MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017545	AATG	2	8	171553	171560	50 %	25 %	25 %	0 %	386045809
4002	NC_017545	TTTA	2	8	171603	171610	25 %	75 %	0 %	0 %	386045809
4003	NC_017545	AGA	2	6	171655	171660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045809
4004	NC_017545	AC	3	6	171675	171680	50 %	0 %	0 %	50 %	386045809
4005	NC_017545	CAG	2	6	171702	171707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4006	NC_017545	GAC	2	6	171767	171772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4007	NC_017545	TGT	2	6	171781	171786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045809
4008	NC_017545	A	6	6	171805	171810	100 %	0 %	0 %	0 %	386045809
4009	NC_017545	CTA	2	6	171814	171819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045809
4010	NC_017545	AGT	2	6	171850	171855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045809
4011	NC_017545	AACG	2	8	171866	171873	50 %	0 %	25 %	25 %	386045809
4012	NC_017545	A	6	6	171914	171919	100 %	0 %	0 %	0 %	386045809
4013	NC_017545	TTCCA	2	10	171931	171940	20 %	40 %	0 %	40 %	386045809
4014	NC_017545	AAAGTG	2	12	171974	171985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386045809
4015	NC_017545	GAC	2	6	172007	172012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4016	NC_017545	ATA	2	6	172062	172067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045809
4017	NC_017545	AGA	2	6	172123	172128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045809
4018	NC_017545	AGA	2	6	172144	172149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045809
4019	NC_017545	CTG	2	6	172151	172156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4020	NC_017545	AGC	2	6	172183	172188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4021	NC_017545	TGA	2	6	172237	172242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045809
4022	NC_017545	AAG	2	6	172275	172280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045809
4023	NC_017545	TTAC	2	8	172341	172348	25 %	50 %	0 %	25 %	386045809
4024	NC_017545	ATT	2	6	172388	172393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045809
4025	NC_017545	GGT	2	6	172400	172405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045809
4026	NC_017545	AAG	2	6	172425	172430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045809
4027	NC_017545	GAT	2	6	172460	172465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045809
4028	NC_017545	CAG	2	6	172506	172511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4029	NC_017545	CAG	2	6	172521	172526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045809
4030	NC_017545	TA	3	6	172557	172562	50 %	50 %	0 %	0 %	386045809
4031	NC_017545	CGAA	2	8	172587	172594	50 %	0 %	25 %	25 %	386045809
4032	NC_017545	AAT	2	6	172613	172618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045809
4033	NC_017545	A	6	6	172760	172765	100 %	0 %	0 %	0 %	386045809
4034	NC_017545	ACC	2	6	172792	172797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045809
4035	NC_017545	TAA	2	6	172811	172816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045809
4036	NC_017545	T	6	6	172859	172864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017545	TGA	2	6	172902	172907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017545	TTGT	2	8	172917	172924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017545	ACTA	2	8	172962	172969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_017545	TAA	2	6	173005	173010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017545	GAT	2	6	173020	173025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017545	ATTA	2	8	173026	173033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017545	GGA	2	6	173040	173045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017545	GTT	3	9	173068	173076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017545	CAA	2	6	173162	173167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017545	TAC	2	6	173172	173177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017545	CAT	2	6	173246	173251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045810
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4049	NC_017545	ACT	2	6	173269	173274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045810
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4051	NC_017545	ATA	2	6	173377	173382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045810
4052	NC_017545	AGA	2	6	173403	173408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045810
4053	NC_017545	TAG	2	6	173456	173461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045810
4054	NC_017545	CAA	2	6	173462	173467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045810
4055	NC_017545	AAC	2	6	173530	173535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045810
4056	NC_017545	AAT	3	9	173596	173604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045810
4057	NC_017545	AC	3	6	173649	173654	50 %	0 %	0 %	50 %	386045810
4058	NC_017545	AACCT	2	10	173702	173711	40 %	20 %	0 %	40 %	386045810
4059	NC_017545	GAA	2	6	173786	173791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045810
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4061	NC_017545	ATT	2	6	173882	173887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045810
4062	NC_017545	TGA	2	6	173895	173900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045810
4063	NC_017545	AGT	2	6	173944	173949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045810
4064	NC_017545	AACT	2	8	173954	173961	50 %	25 %	0 %	25 %	386045810
4065	NC_017545	AAG	2	6	174009	174014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045810
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4071	NC_017545	TGA	2	6	174270	174275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045810
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4082	NC_017545	AT	3	6	175272	175277	50 %	50 %	0 %	0 %	386045810
4083	NC_017545	AAC	2	6	175324	175329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045810
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4088	NC_017545	A	7	7	175550	175556	100 %	0 %	0 %	0 %	386045810
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4092	NC_017545	A	6	6	175927	175932	100 %	0 %	0 %	0 %	386045811
4093	NC_017545	TTTTG	2	10	175968	175977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017545	TAG	2	6	175979	175984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017545	TAC	2	6	176027	176032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017545	TAT	2	6	176050	176055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017545	AAAG	2	8	176064	176071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017545	A	7	7	176095	176101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017545	CGC	2	6	176151	176156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_017545	AAG	2	6	176168	176173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017545	TAT	2	6	176202	176207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017545	GTAAAA	2	12	176233	176244	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017545	A	6	6	176241	176246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017545	CTA	2	6	176268	176273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017545	ACCT	2	8	176344	176351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_017545	GAAG	2	8	176485	176492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017545	CAA	2	6	176737	176742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017545	AGC	2	6	176781	176786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_017545	T	9	9	176849	176857	0 %	100 %	0 %	0 %	386045812
4110	NC_017545	ATA	2	6	176870	176875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045812
4111	NC_017545	AAG	2	6	176895	176900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045812
4112	NC_017545	GAT	2	6	176920	176925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045812
4113	NC_017545	GTT	2	6	176947	176952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045812
4114	NC_017545	GTT	2	6	176968	176973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045812
4115	NC_017545	T	6	6	176972	176977	0 %	100 %	0 %	0 %	386045812
4116	NC_017545	TACTAG	2	12	176987	176998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386045812
4117	NC_017545	TAT	2	6	177005	177010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045812
4118	NC_017545	TTA	2	6	177037	177042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045812
4119	NC_017545	ACT	2	6	177043	177048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045812
4120	NC_017545	T	6	6	177111	177116	0 %	100 %	0 %	0 %	386045812
4121	NC_017545	T	7	7	177200	177206	0 %	100 %	0 %	0 %	386045812
4122	NC_017545	CTGA	2	8	177212	177219	25 %	25 %	25 %	25 %	386045812
4123	NC_017545	TTA	2	6	177265	177270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045812
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