MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017544	TAA	2	6	44685	44690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042386
1002	NC_017544	AGA	2	6	44691	44696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042386
1003	NC_017544	TCTT	2	8	44729	44736	0 %	75 %	0 %	25 %	386042386
1004	NC_017544	ATT	2	6	44806	44811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042386
1005	NC_017544	CTG	2	6	44846	44851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042386
1006	NC_017544	TTG	2	6	44962	44967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042386
1007	NC_017544	ATTA	2	8	44998	45005	50 %	50 %	0 %	0 %	386042386
1008	NC_017544	AT	3	6	45060	45065	50 %	50 %	0 %	0 %	386042386
1009	NC_017544	TGA	2	6	45066	45071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042386
1010	NC_017544	GCA	2	6	45082	45087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042386
1011	NC_017544	AGC	2	6	45111	45116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042386
1012	NC_017544	AAAG	2	8	45130	45137	75 %	0 %	25 %	0 %	386042386
1013	NC_017544	AAT	2	6	45153	45158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042386
1014	NC_017544	TTG	2	6	45212	45217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042386
1015	NC_017544	AGG	2	6	45312	45317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017544	GGC	2	6	45433	45438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042387
1017	NC_017544	TGG	2	6	45440	45445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042387
1018	NC_017544	CAA	2	6	45456	45461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042387
1019	NC_017544	AAG	2	6	45469	45474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042387
1020	NC_017544	ATG	3	9	45586	45594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042387
1021	NC_017544	T	6	6	45620	45625	0 %	100 %	0 %	0 %	386042387
1022	NC_017544	GCG	2	6	45649	45654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042387
1023	NC_017544	TCT	2	6	45683	45688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042387
1024	NC_017544	A	7	7	45731	45737	100 %	0 %	0 %	0 %	386042387
1025	NC_017544	ACT	2	6	45760	45765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042387
1026	NC_017544	ATTTT	2	10	45778	45787	20 %	80 %	0 %	0 %	386042387
1027	NC_017544	GTT	2	6	45793	45798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042387
1028	NC_017544	AGA	2	6	45836	45841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042387
1029	NC_017544	GAAG	2	8	45855	45862	50 %	0 %	50 %	0 %	386042387
1030	NC_017544	A	7	7	45902	45908	100 %	0 %	0 %	0 %	386042387
1031	NC_017544	AAAC	2	8	45961	45968	75 %	0 %	0 %	25 %	386042387
1032	NC_017544	GTT	2	6	46011	46016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042387
1033	NC_017544	GAA	2	6	46105	46110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042387
1034	NC_017544	TTA	2	6	46150	46155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042387
1035	NC_017544	AG	3	6	46163	46168	50 %	0 %	50 %	0 %	386042387
1036	NC_017544	GCT	2	6	46224	46229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042387
1037	NC_017544	ATT	2	6	46263	46268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042387
1038	NC_017544	TGA	2	6	46280	46285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042387
1039	NC_017544	AAAGAT	2	12	46290	46301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386042387
1040	NC_017544	GGC	2	6	46374	46379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042387
1041	NC_017544	AAG	2	6	46435	46440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042387
1042	NC_017544	TTAA	2	8	46543	46550	50 %	50 %	0 %	0 %	386042388
1043	NC_017544	CAA	3	9	46592	46600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042388
1044	NC_017544	GAA	2	6	46732	46737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042388
1045	NC_017544	A	6	6	46743	46748	100 %	0 %	0 %	0 %	386042388
1046	NC_017544	ATT	2	6	46750	46755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042388
1047	NC_017544	A	6	6	46801	46806	100 %	0 %	0 %	0 %	386042388
1048	NC_017544	AAAC	2	8	46812	46819	75 %	0 %	0 %	25 %	386042388
1049	NC_017544	ATTT	2	8	46825	46832	25 %	75 %	0 %	0 %	386042388
1050	NC_017544	T	7	7	46830	46836	0 %	100 %	0 %	0 %	386042388
1051	NC_017544	TGC	2	6	46857	46862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042388
1052	NC_017544	GAT	2	6	46960	46965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042388
1053	NC_017544	TACG	2	8	46980	46987	25 %	25 %	25 %	25 %	386042388
1054	NC_017544	GAAAC	2	10	47036	47045	60 %	0 %	20 %	20 %	386042388
1055	NC_017544	ATA	2	6	47075	47080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042388
1056	NC_017544	ATT	2	6	47083	47088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042388
1057	NC_017544	TA	3	6	47111	47116	50 %	50 %	0 %	0 %	386042388
1058	NC_017544	TGAAAT	2	12	47127	47138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042388
1059	NC_017544	TAG	2	6	47220	47225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042388
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1061	NC_017544	GACTT	2	10	47275	47284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_017544	TAAA	2	8	47308	47315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017544	AGTG	2	8	47325	47332	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017544	TGG	2	6	47335	47340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042389
1065	NC_017544	TTA	2	6	47344	47349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042389
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1067	NC_017544	AAT	2	6	47403	47408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042389
1068	NC_017544	CAT	2	6	47426	47431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042389
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1073	NC_017544	TAA	2	6	47662	47667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042389
1074	NC_017544	A	6	6	47674	47679	100 %	0 %	0 %	0 %	386042389
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1083	NC_017544	T	8	8	48006	48013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017544	TC	3	6	48027	48032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_017544	TTAG	2	8	48059	48066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017544	TGA	2	6	48074	48079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
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1088	NC_017544	TGA	2	6	48198	48203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
1089	NC_017544	ATG	2	6	48220	48225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
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1096	NC_017544	T	6	6	48519	48524	0 %	100 %	0 %	0 %	386042390
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1099	NC_017544	CAT	2	6	48655	48660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042390
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1101	NC_017544	GAAC	2	8	48775	48782	50 %	0 %	25 %	25 %	386042390
1102	NC_017544	TTTA	2	8	48816	48823	25 %	75 %	0 %	0 %	386042390
1103	NC_017544	CAA	2	6	48952	48957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042390
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1106	NC_017544	ATG	2	6	49121	49126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042390
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1108	NC_017544	TTG	2	6	49359	49364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017544	ATA	2	6	49442	49447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017544	ATT	2	6	49469	49474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017544	GCTC	2	8	49479	49486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017544	ATGGT	2	10	49529	49538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017544	AGG	2	6	49571	49576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017544	GTAGA	2	10	49578	49587	40 %	20 %	40 %	0 %	386042391
1115	NC_017544	CAT	2	6	49613	49618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042391
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1122	NC_017544	GAG	2	6	49919	49924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017544	ATG	2	6	49936	49941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042392
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1126	NC_017544	TTA	2	6	50078	50083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042392
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