MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 9212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	386045635
2	NC_017545	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	386045635
3	NC_017545	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	386045635
4	NC_017545	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	386045635
5	NC_017545	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017545	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	386045636
7	NC_017545	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	386045636
8	NC_017545	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017545	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	386045638
10	NC_017545	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	386045639
11	NC_017545	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	386045639
12	NC_017545	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	386045639
13	NC_017545	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	386045639
14	NC_017545	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	386045639
15	NC_017545	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017545	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	386045640
17	NC_017545	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	386045640
18	NC_017545	TAAA	2	8	7135	7142	75 %	25 %	0 %	0 %	386045640
19	NC_017545	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	386045640
20	NC_017545	TAAA	2	8	8105	8112	75 %	25 %	0 %	0 %	386045641
21	NC_017545	ATGA	2	8	8221	8228	50 %	25 %	25 %	0 %	386045641
22	NC_017545	AATT	2	8	9248	9255	50 %	50 %	0 %	0 %	386045641
23	NC_017545	ACAA	2	8	9317	9324	75 %	0 %	0 %	25 %	386045641
24	NC_017545	ATTA	2	8	9411	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	386045641
25	NC_017545	CTAA	2	8	9592	9599	50 %	25 %	0 %	25 %	386045641
26	NC_017545	ACTT	2	8	9827	9834	25 %	50 %	0 %	25 %	386045641
27	NC_017545	ATCT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	0 %	25 %	386045641
28	NC_017545	AAAC	2	8	10225	10232	75 %	0 %	0 %	25 %	386045641
29	NC_017545	AATC	2	8	10790	10797	50 %	25 %	0 %	25 %	386045642
30	NC_017545	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	386045642
31	NC_017545	TCCT	2	8	11583	11590	0 %	50 %	0 %	50 %	386045642
32	NC_017545	ATTA	2	8	13667	13674	50 %	50 %	0 %	0 %	386045644
33	NC_017545	ATTT	2	8	14007	14014	25 %	75 %	0 %	0 %	386045645
34	NC_017545	ATGC	2	8	14557	14564	25 %	25 %	25 %	25 %	386045645
35	NC_017545	TGTA	2	8	15296	15303	25 %	50 %	25 %	0 %	386045646
36	NC_017545	ACCG	2	8	16684	16691	25 %	0 %	25 %	50 %	386045647
37	NC_017545	TACA	2	8	16818	16825	50 %	25 %	0 %	25 %	386045647
38	NC_017545	AGCT	2	8	16929	16936	25 %	25 %	25 %	25 %	386045647
39	NC_017545	CAAA	2	8	17278	17285	75 %	0 %	0 %	25 %	386045647
40	NC_017545	TGCT	2	8	17519	17526	0 %	50 %	25 %	25 %	386045648
41	NC_017545	TTTA	2	8	17658	17665	25 %	75 %	0 %	0 %	386045648
42	NC_017545	ATTA	2	8	18018	18025	50 %	50 %	0 %	0 %	386045648
43	NC_017545	GCTT	2	8	18069	18076	0 %	50 %	25 %	25 %	386045648
44	NC_017545	ACCG	2	8	18393	18400	25 %	0 %	25 %	50 %	386045648
45	NC_017545	GTTT	2	8	18718	18725	0 %	75 %	25 %	0 %	386045648
46	NC_017545	TGTC	2	8	19106	19113	0 %	50 %	25 %	25 %	386045648
47	NC_017545	TCGT	2	8	19203	19210	0 %	50 %	25 %	25 %	386045648
48	NC_017545	ACTT	2	8	19437	19444	25 %	50 %	0 %	25 %	386045649
49	NC_017545	GGCT	2	8	19457	19464	0 %	25 %	50 %	25 %	386045649
50	NC_017545	TATT	2	8	19834	19841	25 %	75 %	0 %	0 %	386045649
51	NC_017545	TTCA	2	8	20092	20099	25 %	50 %	0 %	25 %	386045650
52	NC_017545	GGAC	2	8	21777	21784	25 %	0 %	50 %	25 %	386045652
53	NC_017545	AATC	2	8	22335	22342	50 %	25 %	0 %	25 %	386045652
54	NC_017545	AAGC	2	8	22679	22686	50 %	0 %	25 %	25 %	386045652
55	NC_017545	AGCC	2	8	23766	23773	25 %	0 %	25 %	50 %	386045653
56	NC_017545	GAAC	2	8	23802	23809	50 %	0 %	25 %	25 %	386045653
57	NC_017545	ATTA	2	8	24238	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	386045654
58	NC_017545	GTAA	2	8	24395	24402	50 %	25 %	25 %	0 %	386045654
59	NC_017545	GTTA	2	8	25891	25898	25 %	50 %	25 %	0 %	386045657
60	NC_017545	CAAA	2	8	26575	26582	75 %	0 %	0 %	25 %	386045657
61	NC_017545	GTTG	2	8	26719	26726	0 %	50 %	50 %	0 %	386045658
62	NC_017545	GCCA	2	8	26730	26737	25 %	0 %	25 %	50 %	386045658
63	NC_017545	AAAG	2	8	26927	26934	75 %	0 %	25 %	0 %	386045658
64	NC_017545	GTTA	2	8	28365	28372	25 %	50 %	25 %	0 %	386045660
65	NC_017545	GTCC	2	8	28434	28441	0 %	25 %	25 %	50 %	386045660
66	NC_017545	TGAT	2	8	28486	28493	25 %	50 %	25 %	0 %	386045660
67	NC_017545	AAAT	2	8	28904	28911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017545	AGGA	2	8	29082	29089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017545	GAAA	2	8	29225	29232	75 %	0 %	25 %	0 %	386045661
70	NC_017545	GAAG	2	8	29361	29368	50 %	0 %	50 %	0 %	386045661
71	NC_017545	TTGG	2	8	29497	29504	0 %	50 %	50 %	0 %	386045661
72	NC_017545	GTAC	2	8	29521	29528	25 %	25 %	25 %	25 %	386045661
73	NC_017545	ATTT	2	8	30209	30216	25 %	75 %	0 %	0 %	386045661
74	NC_017545	AACT	2	8	30917	30924	50 %	25 %	0 %	25 %	386045661
75	NC_017545	CAAT	2	8	30926	30933	50 %	25 %	0 %	25 %	386045661
76	NC_017545	TAAA	2	8	31011	31018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017545	CAAA	2	8	31227	31234	75 %	0 %	0 %	25 %	386045662
78	NC_017545	CTTC	2	8	32435	32442	0 %	50 %	0 %	50 %	386045663
79	NC_017545	GGTA	2	8	33449	33456	25 %	25 %	50 %	0 %	386045665
80	NC_017545	CAAT	2	8	34270	34277	50 %	25 %	0 %	25 %	386045666
81	NC_017545	TAAA	2	8	34374	34381	75 %	25 %	0 %	0 %	386045666
82	NC_017545	TTGA	2	8	34651	34658	25 %	50 %	25 %	0 %	386045666
83	NC_017545	AAGC	2	8	35045	35052	50 %	0 %	25 %	25 %	386045667
84	NC_017545	TAAG	2	8	35487	35494	50 %	25 %	25 %	0 %	386045667
85	NC_017545	TTAA	2	8	35528	35535	50 %	50 %	0 %	0 %	386045667
86	NC_017545	CATT	2	8	35767	35774	25 %	50 %	0 %	25 %	386045668
87	NC_017545	TGAA	2	8	35984	35991	50 %	25 %	25 %	0 %	386045668
88	NC_017545	CCTT	2	8	37487	37494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017545	ACTA	2	8	37993	38000	50 %	25 %	0 %	25 %	386045671
90	NC_017545	AATA	2	8	38032	38039	75 %	25 %	0 %	0 %	386045671
91	NC_017545	AAAC	2	8	38947	38954	75 %	0 %	0 %	25 %	386045672
92	NC_017545	TTGT	2	8	39098	39105	0 %	75 %	25 %	0 %	386045672
93	NC_017545	TTGG	2	8	39128	39135	0 %	50 %	50 %	0 %	386045672
94	NC_017545	AAAC	2	8	39143	39150	75 %	0 %	0 %	25 %	386045672
95	NC_017545	TATT	2	8	39156	39163	25 %	75 %	0 %	0 %	386045672
96	NC_017545	AACT	2	8	39401	39408	50 %	25 %	0 %	25 %	386045672
97	NC_017545	GGCT	2	8	40359	40366	0 %	25 %	50 %	25 %	386045673
98	NC_017545	GATG	2	8	41009	41016	25 %	25 %	50 %	0 %	386045673
99	NC_017545	AACA	2	8	41282	41289	75 %	0 %	0 %	25 %	386045673
100	NC_017545	TTTA	2	8	41458	41465	25 %	75 %	0 %	0 %	386045673
101	NC_017545	AAAC	2	8	41511	41518	75 %	0 %	0 %	25 %	386045673
102	NC_017545	CAAT	2	8	41895	41902	50 %	25 %	0 %	25 %	386045673
103	NC_017545	GCGG	2	8	42543	42550	0 %	0 %	75 %	25 %	386045674
104	NC_017545	TTAG	2	8	42609	42616	25 %	50 %	25 %	0 %	386045674
105	NC_017545	TACC	2	8	43392	43399	25 %	25 %	0 %	50 %	386045674
106	NC_017545	CAAA	2	8	43555	43562	75 %	0 %	0 %	25 %	386045675
107	NC_017545	CAAC	2	8	44045	44052	50 %	0 %	0 %	50 %	386045675
108	NC_017545	AAAT	2	8	44493	44500	75 %	25 %	0 %	0 %	386045675
109	NC_017545	AAAT	2	8	44782	44789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017545	TTCT	2	8	45086	45093	0 %	75 %	0 %	25 %	386045676
111	NC_017545	ATTA	2	8	46171	46178	50 %	50 %	0 %	0 %	386045677
112	NC_017545	TTGT	2	8	46207	46214	0 %	75 %	25 %	0 %	386045677
113	NC_017545	ATTT	2	8	46396	46403	25 %	75 %	0 %	0 %	386045677
114	NC_017545	ATTT	2	8	46479	46486	25 %	75 %	0 %	0 %	386045677
115	NC_017545	ACGT	2	8	47592	47599	25 %	25 %	25 %	25 %	386045678
116	NC_017545	ATTT	2	8	47897	47904	25 %	75 %	0 %	0 %	386045678
117	NC_017545	GGAA	2	8	48136	48143	50 %	0 %	50 %	0 %	386045678
118	NC_017545	CGAC	2	8	48163	48170	25 %	0 %	25 %	50 %	386045678
119	NC_017545	ATTA	2	8	48185	48192	50 %	50 %	0 %	0 %	386045678
120	NC_017545	TGGT	2	8	48291	48298	0 %	50 %	50 %	0 %	386045678
121	NC_017545	ATTA	2	8	48709	48716	50 %	50 %	0 %	0 %	386045679
122	NC_017545	ACCA	2	8	48757	48764	50 %	0 %	0 %	50 %	386045679
123	NC_017545	TCTT	2	8	48828	48835	0 %	75 %	0 %	25 %	386045679
124	NC_017545	AAAG	2	8	49229	49236	75 %	0 %	25 %	0 %	386045679
125	NC_017545	GAAG	2	8	49954	49961	50 %	0 %	50 %	0 %	386045680
126	NC_017545	AAAC	2	8	50060	50067	75 %	0 %	0 %	25 %	386045680
127	NC_017545	TTAA	2	8	50642	50649	50 %	50 %	0 %	0 %	386045681
128	NC_017545	AAAC	2	8	50911	50918	75 %	0 %	0 %	25 %	386045681
129	NC_017545	ATTT	2	8	50924	50931	25 %	75 %	0 %	0 %	386045681
130	NC_017545	TACG	2	8	51079	51086	25 %	25 %	25 %	25 %	386045681
131	NC_017545	ATAA	2	8	51345	51352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017545	TAAA	2	8	51407	51414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017545	AGTG	2	8	51424	51431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017545	TTAG	2	8	52158	52165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017545	CCAG	2	8	52705	52712	25 %	0 %	25 %	50 %	386045683
136	NC_017545	TGAA	2	8	52842	52849	50 %	25 %	25 %	0 %	386045683
137	NC_017545	GAAC	2	8	52874	52881	50 %	0 %	25 %	25 %	386045683
138	NC_017545	TTTA	2	8	52915	52922	25 %	75 %	0 %	0 %	386045683
139	NC_017545	GCTC	2	8	53578	53585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017545	GGCG	2	8	54244	54251	0 %	0 %	75 %	25 %	386045685
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142	NC_017545	TAAA	2	8	55684	55691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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