	T	7	7	26368	26374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017949	TAA	2	6	26391	26396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017949	CCT	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_017949	TTTA	2	8	26426	26433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017949	G	6	6	26588	26593	0 %	0 %	100 %	0 %	389853219
610	NC_017949	TTC	2	6	26605	26610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853219
611	NC_017949	TAA	2	6	26631	26636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853219
612	NC_017949	GGA	2	6	26728	26733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389853219
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614	NC_017949	GGT	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853219
615	NC_017949	GAT	2	6	26820	26825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853219
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617	NC_017949	TAA	2	6	26864	26869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853219
618	NC_017949	A	7	7	26868	26874	100 %	0 %	0 %	0 %	389853219
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621	NC_017949	CAG	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853219
622	NC_017949	TGGCT	2	10	26996	27005	0 %	40 %	40 %	20 %	389853219
623	NC_017949	ATTTT	2	10	27091	27100	20 %	80 %	0 %	0 %	389853219
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