MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 67850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017546	CA	3	6	22497	22502	50 %	0 %	0 %	50 %	386048947
502	NC_017546	CTA	2	6	22523	22528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048947
503	NC_017546	TTC	2	6	22529	22534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048947
504	NC_017546	A	6	6	22598	22603	100 %	0 %	0 %	0 %	386048947
505	NC_017546	AAGC	2	8	22615	22622	50 %	0 %	25 %	25 %	386048947
506	NC_017546	GAA	2	6	22740	22745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048947
507	NC_017546	CTT	2	6	22833	22838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048947
508	NC_017546	A	6	6	22893	22898	100 %	0 %	0 %	0 %	386048947
509	NC_017546	ACA	2	6	22927	22932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048947
510	NC_017546	GAA	2	6	22958	22963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048947
511	NC_017546	A	6	6	22962	22967	100 %	0 %	0 %	0 %	386048947
512	NC_017546	A	6	6	22983	22988	100 %	0 %	0 %	0 %	386048947
513	NC_017546	TCA	2	6	23042	23047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017546	TTTTA	2	10	23061	23070	20 %	80 %	0 %	0 %	386048948
515	NC_017546	CG	3	6	23080	23085	0 %	0 %	50 %	50 %	386048948
516	NC_017546	T	7	7	23138	23144	0 %	100 %	0 %	0 %	386048948
517	NC_017546	GACCA	2	10	23145	23154	40 %	0 %	20 %	40 %	386048948
518	NC_017546	GTA	2	6	23164	23169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048948
519	NC_017546	ATT	2	6	23173	23178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048948
520	NC_017546	T	6	6	23254	23259	0 %	100 %	0 %	0 %	386048948
521	NC_017546	TTC	2	6	23303	23308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048948
522	NC_017546	T	6	6	23323	23328	0 %	100 %	0 %	0 %	386048948
523	NC_017546	TGGAT	2	10	23404	23413	20 %	40 %	40 %	0 %	386048948
524	NC_017546	T	6	6	23456	23461	0 %	100 %	0 %	0 %	386048948
525	NC_017546	GCA	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048948
526	NC_017546	AGTTGC	2	12	23584	23595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386048948
527	NC_017546	TAAAGC	2	12	23637	23648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386048948
528	NC_017546	GTT	2	6	23656	23661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048948
529	NC_017546	AGCC	2	8	23702	23709	25 %	0 %	25 %	50 %	386048948
530	NC_017546	GAAC	2	8	23738	23745	50 %	0 %	25 %	25 %	386048948
531	NC_017546	GTT	2	6	23759	23764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048948
532	NC_017546	GCC	3	9	23795	23803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386048948
533	NC_017546	A	7	7	23875	23881	100 %	0 %	0 %	0 %	386048948
534	NC_017546	A	6	6	24057	24062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017546	CG	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017546	TAT	3	9	24150	24158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048949
537	NC_017546	ATTA	2	8	24174	24181	50 %	50 %	0 %	0 %	386048949
538	NC_017546	A	6	6	24206	24211	100 %	0 %	0 %	0 %	386048949
539	NC_017546	AGA	2	6	24219	24224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048949
540	NC_017546	AAG	2	6	24235	24240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048949
541	NC_017546	TAC	2	6	24255	24260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048949
542	NC_017546	GTT	2	6	24262	24267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048949
543	NC_017546	GTAA	2	8	24331	24338	50 %	25 %	25 %	0 %	386048949
544	NC_017546	TAT	2	6	24342	24347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048949
545	NC_017546	GAA	2	6	24352	24357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048949
546	NC_017546	CAAAA	2	10	24405	24414	80 %	0 %	0 %	20 %	386048949
547	NC_017546	AGT	2	6	24435	24440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048949
548	NC_017546	A	6	6	24475	24480	100 %	0 %	0 %	0 %	386048949
549	NC_017546	TGA	2	6	24534	24539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048949
550	NC_017546	AAC	2	6	24559	24564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048949
551	NC_017546	AG	3	6	24681	24686	50 %	0 %	50 %	0 %	386048949
552	NC_017546	AAT	2	6	24718	24723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048949
553	NC_017546	AT	3	6	24807	24812	50 %	50 %	0 %	0 %	386048949
554	NC_017546	ATTGAA	2	12	24844	24855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386048949
555	NC_017546	A	6	6	24859	24864	100 %	0 %	0 %	0 %	386048949
556	NC_017546	ATTAT	2	10	24890	24899	40 %	60 %	0 %	0 %	386048950
557	NC_017546	GCA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048950
558	NC_017546	AAC	2	6	24960	24965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048950
559	NC_017546	GAA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048950
560	NC_017546	TTG	2	6	25073	25078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048950
561	NC_017546	AGG	2	6	25193	25198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048950
562	NC_017546	ATA	2	6	25217	25222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048950
563	NC_017546	TGA	2	6	25263	25268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048950
564	NC_017546	GGA	2	6	25272	25277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048950
565	NC_017546	CAA	2	6	25348	25353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048951
566	NC_017546	TTG	2	6	25390	25395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048951
567	NC_017546	ATG	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048951
568	NC_017546	A	6	6	25409	25414	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
569	NC_017546	CTG	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048951
570	NC_017546	GCA	2	6	25488	25493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048951
571	NC_017546	AAT	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048951
572	NC_017546	AAT	2	6	25503	25508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048951
573	NC_017546	GCA	2	6	25523	25528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048951
574	NC_017546	A	7	7	25643	25649	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
575	NC_017546	ATT	2	6	25687	25692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048951
576	NC_017546	A	7	7	25766	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
577	NC_017546	AAG	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017546	GTTA	2	8	25827	25834	25 %	50 %	25 %	0 %	386048952
579	NC_017546	TAA	2	6	25895	25900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048952
580	NC_017546	CGG	2	6	25995	26000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048952
581	NC_017546	TCG	2	6	26033	26038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048952
582	NC_017546	TCAGG	2	10	26059	26068	20 %	20 %	40 %	20 %	386048952
583	NC_017546	CAG	2	6	26198	26203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048952
584	NC_017546	CG	4	8	26246	26253	0 %	0 %	50 %	50 %	386048952
585	NC_017546	TGG	2	6	26349	26354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048952
586	NC_017546	TTC	2	6	26357	26362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048952
587	NC_017546	AGT	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048952
588	NC_017546	CAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048952
589	NC_017546	TCG	2	6	26411	26416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048952
590	NC_017546	AGC	3	9	26439	26447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048952
591	NC_017546	ATC	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048952
592	NC_017546	CAAA	2	8	26511	26518	75 %	0 %	0 %	25 %	386048952
593	NC_017546	GAG	2	6	26569	26574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048952
594	NC_017546	AGC	2	6	26641	26646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048953
595	NC_017546	GTTG	2	8	26655	26662	0 %	50 %	50 %	0 %	386048953
596	NC_017546	GCCA	2	8	26666	26673	25 %	0 %	25 %	50 %	386048953
597	NC_017546	ATG	2	6	26696	26701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
598	NC_017546	TGA	3	9	26755	26763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
599	NC_017546	ATG	2	6	26774	26779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
600	NC_017546	GGT	2	6	26819	26824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048953
601	NC_017546	AAAG	2	8	26863	26870	75 %	0 %	25 %	0 %	386048953
602	NC_017546	AAG	2	6	26877	26882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048953
603	NC_017546	CGA	2	6	26958	26963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048953
604	NC_017546	AT	3	6	26983	26988	50 %	50 %	0 %	0 %	386048953
605	NC_017546	TTTAC	2	10	27059	27068	20 %	60 %	0 %	20 %	386048953
606	NC_017546	GTC	2	6	27164	27169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048953
607	NC_017546	A	7	7	27323	27329	100 %	0 %	0 %	0 %	386048953
608	NC_017546	TTA	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048953
609	NC_017546	ATT	2	6	27371	27376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048953
610	NC_017546	GGA	2	6	27416	27421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017546	T	6	6	27443	27448	0 %	100 %	0 %	0 %	386048954
612	NC_017546	GGA	2	6	27469	27474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048954
613	NC_017546	A	6	6	27480	27485	100 %	0 %	0 %	0 %	386048954
614	NC_017546	TCA	2	6	27502	27507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048954
615	NC_017546	AGC	2	6	27508	27513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
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617	NC_017546	ACG	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
618	NC_017546	ATT	2	6	27548	27553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
619	NC_017546	AGG	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048954
620	NC_017546	TTA	2	6	27633	27638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
621	NC_017546	CTG	2	6	27645	27650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048954
622	NC_017546	TTA	2	6	27655	27660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
623	NC_017546	AT	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	386048954
624	NC_017546	TTG	2	6	27807	27812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048954
625	NC_017546	CAG	2	6	27837	27842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
626	NC_017546	TTG	2	6	27866	27871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048954
627	NC_017546	CAA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048954
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