MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 4508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	386072489
2	NC_017551	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	386072489
3	NC_017551	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017551	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017551	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017551	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	386072493
7	NC_017551	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	386072493
8	NC_017551	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	386072493
9	NC_017551	AGTTA	2	10	8422	8431	40 %	40 %	20 %	0 %	386072493
10	NC_017551	GGAGG	2	10	9308	9317	20 %	0 %	80 %	0 %	386072494
11	NC_017551	GAGAT	2	10	9908	9917	40 %	20 %	40 %	0 %	386072494
12	NC_017551	AAGGA	2	10	10489	10498	60 %	0 %	40 %	0 %	386072494
13	NC_017551	GGTTT	2	10	11874	11883	0 %	60 %	40 %	0 %	386072495
14	NC_017551	GTTTT	2	10	12046	12055	0 %	80 %	20 %	0 %	386072495
15	NC_017551	ATGGA	2	10	12833	12842	40 %	20 %	40 %	0 %	386072497
16	NC_017551	TCAAG	2	10	13231	13240	40 %	20 %	20 %	20 %	386072497
17	NC_017551	GGATC	2	10	15268	15277	20 %	20 %	40 %	20 %	386072499
18	NC_017551	GTTTT	2	10	17761	17770	0 %	80 %	20 %	0 %	386072501
19	NC_017551	TTAGA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	20 %	0 %	386072501
20	NC_017551	TAAAA	2	10	18315	18324	80 %	20 %	0 %	0 %	386072501
21	NC_017551	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	AGATT	2	10	19909	19918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	GATTC	2	10	20612	20621	20 %	40 %	20 %	20 %	386072504
25	NC_017551	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017551	ATATT	2	10	21237	21246	40 %	60 %	0 %	0 %	386072505
27	NC_017551	AAAAT	2	10	21410	21419	80 %	20 %	0 %	0 %	386072505
28	NC_017551	ATTTT	2	10	24274	24283	20 %	80 %	0 %	0 %	386072509
29	NC_017551	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017551	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017551	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017551	GAAGT	2	10	28128	28137	40 %	20 %	40 %	0 %	386072511
33	NC_017551	GAAAA	2	10	29596	29605	80 %	0 %	20 %	0 %	386072512
34	NC_017551	TATTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	386072512
35	NC_017551	CGATC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	20 %	40 %	386072512
36	NC_017551	GAAAA	2	10	33464	33473	80 %	0 %	20 %	0 %	386072514
37	NC_017551	TATTT	2	10	34033	34042	20 %	80 %	0 %	0 %	386072515
38	NC_017551	GTTTG	2	10	34333	34342	0 %	60 %	40 %	0 %	386072515
39	NC_017551	TACTT	2	10	34446	34455	20 %	60 %	0 %	20 %	386072515
40	NC_017551	TTTCT	2	10	35375	35384	0 %	80 %	0 %	20 %	386072517
41	NC_017551	AGAAT	2	10	35668	35677	60 %	20 %	20 %	0 %	386072517
42	NC_017551	TACAT	2	10	36613	36622	40 %	40 %	0 %	20 %	386072518
43	NC_017551	TGTAA	2	10	37058	37067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017551	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	386072519
45	NC_017551	GTTTG	2	10	38454	38463	0 %	60 %	40 %	0 %	386072519
46	NC_017551	TAAAA	2	10	39505	39514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017551	AAAAT	2	10	40324	40333	80 %	20 %	0 %	0 %	386072520
48	NC_017551	TGGAA	2	10	41429	41438	40 %	20 %	40 %	0 %	386072522
49	NC_017551	TTAAA	2	10	42426	42435	60 %	40 %	0 %	0 %	386072523
50	NC_017551	GGAAA	2	10	42924	42933	60 %	0 %	40 %	0 %	386072523
51	NC_017551	ATCGA	2	10	43914	43923	40 %	20 %	20 %	20 %	386072523
52	NC_017551	GAATT	2	10	44747	44756	40 %	40 %	20 %	0 %	386072525
53	NC_017551	AAAAT	2	10	47121	47130	80 %	20 %	0 %	0 %	386072526
54	NC_017551	TTCAA	2	10	47983	47992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017551	TAAAG	2	10	49738	49747	60 %	20 %	20 %	0 %	386072528
56	NC_017551	AGATC	2	10	52231	52240	40 %	20 %	20 %	20 %	386072531
57	NC_017551	AAAAG	2	10	52927	52936	80 %	0 %	20 %	0 %	386072531
58	NC_017551	AACAT	2	10	55650	55659	60 %	20 %	0 %	20 %	386072533
59	NC_017551	TTTGA	2	10	58539	58548	20 %	60 %	20 %	0 %	386072536
60	NC_017551	TCGAT	2	10	59417	59426	20 %	40 %	20 %	20 %	386072537
61	NC_017551	AGGAT	2	10	59470	59479	40 %	20 %	40 %	0 %	386072537
62	NC_017551	TTTGT	2	10	60770	60779	0 %	80 %	20 %	0 %	386072538
63	NC_017551	GAAGA	2	10	61675	61684	60 %	0 %	40 %	0 %	386072538
64	NC_017551	TTTAT	2	10	63953	63962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017551	GAAAA	2	10	64961	64970	80 %	0 %	20 %	0 %	386072540
66	NC_017551	AAAAC	2	10	66616	66625	80 %	0 %	0 %	20 %	386072542
67	NC_017551	AATCT	2	10	67040	67049	40 %	40 %	0 %	20 %	386072542
68	NC_017551	GGGTT	2	10	69351	69360	0 %	40 %	60 %	0 %	386072544
69	NC_017551	ATACC	2	10	70795	70804	40 %	20 %	0 %	40 %	386072545
70	NC_017551	AGATA	2	10	71417	71426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017551	AAAAT	2	10	72234	72243	80 %	20 %	0 %	0 %	386072546
72	NC_017551	GAGAA	2	10	72539	72548	60 %	0 %	40 %	0 %	386072546
73	NC_017551	TTGAA	2	10	73686	73695	40 %	40 %	20 %	0 %	386072547
74	NC_017551	AAAGA	2	10	75262	75271	80 %	0 %	20 %	0 %	386072548
75	NC_017551	GGATT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	40 %	0 %	386072548
76	NC_017551	GGAAA	2	10	76061	76070	60 %	0 %	40 %	0 %	386072548
77	NC_017551	ATTTG	2	10	77817	77826	20 %	60 %	20 %	0 %	386072548
78	NC_017551	GGTTT	2	10	78368	78377	0 %	60 %	40 %	0 %	386072549
79	NC_017551	TTTTG	2	10	78388	78397	0 %	80 %	20 %	0 %	386072549
80	NC_017551	TCACT	2	10	80077	80086	20 %	40 %	0 %	40 %	386072550
81	NC_017551	AAGAA	2	10	81439	81448	80 %	0 %	20 %	0 %	386072550
82	NC_017551	AGAAT	2	10	82322	82331	60 %	20 %	20 %	0 %	386072550
83	NC_017551	CTAAA	2	10	83242	83251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017551	AATCA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	386072553
85	NC_017551	AATAC	2	10	85416	85425	60 %	20 %	0 %	20 %	386072553
86	NC_017551	TTCTT	2	10	85564	85573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017551	ATTAA	2	10	86553	86562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017551	ATTTT	2	10	87569	87578	20 %	80 %	0 %	0 %	386072556
89	NC_017551	GGATT	2	10	87990	87999	20 %	40 %	40 %	0 %	386072557
90	NC_017551	ATATT	2	10	88932	88941	40 %	60 %	0 %	0 %	386072557
91	NC_017551	AAGGA	2	10	90309	90318	60 %	0 %	40 %	0 %	386072558
92	NC_017551	AGGAA	2	10	91245	91254	60 %	0 %	40 %	0 %	386072559
93	NC_017551	CGGAA	2	10	94233	94242	40 %	0 %	40 %	20 %	386072563
94	NC_017551	TTGAG	2	10	94658	94667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017551	CCCAC	2	10	94825	94834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_017551	TGGTT	2	10	95861	95870	0 %	60 %	40 %	0 %	386072564
97	NC_017551	ATTTT	2	10	96711	96720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017551	TCAGA	2	10	97479	97488	40 %	20 %	20 %	20 %	386072566
99	NC_017551	GTTTT	2	10	98200	98209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017551	ATTTT	2	10	100496	100505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017551	GTAGA	2	10	101154	101163	40 %	20 %	40 %	0 %	386072571
102	NC_017551	CTTTC	2	10	102476	102485	0 %	60 %	0 %	40 %	386072572
103	NC_017551	GATTG	2	10	102842	102851	20 %	40 %	40 %	0 %	386072572
104	NC_017551	TAAAA	2	10	104105	104114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017551	ATATT	2	10	104729	104738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017551	TTGTA	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	386072574
107	NC_017551	TGTAC	2	10	105551	105560	20 %	40 %	20 %	20 %	386072574
108	NC_017551	CTTTT	2	10	105689	105698	0 %	80 %	0 %	20 %	386072574
109	NC_017551	ATTTT	2	10	109811	109820	20 %	80 %	0 %	0 %	386072578
110	NC_017551	CAAAT	2	10	110318	110327	60 %	20 %	0 %	20 %	386072578
111	NC_017551	TTATT	2	10	110463	110472	20 %	80 %	0 %	0 %	386072578
112	NC_017551	TATAA	2	10	111380	111389	60 %	40 %	0 %	0 %	386072579
113	NC_017551	ATTTT	2	10	112538	112547	20 %	80 %	0 %	0 %	386072580
114	NC_017551	TTTAT	2	10	113366	113375	20 %	80 %	0 %	0 %	386072580
115	NC_017551	AAAAT	2	10	116295	116304	80 %	20 %	0 %	0 %	386072584
116	NC_017551	TTTGT	2	10	116363	116372	0 %	80 %	20 %	0 %	386072584
117	NC_017551	AAAAT	2	10	116626	116635	80 %	20 %	0 %	0 %	386072584
118	NC_017551	TGGTT	2	10	116831	116840	0 %	60 %	40 %	0 %	386072584
119	NC_017551	AATTT	2	10	117826	117835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	ACTTT	2	10	118004	118013	20 %	60 %	0 %	20 %	386072585
121	NC_017551	AAGAA	2	10	118842	118851	80 %	0 %	20 %	0 %	386072585
122	NC_017551	AAATC	2	10	119328	119337	60 %	20 %	0 %	20 %	386072585
123	NC_017551	ATACA	2	10	120677	120686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017551	CCTTT	2	10	123941	123950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017551	TTTCT	2	10	124485	124494	0 %	80 %	0 %	20 %	386072589
126	NC_017551	AAAAT	2	10	124696	124705	80 %	20 %	0 %	0 %	386072590
127	NC_017551	AATCG	2	10	127810	127819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017551	ATTAA	2	10	128232	128241	60 %	40 %	0 %	0 %	386072593
129	NC_017551	TCCAA	2	10	128690	128699	40 %	20 %	0 %	40 %	386072593
130	NC_017551	ATTTT	2	10	129003	129012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017551	ACAAT	2	10	129202	129211	60 %	20 %	0 %	20 %	386072594
132	NC_017551	CTTTT	2	10	129329	129338	0 %	80 %	0 %	20 %	386072594
133	NC_017551	AAAAT	2	10	132852	132861	80 %	20 %	0 %	0 %	386072599
134	NC_017551	AGATC	2	10	133903	133912	40 %	20 %	20 %	20 %	386072599
135	NC_017551	TTTTA	2	10	134059	134068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	GAAAA	2	10	135292	135301	80 %	0 %	20 %	0 %	386072601
137	NC_017551	ATTTT	2	10	135574	135583	20 %	80 %	0 %	0 %	386072601
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139	NC_017551	AAAGA	2	10	136164	136173	80 %	0 %	20 %	0 %	386072601
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