MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 66143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017544	AGA	2	6	215298	215303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042551
5002	NC_017544	GACG	2	8	215374	215381	25 %	0 %	50 %	25 %	386042551
5003	NC_017544	A	6	6	215384	215389	100 %	0 %	0 %	0 %	386042551
5004	NC_017544	GAA	2	6	215482	215487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042551
5005	NC_017544	AAAAT	2	10	215564	215573	80 %	20 %	0 %	0 %	386042551
5006	NC_017544	CAG	2	6	215600	215605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042551
5007	NC_017544	GGAA	2	8	215670	215677	50 %	0 %	50 %	0 %	386042551
5008	NC_017544	GAAA	2	8	215772	215779	75 %	0 %	25 %	0 %	386042551
5009	NC_017544	TTA	2	6	215804	215809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017544	GAAG	2	8	215811	215818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017544	CT	3	6	215886	215891	0 %	50 %	0 %	50 %	386042552
5012	NC_017544	TGG	2	6	215939	215944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042552
5013	NC_017544	CAA	2	6	215968	215973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042552
5014	NC_017544	GTT	2	6	216025	216030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042552
5015	NC_017544	GAC	2	6	216068	216073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042552
5016	NC_017544	AAT	2	6	216078	216083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042552
5017	NC_017544	GC	3	6	216087	216092	0 %	0 %	50 %	50 %	386042552
5018	NC_017544	CAT	2	6	216165	216170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042552
5019	NC_017544	AATT	2	8	216194	216201	50 %	50 %	0 %	0 %	386042552
5020	NC_017544	TCA	2	6	216206	216211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042552
5021	NC_017544	GCTT	2	8	216237	216244	0 %	50 %	25 %	25 %	386042552
5022	NC_017544	AAGGAG	2	12	216263	216274	50 %	0 %	50 %	0 %	386042552
5023	NC_017544	ATT	2	6	216313	216318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042552
5024	NC_017544	ATT	2	6	216328	216333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042552
5025	NC_017544	ATG	2	6	216377	216382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042552
5026	NC_017544	GTG	2	6	216401	216406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042552
5027	NC_017544	TAA	2	6	216453	216458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042552
5028	NC_017544	AGA	2	6	216507	216512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042552
5029	NC_017544	CTT	2	6	216534	216539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386042552
5030	NC_017544	TTATT	2	10	216578	216587	20 %	80 %	0 %	0 %	386042552
5031	NC_017544	TTCC	2	8	216600	216607	0 %	50 %	0 %	50 %	386042552
5032	NC_017544	CAA	2	6	216772	216777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042552
5033	NC_017544	TTA	2	6	216857	216862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042552
5034	NC_017544	ATT	2	6	216918	216923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042552
5035	NC_017544	ATC	2	6	216952	216957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042552
5036	NC_017544	GT	3	6	217095	217100	0 %	50 %	50 %	0 %	386042552
5037	NC_017544	TCC	2	6	217115	217120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386042552
5038	NC_017544	ACAA	2	8	217143	217150	75 %	0 %	0 %	25 %	386042552
5039	NC_017544	A	6	6	217169	217174	100 %	0 %	0 %	0 %	386042552
5040	NC_017544	TGT	2	6	217178	217183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042552
5041	NC_017544	GTGG	2	8	217297	217304	0 %	25 %	75 %	0 %	386042552
5042	NC_017544	TTCC	2	8	217363	217370	0 %	50 %	0 %	50 %	386042552
5043	NC_017544	ATT	2	6	217383	217388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042552
5044	NC_017544	TAAG	2	8	217394	217401	50 %	25 %	25 %	0 %	386042552
5045	NC_017544	TTG	2	6	217403	217408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042552
5046	NC_017544	TAAT	2	8	217417	217424	50 %	50 %	0 %	0 %	386042552
5047	NC_017544	AAG	2	6	217513	217518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042553
5048	NC_017544	AGA	2	6	217643	217648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042553
5049	NC_017544	A	6	6	217656	217661	100 %	0 %	0 %	0 %	386042553
5050	NC_017544	ATT	2	6	217686	217691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042553
5051	NC_017544	AGA	2	6	217694	217699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042553
5052	NC_017544	T	6	6	217766	217771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017544	T	6	6	217797	217802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017544	T	7	7	217890	217896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017544	GGGA	2	8	217936	217943	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017544	A	6	6	217953	217958	100 %	0 %	0 %	0 %	386042554
5057	NC_017544	CAA	2	6	218008	218013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042554
5058	NC_017544	A	7	7	218016	218022	100 %	0 %	0 %	0 %	386042554
5059	NC_017544	GTC	2	6	218029	218034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042554
5060	NC_017544	TAT	2	6	218072	218077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042554
5061	NC_017544	TGG	2	6	218086	218091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386042554
5062	NC_017544	A	6	6	218142	218147	100 %	0 %	0 %	0 %	386042554
5063	NC_017544	GCAAGT	2	12	218153	218164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386042554
5064	NC_017544	ATG	2	6	218233	218238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042554
5065	NC_017544	ATT	2	6	218292	218297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042554
5066	NC_017544	AGA	2	6	218309	218314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042554
5067	NC_017544	AGCCG	2	10	218342	218351	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5068	NC_017544	TAT	2	6	218432	218437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017544	AGG	2	6	218469	218474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017544	T	7	7	218480	218486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017544	TCGA	2	8	218490	218497	25 %	25 %	25 %	25 %	386042555
5072	NC_017544	CAA	2	6	218504	218509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042555
5073	NC_017544	TGA	2	6	218678	218683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042555
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5075	NC_017544	A	6	6	218769	218774	100 %	0 %	0 %	0 %	386042555
5076	NC_017544	CTG	2	6	218776	218781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042555
5077	NC_017544	TGA	2	6	218843	218848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042555
5078	NC_017544	ACT	2	6	218856	218861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042555
5079	NC_017544	GGC	2	6	218889	218894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386042555
5080	NC_017544	GAG	2	6	218896	218901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042555
5081	NC_017544	AATT	2	8	218924	218931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017544	TAA	2	6	218977	218982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017544	A	6	6	218981	218986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017544	GAAG	2	8	219004	219011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017544	ATCCG	2	10	219073	219082	20 %	20 %	20 %	40 %	386042556
5086	NC_017544	T	6	6	219138	219143	0 %	100 %	0 %	0 %	386042556
5087	NC_017544	AAG	2	6	219167	219172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042556
5088	NC_017544	AG	3	6	219205	219210	50 %	0 %	50 %	0 %	386042556
5089	NC_017544	GCA	2	6	219214	219219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042556
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5091	NC_017544	CGT	2	6	219231	219236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386042556
5092	NC_017544	AGA	2	6	219276	219281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042556
5093	NC_017544	GAA	2	6	219325	219330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042556
5094	NC_017544	AAAC	2	8	219387	219394	75 %	0 %	0 %	25 %	386042556
5095	NC_017544	AGG	2	6	219504	219509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042556
5096	NC_017544	GCAA	2	8	219510	219517	50 %	0 %	25 %	25 %	386042556
5097	NC_017544	T	6	6	219525	219530	0 %	100 %	0 %	0 %	386042556
5098	NC_017544	ATT	2	6	219550	219555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042556
5099	NC_017544	TGA	2	6	219591	219596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042556
5100	NC_017544	CAG	2	6	219671	219676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386042556
5101	NC_017544	AGA	2	6	219702	219707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042556
5102	NC_017544	GAA	2	6	219756	219761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042556
5103	NC_017544	TCA	2	6	219767	219772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042556
5104	NC_017544	ACA	2	6	219787	219792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042556
5105	NC_017544	TAG	2	6	219801	219806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042556
5106	NC_017544	CGC	2	6	219835	219840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042556
5107	NC_017544	TTA	2	6	219887	219892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386042556
5108	NC_017544	AT	3	6	219904	219909	50 %	50 %	0 %	0 %	386042556
5109	NC_017544	GATT	2	8	219951	219958	25 %	50 %	25 %	0 %	386042556
5110	NC_017544	ATC	2	6	220040	220045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386042556
5111	NC_017544	ATA	2	6	220076	220081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042556
5112	NC_017544	TTAAAG	2	12	220096	220107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386042556
5113	NC_017544	GTT	2	6	220114	220119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386042556
5114	NC_017544	CAAA	2	8	220120	220127	75 %	0 %	0 %	25 %	386042556
5115	NC_017544	ATA	2	6	220162	220167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042556
5116	NC_017544	GTA	2	6	220229	220234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042556
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5119	NC_017544	AGG	2	6	220413	220418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042556
5120	NC_017544	GCAT	2	8	220427	220434	25 %	25 %	25 %	25 %	386042556
5121	NC_017544	GGA	2	6	220461	220466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386042556
5122	NC_017544	AAC	2	6	220506	220511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042556
5123	NC_017544	TAG	2	6	220535	220540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042556
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5125	NC_017544	TAG	2	6	220757	220762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042556
5126	NC_017544	GCAAA	2	10	220778	220787	60 %	0 %	20 %	20 %	386042556
5127	NC_017544	TTACT	2	10	220802	220811	20 %	60 %	0 %	20 %	386042556
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5134	NC_017544	AATA	2	8	221125	221132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_017544	A	6	6	221135	221140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_017544	ATAG	2	8	225279	225286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_017544	TAA	2	6	225295	225300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386042560
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5247	NC_017544	CAA	2	6	225723	225728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386042560
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5249	NC_017544	AGA	2	6	225911	225916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042560
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5255	NC_017544	CGC	2	6	226201	226206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386042560
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5258	NC_017544	T	6	6	226256	226261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_017544	A	8	8	226265	226272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_017544	CAG	2	6	226308	226313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5263	NC_017544	AAC	2	6	226351	226356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_017544	T	6	6	226448	226453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_017544	GAAAA	2	10	226466	226475	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_017544	CCA	2	6	226518	226523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5268	NC_017544	AAC	2	6	226553	226558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_017544	T	6	6	226651	226656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_017544	A	6	6	226662	226667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_017544	AT	3	6	226739	226744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5275	NC_017544	A	6	6	226865	226870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5277	NC_017544	AT	3	6	226942	226947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_017544	AAC	2	6	226959	226964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5283	NC_017544	T	7	7	227059	227065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5291	NC_017544	GAA	2	6	227323	227328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5292	NC_017544	AT	3	6	227378	227383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_017544	TGATA	2	10	227442	227451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5298	NC_017544	A	6	6	227575	227580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_017544	GAA	2	6	231165	231170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386042564
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5375	NC_017544	ATG	2	6	231314	231319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386042564
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5497	NC_017544	GGC	2	6	237988	237993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5500	NC_017544	CCTG	2	8	238080	238087	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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