MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017545	A	6	6	236663	236668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017545	AGC	2	6	236698	236703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017545	ATT	2	6	236723	236728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017545	GGTTTT	2	12	236738	236749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017545	ACG	2	6	236782	236787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017545	TGA	2	6	236791	236796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017545	ACT	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_017545	GGAA	2	8	236887	236894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017545	CAA	2	6	236901	236906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017545	ATG	2	6	236949	236954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017545	ATTT	2	8	237048	237055	25 %	75 %	0 %	0 %	386045862
5512	NC_017545	A	6	6	237153	237158	100 %	0 %	0 %	0 %	386045862
5513	NC_017545	AGA	2	6	237179	237184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045862
5514	NC_017545	TAG	2	6	237226	237231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045862
5515	NC_017545	A	6	6	237268	237273	100 %	0 %	0 %	0 %	386045862
5516	NC_017545	AGA	2	6	237308	237313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045862
5517	NC_017545	TTA	2	6	237328	237333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045862
5518	NC_017545	TCC	2	6	237341	237346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045862
5519	NC_017545	AAG	2	6	237392	237397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045862
5520	NC_017545	AGC	2	6	237558	237563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045863
5521	NC_017545	TTA	2	6	237613	237618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045863
5522	NC_017545	ATT	2	6	237660	237665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045863
5523	NC_017545	ATTGAT	2	12	237685	237696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386045863
5524	NC_017545	TAT	2	6	237701	237706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045863
5525	NC_017545	ATG	3	9	237707	237715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045863
5526	NC_017545	TGA	2	6	237776	237781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045863
5527	NC_017545	A	6	6	237806	237811	100 %	0 %	0 %	0 %	386045863
5528	NC_017545	GAA	2	6	237841	237846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045863
5529	NC_017545	A	6	6	237864	237869	100 %	0 %	0 %	0 %	386045863
5530	NC_017545	A	6	6	237901	237906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017545	AGT	2	6	237997	238002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045864
5532	NC_017545	TA	3	6	238137	238142	50 %	50 %	0 %	0 %	386045864
5533	NC_017545	TGA	2	6	238144	238149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045864
5534	NC_017545	CGG	2	6	238180	238185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045864
5535	NC_017545	GAAA	2	8	238189	238196	75 %	0 %	25 %	0 %	386045864
5536	NC_017545	ATT	2	6	238244	238249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045864
5537	NC_017545	GCT	2	6	238343	238348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045864
5538	NC_017545	GAA	2	6	238403	238408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045864
5539	NC_017545	TGC	2	6	238435	238440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045864
5540	NC_017545	AGA	2	6	238585	238590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045864
5541	NC_017545	GAT	2	6	238663	238668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045864
5542	NC_017545	CAGAAC	2	12	238710	238721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386045864
5543	NC_017545	A	6	6	238728	238733	100 %	0 %	0 %	0 %	386045864
5544	NC_017545	ACA	2	6	238807	238812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045864
5545	NC_017545	TTA	2	6	238819	238824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045864
5546	NC_017545	CG	3	6	238850	238855	0 %	0 %	50 %	50 %	386045864
5547	NC_017545	GCT	2	6	238862	238867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045864
5548	NC_017545	TTC	2	6	238917	238922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045864
5549	NC_017545	GAA	2	6	238928	238933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045864
5550	NC_017545	GAATA	2	10	239049	239058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017545	GAA	2	6	239090	239095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5552	NC_017545	CGTC	2	8	239113	239120	0 %	25 %	25 %	50 %	386045865
5553	NC_017545	GAA	2	6	239144	239149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5554	NC_017545	GAA	2	6	239195	239200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5555	NC_017545	AGA	2	6	239230	239235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5556	NC_017545	GAA	2	6	239240	239245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5557	NC_017545	GCT	2	6	239246	239251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045865
5558	NC_017545	TAT	2	6	239275	239280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045865
5559	NC_017545	AGGT	2	8	239301	239308	25 %	25 %	50 %	0 %	386045865
5560	NC_017545	CA	3	6	239311	239316	50 %	0 %	0 %	50 %	386045865
5561	NC_017545	ATT	2	6	239414	239419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045865
5562	NC_017545	AAC	2	6	239544	239549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045865
5563	NC_017545	GAA	2	6	239585	239590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
5564	NC_017545	TGG	2	6	239698	239703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045865
5565	NC_017545	TGC	3	9	239704	239712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045865
5566	NC_017545	TGG	2	6	239800	239805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045865
5567	NC_017545	GCA	2	6	239897	239902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045865
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5570	NC_017545	A	7	7	240115	240121	100 %	0 %	0 %	0 %	386045865
5571	NC_017545	ATG	2	6	240123	240128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045865
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5574	NC_017545	GAA	2	6	240253	240258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045865
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5576	NC_017545	ATT	2	6	240295	240300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045865
5577	NC_017545	ATG	2	6	240402	240407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045865
5578	NC_017545	TGG	2	6	240466	240471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045865
5579	NC_017545	TAT	2	6	240537	240542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045865
5580	NC_017545	TGT	2	6	240606	240611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017545	A	7	7	240620	240626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017545	AT	3	6	240687	240692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017545	AAAC	2	8	240710	240717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_017545	TCA	2	6	240727	240732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_017545	AAATT	2	10	240735	240744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017545	T	7	7	240743	240749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017545	A	6	6	240751	240756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017545	TAGA	2	8	240775	240782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017545	TGC	2	6	240798	240803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_017545	CAA	2	6	240810	240815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_017545	AGA	2	6	240816	240821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017545	AGA	3	9	240848	240856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017545	CAA	2	6	240920	240925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017545	TAATT	2	10	240936	240945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017545	ATTCAA	2	12	240998	241009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5596	NC_017545	AG	3	6	241022	241027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017545	GGC	2	6	241054	241059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017545	CGAA	2	8	241079	241086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_017545	GGA	2	6	241088	241093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017545	CCTG	2	8	241146	241153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_017545	GCA	2	6	241375	241380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_017545	CGC	2	6	241422	241427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_017545	GAA	2	6	241434	241439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017545	TGT	2	6	241461	241466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017545	AGA	2	6	241470	241475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017545	CAG	2	6	241543	241548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_017545	GC	4	8	241599	241606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_017545	AGA	2	6	241684	241689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017545	GGA	2	6	241734	241739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017545	CT	3	6	241759	241764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_017545	TGC	2	6	241879	241884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017545	GAA	2	6	241998	242003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017545	GGT	2	6	242072	242077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017545	GTC	2	6	242086	242091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017545	TCGTG	2	10	242095	242104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5616	NC_017545	GGA	2	6	242197	242202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_017545	ATC	2	6	242221	242226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_017545	AC	3	6	242248	242253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5619	NC_017545	AC	3	6	242417	242422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_017545	CAC	2	6	242432	242437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_017545	AGCC	2	8	242480	242487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_017545	CCT	2	6	242559	242564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_017545	AAGGAA	2	12	242569	242580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017545	TTC	2	6	242596	242601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_017545	TGTT	2	8	242641	242648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017545	TAT	2	6	242695	242700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017545	ATC	2	6	242722	242727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_017545	ATC	2	6	242758	242763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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