MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 41539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017544	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
2	NC_017544	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
3	NC_017544	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
4	NC_017544	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
5	NC_017544	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042348
6	NC_017544	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042348
7	NC_017544	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
8	NC_017544	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
9	NC_017544	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
10	NC_017544	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
11	NC_017544	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
12	NC_017544	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
13	NC_017544	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
14	NC_017544	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
15	NC_017544	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042348
16	NC_017544	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
17	NC_017544	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042348
18	NC_017544	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042348
19	NC_017544	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042348
20	NC_017544	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042348
21	NC_017544	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
22	NC_017544	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042348
23	NC_017544	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042348
24	NC_017544	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042348
25	NC_017544	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042348
26	NC_017544	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042348
27	NC_017544	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042349
28	NC_017544	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
29	NC_017544	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
30	NC_017544	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042349
31	NC_017544	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042349
32	NC_017544	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042349
33	NC_017544	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042349
34	NC_017544	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
35	NC_017544	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042349
36	NC_017544	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042349
37	NC_017544	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042349
38	NC_017544	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042349
39	NC_017544	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042349
40	NC_017544	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042349
41	NC_017544	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
42	NC_017544	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042349
43	NC_017544	ATG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
44	NC_017544	ACA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042350
45	NC_017544	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
46	NC_017544	TTG	2	6	3234	3239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
47	NC_017544	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042350
48	NC_017544	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
49	NC_017544	GGT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042350
50	NC_017544	ATT	2	6	3431	3436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
51	NC_017544	CTT	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042350
52	NC_017544	GAT	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042350
53	NC_017544	CTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042350
54	NC_017544	ACC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042350
55	NC_017544	TGT	2	6	3667	3672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
56	NC_017544	GCT	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042350
57	NC_017544	TAA	2	6	3900	3905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042350
58	NC_017544	CGG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042350
59	NC_017544	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042350
60	NC_017544	TCC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042350
61	NC_017544	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
62	NC_017544	TTA	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042350
63	NC_017544	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042350
64	NC_017544	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042350
65	NC_017544	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042350
66	NC_017544	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042351
67	NC_017544	TGG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042351
68	NC_017544	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042352
69	NC_017544	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042352
70	NC_017544	CAA	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
71	NC_017544	GCG	2	6	5488	5493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042352
72	NC_017544	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042352
73	NC_017544	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042352
74	NC_017544	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042352
75	NC_017544	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042352
76	NC_017544	TTC	3	9	5801	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042352
77	NC_017544	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042352
78	NC_017544	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042352
79	NC_017544	ACA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
80	NC_017544	CAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042352
81	NC_017544	TGA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017544	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017544	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
84	NC_017544	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042353
85	NC_017544	TGA	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
86	NC_017544	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042353
87	NC_017544	TGG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
88	NC_017544	GGC	3	9	6373	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042353
89	NC_017544	GTG	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
90	NC_017544	GTA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
91	NC_017544	GAA	2	6	6523	6528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
92	NC_017544	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042353
93	NC_017544	GAA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
94	NC_017544	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042353
95	NC_017544	GAT	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
96	NC_017544	ATA	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042353
97	NC_017544	CAT	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042353
98	NC_017544	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042353
99	NC_017544	TAA	2	6	6963	6968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042353
100	NC_017544	TGA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
101	NC_017544	ATT	2	6	7030	7035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042353
102	NC_017544	ATG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042353
103	NC_017544	GCT	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042353
104	NC_017544	TTC	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042353
105	NC_017544	TGG	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
106	NC_017544	GAA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
107	NC_017544	TGG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042353
108	NC_017544	ACT	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042353
109	NC_017544	ACC	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042353
110	NC_017544	AGA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042353
111	NC_017544	AAC	2	6	7799	7804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042353
112	NC_017544	ACA	2	6	7813	7818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042353
113	NC_017544	ACT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042353
114	NC_017544	TCG	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042353
115	NC_017544	TAA	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042353
116	NC_017544	TAA	2	6	7987	7992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017544	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017544	CAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042354
119	NC_017544	TTG	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042354
120	NC_017544	CGT	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042354
121	NC_017544	GCA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042354
122	NC_017544	ACT	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042354
123	NC_017544	TAA	2	6	8482	8487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042354
124	NC_017544	TTA	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042354
125	NC_017544	CAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042354
126	NC_017544	CCA	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042354
127	NC_017544	CTG	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042354
128	NC_017544	GAT	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042354
129	NC_017544	GAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042354
130	NC_017544	TTA	2	6	8844	8849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042354
131	NC_017544	GAA	2	6	8914	8919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042354
132	NC_017544	ATG	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042354
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255	NC_017544	TGA	2	6	17928	17933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042361
256	NC_017544	ATT	3	9	18035	18043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042361
257	NC_017544	TTC	2	6	18110	18115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
258	NC_017544	ATG	2	6	18140	18145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042361
259	NC_017544	ATT	2	6	18224	18229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042361
260	NC_017544	CTT	2	6	18325	18330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
261	NC_017544	CTT	2	6	18361	18366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
262	NC_017544	GAT	3	9	18379	18387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042361
263	NC_017544	TGT	2	6	18496	18501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042361
264	NC_017544	TGG	2	6	18502	18507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042361
265	NC_017544	CTT	2	6	18565	18570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
266	NC_017544	TTC	2	6	18689	18694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
267	NC_017544	GTT	2	6	18704	18709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042361
268	NC_017544	CGT	2	6	18764	18769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042361
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270	NC_017544	CTA	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042361
271	NC_017544	GAT	2	6	19007	19012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042361
272	NC_017544	TTC	3	9	19115	19123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
273	NC_017544	TCT	2	6	19143	19148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042361
274	NC_017544	ATT	2	6	19166	19171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042361
275	NC_017544	AGA	2	6	19261	19266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042361
276	NC_017544	AGG	2	6	19299	19304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042361
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278	NC_017544	TAA	2	6	19514	19519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042362
279	NC_017544	AGT	2	6	19540	19545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042362
280	NC_017544	TTG	2	6	19640	19645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042362
281	NC_017544	TTC	2	6	19720	19725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042362
282	NC_017544	CTA	2	6	19729	19734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042362
283	NC_017544	TGT	2	6	19869	19874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042362
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285	NC_017544	GCA	2	6	19949	19954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042363
286	NC_017544	TTG	2	6	19986	19991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042363
287	NC_017544	GTT	2	6	20006	20011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042363
288	NC_017544	ACA	2	6	20054	20059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042363
289	NC_017544	TTA	2	6	20073	20078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042363
290	NC_017544	GCA	2	6	20180	20185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042363
291	NC_017544	GAA	2	6	20391	20396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042364
292	NC_017544	ATA	2	6	20427	20432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042364
293	NC_017544	CAA	2	6	20602	20607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042364
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295	NC_017544	GAC	2	6	20702	20707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042364
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299	NC_017544	TTA	2	6	20997	21002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042364
300	NC_017544	CAA	2	6	21124	21129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042364
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302	NC_017544	ATA	2	6	21225	21230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042364
303	NC_017544	CAG	2	6	21295	21300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042364
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306	NC_017544	TAA	2	6	21359	21364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042364
307	NC_017544	CTC	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
308	NC_017544	ATT	2	6	21575	21580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017544	GAG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017544	TGC	2	6	21700	21705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042365
311	NC_017544	TTG	2	6	21753	21758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042365
312	NC_017544	ATC	2	6	21867	21872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042365
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315	NC_017544	ATG	2	6	21999	22004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042365
316	NC_017544	TGA	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042365
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322	NC_017544	CAT	2	6	22289	22294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042365
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324	NC_017544	TAC	2	6	22475	22480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042365
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327	NC_017544	TTC	2	6	22594	22599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042365
328	NC_017544	GAA	2	6	22805	22810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042365
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330	NC_017544	ACA	2	6	22992	22997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042365
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332	NC_017544	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
333	NC_017544	GTA	2	6	23229	23234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042366
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338	NC_017544	GTT	2	6	23824	23829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042366
339	NC_017544	GCC	3	9	23860	23868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042366
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342	NC_017544	AAG	2	6	24300	24305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042367
343	NC_017544	TAC	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042367
344	NC_017544	GTT	2	6	24327	24332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042367
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364	NC_017544	AAT	2	6	25568	25573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042369
365	NC_017544	GCA	2	6	25588	25593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042369
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367	NC_017544	AAG	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
368	NC_017544	TAA	2	6	25960	25965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042370
369	NC_017544	CGG	2	6	26060	26065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042370
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377	NC_017544	AGC	3	9	26504	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042370
378	NC_017544	ATC	2	6	26565	26570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042370
379	NC_017544	GAG	2	6	26634	26639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042370
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