MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017544	A	6	6	171964	171969	100 %	0 %	0 %	0 %	386042514
4002	NC_017544	CTT	2	6	171979	171984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042514
4003	NC_017544	AGA	2	6	172056	172061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042514
4004	NC_017544	A	6	6	172072	172077	100 %	0 %	0 %	0 %	386042514
4005	NC_017544	TCG	2	6	172082	172087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042514
4006	NC_017544	TC	3	6	172140	172145	0 %	50 %	0 %	50 %	386042514
4007	NC_017544	T	7	7	172255	172261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017544	A	7	7	172267	172273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017544	A	8	8	172279	172286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017544	TACT	2	8	172325	172332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_017544	AAGT	2	8	172347	172354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017544	TTAA	2	8	172413	172420	50 %	50 %	0 %	0 %	386042515
4013	NC_017544	A	6	6	172491	172496	100 %	0 %	0 %	0 %	386042515
4014	NC_017544	GAT	2	6	172533	172538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042515
4015	NC_017544	AAG	2	6	172546	172551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4016	NC_017544	ATT	2	6	172554	172559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042515
4017	NC_017544	CAT	2	6	172576	172581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042515
4018	NC_017544	AGGC	2	8	172589	172596	25 %	0 %	50 %	25 %	386042515
4019	NC_017544	TAA	2	6	172616	172621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042515
4020	NC_017544	TGT	2	6	172634	172639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042515
4021	NC_017544	AGA	2	6	172652	172657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4022	NC_017544	AAC	2	6	172660	172665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042515
4023	NC_017544	TTC	2	6	172724	172729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042515
4024	NC_017544	A	6	6	172734	172739	100 %	0 %	0 %	0 %	386042515
4025	NC_017544	AGA	2	6	172742	172747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4026	NC_017544	TG	3	6	172783	172788	0 %	50 %	50 %	0 %	386042515
4027	NC_017544	A	6	6	172851	172856	100 %	0 %	0 %	0 %	386042515
4028	NC_017544	CTA	2	6	172873	172878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042515
4029	NC_017544	AC	3	6	172969	172974	50 %	0 %	0 %	50 %	386042515
4030	NC_017544	AAT	2	6	173010	173015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042515
4031	NC_017544	GTT	2	6	173055	173060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042515
4032	NC_017544	TTA	2	6	173075	173080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042515
4033	NC_017544	GAA	2	6	173208	173213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4034	NC_017544	AAG	2	6	173218	173223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4035	NC_017544	CAT	2	6	173403	173408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042515
4036	NC_017544	TGA	2	6	173432	173437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042515
4037	NC_017544	T	7	7	173454	173460	0 %	100 %	0 %	0 %	386042515
4038	NC_017544	GGCT	2	8	173465	173472	0 %	25 %	50 %	25 %	386042515
4039	NC_017544	TAC	2	6	173486	173491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042515
4040	NC_017544	CTT	2	6	173494	173499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042515
4041	NC_017544	ATT	2	6	173549	173554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042515
4042	NC_017544	GAA	3	9	173571	173579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042515
4043	NC_017544	TAC	2	6	173587	173592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042515
4044	NC_017544	AGG	2	6	173617	173622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017544	TGGT	2	8	173634	173641	0 %	50 %	50 %	0 %	386042516
4046	NC_017544	AGAA	2	8	173648	173655	75 %	0 %	25 %	0 %	386042516
4047	NC_017544	CAATCC	2	12	173718	173729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386042516
4048	NC_017544	TCA	2	6	173859	173864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042516
4049	NC_017544	A	6	6	173922	173927	100 %	0 %	0 %	0 %	386042516
4050	NC_017544	CTT	2	6	173959	173964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042516
4051	NC_017544	CTT	2	6	174043	174048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042516
4052	NC_017544	GAT	2	6	174100	174105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042516
4053	NC_017544	ATT	2	6	174113	174118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042516
4054	NC_017544	TAT	2	6	174153	174158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042516
4055	NC_017544	TGG	2	6	174163	174168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042516
4056	NC_017544	TAC	2	6	174191	174196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042516
4057	NC_017544	ATT	2	6	174235	174240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042516
4058	NC_017544	CTT	2	6	174257	174262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042516
4059	NC_017544	ATA	2	6	174287	174292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042516
4060	NC_017544	TGA	2	6	174327	174332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042516
4061	NC_017544	GGT	2	6	174344	174349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042516
4062	NC_017544	CGA	2	6	174360	174365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042516
4063	NC_017544	TCA	2	6	174459	174464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042516
4064	NC_017544	ATT	2	6	174470	174475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042516
4065	NC_017544	A	6	6	174489	174494	100 %	0 %	0 %	0 %	386042516
4066	NC_017544	GGT	2	6	174495	174500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042516
4067	NC_017544	A	6	6	174521	174526	100 %	0 %	0 %	0 %	386042517
4068	NC_017544	ATC	2	6	174574	174579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042517
4069	NC_017544	TGG	2	6	174585	174590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042517
4070	NC_017544	ACC	2	6	174663	174668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042517
4071	NC_017544	AAC	2	6	174771	174776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042517
4072	NC_017544	TACTT	2	10	174857	174866	20 %	60 %	0 %	20 %	386042517
4073	NC_017544	CAA	2	6	174869	174874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042517
4074	NC_017544	GAT	2	6	174897	174902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042517
4075	NC_017544	TGA	2	6	174917	174922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042517
4076	NC_017544	ATT	2	6	174969	174974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042517
4077	NC_017544	TTA	2	6	174994	174999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042517
4078	NC_017544	AGA	2	6	175032	175037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042517
4079	NC_017544	ATGG	2	8	175048	175055	25 %	25 %	50 %	0 %	386042517
4080	NC_017544	TTAT	2	8	175155	175162	25 %	75 %	0 %	0 %	386042517
4081	NC_017544	ATG	2	6	175255	175260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042517
4082	NC_017544	TTA	2	6	175271	175276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042517
4083	NC_017544	A	6	6	175358	175363	100 %	0 %	0 %	0 %	386042517
4084	NC_017544	CAA	2	6	175365	175370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017544	A	6	6	175369	175374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017544	A	6	6	175390	175395	100 %	0 %	0 %	0 %	386042518
4087	NC_017544	TAT	2	6	175400	175405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042518
4088	NC_017544	CTGT	2	8	175423	175430	0 %	50 %	25 %	25 %	386042518
4089	NC_017544	GCG	2	6	175448	175453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042518
4090	NC_017544	AGT	3	9	175459	175467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042518
4091	NC_017544	TAT	2	6	175489	175494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042518
4092	NC_017544	TGA	2	6	175527	175532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042518
4093	NC_017544	AAAGAT	2	12	175729	175740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042518
4094	NC_017544	AACA	2	8	175759	175766	75 %	0 %	0 %	25 %	386042518
4095	NC_017544	ATG	2	6	175772	175777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042518
4096	NC_017544	TAA	2	6	175842	175847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042518
4097	NC_017544	GAA	2	6	175906	175911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042518
4098	NC_017544	GCA	2	6	175915	175920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042518
4099	NC_017544	A	7	7	175920	175926	100 %	0 %	0 %	0 %	386042518
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4101	NC_017544	TGG	2	6	176007	176012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042518
4102	NC_017544	AAC	2	6	176040	176045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042518
4103	NC_017544	AGA	2	6	176148	176153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042518
4104	NC_017544	CA	3	6	176185	176190	50 %	0 %	0 %	50 %	386042518
4105	NC_017544	GTT	2	6	176199	176204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042518
4106	NC_017544	AC	3	6	176258	176263	50 %	0 %	0 %	50 %	386042518
4107	NC_017544	CTT	2	6	176277	176282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042518
4108	NC_017544	A	6	6	176317	176322	100 %	0 %	0 %	0 %	386042518
4109	NC_017544	CTTC	2	8	176342	176349	0 %	50 %	0 %	50 %	386042518
4110	NC_017544	CGAA	2	8	176357	176364	50 %	0 %	25 %	25 %	386042518
4111	NC_017544	AGC	2	6	176367	176372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042518
4112	NC_017544	ATA	2	6	176387	176392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042518
4113	NC_017544	CTC	2	6	176450	176455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042518
4114	NC_017544	ATA	2	6	176459	176464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042518
4115	NC_017544	AT	3	6	176490	176495	50 %	50 %	0 %	0 %	386042518
4116	NC_017544	ACA	2	6	176612	176617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042518
4117	NC_017544	CAA	2	6	176619	176624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042518
4118	NC_017544	A	6	6	176776	176781	100 %	0 %	0 %	0 %	386042519
4119	NC_017544	A	6	6	176784	176789	100 %	0 %	0 %	0 %	386042519
4120	NC_017544	TGG	2	6	176802	176807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042519
4121	NC_017544	ATGGCT	2	12	176854	176865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042519
4122	NC_017544	TTA	2	6	176910	176915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042519
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4124	NC_017544	ATTT	2	8	176978	176985	25 %	75 %	0 %	0 %	386042519
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4251	NC_017544	A	6	6	182777	182782	100 %	0 %	0 %	0 %	386042521
4252	NC_017544	A	6	6	182812	182817	100 %	0 %	0 %	0 %	386042521
4253	NC_017544	TA	3	6	182861	182866	50 %	50 %	0 %	0 %	386042521
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4363	NC_017544	A	7	7	187941	187947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4371	NC_017544	GCTA	2	8	188378	188385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4495	NC_017544	CTT	2	6	193901	193906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4496	NC_017544	TTGTC	2	10	193931	193940	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4497	NC_017544	A	6	6	193995	194000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_017544	AATAAA	2	12	194006	194017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_017544	AT	3	6	194115	194120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_017544	ATG	2	6	194223	194228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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