MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 2138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017728	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	386730763
3	NC_017728	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	386730763
4	NC_017728	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386730764
5	NC_017728	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	386730767
6	NC_017728	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	386730769
7	NC_017728	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	386730770
8	NC_017728	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	386730772
9	NC_017728	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	386730773
10	NC_017728	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017728	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017728	ATGAA	2	10	19331	19340	60 %	20 %	20 %	0 %	386730776
13	NC_017728	GAATG	2	10	21073	21082	40 %	20 %	40 %	0 %	386730777
14	NC_017728	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	386730780
15	NC_017728	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	386730781
16	NC_017728	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	386730781
17	NC_017728	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	386730782
18	NC_017728	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	386730782
19	NC_017728	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017728	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	386730789
21	NC_017728	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	386730791
22	NC_017728	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	386730792
23	NC_017728	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	386730792
24	NC_017728	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	386730793
25	NC_017728	CCATA	2	10	35591	35600	40 %	20 %	0 %	40 %	386730794
26	NC_017728	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	386730795
27	NC_017728	AGATA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	386730795
28	NC_017728	AATTG	2	10	37004	37013	40 %	40 %	20 %	0 %	386730796
29	NC_017728	TAAAA	2	10	37256	37265	80 %	20 %	0 %	0 %	386730796
30	NC_017728	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017728	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017728	GAAAA	2	10	39246	39255	80 %	0 %	20 %	0 %	386730799
33	NC_017728	TGAAA	2	10	40401	40410	60 %	20 %	20 %	0 %	386730800
34	NC_017728	GAATG	2	10	42272	42281	40 %	20 %	40 %	0 %	386730802
35	NC_017728	AAATT	2	10	42399	42408	60 %	40 %	0 %	0 %	386730802
36	NC_017728	ATTTT	2	10	43005	43014	20 %	80 %	0 %	0 %	386730802
37	NC_017728	AAAAC	2	10	46632	46641	80 %	0 %	0 %	20 %	386730804
38	NC_017728	TTATT	2	10	48118	48127	20 %	80 %	0 %	0 %	386730806
39	NC_017728	GAAAA	2	10	49331	49340	80 %	0 %	20 %	0 %	386730806
40	NC_017728	ATAAA	2	10	50156	50165	80 %	20 %	0 %	0 %	386730807
41	NC_017728	ATTTT	2	10	51960	51969	20 %	80 %	0 %	0 %	386730809
42	NC_017728	GACAT	2	10	53173	53182	40 %	20 %	20 %	20 %	386730810
43	NC_017728	GACTT	2	10	53457	53466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017728	ATTTT	2	10	53543	53552	20 %	80 %	0 %	0 %	386730811
45	NC_017728	AAATG	2	10	54672	54681	60 %	20 %	20 %	0 %	386730812
46	NC_017728	ATGGT	2	10	55709	55718	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017728	GTAGA	2	10	55758	55767	40 %	20 %	40 %	0 %	386730813
48	NC_017728	TTACT	2	10	56740	56749	20 %	60 %	0 %	20 %	386730815
49	NC_017728	CAAAA	2	10	57247	57256	80 %	0 %	0 %	20 %	386730816
50	NC_017728	GAAAT	2	10	57397	57406	60 %	20 %	20 %	0 %	386730816
51	NC_017728	CTTAG	2	10	57496	57505	20 %	40 %	20 %	20 %	386730816
52	NC_017728	AAATA	2	10	57765	57774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017728	TAAAA	2	10	58747	58756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017728	TGCTA	2	10	58921	58930	20 %	40 %	20 %	20 %	386730819
55	NC_017728	TTTTA	2	10	59089	59098	20 %	80 %	0 %	0 %	386730819
56	NC_017728	AGTTA	2	10	60405	60414	40 %	40 %	20 %	0 %	386730820
57	NC_017728	TTATG	2	10	60954	60963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017728	AGTCT	2	10	61870	61879	20 %	40 %	20 %	20 %	386730821
59	NC_017728	TTTTA	2	10	64866	64875	20 %	80 %	0 %	0 %	386730824
60	NC_017728	AAACG	2	10	69235	69244	60 %	0 %	20 %	20 %	386730828
61	NC_017728	CAAAA	2	10	70735	70744	80 %	0 %	0 %	20 %	386730829
62	NC_017728	AACAA	2	10	72154	72163	80 %	0 %	0 %	20 %	386730831
63	NC_017728	GAGAG	2	10	76937	76946	40 %	0 %	60 %	0 %	386730833
64	NC_017728	GAAAA	2	10	77744	77753	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017728	GCAAA	2	10	78082	78091	60 %	0 %	20 %	20 %	386730835
66	NC_017728	CAATA	2	10	78149	78158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017728	CAAAA	2	10	79154	79163	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017728	TAATT	2	10	81229	81238	40 %	60 %	0 %	0 %	386730840
69	NC_017728	GCCTT	2	10	82286	82295	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017728	CAAAA	2	10	82571	82580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017728	AATTA	2	10	83467	83476	60 %	40 %	0 %	0 %	386730843
72	NC_017728	ATAAA	2	10	84551	84560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017728	ATAGC	2	10	84868	84877	40 %	20 %	20 %	20 %	386730844
74	NC_017728	GGAAG	2	10	85231	85240	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017728	GCTTT	2	10	85580	85589	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017728	GTATT	2	10	86457	86466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017728	AGTAA	2	10	87169	87178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017728	TTATA	2	10	87384	87393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017728	TATTT	2	10	87479	87488	20 %	80 %	0 %	0 %	386730847
80	NC_017728	GCTTG	2	10	89460	89469	0 %	40 %	40 %	20 %	386730848
81	NC_017728	GCGCT	2	10	91514	91523	0 %	20 %	40 %	40 %	386730850
82	NC_017728	AAACT	2	10	93106	93115	60 %	20 %	0 %	20 %	386730851
83	NC_017728	ATTTG	2	10	93318	93327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017728	ATTTA	2	10	93444	93453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017728	TAAAA	2	10	94515	94524	80 %	20 %	0 %	0 %	386730854
86	NC_017728	TTTGT	2	10	95620	95629	0 %	80 %	20 %	0 %	386730857
87	NC_017728	TTTCT	2	10	96358	96367	0 %	80 %	0 %	20 %	386730857
88	NC_017728	ATTTT	2	10	96607	96616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017728	CTAAA	2	10	98719	98728	60 %	20 %	0 %	20 %	386730859
90	NC_017728	GAAAA	2	10	100062	100071	80 %	0 %	20 %	0 %	386730859
91	NC_017728	TGAAA	2	10	100304	100313	60 %	20 %	20 %	0 %	386730859
92	NC_017728	AAATT	2	10	100648	100657	60 %	40 %	0 %	0 %	386730859
93	NC_017728	AGCGG	2	10	101232	101241	20 %	0 %	60 %	20 %	386730859
94	NC_017728	GGAAA	2	10	102411	102420	60 %	0 %	40 %	0 %	386730859
95	NC_017728	CGAAA	2	10	103727	103736	60 %	0 %	20 %	20 %	386730860
96	NC_017728	AAAAG	2	10	104040	104049	80 %	0 %	20 %	0 %	386730860
97	NC_017728	TGCAT	2	10	107700	107709	20 %	40 %	20 %	20 %	386730863
98	NC_017728	TTACT	2	10	107946	107955	20 %	60 %	0 %	20 %	386730863
99	NC_017728	GTTTT	2	10	109544	109553	0 %	80 %	20 %	0 %	386730865
100	NC_017728	TGGCT	2	10	109695	109704	0 %	40 %	40 %	20 %	386730865
101	NC_017728	ATATC	2	10	118556	118565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017728	AAAAG	2	10	121244	121253	80 %	0 %	20 %	0 %	386730879
103	NC_017728	ACGGT	2	10	122788	122797	20 %	20 %	40 %	20 %	386730880
104	NC_017728	GAAAT	2	10	124027	124036	60 %	20 %	20 %	0 %	386730881
105	NC_017728	GAATT	2	10	124668	124677	40 %	40 %	20 %	0 %	386730881
106	NC_017728	CTTTA	2	10	128872	128881	20 %	60 %	0 %	20 %	386730884
107	NC_017728	AGAGA	2	10	129382	129391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017728	CTCGA	2	10	130223	130232	20 %	20 %	20 %	40 %	386730886
109	NC_017728	TTCCA	2	10	130557	130566	20 %	40 %	0 %	40 %	386730886
110	NC_017728	TTACT	2	10	130821	130830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017728	TTTTA	2	10	131755	131764	20 %	80 %	0 %	0 %	386730888
112	NC_017728	AAAAG	2	10	132024	132033	80 %	0 %	20 %	0 %	386730889
113	NC_017728	AAAGT	2	10	133062	133071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017728	TTAGT	2	10	134184	134193	20 %	60 %	20 %	0 %	386730893
115	NC_017728	TGAAC	2	10	134866	134875	40 %	20 %	20 %	20 %	386730895
116	NC_017728	AGATG	2	10	134908	134917	40 %	20 %	40 %	0 %	386730895
117	NC_017728	TTTAT	2	10	137184	137193	20 %	80 %	0 %	0 %	386730896
118	NC_017728	AAGTG	2	10	139206	139215	40 %	20 %	40 %	0 %	386730898
119	NC_017728	AGTCT	2	10	139486	139495	20 %	40 %	20 %	20 %	386730898
120	NC_017728	TGTAA	2	10	140566	140575	40 %	40 %	20 %	0 %	386730900
121	NC_017728	AATTT	2	10	140948	140957	40 %	60 %	0 %	0 %	386730901
122	NC_017728	TTGTT	2	10	143314	143323	0 %	80 %	20 %	0 %	386730903
123	NC_017728	ATTTT	2	10	145116	145125	20 %	80 %	0 %	0 %	386730905
124	NC_017728	AAAAT	2	10	146618	146627	80 %	20 %	0 %	0 %	386730905
125	NC_017728	AACTT	2	10	147927	147936	40 %	40 %	0 %	20 %	386730908
126	NC_017728	ACAAA	2	10	148029	148038	80 %	0 %	0 %	20 %	386730908
127	NC_017728	ACTTG	2	10	148823	148832	20 %	40 %	20 %	20 %	386730908
128	NC_017728	CCACA	2	10	149164	149173	40 %	0 %	0 %	60 %	386730908
129	NC_017728	TTGGT	2	10	149619	149628	0 %	60 %	40 %	0 %	386730909
130	NC_017728	TGTTT	2	10	149962	149971	0 %	80 %	20 %	0 %	386730909
131	NC_017728	TATGA	2	10	152598	152607	40 %	40 %	20 %	0 %	386730913
132	NC_017728	TAACG	2	10	154447	154456	40 %	20 %	20 %	20 %	386730916
133	NC_017728	AGTAG	2	10	154769	154778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017728	ATAAA	2	10	155900	155909	80 %	20 %	0 %	0 %	386730919
135	NC_017728	ATCCG	2	10	157029	157038	20 %	20 %	20 %	40 %	386730921
136	NC_017728	TTTAA	2	10	157722	157731	40 %	60 %	0 %	0 %	386730921
137	NC_017728	AATTT	2	10	157908	157917	40 %	60 %	0 %	0 %	386730921
138	NC_017728	GATAA	2	10	158075	158084	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017728	AAACG	2	10	159058	159067	60 %	0 %	20 %	20 %	386730922
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