MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 67850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017546	A	6	6	44225	44230	100 %	0 %	0 %	0 %	386048968
1002	NC_017546	TGG	2	6	44244	44249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048968
1003	NC_017546	GAA	2	6	44302	44307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048968
1004	NC_017546	GAT	2	6	44344	44349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048968
1005	NC_017546	ATT	2	6	44353	44358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048968
1006	NC_017546	ACA	3	9	44397	44405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048968
1007	NC_017546	GT	3	6	44448	44453	0 %	50 %	50 %	0 %	386048968
1008	NC_017546	ATTA	2	8	44544	44551	50 %	50 %	0 %	0 %	386048968
1009	NC_017546	GTT	2	6	44557	44562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048968
1010	NC_017546	GAT	2	6	44572	44577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048968
1011	NC_017546	ACCA	2	8	44592	44599	50 %	0 %	0 %	50 %	386048968
1012	NC_017546	TAA	2	6	44619	44624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048968
1013	NC_017546	AGA	2	6	44625	44630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048968
1014	NC_017546	TCTT	2	8	44663	44670	0 %	75 %	0 %	25 %	386048968
1015	NC_017546	ATT	2	6	44740	44745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048968
1016	NC_017546	CTG	2	6	44780	44785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048968
1017	NC_017546	TTG	2	6	44896	44901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048968
1018	NC_017546	AT	3	6	44994	44999	50 %	50 %	0 %	0 %	386048968
1019	NC_017546	TGA	2	6	45000	45005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048968
1020	NC_017546	GCA	2	6	45016	45021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048968
1021	NC_017546	AGC	2	6	45045	45050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048968
1022	NC_017546	AAAG	2	8	45064	45071	75 %	0 %	25 %	0 %	386048968
1023	NC_017546	AAT	2	6	45087	45092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048968
1024	NC_017546	TTG	2	6	45146	45151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048968
1025	NC_017546	AGG	2	6	45246	45251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017546	GGC	2	6	45367	45372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048969
1027	NC_017546	TGG	2	6	45374	45379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048969
1028	NC_017546	CAA	2	6	45390	45395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048969
1029	NC_017546	AAG	2	6	45403	45408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048969
1030	NC_017546	ATG	3	9	45520	45528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048969
1031	NC_017546	T	6	6	45554	45559	0 %	100 %	0 %	0 %	386048969
1032	NC_017546	GCG	2	6	45583	45588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048969
1033	NC_017546	TCT	2	6	45617	45622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048969
1034	NC_017546	A	7	7	45665	45671	100 %	0 %	0 %	0 %	386048969
1035	NC_017546	ACT	2	6	45694	45699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048969
1036	NC_017546	ATTTT	2	10	45712	45721	20 %	80 %	0 %	0 %	386048969
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1038	NC_017546	AGA	2	6	45770	45775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048969
1039	NC_017546	GAAG	2	8	45789	45796	50 %	0 %	50 %	0 %	386048969
1040	NC_017546	A	7	7	45836	45842	100 %	0 %	0 %	0 %	386048969
1041	NC_017546	AAAC	2	8	45895	45902	75 %	0 %	0 %	25 %	386048969
1042	NC_017546	GTT	2	6	45945	45950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048969
1043	NC_017546	GAA	2	6	46039	46044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048969
1044	NC_017546	TTA	2	6	46084	46089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048969
1045	NC_017546	AG	3	6	46097	46102	50 %	0 %	50 %	0 %	386048969
1046	NC_017546	GCT	2	6	46158	46163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048969
1047	NC_017546	ATT	2	6	46197	46202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048969
1048	NC_017546	TGA	2	6	46214	46219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048969
1049	NC_017546	AAAGAT	2	12	46224	46235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386048969
1050	NC_017546	GGC	2	6	46308	46313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048969
1051	NC_017546	AAG	2	6	46369	46374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048969
1052	NC_017546	TTAA	2	8	46477	46484	50 %	50 %	0 %	0 %	386048970
1053	NC_017546	CAA	3	9	46526	46534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048970
1054	NC_017546	GAA	2	6	46666	46671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048970
1055	NC_017546	A	6	6	46677	46682	100 %	0 %	0 %	0 %	386048970
1056	NC_017546	ATT	2	6	46684	46689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048970
1057	NC_017546	A	6	6	46735	46740	100 %	0 %	0 %	0 %	386048970
1058	NC_017546	AAAC	2	8	46746	46753	75 %	0 %	0 %	25 %	386048970
1059	NC_017546	ATTT	2	8	46759	46766	25 %	75 %	0 %	0 %	386048970
1060	NC_017546	T	7	7	46764	46770	0 %	100 %	0 %	0 %	386048970
1061	NC_017546	TGC	2	6	46791	46796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048970
1062	NC_017546	GAT	2	6	46894	46899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048970
1063	NC_017546	TACG	2	8	46914	46921	25 %	25 %	25 %	25 %	386048970
1064	NC_017546	GAAAC	2	10	46970	46979	60 %	0 %	20 %	20 %	386048970
1065	NC_017546	ATA	2	6	47009	47014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048970
1066	NC_017546	ATT	2	6	47017	47022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048970
1067	NC_017546	TA	3	6	47045	47050	50 %	50 %	0 %	0 %	386048970
1068	NC_017546	TGAAAT	2	12	47061	47072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048970
1069	NC_017546	TAG	2	6	47154	47159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048970
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1071	NC_017546	GACTT	2	10	47209	47218	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_017546	TAAA	2	8	47242	47249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017546	AGTG	2	8	47259	47266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017546	TGG	2	6	47269	47274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048971
1075	NC_017546	TTA	2	6	47278	47283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048971
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1077	NC_017546	AAT	2	6	47337	47342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048971
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1083	NC_017546	TAA	2	6	47596	47601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048971
1084	NC_017546	A	6	6	47608	47613	100 %	0 %	0 %	0 %	386048971
1085	NC_017546	TTC	2	6	47631	47636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048971
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1088	NC_017546	TAG	2	6	47842	47847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048971
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1093	NC_017546	T	8	8	47940	47947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017546	TC	3	6	47961	47966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017546	TTAG	2	8	47993	48000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017546	TGA	2	6	48008	48013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048972
1097	NC_017546	TAT	2	6	48125	48130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048972
1098	NC_017546	TGA	2	6	48132	48137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048972
1099	NC_017546	ATG	2	6	48154	48159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048972
1100	NC_017546	T	7	7	48174	48180	0 %	100 %	0 %	0 %	386048972
1101	NC_017546	GA	3	6	48192	48197	50 %	0 %	50 %	0 %	386048972
1102	NC_017546	ATT	2	6	48332	48337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048972
1103	NC_017546	GAA	2	6	48355	48360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048972
1104	NC_017546	A	6	6	48388	48393	100 %	0 %	0 %	0 %	386048972
1105	NC_017546	AAATG	2	10	48426	48435	60 %	20 %	20 %	0 %	386048972
1106	NC_017546	T	6	6	48453	48458	0 %	100 %	0 %	0 %	386048972
1107	NC_017546	CAG	2	6	48497	48502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048972
1108	NC_017546	CCAG	2	8	48540	48547	25 %	0 %	25 %	50 %	386048972
1109	NC_017546	CAT	2	6	48589	48594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048972
1110	NC_017546	TGAA	2	8	48677	48684	50 %	25 %	25 %	0 %	386048972
1111	NC_017546	GAAC	2	8	48709	48716	50 %	0 %	25 %	25 %	386048972
1112	NC_017546	TTTA	2	8	48750	48757	25 %	75 %	0 %	0 %	386048972
1113	NC_017546	CAA	2	6	48886	48891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048972
1114	NC_017546	AT	6	12	48902	48913	50 %	50 %	0 %	0 %	386048972
1115	NC_017546	A	6	6	48917	48922	100 %	0 %	0 %	0 %	386048972
1116	NC_017546	ATG	2	6	49055	49060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048972
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1118	NC_017546	TTG	2	6	49293	49298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017546	ATA	2	6	49376	49381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017546	ATT	2	6	49403	49408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017546	GCTC	2	8	49413	49420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017546	ATGGT	2	10	49463	49472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017546	AGG	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017546	GTAGA	2	10	49512	49521	40 %	20 %	40 %	0 %	386048973
1125	NC_017546	CAT	2	6	49547	49552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048973
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1127	NC_017546	A	6	6	49578	49583	100 %	0 %	0 %	0 %	386048973
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