MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017544	TGT	2	6	106842	106847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2502	NC_017544	GTT	2	6	106848	106853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2503	NC_017544	GAG	2	6	106967	106972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042448
2504	NC_017544	TGC	2	6	107079	107084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042448
2505	NC_017544	GC	3	6	107163	107168	0 %	0 %	50 %	50 %	386042448
2506	NC_017544	CAA	2	6	107249	107254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042448
2507	NC_017544	TGA	2	6	107279	107284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2508	NC_017544	TTG	2	6	107312	107317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2509	NC_017544	TTG	2	6	107360	107365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2510	NC_017544	ATA	2	6	107366	107371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042448
2511	NC_017544	ACAA	2	8	107408	107415	75 %	0 %	0 %	25 %	386042448
2512	NC_017544	TTA	2	6	107420	107425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042448
2513	NC_017544	ATTT	2	8	107549	107556	25 %	75 %	0 %	0 %	386042448
2514	NC_017544	AGT	2	6	107559	107564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2515	NC_017544	TGA	2	6	107579	107584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2516	NC_017544	TCA	2	6	107622	107627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042448
2517	NC_017544	AAAAG	2	10	107703	107712	80 %	0 %	20 %	0 %	386042448
2518	NC_017544	TTG	3	9	107732	107740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2519	NC_017544	GCA	2	6	107743	107748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042448
2520	NC_017544	GCT	2	6	107776	107781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042448
2521	NC_017544	GCT	2	6	107815	107820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042448
2522	NC_017544	A	6	6	107822	107827	100 %	0 %	0 %	0 %	386042448
2523	NC_017544	CTTA	2	8	107851	107858	25 %	50 %	0 %	25 %	386042448
2524	NC_017544	AAC	2	6	107866	107871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042448
2525	NC_017544	GAT	2	6	107977	107982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2526	NC_017544	ATA	2	6	108080	108085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042448
2527	NC_017544	TGG	2	6	108090	108095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042448
2528	NC_017544	GAT	2	6	108096	108101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2529	NC_017544	AAC	2	6	108126	108131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042448
2530	NC_017544	AAT	2	6	108292	108297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042448
2531	NC_017544	CT	3	6	108340	108345	0 %	50 %	0 %	50 %	386042448
2532	NC_017544	CTG	2	6	108404	108409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042448
2533	NC_017544	TAC	2	6	108432	108437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042448
2534	NC_017544	AGT	2	6	108453	108458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2535	NC_017544	ATG	2	6	108476	108481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2536	NC_017544	AAAC	2	8	108610	108617	75 %	0 %	0 %	25 %	386042448
2537	NC_017544	GGA	2	6	108628	108633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042448
2538	NC_017544	TGT	2	6	108636	108641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2539	NC_017544	TCT	2	6	108691	108696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042448
2540	NC_017544	ACT	2	6	108808	108813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042448
2541	NC_017544	ATG	2	6	108869	108874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042448
2542	NC_017544	ACC	2	6	108936	108941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042448
2543	NC_017544	GTG	2	6	109023	109028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042448
2544	NC_017544	GTT	2	6	109071	109076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042448
2545	NC_017544	AG	3	6	109172	109177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_017544	TGG	2	6	109209	109214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042449
2547	NC_017544	ACGGT	2	10	109247	109256	20 %	20 %	40 %	20 %	386042449
2548	NC_017544	AGA	2	6	109296	109301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042449
2549	NC_017544	TAT	2	6	109421	109426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042449
2550	NC_017544	ATG	2	6	109493	109498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042449
2551	NC_017544	A	6	6	109539	109544	100 %	0 %	0 %	0 %	386042449
2552	NC_017544	GCG	2	6	109555	109560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042449
2553	NC_017544	TGG	2	6	109584	109589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042449
2554	NC_017544	ATT	2	6	109594	109599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042449
2555	NC_017544	ATGG	2	8	109600	109607	25 %	25 %	50 %	0 %	386042449
2556	NC_017544	AGTT	2	8	109644	109651	25 %	50 %	25 %	0 %	386042449
2557	NC_017544	CTT	2	6	109661	109666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042449
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2559	NC_017544	GAA	2	6	109700	109705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042449
2560	NC_017544	TTAA	2	8	109723	109730	50 %	50 %	0 %	0 %	386042449
2561	NC_017544	AGA	2	6	109745	109750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042449
2562	NC_017544	A	6	6	109762	109767	100 %	0 %	0 %	0 %	386042449
2563	NC_017544	AATT	2	8	109787	109794	50 %	50 %	0 %	0 %	386042449
2564	NC_017544	TGA	2	6	109803	109808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042449
2565	NC_017544	TGAT	2	8	109877	109884	25 %	50 %	25 %	0 %	386042449
2566	NC_017544	ATT	2	6	109891	109896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042449
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2568	NC_017544	GTT	3	9	109927	109935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042449
2569	NC_017544	AGC	2	6	109968	109973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042449
2570	NC_017544	ATG	2	6	110024	110029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042449
2571	NC_017544	T	6	6	110110	110115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_017544	TGAT	2	8	110143	110150	25 %	50 %	25 %	0 %	386042450
2573	NC_017544	TTC	2	6	110185	110190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
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2575	NC_017544	AGA	2	6	110229	110234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042450
2576	NC_017544	GAAG	2	8	110278	110285	50 %	0 %	50 %	0 %	386042450
2577	NC_017544	AGT	2	6	110297	110302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042450
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2579	NC_017544	TCA	2	6	110360	110365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042450
2580	NC_017544	TGC	2	6	110439	110444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042450
2581	NC_017544	TAA	2	6	110465	110470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042450
2582	NC_017544	GAAAT	2	10	110486	110495	60 %	20 %	20 %	0 %	386042450
2583	NC_017544	GCT	2	6	110516	110521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042450
2584	NC_017544	AAT	2	6	110524	110529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042450
2585	NC_017544	TTC	3	9	110530	110538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
2586	NC_017544	CTT	2	6	110646	110651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
2587	NC_017544	TAT	2	6	110691	110696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042450
2588	NC_017544	TGA	2	6	110715	110720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042450
2589	NC_017544	GGC	2	6	110861	110866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042450
2590	NC_017544	TTC	2	6	110870	110875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
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2592	NC_017544	TAA	2	6	110979	110984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042450
2593	NC_017544	GAATT	2	10	111127	111136	40 %	40 %	20 %	0 %	386042450
2594	NC_017544	CGG	2	6	111158	111163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042450
2595	NC_017544	TTAC	2	8	111170	111177	25 %	50 %	0 %	25 %	386042450
2596	NC_017544	TCT	2	6	111200	111205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
2597	NC_017544	ATCA	2	8	111382	111389	50 %	25 %	0 %	25 %	386042450
2598	NC_017544	ACA	2	6	111456	111461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042450
2599	NC_017544	ATC	2	6	111712	111717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042450
2600	NC_017544	TAA	2	6	111766	111771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042450
2601	NC_017544	GCG	2	6	111842	111847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042450
2602	NC_017544	TTC	2	6	111865	111870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042450
2603	NC_017544	ATTT	2	8	111882	111889	25 %	75 %	0 %	0 %	386042450
2604	NC_017544	GTT	2	6	111919	111924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042451
2605	NC_017544	ATA	2	6	111941	111946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042451
2606	NC_017544	GT	4	8	111969	111976	0 %	50 %	50 %	0 %	386042451
2607	NC_017544	GAT	2	6	111986	111991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042451
2608	NC_017544	TAAAAT	2	12	112004	112015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042451
2609	NC_017544	CTT	2	6	112024	112029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042451
2610	NC_017544	AGA	2	6	112034	112039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042451
2611	NC_017544	ATA	2	6	112053	112058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042451
2612	NC_017544	T	8	8	112081	112088	0 %	100 %	0 %	0 %	386042451
2613	NC_017544	ATC	2	6	112139	112144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042451
2614	NC_017544	CAAAAT	2	12	112145	112156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386042451
2615	NC_017544	GGAT	2	8	112157	112164	25 %	25 %	50 %	0 %	386042451
2616	NC_017544	T	6	6	112164	112169	0 %	100 %	0 %	0 %	386042451
2617	NC_017544	GCT	2	6	112195	112200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042451
2618	NC_017544	GTCCGC	2	12	112277	112288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386042451
2619	NC_017544	TTG	2	6	112318	112323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042451
2620	NC_017544	GTC	2	6	112595	112600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042451
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2622	NC_017544	CAT	2	6	112694	112699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042451
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2993	NC_017544	GTA	3	9	128375	128383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042473
2994	NC_017544	CCG	2	6	128387	128392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042473
2995	NC_017544	GTT	2	6	128413	128418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042473
2996	NC_017544	CCA	2	6	128423	128428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042473
2997	NC_017544	TCC	2	6	128440	128445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042473
2998	NC_017544	GCC	2	6	128476	128481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042473
2999	NC_017544	GGA	2	6	128495	128500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042473
3000	NC_017544	GTG	2	6	128534	128539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042473

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