MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017544	CTT	2	6	22898	22903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042365
502	NC_017544	A	6	6	22958	22963	100 %	0 %	0 %	0 %	386042365
503	NC_017544	ACA	2	6	22992	22997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042365
504	NC_017544	GAA	2	6	23023	23028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042365
505	NC_017544	A	6	6	23027	23032	100 %	0 %	0 %	0 %	386042365
506	NC_017544	A	6	6	23048	23053	100 %	0 %	0 %	0 %	386042365
507	NC_017544	AT	3	6	23086	23091	50 %	50 %	0 %	0 %	386042365
508	NC_017544	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017544	TTTTA	2	10	23126	23135	20 %	80 %	0 %	0 %	386042366
510	NC_017544	CG	3	6	23145	23150	0 %	0 %	50 %	50 %	386042366
511	NC_017544	T	7	7	23203	23209	0 %	100 %	0 %	0 %	386042366
512	NC_017544	GACCA	2	10	23210	23219	40 %	0 %	20 %	40 %	386042366
513	NC_017544	GTA	2	6	23229	23234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042366
514	NC_017544	ATT	2	6	23238	23243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042366
515	NC_017544	T	6	6	23319	23324	0 %	100 %	0 %	0 %	386042366
516	NC_017544	TTC	2	6	23368	23373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042366
517	NC_017544	T	6	6	23388	23393	0 %	100 %	0 %	0 %	386042366
518	NC_017544	TGGAT	2	10	23469	23478	20 %	40 %	40 %	0 %	386042366
519	NC_017544	T	6	6	23521	23526	0 %	100 %	0 %	0 %	386042366
520	NC_017544	GCA	2	6	23537	23542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042366
521	NC_017544	AGTTGC	2	12	23649	23660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386042366
522	NC_017544	TAAAGC	2	12	23702	23713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386042366
523	NC_017544	GTT	2	6	23721	23726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042366
524	NC_017544	AGCC	2	8	23767	23774	25 %	0 %	25 %	50 %	386042366
525	NC_017544	GAAC	2	8	23803	23810	50 %	0 %	25 %	25 %	386042366
526	NC_017544	GTT	2	6	23824	23829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042366
527	NC_017544	GCC	3	9	23860	23868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042366
528	NC_017544	A	7	7	23940	23946	100 %	0 %	0 %	0 %	386042366
529	NC_017544	A	6	6	24122	24127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017544	CG	3	6	24166	24171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017544	TAT	3	9	24215	24223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042367
532	NC_017544	ATTA	2	8	24239	24246	50 %	50 %	0 %	0 %	386042367
533	NC_017544	A	6	6	24271	24276	100 %	0 %	0 %	0 %	386042367
534	NC_017544	AGA	2	6	24284	24289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042367
535	NC_017544	AAG	2	6	24300	24305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042367
536	NC_017544	TAC	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042367
537	NC_017544	GTT	2	6	24327	24332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042367
538	NC_017544	GTAA	2	8	24396	24403	50 %	25 %	25 %	0 %	386042367
539	NC_017544	TAT	2	6	24407	24412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042367
540	NC_017544	GAA	2	6	24417	24422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042367
541	NC_017544	CAAAA	2	10	24470	24479	80 %	0 %	0 %	20 %	386042367
542	NC_017544	AGT	2	6	24500	24505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042367
543	NC_017544	A	6	6	24540	24545	100 %	0 %	0 %	0 %	386042367
544	NC_017544	TGA	2	6	24599	24604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042367
545	NC_017544	AAC	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042367
546	NC_017544	AG	3	6	24746	24751	50 %	0 %	50 %	0 %	386042367
547	NC_017544	AAT	2	6	24783	24788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042367
548	NC_017544	AT	3	6	24872	24877	50 %	50 %	0 %	0 %	386042367
549	NC_017544	ATTGAA	2	12	24909	24920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042367
550	NC_017544	A	6	6	24924	24929	100 %	0 %	0 %	0 %	386042367
551	NC_017544	ATTAT	2	10	24955	24964	40 %	60 %	0 %	0 %	386042368
552	NC_017544	GCA	2	6	24966	24971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042368
553	NC_017544	AAC	2	6	25025	25030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042368
554	NC_017544	GAA	2	6	25056	25061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042368
555	NC_017544	TTG	2	6	25138	25143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042368
556	NC_017544	AGG	2	6	25258	25263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042368
557	NC_017544	ATA	2	6	25282	25287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042368
558	NC_017544	TGA	2	6	25328	25333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042368
559	NC_017544	GGA	2	6	25337	25342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042368
560	NC_017544	CAA	2	6	25413	25418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042369
561	NC_017544	TTG	2	6	25455	25460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042369
562	NC_017544	ATG	2	6	25461	25466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042369
563	NC_017544	A	6	6	25474	25479	100 %	0 %	0 %	0 %	386042369
564	NC_017544	GCA	2	6	25553	25558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042369
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566	NC_017544	AAT	2	6	25568	25573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042369
567	NC_017544	GCA	2	6	25588	25593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042369
568	NC_017544	A	7	7	25708	25714	100 %	0 %	0 %	0 %	386042369
569	NC_017544	ATT	2	6	25752	25757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042369
570	NC_017544	A	7	7	25831	25837	100 %	0 %	0 %	0 %	386042369
571	NC_017544	AAG	2	6	25846	25851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017544	GTTA	2	8	25892	25899	25 %	50 %	25 %	0 %	386042370
573	NC_017544	TAA	2	6	25960	25965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042370
574	NC_017544	CGG	2	6	26060	26065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042370
575	NC_017544	TCG	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042370
576	NC_017544	TCAGG	2	10	26124	26133	20 %	20 %	40 %	20 %	386042370
577	NC_017544	CAG	2	6	26263	26268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042370
578	NC_017544	CG	4	8	26311	26318	0 %	0 %	50 %	50 %	386042370
579	NC_017544	TGG	2	6	26414	26419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042370
580	NC_017544	TTC	2	6	26422	26427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042370
581	NC_017544	AGT	2	6	26429	26434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042370
582	NC_017544	CAA	2	6	26464	26469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042370
583	NC_017544	TCG	2	6	26476	26481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042370
584	NC_017544	AGC	3	9	26504	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042370
585	NC_017544	ATC	2	6	26565	26570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042370
586	NC_017544	CAAA	2	8	26576	26583	75 %	0 %	0 %	25 %	386042370
587	NC_017544	GAG	2	6	26634	26639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042370
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589	NC_017544	GTTG	2	8	26720	26727	0 %	50 %	50 %	0 %	386042371
590	NC_017544	ATG	2	6	26761	26766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042371
591	NC_017544	TGA	3	9	26820	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042371
592	NC_017544	ATG	2	6	26839	26844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042371
593	NC_017544	GGT	2	6	26884	26889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042371
594	NC_017544	AAAG	2	8	26928	26935	75 %	0 %	25 %	0 %	386042371
595	NC_017544	AAG	2	6	26942	26947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042371
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597	NC_017544	AT	3	6	27048	27053	50 %	50 %	0 %	0 %	386042371
598	NC_017544	TTTAC	2	10	27124	27133	20 %	60 %	0 %	20 %	386042371
599	NC_017544	GTC	2	6	27229	27234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042371
600	NC_017544	A	7	7	27388	27394	100 %	0 %	0 %	0 %	386042371
601	NC_017544	TTA	2	6	27415	27420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042371
602	NC_017544	ATT	2	6	27436	27441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042371
603	NC_017544	GGA	2	6	27481	27486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017544	GGA	2	6	27534	27539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042372
606	NC_017544	A	6	6	27545	27550	100 %	0 %	0 %	0 %	386042372
607	NC_017544	TCA	2	6	27567	27572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042372
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609	NC_017544	TGG	2	6	27584	27589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042372
610	NC_017544	ACG	2	6	27605	27610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042372
611	NC_017544	ATT	2	6	27613	27618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042372
612	NC_017544	AGG	2	6	27675	27680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042372
613	NC_017544	TTA	2	6	27698	27703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042372
614	NC_017544	CTG	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042372
615	NC_017544	TTA	2	6	27720	27725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042372
616	NC_017544	AT	3	6	27785	27790	50 %	50 %	0 %	0 %	386042372
617	NC_017544	TTG	2	6	27872	27877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042372
618	NC_017544	CAG	2	6	27902	27907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042372
619	NC_017544	TTG	2	6	27931	27936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042372
620	NC_017544	CAA	2	6	28057	28062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042372
621	NC_017544	ACC	2	6	28107	28112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386042372
622	NC_017544	TGG	2	6	28137	28142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042372
623	NC_017544	TAA	2	6	28198	28203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042372
624	NC_017544	T	6	6	28237	28242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017544	ATG	2	6	28252	28257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042373
626	NC_017544	AAG	2	6	28265	28270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042373
627	NC_017544	TAC	2	6	28284	28289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042373
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629	NC_017544	TGT	2	6	28389	28394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042373
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