MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43238	NC_017545	CTT	2	6	1881304	1881309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047461
43239	NC_017545	GCT	2	6	1881381	1881386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047461
43240	NC_017545	CAA	2	6	1881451	1881456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386047461
43241	NC_017545	TAA	2	6	1881581	1881586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386047461
43242	NC_017545	TAA	2	6	1881604	1881609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386047461
43243	NC_017545	CAT	3	9	1881643	1881651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047461
43244	NC_017545	T	8	8	1881655	1881662	0 %	100 %	0 %	0 %	386047461
43245	NC_017545	CTG	2	6	1881676	1881681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047461
43246	NC_017545	T	6	6	1881703	1881708	0 %	100 %	0 %	0 %	386047461
43247	NC_017545	TCC	2	6	1881759	1881764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386047462
43248	NC_017545	TACTTT	2	12	1881765	1881776	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386047462
43249	NC_017545	AACA	2	8	1881904	1881911	75 %	0 %	0 %	25 %	386047462
43250	NC_017545	T	6	6	1881963	1881968	0 %	100 %	0 %	0 %	386047462
43251	NC_017545	AAG	2	6	1881970	1881975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386047462
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43257	NC_017545	TCT	2	6	1882213	1882218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047462
43258	NC_017545	CG	3	6	1882241	1882246	0 %	0 %	50 %	50 %	386047462
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43261	NC_017545	T	6	6	1882527	1882532	0 %	100 %	0 %	0 %	386047462
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43264	NC_017545	GTAT	2	8	1882585	1882592	25 %	50 %	25 %	0 %	386047462
43265	NC_017545	ATTT	2	8	1882626	1882633	25 %	75 %	0 %	0 %	386047462
43266	NC_017545	AGA	2	6	1882651	1882656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386047462
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43269	NC_017545	TGT	2	6	1882867	1882872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386047463
43270	NC_017545	CTTTTG	2	12	1882888	1882899	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386047463
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43272	NC_017545	GAAC	2	8	1882926	1882933	50 %	0 %	25 %	25 %	386047463
43273	NC_017545	TGT	2	6	1882952	1882957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386047463
43274	NC_017545	CGG	2	6	1882981	1882986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386047463
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43277	NC_017545	CT	3	6	1883186	1883191	0 %	50 %	0 %	50 %	386047463
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43281	NC_017545	T	6	6	1883362	1883367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43282	NC_017545	CTA	2	6	1883388	1883393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43283	NC_017545	A	7	7	1883404	1883410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43284	NC_017545	TTG	2	6	1883454	1883459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43285	NC_017545	TTA	2	6	1883473	1883478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43286	NC_017545	T	7	7	1883500	1883506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43287	NC_017545	CTT	2	6	1883554	1883559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047464
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43290	NC_017545	GGCG	2	8	1883638	1883645	0 %	0 %	75 %	25 %	386047464
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43293	NC_017545	ATC	2	6	1883790	1883795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047464
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43296	NC_017545	T	7	7	1883992	1883998	0 %	100 %	0 %	0 %	386047464
43297	NC_017545	CTG	2	6	1884031	1884036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047464
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43299	NC_017545	ATTT	2	8	1884082	1884089	25 %	75 %	0 %	0 %	386047464
43300	NC_017545	TTC	2	6	1884140	1884145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047464
43301	NC_017545	TGA	2	6	1884171	1884176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386047464
43302	NC_017545	CAG	2	6	1884262	1884267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386047464
43303	NC_017545	ATAA	2	8	1884345	1884352	75 %	25 %	0 %	0 %	386047464
43304	NC_017545	ACG	2	6	1884386	1884391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386047464
43305	NC_017545	TGC	2	6	1884411	1884416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047464
43306	NC_017545	TAA	2	6	1884424	1884429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386047464
43307	NC_017545	GAT	2	6	1884442	1884447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386047464
43308	NC_017545	CTTTC	2	10	1884536	1884545	0 %	60 %	0 %	40 %	386047464
43309	NC_017545	CTA	2	6	1884595	1884600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047464
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43315	NC_017545	CTT	2	6	1885054	1885059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047464
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43317	NC_017545	GTTG	2	8	1885276	1885283	0 %	50 %	50 %	0 %	386047464
43318	NC_017545	A	6	6	1885284	1885289	100 %	0 %	0 %	0 %	386047464
43319	NC_017545	TGA	2	6	1885297	1885302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386047464
43320	NC_017545	AG	3	6	1885328	1885333	50 %	0 %	50 %	0 %	386047464
43321	NC_017545	T	6	6	1885340	1885345	0 %	100 %	0 %	0 %	386047464
43322	NC_017545	TTC	2	6	1885403	1885408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047464
43323	NC_017545	TTC	2	6	1885520	1885525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047464
43324	NC_017545	TCAC	2	8	1885566	1885573	25 %	25 %	0 %	50 %	386047464
43325	NC_017545	TCT	2	6	1885579	1885584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047465
43326	NC_017545	GCC	2	6	1885633	1885638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386047465
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43328	NC_017545	TCA	2	6	1885711	1885716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047465
43329	NC_017545	CTG	2	6	1885754	1885759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047465
43330	NC_017545	TTGC	2	8	1885766	1885773	0 %	50 %	25 %	25 %	386047465
43331	NC_017545	CA	4	8	1885832	1885839	50 %	0 %	0 %	50 %	386047465
43332	NC_017545	CATCGC	2	12	1885863	1885874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386047465
43333	NC_017545	GCT	3	9	1885903	1885911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047465
43334	NC_017545	CGC	2	6	1885917	1885922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386047465
43335	NC_017545	CCA	2	6	1885963	1885968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386047465
43336	NC_017545	ATT	2	6	1885989	1885994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386047465
43337	NC_017545	CAA	2	6	1885997	1886002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386047465
43338	NC_017545	CTG	2	6	1886018	1886023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047465
43339	NC_017545	A	6	6	1886078	1886083	100 %	0 %	0 %	0 %	386047465
43340	NC_017545	AAG	2	6	1886206	1886211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386047465
43341	NC_017545	T	6	6	1886217	1886222	0 %	100 %	0 %	0 %	386047465
43342	NC_017545	CTT	2	6	1886303	1886308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047465
43343	NC_017545	ATA	2	6	1886311	1886316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386047465
43344	NC_017545	TTC	2	6	1886346	1886351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386047465
43345	NC_017545	CTA	2	6	1886429	1886434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047465
43346	NC_017545	CACT	2	8	1886463	1886470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43347	NC_017545	ACT	2	6	1886588	1886593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386047466
43348	NC_017545	TTG	2	6	1886664	1886669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386047466
43349	NC_017545	TCG	2	6	1886695	1886700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047466
43350	NC_017545	TTTAC	2	10	1886704	1886713	20 %	60 %	0 %	20 %	386047466
43351	NC_017545	GCA	2	6	1886770	1886775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386047466
43352	NC_017545	AAT	2	6	1886856	1886861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386047466
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43354	NC_017545	TTG	2	6	1886904	1886909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386047466
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43473	NC_017545	CTG	2	6	1892595	1892600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386047473
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