MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 93504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017551	AG	3	6	249144	249149	50 %	0 %	50 %	0 %	386072698
5503	NC_017551	TCA	2	6	249156	249161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072698
5504	NC_017551	CTT	2	6	249168	249173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072698
5505	NC_017551	CTGA	2	8	249179	249186	25 %	25 %	25 %	25 %	386072698
5506	NC_017551	AAT	2	6	249206	249211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072698
5507	NC_017551	ATC	2	6	249227	249232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072698
5508	NC_017551	TGG	2	6	249442	249447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072698
5509	NC_017551	ATC	2	6	249472	249477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072698
5510	NC_017551	A	7	7	249508	249514	100 %	0 %	0 %	0 %	386072698
5511	NC_017551	ATCT	2	8	249517	249524	25 %	50 %	0 %	25 %	386072698
5512	NC_017551	CCA	2	6	249623	249628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386072698
5513	NC_017551	T	6	6	249651	249656	0 %	100 %	0 %	0 %	386072698
5514	NC_017551	CTT	2	6	249659	249664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072698
5515	NC_017551	TCT	2	6	249665	249670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072698
5516	NC_017551	GGAA	2	8	249675	249682	50 %	0 %	50 %	0 %	386072698
5517	NC_017551	TAA	2	6	249696	249701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072698
5518	NC_017551	ATCTAA	2	12	249727	249738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386072698
5519	NC_017551	CT	4	8	249747	249754	0 %	50 %	0 %	50 %	386072698
5520	NC_017551	T	6	6	249754	249759	0 %	100 %	0 %	0 %	386072698
5521	NC_017551	GTT	2	6	249794	249799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072698
5522	NC_017551	A	6	6	249847	249852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017551	GCTCA	2	10	249999	250008	20 %	20 %	20 %	40 %	386072699
5524	NC_017551	TCC	2	6	250055	250060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072699
5525	NC_017551	GTTT	2	8	250080	250087	0 %	75 %	25 %	0 %	386072699
5526	NC_017551	ATT	2	6	250201	250206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072699
5527	NC_017551	TGG	2	6	250265	250270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072699
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5529	NC_017551	TCAT	2	8	250357	250364	25 %	50 %	0 %	25 %	386072699
5530	NC_017551	TTC	2	6	250454	250459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072699
5531	NC_017551	TAT	3	9	250470	250478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072699
5532	NC_017551	GAA	2	6	250533	250538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072699
5533	NC_017551	CGAT	2	8	250648	250655	25 %	25 %	25 %	25 %	386072699
5534	NC_017551	GGAA	2	8	250688	250695	50 %	0 %	50 %	0 %	386072699
5535	NC_017551	CAA	3	9	250704	250712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072699
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5539	NC_017551	CGAA	2	8	250867	250874	50 %	0 %	25 %	25 %	386072699
5540	NC_017551	A	6	6	250877	250882	100 %	0 %	0 %	0 %	386072699
5541	NC_017551	ACG	2	6	250915	250920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072699
5542	NC_017551	A	7	7	250992	250998	100 %	0 %	0 %	0 %	386072699
5543	NC_017551	TTTCTG	2	12	251065	251076	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386072699
5544	NC_017551	AATT	2	8	251101	251108	50 %	50 %	0 %	0 %	386072699
5545	NC_017551	GAA	2	6	251151	251156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072699
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5547	NC_017551	A	7	7	251197	251203	100 %	0 %	0 %	0 %	386072699
5548	NC_017551	CG	3	6	251304	251309	0 %	0 %	50 %	50 %	386072699
5549	NC_017551	TGA	2	6	251332	251337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072699
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5551	NC_017551	GCC	2	6	251405	251410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386072699
5552	NC_017551	TA	3	6	251459	251464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017551	TTG	2	6	251471	251476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017551	CAA	2	6	251558	251563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_017551	AAG	2	6	251572	251577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017551	T	6	6	251595	251600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017551	A	6	6	251700	251705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017551	TAA	2	6	251724	251729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017551	AGC	2	6	251910	251915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017551	GTA	2	6	251935	251940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017551	T	7	7	251976	251982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017551	TTA	2	6	252016	252021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017551	T	6	6	252079	252084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017551	GTA	2	6	252170	252175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017551	TA	3	6	252178	252183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017551	GTT	2	6	252185	252190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017551	T	6	6	252306	252311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017551	GAA	2	6	252434	252439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017551	A	7	7	252545	252551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017551	GATC	2	8	252648	252655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5572	NC_017551	TAT	2	6	252761	252766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017551	CA	3	6	252804	252809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_017551	ATT	2	6	252811	252816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_017551	GACC	2	8	252893	252900	25 %	0 %	25 %	50 %	386072700
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5609	NC_017551	AGA	2	6	254505	254510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072700
5610	NC_017551	ATAC	2	8	254554	254561	50 %	25 %	0 %	25 %	386072700
5611	NC_017551	TCT	2	6	254564	254569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072700
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5616	NC_017551	GAAA	2	8	254786	254793	75 %	0 %	25 %	0 %	386072700
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5620	NC_017551	A	6	6	254898	254903	100 %	0 %	0 %	0 %	386072700
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